Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5188
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5188, 422 aa
1>>>pF1KB5188 422 - 422 aa - 422 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9227+/-0.000921; mu= 15.0626+/- 0.056
mean_var=145.2207+/-41.286, 0's: 0 Z-trim(108.8): 284 B-trim: 1245 in 2/49
Lambda= 0.106429
statistics sampled from 9940 (10474) to 9940 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 659 113.3 4.5e-25
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CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 592 103.0 5.7e-22
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 592 103.0 5.9e-22
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 592 103.1 6.3e-22
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 578 100.8 2.4e-21
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 572 99.8 4.1e-21
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CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 495 87.9 1.4e-17
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 478 85.3 8.4e-17
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 457 82.2 8.8e-16
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 454 81.7 1.3e-15
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CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 452 81.5 1.6e-15
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 452 81.5 1.6e-15
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 449 81.0 2.2e-15
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 438 79.3 6.7e-15
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 437 79.1 7.6e-15
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 430 78.0 1.6e-14
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 425 77.3 2.7e-14
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 419 76.3 4.9e-14
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 419 76.3 5e-14
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 418 76.2 5.6e-14
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 414 75.6 8.8e-14
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 411 75.1 1.2e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 410 75.0 1.4e-13
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 407 74.5 1.8e-13
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 407 74.5 1.9e-13
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 404 74.0 2.5e-13
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 399 73.3 4.5e-13
CCDS44012.1 GPR50 gene_id:9248|Hs108|chrX ( 617) 394 72.8 1e-12
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 389 71.7 1.2e-12
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 389 71.8 1.4e-12
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 387 71.4 1.5e-12
>>CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 (422 aa)
initn: 2829 init1: 2829 opt: 2829 Z-score: 2364.2 bits: 446.5 E(32554): 2.3e-125
Smith-Waterman score: 2829; 99.8% identity (100.0% similar) in 422 aa overlap (1-422:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSVGAMKKGVGRAVGLGGGSGCQATEEDPLPDCGACAPGQGGRRWRLPQPAWVEGSSARL
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSVGAMKKGVGRAVGLGGGSGCQATEEDPLPNCGACAPGQGGRRWRLPQPAWVEGSSARL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WEQATGTGWMDLEASLLPTGPNASNTSDGPDNLTSAGSPPRTGSISYINIIMPSVFGTIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WEQATGTGWMDLEASLLPTGPNASNTSDGPDNLTSAGSPPRTGSISYINIIMPSVFGTIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LLGIIGNSTVIFAVVKKSKLHWCNNVPDIFIINLSVVDLLFLLGMPFMIHQLMGNGVWHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLGIIGNSTVIFAVVKKSKLHWCNNVPDIFIINLSVVDLLFLLGMPFMIHQLMGNGVWHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GETMCTLITAMDANSQFTSTYILTAMAIDRYLATVHPISSTKFRKPSVATLVICLLWALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GETMCTLITAMDANSQFTSTYILTAMAIDRYLATVHPISSTKFRKPSVATLVICLLWALS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FISITPVWLYARLIPFPGGAVGCGIRLPNPDTDLYWFTLYQFFLAFALPFVVITAAYVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FISITPVWLYARLIPFPGGAVGCGIRLPNPDTDLYWFTLYQFFLAFALPFVVITAAYVRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LQRMTSSVAPASQRSIRLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWAPYYVLQLTQLSISRPTLTFVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQRMTSSVAPASQRSIRLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWAPYYVLQLTQLSISRPTLTFVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LYNAAISLGYANSCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPAAQGQLRAVSNAQTADEERTESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LYNAAISLGYANSCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPAAQGQLRAVSNAQTADEERTESK
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GT
::
CCDS14 GT
>>CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 (340 aa)
initn: 683 init1: 399 opt: 733 Z-score: 626.0 bits: 124.5 E(32554): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 733; 37.9% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (110-408:35-334)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 GPNASNTSDGPDNLTSAGSPPRTGSISYINIIMPSVFGTICLLGIIGNSTVIFAVVKKSK
.:.::..: :: :..:: ..:..... :
CCDS50 HASCWNTSAELLNKSWNKEFAYQTASVVDTVILPSMIGIICSTGLVGNILIVFTIIRSRK
10 20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 LHWCNNVPDIFIINLSVVDLLFLLGMPFMIHQLMGNGVWHFGETMCTLITAMDANSQFTS
..::::.: ::.:.::. ..::::.::: .: : :: .::.::..:. .::.
