Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5260
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5260, 381 aa
1>>>pF1KB5260 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0677+/-0.00083; mu= 13.0616+/- 0.050
mean_var=79.0880+/-15.526, 0's: 0 Z-trim(107.9): 38 B-trim: 2 in 1/48
Lambda= 0.144218
statistics sampled from 9815 (9853) to 9815 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7 ( 381) 2511 531.9 3.5e-151
CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 ( 381) 2088 443.9 1.1e-124
CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 ( 337) 1743 372.1 4e-103
CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7 ( 418) 788 173.5 3.2e-43
CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 ( 404) 771 169.9 3.6e-42
CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 671) 580 130.3 5.1e-30
CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 686) 554 124.9 2.2e-28
CCDS82771.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 ( 382) 499 113.3 3.7e-25
CCDS64005.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 733) 475 108.4 2.1e-23
CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 762) 475 108.4 2.1e-23
>>CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7 (381 aa)
initn: 2511 init1: 2511 opt: 2511 Z-score: 2827.6 bits: 531.9 E(32554): 3.5e-151
Smith-Waterman score: 2511; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
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CCDS34 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ENRQILARQKSNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ENRQILARQKSNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EVDVYVNGEWVTNISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EVDVYVNGEWVTNISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SVLQRRSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVLQRRSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB5 PCSEILKRNIQRYNSFISLTV
:::::::::::::::::::::
CCDS34 PCSEILKRNIQRYNSFISLTV
370 380
>>CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 (381 aa)
initn: 2342 init1: 2082 opt: 2088 Z-score: 2352.0 bits: 443.9 E(32554): 1.1e-124
Smith-Waterman score: 2088; 81.4% identity (94.2% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
: : . ::: .::. :::::: :.:: .::: ::.:: ..::::: ::::.::.::::
CCDS11 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ENRQILARQKSNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPK
: .:: ::.....::...:.:: :::::::.:::::..::::::::::.:::::::::
CCDS11 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQG
:::::.:::::: :::::.::::::::::::::: :. ::::::::::.:::::::.:::
CCDS11 DYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EVDVYVNGEWVTNISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTL
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CCDS11 ETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::.:.:: ::.:
CCDS11 RKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SVLQRRSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
.:::::: :::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB5 PCSEILKRNIQRYNSFISLTV
:::.:::::::.::::.::.:
CCDS11 PCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
370 380
>>CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 (337 aa)
initn: 1893 init1: 1737 opt: 1743 Z-score: 1964.9 bits: 372.1 E(32554): 4e-103
Smith-Waterman score: 1743; 78.7% identity (93.0% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
: : . ::: .::. :::::: :.:: .::: ::.:: ..::::: ::::.::.::::
CCDS62 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ENRQILARQKSNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEEDAVSYVRKVIPK
: .:: ::.....::...:.:: :::::::.:::::..::::::::::.:::::::::
CCDS62 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPNPVVKGRRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQG
:::::.:::::: :::::.::::::::::::::: :. ::::::::::.:::::::.:::
CCDS62 DYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EVDVYVNGEWVTNISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTL
:.:::::.::.:...::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS62 ETDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTA
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::.:.:: ::.:
CCDS62 RKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SVLQRRSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLG
.:::::: :::.:::::::::::::.. .
CCDS62 AVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGHLIISRRSIPLG
310 320 330
>>CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7 (418 aa)
initn: 823 init1: 363 opt: 788 Z-score: 889.5 bits: 173.5 E(32554): 3.2e-43
Smith-Waterman score: 820; 38.3% identity (64.2% similar) in 394 aa overlap (26-373:8-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
:. ..:. :.. .: ..: .:: .:..:
CCDS57 MSIEIPAGLTELLQGFTVEVLRHQPADLLEFALQHFTRLQQE
10 20 30 40
70 80
pF1KB5 ENRQILAR--------------------------QKSNSQSDSHD---EEVSPTPPN---
..:. :: . ::::.: ::..:. .
