Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5225
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5225, 701 aa
1>>>pF1KB5225 701 - 701 aa - 701 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8454+/-0.00124; mu= -13.8789+/- 0.075
mean_var=694.8930+/-145.227, 0's: 0 Z-trim(116.9): 114 B-trim: 600 in 1/54
Lambda= 0.048654
statistics sampled from 17467 (17579) to 17467 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.794), E-opt: 0.2 (0.54), width: 16
Scan time: 5.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13952.2 SH3BP1 gene_id:23616|Hs108|chr22 ( 701) 4611 338.9 1.5e-92
CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 803) 982 84.2 8.1e-16
CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 812) 910 79.2 2.7e-14
CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 881) 891 77.9 7.2e-14
CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 774) 872 76.5 1.7e-13
CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 ( 818) 872 76.5 1.7e-13
>>CCDS13952.2 SH3BP1 gene_id:23616|Hs108|chr22 (701 aa)
initn: 4611 init1: 4611 opt: 4611 Z-score: 1774.8 bits: 338.9 E(32554): 1.5e-92
Smith-Waterman score: 4611; 100.0% identity (100.0% similar) in 701 aa overlap (1-701:1-701)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSSQGLGGSPGSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSSQGLGGSPGSHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMML
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 FSAVTLQDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAPALASAATKERTESEVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FSAVTLQDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAPALASAATKERTESEVPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 RPASPKVTRSPPETAAPVEDMARRTKRPAPARPTMPPPQVSGSRSSPPAPPLPPGSGSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RPASPKVTRSPPETAAPVEDMARRTKRPAPARPTMPPPQVSGSRSSPPAPPLPPGSGSPG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 TPQALPRRLVGSSLRAPTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPASPSPASPGPASPSPVSLSNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPQALPRRLVGSSLRAPTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPASPSPASPGPASPSPVSLSNP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB5 AQVDLGAATAEGGAPEAISGVPTPPAIPPQPRPRSLASETN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AQVDLGAATAEGGAPEAISGVPTPPAIPPQPRPRSLASETN
670 680 690 700
>>CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 (803 aa)
initn: 1541 init1: 722 opt: 982 Z-score: 397.5 bits: 84.2 E(32554): 8.1e-16
Smith-Waterman score: 1725; 42.7% identity (66.2% similar) in 749 aa overlap (2-697:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
::.:..::.:::. ..::. : .: :.:::::.:.::. .. :. :::: ::.:::
CCDS32 MKKQFNRMKQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
:.: ..: ::::: ::. .: :. .:. :: .:: :: .:::: :.. :. .:
CCDS32 HGTDAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQLE-DSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-QGLGGSPGSH
.....:: ..: :.: : :..:.: .:: ::.....: .:: :.::.. ::: :
CCDS32 KEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGL---P---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SHTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHR
.:..::::: .: :::::.:. ::.:.:..:: :...:. ::: ::::::
CCDS32 ------SKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHR
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RSLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMM
..:. :. .: :.: .. . ..:. .:. : ::.. :::::::::::::.
CCDS32 KALAVLEKTLPEMRAHQDKWAEKPA---------FGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVML
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LLSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPL
:: :::::::::..:::: ::.:: .. . :.:: :::::::::::::::::::::
CCDS32 LLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 MTFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMT
:::.::..: ..::... .:: : ..:..:::.:. :.:::.::::.::. ..:::::
CCDS32 MTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMT
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PSNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSG
:::::::::::::: ..:: :.. ::. :..::.:.: .:: :: .:: ...::::
CCDS32 PSNIAIVLGPNLLWA-RNEGTLAEMAAAT--SVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSE
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB5 LFSAVTL----------QDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAPALASAA
: .: .:. : : .. : :: . .: : : :. :..
CCDS32 AFVPLTTPSSNHSFHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESP-PKPKD-PVSAAVP
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570
pF1KB5 TKERTESEVP-----PRPA--SPKVTRSPPETAA-PVEDMARRT-KRPAPA--RPTMPPP
. :..:.. :. : : ... . :..:: : ::. :.:::: .: :::
CCDS32 APGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPP
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610
pF1KB5 QVSGSRSS------PPA----PPL----PPGS------GSPGTPQAL--PRRLVGS--SL
:..:: ::. :: :: . :.:..:. : ::: .: .
