FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5181, 656 aa
1>>>pF1KB5181 656 - 656 aa - 656 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8326+/-0.000855; mu= -0.0839+/- 0.052
mean_var=235.7488+/-49.174, 0's: 0 Z-trim(114.9): 25 B-trim: 160 in 2/52
Lambda= 0.083531
statistics sampled from 15440 (15461) to 15440 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.475), width: 16
Scan time: 3.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 639) 3756 465.6 9.6e-131
CCDS54526.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 566) 3722 461.4 1.5e-129
CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 552) 1858 236.8 6.1e-62
CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 723) 1091 144.4 5.1e-34
CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16 ( 613) 1016 135.4 2.3e-31
CCDS54164.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 651) 742 102.4 2.1e-21
CCDS11716.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 690) 742 102.4 2.2e-21
CCDS58597.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 592) 569 81.5 3.7e-15
>>CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 (639 aa)
initn: 3756 init1: 3756 opt: 3756 Z-score: 2460.7 bits: 465.6 E(32554): 9.6e-131
Smith-Waterman score: 4173; 97.4% identity (97.4% similar) in 656 aa overlap (1-656:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WEAIQALTV-----------------LETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650
pF1KB5 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
590 600 610 620 630
>>CCDS54526.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 (566 aa)
initn: 3722 init1: 3722 opt: 3722 Z-score: 2439.4 bits: 461.4 E(32554): 1.5e-129
Smith-Waterman score: 3722; 100.0% identity (100.0% similar) in 566 aa overlap (91-656:1-566)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650
pF1KB5 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
520 530 540 550 560
>>CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 (552 aa)
initn: 2306 init1: 1854 opt: 1858 Z-score: 1225.5 bits: 236.8 E(32554): 6.1e-62
Smith-Waterman score: 3436; 84.1% identity (84.1% similar) in 656 aa overlap (1-656:1-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WEAIQALTV-----------------LETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLPDDTTFPLPPPR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEAL------
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLDLPPAGTTYPAMPTRPGE
CCDS33 ------------------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QASPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ---------------------GLSDPTPPSGPSLDGTGWNSFQSSDATEPPAPALAQAPS
280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MESRPPAQTSLPASSGLDDLDLLGKTLLQQSLPPESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSS
320 330 340 350 360 370
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SCSSPSSSATSLLHTVSPEPPRPPQQPVPTELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGF
380 390 400 410 420 430
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAF
440 450 460 470 480 490
610 620 630 640 650
pF1KB5 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
500 510 520 530 540 550
>>CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 (723 aa)
initn: 1482 init1: 720 opt: 1091 Z-score: 724.3 bits: 144.4 E(32554): 5.1e-34
Smith-Waterman score: 1824; 48.7% identity (69.4% similar) in 684 aa overlap (6-603:5-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
: :.::. .:.:::: :.. :: : :::.:.:...::: .:.::::::::::::
CCDS11 MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
:::.::::: ::.:::.::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS11 WEALQALTV-----------------LEACMKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYL
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 GSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPP
:.:.:::::.:..:::::::..::::.:: .::.:::.::::.::: .: : : .: :::
CCDS11 GDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVN
:::: .:.::::::.::.::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..::....::::
CCDS11 RPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQ
:::.::.::.. .:: .. :. : :::::...:: : :::.:::.:::::..:..:::
CCDS11 NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB5 ANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTS--------ALLDLSGLD--------
:.:::..::: :: ...:. .::.... ..: : . .:.::. ::
CCDS11 ASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSV
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KB5 LPPAGTT----YPAMP----------TRPGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSD
: :: : : .: .: . :: .: . : ..: ::.::. :::.:
CCDS11 LAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLAD
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420
pF1KB5 PTP--PSGPSLDGTGWNSFQ-------------------SSDAT--EPPAPALA--QAPS
:.: : : .. :. .: .::: .: ::. . :::
CCDS11 PAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPL
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470
pF1KB5 MESRP-PA-QTSLPASSGLDDLDLLG--KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRD
: :. .:.:: :. ..: : .: . : : . . .. .: .
CCDS11 PPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQ
470 480 490 500 510 520
480 490 500 510
pF1KB5 LQNKSSSCSSPSSSATS-LLHTVSPE---------PPRPPQQPV-------PT---ELSL
: .... :. . .:: :. :..: : : ::. : ::::
CCDS11 LLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSL
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 ASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRN
::: :::::::::. ::::.::..:::::::::.. ::: ::::::::::.::: :...
CCDS11 ASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKS
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 IVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMG
::.:.:::: ::::::::::::: :.::
CCDS11 IVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALG
650 660 670 680 690 700
>>CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16 (613 aa)
initn: 1276 init1: 706 opt: 1016 Z-score: 676.5 bits: 135.4 E(32554): 2.3e-31
Smith-Waterman score: 1735; 46.4% identity (70.5% similar) in 657 aa overlap (3-655:19-612)
10 20 30 40
pF1KB5 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGP
: .:: .:.::.: .: ::..:..::::.: : .::
CCDS10 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 PLATRLLAHKIQSPQEWEAIQALTVRRGEATIRPPPCDDTKVLETCMKSCGKRFHDEVGK
: ::::::::::: ::. :::: :: ::. ::..::.::.:
CCDS10 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTV-----------------LEMCMNHCGEKFHSEVAK
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 FRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKS
::::::::::.::::::: .. :::....:.:.:::: .::..:: .::::::::::.:.
CCDS10 FRFLNELIKVLSPKYLGSWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQ
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 DPKLPDDTTFPLPPPRPKNVIFE-DEEKSKMLARLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQK
::::: : .: : : ::. ::. ::::::.:.:::::.:::::.:::.:::..:.:.:.
CCDS10 DPKLPVDKILPPPSPWPKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 RMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRL
. ::.::::.:.::: ..::.: ::. . . : : ..: : . .:.:::..:::::::
CCDS10 KSEKVSKRVSAVEEVRSHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEAL-QVVYERCEKLRPTLFRL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 ASDTEDNDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAGSIPGSTSALLDLSGLD
:::: :.:.:::::::::: ::: . ::::...:. . :. ...:. :. . .: .
CCDS10 ASDTTDDDDALAEILQANDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSL-GD----IPVSRVF
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
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. . . :: . : . .. : :. . :::: : : .
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. .:. .:. . .. :::. : . .: : : .: .: ::.. ::
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: :. .:.:: :. ..: : .: . : : . . .. .: .
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CCDS54 EQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
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CCDS11 RPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
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CCDS11 LLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSL
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CCDS11 EQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
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CCDS58 DRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVT
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CCDS58 NDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAE
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CCDS58 ALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQG
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656 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:23:40 2016 done: Fri Nov 4 03:23:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]