CCDS57 NERKGTARFGHEGRTWGDLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFN
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 -PVVKARRRRGGVSAEVYT----EEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDD
::.. ::..: ::.:. :.:: : : . :: . : .: . .:: .::
CCDS57 APVINRFTRRASVCAEAYNPDEEEDDAES--RIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDP
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KB5 NERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQGEVDVYVN----GEWVTNISEGGS
.. :...:::: :: ::.::..::::::.:.: :.::. :. : : .. ::
CCDS57 EQMSQVLDAMFEKLVKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGS
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 FGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESL
::::::.:.::::::. : . :::.:: ..:::.. .. .:::::: :. .. .:.::
CCDS57 FGELALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSL
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 EKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEY-----VE
: ::: :.:.. ..:::.:..::. .:.:.:. : ... ..:. . : ::
CCDS57 EFSERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVE
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 VGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSEILKRNIQRYN
..: . ..::::.::. :.::::.. : : .::. .: :::.:::: ::.:::: :
CCDS57 IARCSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYE
350 360 370 380 390 400
380
pF1KB5 SFISLTV
CCDS57 EQLVALFGTNMDIVEPTA
410
>>CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 (404 aa)
initn: 877 init1: 371 opt: 771 Z-score: 870.6 bits: 169.9 E(32554): 3.6e-42
Smith-Waterman score: 776; 37.0% identity (66.4% similar) in 384 aa overlap (21-373:3-385)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLH-GIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEK
..:. :. ..:. :.. ..: ..: :.: .:..
CCDS27 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLRE
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB5 EEN----------RQILARQK--------SNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVS
. :: :.. .....::..:: . :: . :: .:
CCDS27 ARAPASVLPAATPRQSLGHPPPEPGPDRVADAKGDSESEE-DEDLEVPVPSRFNRRVSVC
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KB5 AEVYT--EEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHI
::.:. ::. . : . :: . : .: . .:: .::... :...::::
CCDS27 AETYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVK
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AGETVIQQGNEGDNFYVVDQGEVDVYVNGEW----VTNISEGGSFGELALIYGTPRAATV
: : ::.::..::::::...: :. :. . : . .. ::::::::.:.::::::.
CCDS27 ADEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATI
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 KAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQ
: .. .:::.:: ..:::.. .. .::::.: :. .: .:.::: ::. ..:..
CCDS27 VATSEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKI
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB5 FEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTASVLQR------RSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIAL
..:::.:..::: .:.:::: : .:.: : .. ... ::..: ..::::.::
CCDS27 YKDGERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELAL
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 LLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSEILKRNIQRYNSFISLTV
. :.::::.. : : .::. .: :::.:::: .:.::::..:
CCDS27 VTNKPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGN
350 360 370 380 390 400
CCDS27 LGQ
>>CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 (671 aa)
initn: 589 init1: 483 opt: 580 Z-score: 652.4 bits: 130.3 E(32554): 5.1e-30
Smith-Waterman score: 580; 33.7% identity (64.8% similar) in 338 aa overlap (31-365:4-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
:.. .... . : :: .: :.... :::
CCDS44 MSELEEDFAKILMLKEER-IKELEKRLS--EKE
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB5 ENRQILARQKSNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVSAEVYTEE---DAVSYVRKV
:. : : :. . :: : :.: . . : :.::: : . : . ::
CCDS44 EEIQELKRKLHKCQS------VLPVPSTHIGPRTTRAQGISAEPQTYRSFHDLRQAFRK-
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVV
. :. .. . .:: : .. .:. .. ..: : :.:: . .:..:. :. ::.
CCDS44 FTKSERSKDLIKEAILDNDFMKNLELSQIQEIVDCMYPVEYGKDSCIIKEGDVGSLVYVM
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DQGEVDVYVNGEWVTNISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMG
..:.:.: .: . ... : :::::..:. :.::::. ...:::.:::. .. :.:
CCDS44 EDGKVEVTKEGVKLCTMGPGKVFGELAILYNCTRTATVKTLVNVKLWAIDRQCFQTIMMR
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 STLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITE
. : :. : :::..: ..:: . .::.:: ...:.:: :. :: :: :.::..
CCDS44 TGLIKHTEYMEFLKSVPTFQSLPEEILSKLADVLEETHYENGEYIIRQGARGDTFFIISK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GTASVLQRRSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFER
::..: .. ::.:. : . :: .:.::: :: . :.:.:.: . :. .:: :..