CCDS32 GHPGGQSSSGTSQHPPSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPI
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 RAPTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPASPSPASPGPASPSPVSLSNPAQVDLGAATAEGGA
.::. ::: ::: : . .: : .: .: : :: .: .:...
CCDS32 QAPNHPPPQPPTQATPLMH---TKPNSQGPPNPM-ALPSEHGLEQPSHTP----------
640 650 660 670
680 690 700
pF1KB5 PEAISGVPTPPAIPPQ-------PRPRSLASETN
:. .::::. :: : :..::
CCDS32 PQ----TPTPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETAQPHAGTLPRPRPVPKPRNRPSVP
680 690 700 710 720 730
>>CCDS82077.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 (812 aa)
initn: 1510 init1: 679 opt: 910 Z-score: 370.1 bits: 79.2 E(32554): 2.7e-14
Smith-Waterman score: 1621; 41.1% identity (65.1% similar) in 733 aa overlap (2-698:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
::.:..::::::. ..::. : .: :.:::::::.::: .:...:. ::.: ::::::
CCDS82 MKKQFNRMRQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
.::. ::: ::::: .:. . :. : :. .:: :.. ...::. : .::. .:
CCDS82 QGAEADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSSQGLGGSPGSHS
:::..:: :.: :.: : :..: : ::: : .. ..: .:..:.:: :..: .:..
CCDS82 RDVIEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSL--QPAG--
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHRR
:...:.:: :: .:: :::. ::.: ::.:: .::::: :.:.::.:::.
CCDS82 -----AKADALREEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRK
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMML
::. :...: ... .. ..:: .: : :: :::::.:::::: ::
CCDS82 SLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPS---------FGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTML
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLM
: ::.::::::.: .:: ::.:: .. ...:. .::::.::::::::::::::::
CCDS82 LECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTP
::.:::.:..:....: .:::: ..: .:: : .:.:::.:::..:.: :.::::::
CCDS82 TFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTP
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSGL
::.::::::::::: . ::. ... .. :.:.::..: .:: :: .:::.:.::..:
CCDS82 SNMAIVLGPNLLWP-QAEGNITEM--MTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGN
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KB5 FSAVTLQDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAPALASAATKERTE-----
.. : .... ...:.: :: : : : :. :. . :
CCDS82 YG--------SPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRP-LSVATDNMMLEFYKKD
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KB5 ---------SEVPPRPASP--KVTRSPP--ETAAPVEDMARRTKRPAPARPTMPPPQVSG
. : : .: ::. .:: . :: ..: : : .: : .
CCDS82 GMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSPAAPAL
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 SRSSPPAPPLPPGSGSPGTPQALPRRLVGSSLR-APTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPAS
: :. : : ... . . : ::. . .: . ::. . . . ::
CCDS82 SPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSP----GSAQKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGAS
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680
pF1KB5 PSPASPGPASPSPVSLSN--------PAQVDLG--AATAE--GGAPEAISGVPTPPAIP-
:::..: ::. :: .: . : .: .: .: :. .: : .: ::::. :
CCDS82 PSPSQP-PADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTPPSTPS
630 640 650 660 670 680
690 700
pF1KB5 PQ----PRPRSLASETN
: :. ::::
CCDS82 PYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQPPTVNL
690 700 710 720 730 740
>>CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 (881 aa)
initn: 1541 init1: 722 opt: 891 Z-score: 362.5 bits: 77.9 E(32554): 7.2e-14
Smith-Waterman score: 1610; 41.1% identity (65.3% similar) in 718 aa overlap (2-691:1-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
::.:..::.:::. ..::. : .: :.:::::.:.::. .. :. :::: ::.:::
CCDS32 MKKQFNRMKQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
:.: ..: ::::: ::. .: :. .:. :: .:: :: .:::: :.. :. .:
CCDS32 HGTDAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQLE-DSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-QGLGGSPGSH
.....:: ..: :.: : :..:.: .:: ::.....: .:: :.::.. ::: :
CCDS32 KEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGL---P---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SHTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHR
.:..::::: .: :::::.:. ::.:.:..:: :...:. ::: ::::::
CCDS32 ------SKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHR
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RSLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMM
..:. :. .: :.: .. . ..:. .:. : ::.. :::::::::::::.
