FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5144, 730 aa 1>>>pF1KB5144 730 - 730 aa - 730 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5526+/-0.000461; mu= 18.5238+/- 0.028 mean_var=65.4625+/-13.171, 0's: 0 Z-trim(109.0): 97 B-trim: 52 in 1/46 Lambda= 0.158518 statistics sampled from 17031 (17129) to 17031 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16 Scan time: 11.380 The best scores are: opt bits E(85289) NP_877499 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral ( 730) 4873 1124.0 0 NP_001139807 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutr ( 623) 4167 962.5 0 NP_001010898 (OMIM: 610299,616269) sodium-dependen ( 727) 3376 781.6 0 XP_006710706 (OMIM: 610299,616269) PREDICTED: sodi ( 727) 3376 781.6 0 XP_011536827 (OMIM: 607971) PREDICTED: sodium-depe ( 554) 3315 767.6 0 NP_060527 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral ( 289) 1735 406.2 9.6e-113 NP_064593 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 592) 1593 373.8 1.1e-102 XP_005258877 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 1549 363.8 1.4e-99 NP_054756 (OMIM: 607972) orphan sodium- and chlori ( 736) 1549 363.8 1.4e-99 XP_006723231 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 1549 363.8 1.4e-99 XP_011525162 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 758) 1549 363.8 1.4e-99 XP_016882201 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 818) 1549 363.8 1.5e-99 NP_001003841 (OMIM: 138500,234500,242600,608893) s ( 634) 1498 352.1 4e-96 NP_872438 (OMIM: 610300) sodium-dependent neutral ( 628) 1481 348.2 5.8e-95 XP_011525163 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 589) 1390 327.4 1e-88 XP_011532150 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 321) 1268 299.4 1.5e-80 XP_011532149 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 493) 1152 272.9 2.1e-72 XP_006713369 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 912 218.1 8.3e-56 XP_005265468 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 912 218.1 8.3e-56 XP_011532329 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 912 218.1 8.3e-56 XP_011532327 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 912 218.1 8.3e-56 XP_016862561 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 912 218.1 8.3e-56 NP_003033 (OMIM: 137165,616421) sodium- and chlori ( 599) 912 218.1 8.3e-56 XP_016862560 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 912 218.1 8.3e-56 XP_005265467 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 912 218.1 8.3e-56 NP_071800 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 555) 828 198.9 4.7e-50 XP_011525161 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 781) 675 163.9 2.2e-39 NP_001248309 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 637) 537 132.3 5.7e-30 NP_001136278 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 520) 519 128.2 8.3e-29 NP_005620 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chlori ( 635) 519 128.2 9.9e-29 NP_001127840 (OMIM: 186854) sodium- and chloride-d ( 200) 508 125.5 2e-28 NP_001315559 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 465) 512 126.6 2.3e-28 NP_001315555 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 522) 512 126.6 2.5e-28 NP_001315557 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 568) 512 126.6 2.7e-28 XP_016857642 (OMIM: 601019) PREDICTED: sodium- and ( 595) 512 126.6 2.8e-28 XP_016857641 (OMIM: 601019) PREDICTED: sodium- and ( 606) 512 126.6 2.9e-28 NP_001315556 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 612) 512 126.6 2.9e-28 XP_011540319 (OMIM: 601019) PREDICTED: sodium- and ( 618) 512 126.6 2.9e-28 NP_001315558 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 633) 512 126.6 3e-28 NP_001020016 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 633) 512 126.6 3e-28 NP_008865 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-depe ( 652) 512 126.6 3.1e-28 NP_964012 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-depe ( 706) 512 126.6 3.3e-28 NP_001036 (OMIM: 164230,182138,607834) sodium-depe ( 630) 511 126.4 3.5e-28 XP_011532332 (OMIM: 186854) PREDICTED: sodium- and ( 620) 508 125.7 5.5e-28 NP_003034 (OMIM: 186854) sodium- and chloride-depe ( 620) 508 125.7 5.5e-28 XP_006713370 (OMIM: 186854) PREDICTED: sodium- and ( 649) 508 125.7 5.8e-28 NP_001127839 (OMIM: 186854) sodium- and chloride-d ( 721) 508 125.7 6.3e-28 XP_011521599 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 572) 503 124.6 1.1e-27 XP_011521598 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 583) 503 124.6 1.2e-27 XP_016874034 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 450) 501 124.1 1.3e-27 >>NP_877499 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral amin (730 aa) initn: 4873 init1: 4873 opt: 4873 Z-score: 6017.2 bits: 1124.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4873; 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