CCDS50 ----KTVPDIYICNLAVADLVHIVGMPFLIHQWARGGEWVFGGPLCTIITSLDTCNQFAC
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 TYILTAMAIDRYLATVHPISSTKFRKPSVATLVICL-LWALSFISITPVWLYARLIPFPG
. :.:.:..:::.: :.:. :..: :. : : ::: ::: :::.:...: :
CCDS50 SAIMTVMSVDRYFALVQPFRLTRWRT-RYKTIRINLGLWAASFILALPVWVYSKVIKFKD
130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 GAVGCGIRLPNPDTDLYWFTLYQFFLAFALPFVVITAAYVRIL-----QRMTSSVAPASQ
:. .:.. : .:: :. :.::: . .: .:. .: . :. :: . . .. : .
CCDS50 GVESCAFDLTSPD-DVLWYTLYLTITTFFFPLPLILVCYILILCYTWEMYQQNKDARCCN
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 RSI-RLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWAPYYVLQLTQLSISRPTLTFVYLYNAAISLGYAN
:. . :. ..:. .... .::.. :::.:.::..:.. .:::.: : .: :.::.
CCDS50 PSVPKQRVMKLTKMVLVLVVVFILSAAPYHVIQLVNLQMEQPTLAFYVGYYLSICLSYAS
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420
pF1KB5 SCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPAAQGQLRAVSNAQTADEERTESKGT
: .:::.::.: .:.::: . :.. .. ..:
CCDS50 SSINPFLYILLSGNFQKRLPQIQRRATEKEINNMGNTLKSHF
300 310 320 330 340
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
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Smith-Waterman score: 678; 32.4% identity (65.3% similar) in 352 aa overlap (71-420:20-344)
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pF1KB5 GGRRWRLPQPAWVEGSSARLWEQATGTGWMDLEASLLPTGPNASNTSDGPDNLTSAGSPP
::..:.. : :.:: .. .:::
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVST--NTSNQTEPYYDLTS-----
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 RTGSISYINIIMPSVFGTICLLGIIGNSTVIFAVVKKSKLHWCNNVPDIFIINLSVVDLL
: .. .. ..:..:. ::. ::..... .:. ... .:.:.::...: :
CCDS11 --------NAVLTFIYFVVCIIGLCGNTLVIYVILRYAKM---KTITNIYILNLAIADEL
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FLLGMPFMIHQLMGNGVWHFGETMCTLITAMDANSQFTSTYILTAMAIDRYLATVHPISS
:.::.::. :. : ::...: .. ..:. .:::: . ::.:.::::::.::::.:
CCDS11 FMLGLPFLAMQVALVH-WPFGKAICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB5 TKFRKPSVATLVICLLWALSFISITPVWLYARLIPFPGGAVGCGIRLPNPDTDLYW-FTL
.:.:.: .: .. .:..:.. : :. .:: : : .: : :. . : : .
CCDS11 AKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFII
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YQFFLAFALPFVVITAAYVRILQRMTSSVAPASQRSIRLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWA
: :.:.: .:...: :. :. .. :: ... . . :.::: . . ::. ::
CCDS11 YTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWL
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 PYYVLQLTQLSIS-RPTLTFVYLYNAAISLGYANSCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPA
:.:.......:.. :: .. ... .. : ::::: ::..: : ..:.: .
CCDS11 PFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSF-------
280 290 300 310 320
400 410 420
pF1KB5 AQGQLRAVSNAQTADEERTESKGT
:. : :. . : : ::..::
CCDS11 -QNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNETTETQRTLLNGDLQTSI
330 340 350 360
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 571 init1: 293 opt: 666 Z-score: 569.7 bits: 114.3 E(32554): 2.1e-25
Smith-Waterman score: 666; 33.3% identity (67.6% similar) in 312 aa overlap (80-389:29-332)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 PAWVEGSSARLWEQATGTGWMDLEASLLPTGPNASNTSDGPDNLTSAGSPPRTGSISYIN
::.:. ..:: .. .: : : . .
CCDS96 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAG-AADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGS
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 IIMPS-VFGTICLLGIIGNSTVIFAVVKKSKLHWCNNVPDIFIINLSVVDLLFLLGMPFM
:. : .....::.:. ::: ::..... .:.. .: :.:.::...: :..:..::.