CCDS32 KALAVLEKTLPEMRAHQDKWAEKPA---------FGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVML
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LLSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPL
:: :::::::::..:::: ::.:: .. . :.:: :::::::::::::::::::::
CCDS32 LLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 MTFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMT
:::.::..: ..::... .:: : ..:..:::.:. :.:::.::::.::. ..:::::
CCDS32 MTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMT
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PSNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSG
:::::::::::::: ..:: :.. ::. :..::.:.: .:: :: .:: ...::::
CCDS32 PSNIAIVLGPNLLWA-RNEGTLAEMAAAT--SVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSE
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB5 LFSAVTL----------QDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAPALASAA
: .: .:. : : .. : :: . . . : ..
CCDS32 AFVPLTTPSSNHSFHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESFGVKLMDFQAHRRGG
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 TKERT------ESEVPPRPASPKVTRSP--PETAAPVEDMARRTKRPAPARPTMPPPQVS
: .: . .:: .: : .: : .. .:. . :. : : :
CCDS32 TLNRKHISPAFQPPLPPTDGSTVVPAGPEPPPQSSRAESSSGGGTVPSSAGILEQGP--S
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630
pF1KB5 GSRSSPPAP--PLPPGSGSPG-------TPQALPRRLVGSSLRAPTVPPPLPPTPPQPAR
. .::: : :. . .:: . : :. .:: . .. : . :.:
CCDS32 PGDGSPPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGS--HQLSMGQPHNAAGPSP--
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 RQSRRSPASPSPASPGPASPSPVSLSNPAQVDLGAATAEGGAPEAISGVPTPPAIPPQPR
. ::. .:.:: : :..: : ..: :. .. : . . : : ::. :.:
CCDS32 HTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPP---GHP-----GGQSSSGTSQHPPSLSPKPPTRSPSPP
630 640 650 660 670
700
pF1KB5 PRSLASETN
CCDS32 TQHTGQPPGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMHTKPNSQGPPNP
680 690 700 710 720 730
>>CCDS82076.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 (774 aa)
initn: 1533 init1: 679 opt: 872 Z-score: 355.9 bits: 76.5 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 1614; 40.5% identity (64.5% similar) in 738 aa overlap (2-698:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
::.:..::::::. ..::. : .: :.:::::::.::: .:...:. ::.: ::::::
CCDS82 MKKQFNRMRQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
.::. ::: ::::: .:. . :. : :. .:: :.. ...::. : .::. .:
CCDS82 QGAEADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSSQGLGGSPGSHS
:::..:: :.: :.: : :..: : ::: : .. ..: .:..:.:: :..: .:..
CCDS82 RDVIEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSL--QPAG--
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHRR
:...:.:: :: .:: :::. ::.: ::.:: .::::: :.:.::.:::.
CCDS82 -----AKADALREEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRK
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMML
::. :...: ... .. ..:: .: : :: :::::.:::::: ::
CCDS82 SLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPS---------FGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTML
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLM
: ::.::::::.: .:: ::.:: .. ...:. .::::.::::::::::::::::
CCDS82 LECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTP
::.:::.:..:....: .:::: ..: .:: : .:.:::.:::..:.: :.::::::
CCDS82 TFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTP
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSGL
::.::::::::::: . ::. ... .. :.:.::..: .:: :: .:::.:.::..:
CCDS82 SNMAIVLGPNLLWP-QAEGNITEM--MTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGN
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520
pF1KB5 FSAVTLQDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAP-----------------
.. : .... ...:.: :: : : :
CCDS82 YG--------SPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KB5 --ALASAATKERTESEVPPRPASP--KVTRSPP--ETAAPVEDMARRTKRPAPARPTMPP
. : ... . : : .: ::. .:: . :: ..: : : .: :
CCDS82 LRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSP
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 PQVSGSRSSPPAPPLPPGSGSPGTPQALPRRLVGSSLR-APTVPPPLPPTPPQPARRQSR
. : :. : : ... . . : ::. . .: . ::. . .
