FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5152, 654 aa 1>>>pF1KB5152 654 - 654 aa - 654 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7438+/-0.00097; mu= -3.9023+/- 0.058 mean_var=321.0443+/-66.796, 0's: 0 Z-trim(115.4): 63 B-trim: 117 in 1/52 Lambda= 0.071580 statistics sampled from 15906 (15966) to 15906 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16 Scan time: 4.810 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12074.1 TCF3 gene_id:6929|Hs108|chr19 ( 654) 4405 468.7 1.1e-131 CCDS45899.1 TCF3 gene_id:6929|Hs108|chr19 ( 651) 4231 450.7 2.9e-126 CCDS59321.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 664) 802 96.6 1.2e-19 CCDS58628.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 625) 800 96.4 1.3e-19 CCDS77192.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 643) 800 96.4 1.3e-19 CCDS11960.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 667) 800 96.4 1.4e-19 CCDS58625.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 507) 791 95.4 2.1e-19 CCDS58623.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 507) 791 95.4 2.1e-19 CCDS58626.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 537) 791 95.4 2.2e-19 CCDS77191.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 596) 791 95.4 2.4e-19 CCDS76761.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 446) 752 91.3 3.1e-18 CCDS42042.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 512) 752 91.4 3.4e-18 CCDS76760.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 536) 752 91.4 3.6e-18 CCDS10159.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 682) 752 91.4 4.3e-18 CCDS10160.1 TCF12 gene_id:6938|Hs108|chr15 ( 706) 752 91.5 4.4e-18 CCDS82257.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 670) 751 91.3 4.6e-18 CCDS58629.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 647) 744 90.6 7.3e-18 CCDS42438.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 671) 744 90.6 7.5e-18 CCDS58630.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 677) 744 90.6 7.6e-18 CCDS58631.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 773) 744 90.7 8.4e-18 CCDS58624.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 511) 735 89.6 1.2e-17 CCDS58627.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 600) 732 89.3 1.6e-17 CCDS82255.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 ( 541) 728 88.9 2e-17 >>CCDS12074.1 TCF3 gene_id:6929|Hs108|chr19 (654 aa) initn: 4405 init1: 4405 opt: 4405 Z-score: 2477.3 bits: 468.7 E(32554): 1.1e-131 Smith-Waterman score: 4405; 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51.2% identity (74.0% similar) in 649 aa overlap (50-654:8-625) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 LDFSMMFPLPVTNGKGRPASLAGAQFGGSGLEDRPSSGSWGSGDQSSSSFDPSRTFSEGT .::: ::::::.: . : :::....:: CCDS58 MEEDSRDVEDRSSSGSWGNGGHPS----PSRNYGDGT 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 ---HFTE----SHSSLSSSTFLGPGLGGKSGERGAYASFGRDAGVGGLTQAGFLSGELAL :.: ::..:: :.. . .:. :::.:.:.::.... : : ..:.:.. . CCDS58 PYDHMTSRDLGSHDNLSPP-FVNSRIQSKT-ERGSYSSYGRESNLQGCHQQSLLGGDMDM 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 NSPGPLSPSGMKGTSQYYPSYSGSSRRRAADGS-LDTQPKKVRKVPPGLPSSVYPPS-SG ..:: :::. : :::: :.. ::: .: ...: ::::::::::::::: :: : CCDS58 GNPGTLSPT--KPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSAST 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 pF1KB5 EDYGRDATAYPSAKTPSSTYPAPFYVADGSLHPSAELWSPPG---QAGFGPMLGGGSSPL ::.::. .:::.: .::.:. :.. :: : :.. :: . : :.. :::. :: . CCDS58 ADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDG--HHSSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGN-SSHI 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 PLPPGSGPVGSSGSSSTFGGLHQHERMGYQLHG-AEVNGGLPSASSFSSAPGATYGGVSS : .::.. .:: :::..: :. :..:..:: :.: . :... ..:: CCDS58 P------------QSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRS-GTNHYSTSS 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 HTPPVSGADSLLGSRGT-TAGSS--GDALGKALASIYSPDHSSNNFSSSPSTPVGSPQGL :::..:.::....::. .:::: ::::::::::::::::..:.:::.:::::::: .: CCDS58 CTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSL 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 pF1KB5 -AGTSQWPRAGAPGALSPSYDGGLHGLQSKIEDHL---DEAIHVLRSHAVGTA------- :::. : : :. .. ::.:.: ::.:::.:::.: :.::::::.:::: . CCDS58 SAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGH 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 pF1KB5 GDMHTLL-PGH----GALASGF-TGPMSLGGRHAGLVGGSHPEDGLA--GSTSLMHNHAA :::: .. :.: :.:.::. :: .: ..::. .:: .: :::.: :: ::. :.. CCDS58 GDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLS-ANRHSLMVG-THREDGVALRGSHSLLPNQVP 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 pF1KB5 LPSQP---GTLPDLSRPPDSYSGL--GRAG--ATAAASEIKREEKEDEENTSAADHSEEE .:. : .: :::. : : : :. : : .....:::: .. : .:: . . ::.. CCDS58 VPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDD-EGDENLQDTKSSEDK 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 K--KELKAPRARTSPDEDEDDLLPPEQKAEREKERRVANNARERLRVRDINEAFKELGRM : . : .. :: ..::: : ::::::::::::.::::::::::::::::::::::: CCDS58 KLDDDKKDIKSITSNNDDED--LTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRM 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 CQLHLNSEKPQTKLLILHQAVSVILNLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSGVVGDPQM ::::.:.:::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::. : . CCDS58 VQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSS--EPPPL 550 560 570 580 590 600 640 650 pF1KB5 VLSAPHPGLSEAHNPAGHM :..::::...: : :.: CCDS58 SLAGPHPGMGDASNHMGQM 610 620 >>CCDS77192.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 (643 aa) initn: 1207 init1: 566 opt: 800 Z-score: 465.4 bits: 96.4 E(32554): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 1907; 51.2% identity (74.3% similar) in 674 aa overlap (25-654:1-643) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MNQPQRMAPVGTDKELSDLLDFSMMFPLPVTNGKGRPASLAGAQFGGSGLEDRPSSGSWG :: ::..::. :.:::...: ::..::: :::::: CCDS77 MFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWG 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB5 SGDQSSSSFDPSRTFSEGT---HFTE----SHSSLSSSTFLGPGLGGKSGERGAYASFGR .: . : :::....:: :.: ::..:: :.. . .:. :::.:.:.:: CCDS77 NGGHPS----PSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPP-FVNSRIQSKT-ERGSYSSYGR 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 DAGVGGLTQAGFLSGELALNSPGPLSPSGMKGTSQYYPSYSGSSRRRAADGS-LDTQPKK .... : : ..:.:.. ...:: :::. : :::: :.. ::: .: ...: :: CCDS77 ESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPT--KPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKK 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VRKVPPGLPSSVYPPS-SGEDYGRDATAYPSAKTPSSTYPAPFYVADGSLHPSAELWSPP ::::::::::::: :: : ::.::. .:::.: .::.:. :.. :: : :.. :: CCDS77 VRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDG--HHSSDPWSSS 