CCDS44 GTVNVTREDSPSEDPVFLRTLGKGDWFGEKALQGEDVRTANVIAAEAVTCLVIDRDSFKH
270 280 290 300 310 320
360 370 380
pF1KB5 VLGPCSEILKRNIQRYNSFISLTV
..: ...
CCDS44 LIGGLDDVSNKAYEDAEAKAKYEAEAAFFANLKLSDFNIIDTLGVGGFGRVELVQLKSEE
330 340 350 360 370 380
>>CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 (686 aa)
initn: 612 init1: 533 opt: 554 Z-score: 623.0 bits: 124.9 E(32554): 2.2e-28
Smith-Waterman score: 554; 32.8% identity (65.3% similar) in 320 aa overlap (52-365:37-346)
30 40 50 60 70
pF1KB5 VQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKEEN--RQIL--ARQKSNSQSDS
: ..::..: . :... : :....:: :
CCDS72 LQYALQEKIEELRQRDALIDELELELDQKDELIQKLQNELDKYRSVIRPATQQAQKQSAS
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 HDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVSAE--VYTEEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKN
.. : : .: ..::: .. .: . ::. .. . .:: :
CCDS72 ---TLQGEP-------RTKRQAISAEPTAFDIQDLSHVTLPFYPKSPQSKDLIKEAILDN
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 VLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQGEVDVYVNGEWVTNIS
.. .:. .. ..: : :.:: . .:..:. :. ::...:.:.: .: . ...
CCDS72 DFMKNLELSQIQEIVDCMYPVEYGKDSCIIKEGDVGSLVYVMEDGKVEVTKEGVKLCTMG
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 EGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSI
: :::::..:. :.::::. ...:::.:::. .. :.: . : :. : :::..:
CCDS72 PGKVFGELAILYNCTRTATVKTLVNVKLWAIDRQCFQTIMMRTGLIKHTEYMEFLKSVPT
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 LESLEKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEYVEV
..:: . .::.:: ...:.:: :. :: :: :.::..::..: .. ::.:. : .
CCDS72 FQSLPEEILSKLADVLEETHYENGEYIIRQGARGDTFFIISKGTVNVTREDSPSEDPVFL
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
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:: .:.::: :: . :.:.:.: . :. .:: :....: ...
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380
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. :: :.. .....::..:: . :: . :: .:
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CCDS64 EENDVACLVIDRETFNQTVGTFEELQKYLEGYVANLNRDDEKRHAKRSMSNWKLSKALSL
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 EEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKL-----EKEENRQ
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CCDS35 PDGHSGNLTTDALRNKVTELERELRRKDAEIQEREYHLKELREQLSKQTVAIAELTEELQ
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pF1KB5 ILARQKSNSQSDSHDEEVSPTPPNP-------------VVKARRRRG---GVSAEVYT--
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CCDS35 NKCIQLNKLQDVVHMQGGSPLQASPDKVPLEVHRKTSGLVSLHSRRGAKAGVSAEPTTRT
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 ----EEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHIAGE
. :. . . :: . .. :..:: .. .:: .. .:. . :. .. :
CCDS35 YDLNKPPEFSFEKARVRKDSSEKKLITDALNKNQFLKRLDPQQIKDMVECMYGRNYQQGS
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 TVIQQGNEGDNFYVVDQGEVDVYVNGEWVTNISEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTDLK
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CCDS35 YIIKQGEPGNHIFVLAEGRLEVFQGEKLLSSIPMWTTFGELAILYNCTRTASVKAITNVK
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 LWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLT-VADALEPVQFEDGEK
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CCDS35 TWALDREVFQNIMRRTAQARDEQYRNFLRSVSLLKNLPE-DKLTKIIDCLEVEYYDKGDY
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CCDS35 IIREGEEGSTFFILAKGKVKVTQSTEGHDQPQLIKTLQKGEYFGEKALISDDVRSANIIA
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CCDS35 EENDVACLVIDRETFNQTVGTFEELQKYLEGYVANLNRDDEKRHAKRSMSNWKLSKALSL
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]