CCDS96 AILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATN---IYILNLAIADELLMLSVPFL
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 IHQLMGNGVWHFGETMCTLITAMDANSQFTSTYILTAMAIDRYLATVHPISSTKFRKPSV
. . . : :: .: :. ..:: ..::: : ::....:::.:.::::.....:.:.:
CCDS96 VTSTLLRH-WPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTV
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 ATLVICLLWALSFISITPVWLYARLIPFPGGAVGCGIRLPNPDTD-LYWFTLYQFFLAFA
: .: .:.::.. : :. ...: :.:.:.. .:.: : :.:: :...:
CCDS96 AKVVNLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFL
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LPFVVITAAYVRILQRMTSSVAPASQRSIRLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWAPYYVLQLT
:: .: :: :. .: . :. .. . ...: .. . .:: .:: :.::.::.
CCDS96 LPVGAICLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLV
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 QLSISRPTLTFVYLYNAAISLGYANSCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPAAQGQLRAVS
.. . : : .. ::::::: ::..: : ..:..
CCDS96 NVFAEQDDATVSQL---SVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCLSWMDNAAEEP
300 310 320 330 340 350
410 420
pF1KB5 NAQTADEERTESKGT
CCDS96 VDYYATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
360 370 380 390
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 575 init1: 377 opt: 659 Z-score: 563.9 bits: 113.2 E(32554): 4.3e-25
Smith-Waterman score: 660; 31.9% identity (66.0% similar) in 329 aa overlap (62-389:12-320)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 DCGACAPGQGGRRWRLPQPAWVEGSSARLWEQATGTGWMDLEASLLPTGPNASNTSDGPD
:.. ::.: :.:.:.:..:
CCDS42 MSAPSTLPPGGEEGLGTAW-----------PSAANASSAPA
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 NLTSAGSPPRTGSISYINIIMPSVFGTICLLGIIGNSTVIFAVVKKSKLHWCNNVPDIFI
. : . : . . . . . ... .::.:..::. :::.... .:.. .: :..
CCDS42 EAEEAVAGPGDARAAGM-VAIQCIYALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTATN---IYL
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 INLSVVDLLFLLGMPFMIHQLMGNGVWHFGETMCTLITAMDANSQFTSTYILTAMAIDRY
.::.:.: ::.:..::. . : :: ..: . ..:. ..:::.. ::....:::
CCDS42 LNLAVADELFMLSVPFVASSAALRH-WPFGSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRY
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LATVHPISSTKFRKPSVATLVICLLWALSFISITPVWLYARLIPFPGG-AVGCGIRLPNP
.:.:::. .. .:.:::: :. .: :.. :. ..: : :: ::.:... :.:
CCDS42 VAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHP
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 DTDLYWFTLYQFFLAFALPFVVITAAYVRILQRMTSSVAPASQRSIRLRTKRVTRTAIAI
. :..: :.:.: :: ..: :. :. .: . . :. .. : :..:: .. .
CCDS42 AWSAV-FVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMV
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 CLVFFVCWAPYYVLQLTQLSISRPTLTFVYLYNAAISLGYANSCLNPFVYIVLCETFRKR
.:: .:: :.::.:: .: .. : . .... :.::::: ::..: : ..::.
CCDS42 VVVFVLCWMPFYVVQLLNLFVTSLDAT---VNHVSLILSYANSCANPILYGFLSDNFRRF
270 280 290 300 310 320
400 410 420
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CCDS42 FQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYYATALKSKGGAGCMCPPLPCQQEALQPEPGRKRIP
330 340 350 360 370 380
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:.. .:.. :.: .:: : :
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.... ....: :. ..:..:..::: ::..:.... .: ...:.::...: :
CCDS13 SPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLLGNSLVIYVVLRHTA---SPSVTNVYILNLALADEL
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:.::.::. : . . : :: :: :. :.:. .:::: . ::.:..:::::.::: :
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...: :: : .:. : . . :: ... . : : : .. :.: . : :
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.: :.: :..:: :. :. .. :. ::. :: : .:::: ..:. .
CCDS13 IIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAGRRVWAPSCQRR-RRSERRVTRMVVAVVAL
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: .:: :.:::..... : .: :: ...: ::::: ::..: : :. .
CCDS13 FVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFR
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:..: . ...: .:. . ..:: :
CCDS13 RVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEEEDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQ
330 340 350 360 370 380
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..:.:. : : :: : .: : .:. .
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...: .. .: :. ::. ::..:.. .:.. .: .:.:.::.:.:.:..::.::.