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 pF1KB5 G---QAGFGPMLGGGSSPLPLPPGSGPVGSSGSSSTFGGLHQHERMGYQLHG-AEVNGGL . : :.. :::. :: .: .::.. .:: :::..: :. :..:..: CCDS77 SGMNQPGYAGMLGN-SSHIP------------QSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSL 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 PSASSFSSAPGATYGGVSSHTPPVSGADSLLGSRGT-TAGSS--GDALGKALASIYSPDH : :.: . :... ..:: :::..:.::....::. .:::: :::::::::::::::: CCDS77 PPMSTFHRS-GTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDH 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SSNNFSSSPSTPVGSPQGL-AGTSQWPRAGAPGALSPSYDGGLHGLQSKIEDHL---DEA ..:.:::.:::::::: .: :::. : : :. .. ::.:.: ::.:::.:::.: :.: CCDS77 TNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDA 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 pF1KB5 IHVLRSHAVGTA-------GDMHTLL-PGH----GALASGF-TGPMSLGGRHAGLVGGSH :::::.:::: . :::: .. :.: :.:.::. :: .: ..::. .:: .: CCDS77 IHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLS-ANRHSLMVG-TH 380 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 pF1KB5 PEDGLA--GSTSLMHNHAALPSQP---GTLPDLSRPPDSYSGL--GRAG--ATAAASEIK :::.: :: ::. :.. .:. : .: :::. : : : :. : : .....:::: CCDS77 REDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIK 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 REEKEDEENTSAADHSEEEK--KELKAPRARTSPDEDEDDLLPPEQKAEREKERRVANNA .. : .:: . . ::..: . : .. :: ..::: : ::::::::::::.:::: CCDS77 SDD-EGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDED--LTPEQKAEREKERRMANNA 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 RERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLNSEKPQTKLLILHQAVSVILNLEQQVRERNLNPKAA ::::::::::::::::::: ::::.:.:::::::::::::.:::.::::::::::::::: CCDS77 RERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAA 550 560 570 580 590 600 620 630 640 650 pF1KB5 CLKRREEEKVSGVVGDPQMVLSAPHPGLSEAHNPAGHM :::::::::::. : . :..::::...: : :.: CCDS77 CLKRREEEKVSSE--PPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM 610 620 630 640 >>CCDS11960.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 (667 aa) initn: 1322 init1: 566 opt: 800 Z-score: 465.2 bits: 96.4 E(32554): 1.4e-19 Smith-Waterman score: 2022; 52.0% identity (74.8% similar) in 698 aa overlap (1-654:1-667) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MNQPQRMAPVGTDKELSDLLDFSMMFPLPVTNGKGRPASLAGAQFGGSGLEDRPSSGSWG :.. :::: .::::::::::::: :: ::..::. :.:::...: ::..::: :::::: CCDS11 MHHQQRMAALGTDKELSDLLDFSAMFSPPVSSGKNGPTSLASGHFTGSNVEDRSSSGSWG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 SGDQSSSSFDPSRTFSEGT---HFTE----SHSSLSSSTFLGPGLGGKSGERGAYASFGR .: . : :::....:: :.: ::..:: :.. . .:. :::.:.:.:: CCDS11 NGGHPS----PSRNYGDGTPYDHMTSRDLGSHDNLSPP-FVNSRIQSKT-ERGSYSSYGR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 DAGVGGLTQAGFLSGELALNSPGPLSPSGMKGTSQYYPSYSGSSRRRAADGS-LDTQPKK .... : : ..:.:.. ...:: :::. : :::: :.. ::: .: ...: :: CCDS11 ESNLQGCHQQSLLGGDMDMGNPGTLSPT--KPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VRKVPPGLPSSVYPPS-SGEDYGRDATAYPSAKTPSSTYPAPFYVADGSLHPSAELWSPP ::::::::::::: :: : ::.::. .:::.: .::.:. :.. :: : :.. :: CCDS11 VRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDG--HHSSDPWSSS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 G---QAGFGPMLGGGSSPLPLPPGSGPVGSSGSSSTFGGLHQHERMGYQLHG-AEVNGGL . : :.. :::. :: .: .::.. .:: :::..: :. :..:..: CCDS11 SGMNQPGYAGMLGN-SSHIP------------QSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSL 