FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5220, 702 aa
1>>>pF1KB5220 702 - 702 aa - 702 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8656+/-0.00151; mu= -14.6013+/- 0.089
mean_var=454.8180+/-95.020, 0's: 0 Z-trim(109.2): 92 B-trim: 102 in 1/51
Lambda= 0.060139
statistics sampled from 10659 (10741) to 10659 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 4519 407.4 3.8e-113
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 4483 404.2 3.3e-112
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 2716 251.0 4.7e-66
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 2191 205.4 2.5e-52
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 1486 144.3 8.3e-34
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 1486 144.3 8.3e-34
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 1153 115.4 3.8e-25
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 1002 102.4 4.2e-21
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 1000 102.2 4.7e-21
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 971 99.7 2.5e-20
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 957 98.4 5.1e-20
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 963 99.3 7.7e-20
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 950 97.8 8.3e-20
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 961 99.1 9e-20
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 939 96.9 1.8e-19
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 939 97.1 2.4e-19
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 931 96.2 2.5e-19
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 926 95.9 5.5e-19
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 907 94.3 1.7e-18
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 907 94.3 1.7e-18
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 907 94.3 1.7e-18
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 907 94.3 1.7e-18
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 845 88.6 3.3e-17
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 845 88.6 3.5e-17
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 845 88.7 3.9e-17
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 845 88.7 3.9e-17
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 845 88.7 3.9e-17
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 843 88.5 4.3e-17
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 807 85.4 3.9e-16
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 807 85.4 4e-16
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 792 84.1 9.4e-16
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 790 84.0 1.3e-15
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 785 83.5 1.6e-15
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 788 83.9 1.8e-15
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 770 82.1 3e-15
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 746 80.0 1.3e-14
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 746 80.1 1.4e-14
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 702 76.2 1.8e-13
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 692 75.3 3e-13
CCDS34430.1 KIFC1 gene_id:3833|Hs108|chr6 ( 673) 664 72.9 1.8e-12
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 673 74.0 2.1e-12
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 673 74.0 2.2e-12
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 630 70.2 2.3e-11
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 614 68.6 3.5e-11
CCDS512.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 725) 614 68.6 3.8e-11
CCDS47216.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 744) 602 67.5 7.9e-11
CCDS1719.1 KIF3C gene_id:3797|Hs108|chr2 ( 793) 600 67.4 9.4e-11
>>CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (702 aa)
initn: 4519 init1: 4519 opt: 4519 Z-score: 2144.9 bits: 407.4 E(32554): 3.8e-113
Smith-Waterman score: 4519; 100.0% identity (100.0% similar) in 702 aa overlap (1-702:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRDQAGKKKVSPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRDQAGKKKVSPD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 KVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIP
550 560 570 580 590 600
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pF1KB5 RDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTE
610 620 630 640 650 660
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pF1KB5 ESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
670 680 690 700
>>CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (699 aa)
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Smith-Waterman score: 4483; 99.6% identity (99.6% similar) in 702 aa overlap (1-702:1-699)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
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130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
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250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
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>>CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (726 aa)
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Smith-Waterman score: 4455; 96.6% identity (96.7% similar) in 726 aa overlap (1-702:1-726)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB5 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSSSDST
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410 420 430 440 450
pF1KB5 -------------DQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEK
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEK
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460 470 480 490 500 510
pF1KB5 REKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 REKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQ
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 LRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEG
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 LLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQT
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 PVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKPETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKPETV
670 680 690 700 710 720
700
pF1KB5 IDSLLQ
::::::
CCDS75 IDSLLQ
>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 (747 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS13 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPK
10 20 30 40 50
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CCDS13 YVKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGEN
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CCDS13 SKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDAL
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CCDS13 LREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEE----GEEGEEEGDDK
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: : :.: :.. :..:. .. ::. . : ::. .:: . .. .
CCDS13 D---------DYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAE
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CCDS13 MLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETL
470 480 490 500 510 520
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pF1KB5 DIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELR
...: :.:::.:.. :::::::... :.:.:.:. :::.:: .: . : .. .:.:::.
CCDS13 ELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELK
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pF1KB5 LQMLIIDNFIPRDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEV
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CCDS13 LKHLIIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQ
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pF1KB5 DLSHVYLAYTEESLRQS---LMKLERP-RTSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
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CCDS13 HARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSRTTRDYEGPAI-----APKVQAALDAALQDED
650 660 670 680 690
CCDS13 EIQVDASSFESTANKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
700 710 720 730 740
>>CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
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CCDS44 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQ
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:::: .. . ..:: : :....: ::::::::::::::.::.:::.:. : :
CCDS44 FTFDGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQR
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pF1KB5 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
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CCDS44 GIIPRAFEHVFESVQCAE-NTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
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CCDS44 VKGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
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CCDS44 LRAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDS
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CCDS44 KLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALL
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370 380 390 400 410
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CCDS44 REYQEEIKKLKAILTQ--QMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDVEAEKQL
360 370 380 390 400
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pF1KB5 SPDKMIEMQAKIDEERKA-LETKLDMEEE---ERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLE
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CCDS44 IREEYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRK---ETEAVLQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEE
...: : ... ... ..::
CCDS44 -VGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAEL
470 480 490 500 510 520
>>CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
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CCDS21 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
:::: .. . ..:: : :....: ::::::::::::::.::.:::.:. : :
CCDS21 FTFDGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
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CCDS21 GIIPRAFEHVFESVQCAE-NTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
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CCDS21 VKGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
.: :::.::::::::::.::::::.:::::::::::::.:::::::::::. :::::.:
CCDS21 LRAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
:::::::::::::.::.: : ..::: :::::.::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS21 KLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
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:..:.::..:: : . ..: :..:. :.. . .: : . ..: ..:..