CCDS82 AAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSP----GSAQKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGA
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KB5 RSPASPSPASPGPASPSPVSLSN--------PAQVDLG--AATAE--GGAPEAISGVPTP
. :::::..: ::. :: .: . : .: .: .: :. .: : .: :::
CCDS82 QPGASPSPSQP-PADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTP
630 640 650 660 670 680
690 700
pF1KB5 PAIP-PQ----PRPRSLASETN
:. : : :. ::::
CCDS82 PSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQP
690 700 710 720 730 740
>>CCDS45616.1 ARHGAP44 gene_id:9912|Hs108|chr17 (818 aa)
initn: 1450 init1: 679 opt: 872 Z-score: 355.6 bits: 76.5 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 1614; 40.5% identity (64.5% similar) in 738 aa overlap (2-698:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
::.:..::::::. ..::. : .: :.:::::::.::: .:...:. ::.: ::::::
CCDS45 MKKQFNRMRQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQVEKRLELVKQVSHSTHKKLTACLQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
.::. ::: ::::: .:. . :. : :. .:: :.. ...::. : .::. .:
CCDS45 QGAEADKRSKKLPLTTLAQCLMEGSAILGDDTLLGKMLKLCGETEDKLAQELIHFELQVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSSQGLGGSPGSHS
:::..:: :.: :.: : :..: : ::: : .. ..: .:..:.:: :..: .:..
CCDS45 RDVIEPLFLLAEVEIPNIQKQRKHLAKLVLDMDSSRTRWQQTSKSSGLSSSL--QPAG--
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHRR
:...:.:: :: .:: :::. ::.: ::.:: .::::: :.:.::.:::.
CCDS45 -----AKADALREEMEEAANRVEICRDQLSADMYSFVAKEIDYANYFQTLIEVQAEYHRK
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMML
::. :...: ... .. ..:: .: : :: :::::.:::::: ::
CCDS45 SLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPS---------FGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTML
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLM
: ::.::::::.: .:: ::.:: .. ...:. .::::.::::::::::::::::
CCDS45 LECGMQEEGLFRVAPSASKLKKLKAALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALKSYLRELPEPLM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTP
::.:::.:..:....: .:::: ..: .:: : .:.:::.:::..:.: :.::::::
CCDS45 TFELYDEWIQASNVQEQDKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTP
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSGL
::.::::::::::: . ::. ... .. :.:.::..: .:: :: .:::.:.::..:
CCDS45 SNMAIVLGPNLLWP-QAEGNITEM--MTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGN
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520
pF1KB5 FSAVTLQDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAP-----------------
.. : .... ...:.: :: : : :
CCDS45 YG--------SPVHVNHNANYSSMPSPDMDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDG
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KB5 --ALASAATKERTESEVPPRPASP--KVTRSPP--ETAAPVEDMARRTKRPAPARPTMPP
. : ... . : : .: ::. .:: . :: ..: : : .: :
CCDS45 LRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKVSCAPPSMQPPAPPAELAAPLPSPLPEQPLDSP
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 PQVSGSRSSPPAPPLPPGSGSPGTPQALPRRLVGSSLR-APTVPPPLPPTPPQPARRQSR
. : :. : : ... . . : ::. . .: . ::. . .
CCDS45 AAPALSPSGLGLQPGPERTSTTKSKELSP----GSAQKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGA
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KB5 RSPASPSPASPGPASPSPVSLSN--------PAQVDLG--AATAE--GGAPEAISGVPTP
. :::::..: ::. :: .: . : .: .: .: :. .: : .: :::
CCDS45 QPGASPSPSQP-PADQSPHTLRKVSKKLAPIPPKVPFGQPGAMADQSAGQPSPVSLSPTP
630 640 650 660 670 680
690 700
pF1KB5 PAIP-PQ----PRPRSLASETN
:. : : :. ::::
CCDS45 PSTPSPYGLSYPQGYSLASGQLSPAAAPPLASPSVFTSTLSKSRPTPKPRQRPTLPPPQP
690 700 710 720 730 740
701 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:28:57 2016 done: Fri Nov 4 03:28:58 2016
Total Scan time: 5.110 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]