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: . . : :: ..: :. ..:. .::::.. ::.:..:::::.:::.::...:.: :
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: :. :.::. :. ..: . ::. :. :.: . : : : .: :.
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: :..:: :. :. .. . : . .: :..: ::: .... ::: :: :....
CCDS10 FFAPLLVICLCYLLIVVKVRA--AGVRVGCVRRRSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTV
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....:... : . . :: .. :.::::: :: .: : ..::. . :: .. .. :
CCDS10 NIVNLAVALPQEPASAGLYFFVVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLRKGS-G
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pF1KB5 QLRAVSNAQTADEERTESKGT
: .. :. : ....:
CCDS10 AKDADATEPRPDRIRQQQEATPPAHRAAANGLMQTSKL
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pF1KB5 PP--RTGSISYINIIMPSVFGTICLLGIIGNSTVIFAVVKKSKLHWCNNVPDIFIINLSV
:: :..: . : . ......: .:..:: :.:..:. .:.. .: :.:.::..
CCDS32 PPGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATN---IYIFNLAL
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.: : .::. . . . .: ::: .: . ..: ..::: . :: :..:::.:. :
CCDS32 ADALATSTLPFQSAKYLME-TWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCH
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pF1KB5 PISSTKFRKPSVATLV-ICLLWALSFISITPVWLYARLIPFPGGAVGCGIRLPNPDTDLY
:... :: :. : :. ::. :.:. .:. ..: : : :: : ...:.:. :
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: :. . :..::..:...::. : .: :. : .... .:.:: ....
CCDS32 WDTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVG
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pF1KB5 VFFVCWAPYYVLQL--TQLSISRPTLTFVYLYNAAISLGYANSCLNPFVYIVLCETFRKR
.: ::::: ... . : ..:.: : . :.:::::: ::: .: : :.:..
CCDS32 AFVVCWAPIHIFVIVWTLVDIDRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDENFKRC
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CCDS32 FRQLCRKPCGRPDPSSFSRAREATARERVTACTPSDGPGGGAAA
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:. .. ::: .: :: .: .. ..: ..::: . : .:..:::.:. ::... ::
CCDS55 FQSVNYLMG--TWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRT
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: : .. : :: :: ..: . :.. : . . .: :: .: . :
CCDS55 PRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATT-KYRQGSIDCTLTFSHP--TWYWENLLKICVF
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..:: .: ..::. : .. :. : .... .:.:: .... ::.:::.: .
CCDS55 IFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIH
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. . . .. : :: . .. :.:::.:::::: .: : :.:..
CCDS55 IYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTSSN
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410 420
pF1KB5 QLRAVSNAQTADEERTESKGT
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Smith-Waterman score: 604; 31.8% identity (62.9% similar) in 318 aa overlap (78-389:44-347)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 PQPAWVEGSSARLWEQATGTGWMDLEASLLPTGPNASNTSDGPDNLTSAGSPPRTGSISY
: ::: .. . : :.: :: ::: :.
CCDS47 TDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGPNRTDLG-GRDSLC----PP-TGSPSM
20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 INII-MPSVFGTICLLGIIGNSTVIFAVVKKSKLHWCNNVPDIFIINLSVVDLLFLLGMP
:. : . .... .:..:..:: :....:. .:.. .: :.:.::...: : .:
CCDS47 ITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATN---IYIFNLALADALATSTLP
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FM-IHQLMGNGVWHFGETMCTLITAMDANSQFTSTYILTAMAIDRYLATVHPISSTKFRK
:. .. ::: .: :: .: .. ..: ..::: . : .:..:::.:. ::... ::
CCDS47 FQSVNYLMG--TWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRT
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 PSVATLVICLLWALSFISITPVWLYARLIPFPGGAVGCGIRLPNPDTDLYWFTLYQ---F
: : .. : :: :: ..: . :.. : . . .: :: .: . :
CCDS47 PRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATT-KYRQGSIDCTLTFSHP--TWYWENLLKICVF
190 200 210 220 230
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pF1KB5 FLAFALPFVVITAAYVRILQRMTSSVAPASQRSIRLRTKRVTRTAIAICLVFFVCWAPYY
..:: .: ..::. : .. :. : .... .:.:: .... ::.:::.: .
CCDS47 IFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIH
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 VLQLTQLSISRPTLTFVYL-YNAAISLGYANSCLNPFVYIVLCETFRKRLVLSVKPAAQG
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CCDS47 IYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIPTSSN
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360 370 380 390
422 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]