CCDS21 REYQEEIKKLKAILTQ--QMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDVEAEKQL
360 370 380 390 400
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pF1KB5 SPDKMIEMQAKIDEERKA-LETKLDMEEE---ERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLE
... : :.. . :: :.. .::. ::. ..: :..: : : ...:.
CCDS21 IREEYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRK---ETEAVLQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEE
...: : ... ... ..::
CCDS21 -VGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAEL
470 480 490 500 510 520
>>CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (929 aa)
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CCDS72 MQGLPDPPSQRGIIPRAFEHVFESVQCAE-
10 20
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pF1KB5 DTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVYIKDLSAYVVNNADDMDRIM
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CCDS72 NTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVHSVAQCEHIM
30 40 50 60 70 80
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pF1KB5 TLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMHVRMGKLHLVDLAGSERQAK
: :::::: : ::. :::::.::::.:: : :. :.: :::.::::::::::.:
CCDS72 ETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVDLAGSERQSK
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pF1KB5 TGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMC
:::::.:::::::::::::.:::::::::::. :::::.::::::::::::::.::.:
CCDS72 TGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMV
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pF1KB5 ANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALLRQFQKEIEELKKKLEEGEE
: ..::: :::::.::::::::::::.:: ::::::::::::..:.::..:: : . .
CCDS72 ACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQ--Q
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pF1KB5 ISGSDISG--SEEDDDEEGEVGEDGEKRKK-RRDQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKA-
.: :..:. :.. . .: : . ..: ..:.. ... : :.. . ::
CCDS72 MSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAE
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pF1KB5 LETKLDMEEE---ERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAK
:.. .::. ::. ..: :..: : : ...:. ...: : ... ... ..
CCDS72 QESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRK---ETEAVLQ-VGVLYKAEVMSRAEFASS
330 340 350 360 370 380
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pF1KB5 AEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKV
::
CCDS72 AEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSS
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>>CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
:.:..::::: .: : .. .: . ..: :: :.
CCDS14 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVPGEPQVVVG-TD------KS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
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CCDS14 FTYDFVFDPSTEQEEVFNTAVAPLIKGVFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQEN
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 ----GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLL--GKDQTQRLEVKER
:.:: . .: .: : ..: .: ..::::::::::. ::: .....: ....:
CCDS14 EPTVGVIPRVIQLLFKEIDK-KSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQ-INIRED
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PDVGVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKG
: :. : :. .: : : . :...:.:..: :: .::::::::::..: .:.
CCDS14 PKEGIKIVGLTEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISLEQRKKS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 IDGNMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKST-
: : : .::::::::::::: :: : :.::::. .:: .: :::::::: : :.
CCDS14 -DKNSSFR-SKLHLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGG
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 HVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINE
::::.:::::::::::::::.:.: : ..::: : .::..:::::.::..:::: .:
CCDS14 FVPYRDSKLTRLLQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLNTLRYADRARKIKNKPIVNI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB5 DPKDALLRQFQKEIEELKKKLEE--GEEISGS-DISGSEEDD---DEEGEVGEDGEKRKK
::. : : ........:. : . : . :: . ::. . ... . :..:: ..
CCDS14 DPQTAELNHLKQQVQQLQVLLLQAHGGTLPGSITVEPSENLQSLMEKNQSLVEENEKLSR
350 360 370 380 390 400
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pF1KB5 R-RDQAGKKKVSPDKMI-------EMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREK
. ::. ...: .:.::..: :. :::... .. ::.. .
CCDS14 GLSEAAGQTAQMLERIILTEQANEKMNAKLEELRQHAACKLDLQKLVETLEDQELKENVE
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 DLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRR
. . :: .: .. : .: .:. :..: . . . :. .. : :. .
CCDS14 IICNLQQLITQLSDETVACMAAAIDTAVEQEAQVETSPETSRSSDAFTTQHALRQAQMSK
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 ELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLK-KVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLL
:: : .. : ..: . . . ... . .. . . . :. .::.:... . :
CCDS14 ELVELNKA-LALKEALARKMTQNDSQLQPIQYQYQDNIKELELEVINLQKEKEELVLELQ
530 540 550 560 570 580
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pF1KB5 E-----NIRQLS--RELRLQMLIIDNFIPRDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNN
: .:: :. ::: :
CCDS14 TAKKDANQAKLSERRRKRLQELEGQIADLKKKLNEQSKLLKLKESTERTVSKLNQEIRMM
590 600 610 620 630 640
>>CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234 aa)
initn: 668 init1: 322 opt: 1000 Z-score: 491.5 bits: 102.2 E(32554): 4.7e-21
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CCDS47 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVPGETQVVVG-TD------KS
10 20 30 40
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pF1KB5 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
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