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 PSASSFSSAPGATYGGVSSHTPPVSGADSLLGSRGT-TAGSS--GDALGKALASIYSPDH : :.: . :... ..:: :::..:.::....::. .:::: :::::::::::::::: CCDS11 PPMSTFHRS-GTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDH 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SSNNFSSSPSTPVGSPQGL-AGTSQWPRAGAPGALSPSYDGGLHGLQSKIEDHL---DEA ..:.:::.:::::::: .: :::. : : :. .. ::.:.: ::.:::.:::.: :.: CCDS11 TNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDA 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 pF1KB5 IHVLRSHAVGTA-------GDMHTLL-PGH----GALASGF-TGPMSLGGRHAGLVGGSH :::::.:::: . :::: .. :.: :.:.::. :: .: ..::. .:: .: CCDS11 IHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGYGTGLLS-ANRHSLMVG-TH 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 pF1KB5 PEDGLA--GSTSLMHNHAALPSQP---GTLPDLSRPPDSYSGL--GRAG--ATAAASEIK :::.: :: ::. :.. .:. : .: :::. : : : :. : : .....:::: CCDS11 REDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYRGMPPGLQGQSVSSGSSEIK 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 REEKEDEENTSAADHSEEEK--KELKAPRARTSPDEDEDDLLPPEQKAEREKERRVANNA .. : .:: . . ::..: . : .. :: ..::: : ::::::::::::.:::: CCDS11 SDD-EGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDED--LTPEQKAEREKERRMANNA 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 RERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLNSEKPQTKLLILHQAVSVILNLEQQVRERNLNPKAA ::::::::::::::::::: ::::.:.:::::::::::::.:::.::::::::::::::: CCDS11 RERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVAVILSLEQQVRERNLNPKAA 580 590 600 610 620 630 620 630 640 650 pF1KB5 CLKRREEEKVSGVVGDPQMVLSAPHPGLSEAHNPAGHM :::::::::::. : . :..::::...: : :.: CCDS11 CLKRREEEKVSS--EPPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM 640 650 660 >>CCDS58625.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 (507 aa) initn: 945 init1: 566 opt: 791 Z-score: 461.8 bits: 95.4 E(32554): 2.1e-19 Smith-Waterman score: 1476; 52.8% identity (74.8% similar) in 508 aa overlap (183-654:23-507) 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 YSGSSRRRAADGSLDTQPKKVRKVPPGLPSSVYPPS-SGEDYGRDATAYPSAKTPSSTYP .:: :: : ::.::. .:::.: .::.: CCDS58 MYCAYTIPGMGGNSLMYYYNGKAVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFP 10 20 30 40 50 220 230 240 250 260 pF1KB5 APFYVADGSLHPSAELWSPPG---QAGFGPMLGGGSSPLPLPPGSGPVGSSGSSSTFGGL . :.. :: : :.. :: . : :.. :::. :: .: .::.. .: CCDS58 SSFFMQDG--HHSSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGN-SSHIP------------QSSSYCSL 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 HQHERMGYQLHG-AEVNGGLPSASSFSSAPGATYGGVSSHTPPVSGADSLLGSRGT-TAG : :::..: :. :..:..:: :.: . :... ..:: :::..:.::....::. .:: CCDS58 HPHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRS-GTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAG 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 SS--GDALGKALASIYSPDHSSNNFSSSPSTPVGSPQGL-AGTSQWPRAGAPGALSPSYD :: ::::::::::::::::..:.:::.:::::::: .: :::. : : :. .. ::.:. CCDS58 SSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYE 160 170 180 190 200 210 390 400 410 420 pF1KB5 GGLHGLQSKIEDHL---DEAIHVLRSHAVGTA-------GDMHTLL-PGH----GALASG : ::.:::.:::.: :.::::::.:::: . :::: .. :.: :.:.:: CCDS58 GPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSG 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 F-TGPMSLGGRHAGLVGGSHPEDGLA--GSTSLMHNHAALPSQP---GTLPDLSRPPDSY . :: .: ..::. .:: .: :::.: :: ::. :.. .:. : .: :::. : : : CCDS58 YGTGLLS-ANRHSLMVG-THREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPY 280 290 300 310 320 330 490 500 510 520 530 pF1KB5 SGL--GRAG--ATAAASEIKREEKEDEENTSAADHSEEEK--KELKAPRARTSPDEDEDD :. : : .....:::: .. : .:: . . ::..: . : .. :: ..::: CCDS58 RGMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDD-EGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDED- 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 LLPPEQKAEREKERRVANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLNSEKPQTKLLILHQAV : ::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::.:.::::::::::::: CCDS58 -LTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAV 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 SVILNLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSGVVGDPQMVLSAPHPGLSEAHNPAGHM .:::.::::::::::::::::::::::::::. : . :..::::...: : :.: CCDS58 AVILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSE--PPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM 460 470 480 490 500 >>CCDS58623.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 (507 aa) initn: 945 init1: 566 opt: 791 Z-score: 461.8 bits: 95.4 E(32554): 2.1e-19 Smith-Waterman score: 1475; 52.9% identity (74.8% similar) in 507 aa overlap (184-654:24-507) 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 SGSSRRRAADGSLDTQPKKVRKVPPGLPSSVYPPS-SGEDYGRDATAYPSAKTPSSTYPA :: :: : ::.::. .:::.: .::.:. CCDS58 MKFKQCRCSDTGLCCLDHEGKAEVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPS 10 20 30 40 50 220 230 240 250 260 pF1KB5 PFYVADGSLHPSAELWSPPG---QAGFGPMLGGGSSPLPLPPGSGPVGSSGSSSTFGGLH :.. :: : :.. :: . : :.. :::. :: .: .::.. .:: CCDS58 SFFMQDG--HHSSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGN-SSHIP------------QSSSYCSLH 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 QHERMGYQLHG-AEVNGGLPSASSFSSAPGATYGGVSSHTPPVSGADSLLGSRGT-TAGS :::..: :. :..:..:: :.: . :... ..:: :::..:.::....::. .::: CCDS58 PHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRS-GTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGS 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 S--GDALGKALASIYSPDHSSNNFSSSPSTPVGSPQGL-AGTSQWPRAGAPGALSPSYDG : ::::::::::::::::..:.:::.:::::::: .: :::. : : :. .. ::.:.: CCDS58 SQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEG 160 170 180 190 200 210 390 400 410 420 pF1KB5 GLHGLQSKIEDHL---DEAIHVLRSHAVGTA-------GDMHTLL-PGH----GALASGF ::.:::.:::.: :.::::::.:::: . :::: .. :.: :.:.::. CCDS58 PLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPGGHGDMHGIIGPSHNGAMGGLGSGY 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 -TGPMSLGGRHAGLVGGSHPEDGLA--GSTSLMHNHAALPSQP---GTLPDLSRPPDSYS :: .: ..::. .:: .: :::.: :: ::. :.. .:. : .: :::. : : : CCDS58 GTGLLS-ANRHSLMVG-THREDGVALRGSHSLLPNQVPVPQLPVQSATSPDLNPPQDPYR 280 290 300 310 320 330 490 500 510 520 530 pF1KB5 GL--GRAG--ATAAASEIKREEKEDEENTSAADHSEEEK--KELKAPRARTSPDEDEDDL :. : : .....:::: .. : .:: . . ::..: . : .. :: ..::: CCDS58 GMPPGLQGQSVSSGSSEIKSDD-EGDENLQDTKSSEDKKLDDDKKDIKSITSNNDDED-- 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 LPPEQKAEREKERRVANNARERLRVRDINEAFKELGRMCQLHLNSEKPQTKLLILHQAVS : ::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::.:.:::::::::::::. CCDS58 LTPEQKAEREKERRMANNARERLRVRDINEAFKELGRMVQLHLKSDKPQTKLLILHQAVA 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 VILNLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSGVVGDPQMVLSAPHPGLSEAHNPAGHM :::.::::::::::::::::::::::::::. : . :..::::...: : :.: CCDS58 VILSLEQQVRERNLNPKAACLKRREEEKVSSE--PPPLSLAGPHPGMGDASNHMGQM 460 470 480 490 500 >>CCDS58626.1 TCF4 gene_id:6925|Hs108|chr18 (537 aa) initn: 1132 init1: 566 opt: 791 Z-score: 461.5 bits: 95.4 E(32554): 2.2e-19 Smith-Waterman score: 1644; 52.8% identity (74.6% similar) in 562 aa overlap (130-654:1-537) 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 GKSGERGAYASFGRDAGVGGLTQAGFLSGELALNSPGPLSPSGMKGTSQYYPSYSGSSRR . ...:: :::. : :::: :.. :: CCDS58 MDMGNPGTLSPT--KPGSQYYQYSSNNPRR 10 20 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 RAADGS-LDTQPKKVRKVPPGLPSSVYPPS-SGEDYGRDATAYPSAKTPSSTYPAPFYVA : .: ...: ::::::::::::::: :: : ::.::. .:::.: .::.:. :.. CCDS58 RPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSASTADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQ 30 40 50 60 70 80 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 DGSLHPSAELWSPPG---QAGFGPMLGGGSSPLPLPPGSGPVGSSGSSSTFGGLHQHERM :: : :.. :: . : :.. :::. :: .: .::.. .:: :::. CCDS58 DG--HHSSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGN-SSHIP------------QSSSYCSLHPHERL 90 100 110 120 130 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 GYQLHG-AEVNGGLPSASSFSSAPGATYGGVSSHTPPVSGADSLLGSRGT-TAGSS--GD .: :. :..:..:: :.: . :... ..:: :::..:.::....::. .:::: :: CCDS58 SYPSHSSADINSSLPPMSTFHRS-GTNHYSTSSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGD 140 150 160 170 180 190 340 350 360 370 380 pF1KB5 ALGKALASIYSPDHSSNNFSSSPSTPVGSPQGL-AGTSQWPRAGAPGALSPSYDGGLHGL ::::::::::::::..:.:::.:::::::: .: :::. : : :. .. ::.:.: ::.: CCDS58 ALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPPSLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSL 200 210 220 230 240 250 390 400 410 420 430 pF1KB5 QSKIEDHL---DEAIHVLRSHAVGTA-------GDMHTLL-PGH----GALASGF-TGPM ::.:::.: :.::::::.:::: . :::: .. :.: :.:.::. :: . 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CCDS77 KDIFFQFIIARVRKCYSLSCLHTLPVVPTLRKTERGSYSSYGRESNLQGCHQS-LLGGDM 10 20 30 40 50 60 140 150 160 170 180 pF1KB5 ALNSPGPLSPSGMKGTSQYYPSYSGSSRRRAADGS-LDTQPKKVRKVPPGLPSSVYPPS- ...:: :::. : :::: :.. ::: .: ...: ::::::::::::::: :: CCDS77 DMGNPGTLSPT--KPGSQYYQYSSNNPRRRPLHSSAMEVQTKKVRKVPPGLPSSVYAPSA 70 80 90 100 110 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 SGEDYGRDATAYPSAKTPSSTYPAPFYVADGSLHPSAELWSPPG---QAGFGPMLGGGSS : ::.::. .:::.: .::.:. :.. :: : :.. :: . : :.. :::. :: CCDS77 STADYNRDSPGYPSSKPATSTFPSSFFMQDG--HHSSDPWSSSSGMNQPGYAGMLGN-SS 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 PLPLPPGSGPVGSSGSSSTFGGLHQHERMGYQLHG-AEVNGGLPSASSFSSAPGATYGGV .: .::.. .:: :::..: :. :..:..:: :.: . :... .. CCDS77 HIP------------QSSSYCSLHPHERLSYPSHSSADINSSLPPMSTFHRS-GTNHYST 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 SSHTPPVSGADSLLGSRGT-TAGSS--GDALGKALASIYSPDHSSNNFSSSPSTPVGSPQ :: :::..:.::....::. .:::: ::::::::::::::::..:.:::.:::::::: CCDS77 SSCTPPANGTDSIMANRGSGAAGSSQTGDALGKALASIYSPDHTNNSFSSNPSTPVGSPP 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 pF1KB5 GL-AGTSQWPRAGAPGALSPSYDGGLHGLQSKIEDHL---DEAIHVLRSHAVGTA----- .: :::. : : :. .. ::.:.: ::.:::.:::.: :.::::::.:::: . CCDS77 SLSAGTAVWSRNGGQASSSPNYEGPLHSLQSRIEDRLERLDDAIHVLRNHAVGPSTAMPG 290 300 310 320 330 340 420 430 440 450 460 pF1KB5 --GDMHTLL-PGH----GALASGF-TGPMSLGGRHAGLVGGSHPEDGLA--GSTSLMHNH :::: .. :.: :.:.::. :: .: ..::. .:: .: :::.: :: ::. :. 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