Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5289, 418 aa
1>>>pF1KB5289 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7440+/-0.000791; mu= 15.5161+/- 0.048
mean_var=71.5838+/-14.273, 0's: 0 Z-trim(108.0): 53 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.151589
statistics sampled from 9908 (9962) to 9908 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 521 122.9 5.8e-28
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CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 492 116.6 4.6e-26
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CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 419 100.6 2.9e-21
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 418 100.4 3.7e-21
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CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 343 84.0 2.6e-16
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 322 79.4 6.9e-15
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 316 78.0 1.3e-14
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CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 291 72.6 7.2e-13
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 291 72.6 7.5e-13
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 286 71.5 1.4e-12
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 275 69.0 5.5e-12
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 278 69.8 5.7e-12
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 276 69.3 7.3e-12
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 276 69.3 7.3e-12
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 276 69.3 7.5e-12
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 266 67.1 3.3e-11
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 263 66.5 5.3e-11
>>CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 (418 aa)
initn: 2703 init1: 2703 opt: 2703 Z-score: 3194.7 bits: 600.1 E(32554): 1.3e-171
Smith-Waterman score: 2703; 99.8% identity (99.8% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQALVLLLCIGALLGHSSCQNPASPPEEGSPDPDSTGALVEEEDPFFKVPVNKLAAAVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MQALVLLLCIGALLGHSSCQNPASPPEEGSPDPDSTGALVEEEDPFFKVPVNKLAAAVSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 FGYDLYRVRSSMSPTTNVLLSPLSVATALSALSLGAEQRTESIIHRALYYDLISSPDIHG
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FGYDLYRVRSSTSPTTNVLLSPLSVATALSALSLGAEQRTESIIHRALYYDLISSPDIHG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TYKELLDTVTAPQKNLKSASRIVFEKKLRIKSSFVAPLEKSYGTRPRVLTGNPRLDLQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TYKELLDTVTAPQKNLKSASRIVFEKKLRIKSSFVAPLEKSYGTRPRVLTGNPRLDLQEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NNWVQAQMKGKLARSTKEIPDEISILLLGVAHFKGQWVTKFDSRKTSLEDFYLDEERTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NNWVQAQMKGKLARSTKEIPDEISILLLGVAHFKGQWVTKFDSRKTSLEDFYLDEERTVR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VPMMSDPKAVLRYGLDSDLSCKIAQLPLTGSMSIIFFLPLKVTQNLTLIEESLTSEFIHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VPMMSDPKAVLRYGLDSDLSCKIAQLPLTGSMSIIFFLPLKVTQNLTLIEESLTSEFIHD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IDRELKTVQAVLTVPKLKLSYEGEVTKSLQEMKLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IDRELKTVQAVLTVPKLKLSYEGEVTKSLQEMKLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB5 GFEWNEDGAGTTPSPGLQPAHLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GFEWNEDGAGTTPSPGLQPAHLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGP
370 380 390 400 410
>>CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 (491 aa)
initn: 599 init1: 326 opt: 607 Z-score: 716.3 bits: 141.8 E(32554): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 607; 29.0% identity (63.5% similar) in 414 aa overlap (10-415:31-436)
10 20 30
pF1KB5 MQALVLLLCIGALLGHSSCQNPASPP---EEGSPDPDST
.: : . :. .:: . :. .: .
CCDS11 MALLWGLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQEPGGQ
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 GAL-----VEEEDPFFKVPVNKLAAAVSNFGYDLYRVRSSMSPTTNVLLSPLSVATALSA
:: : .:: . ...:: :. : ::. . .. : :..::::::: :::
CCDS11 TALKSPPGVCSRDPTPE-QTHRLARAMMAFTADLFSLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSH
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100 110 120 130 140 150
pF1KB5 LSLGAEQRTESIIHRALYYDLISSPDIHGTYKELLDTVTAPQKNLKSASRIVFEKKLRIK
:.:::...: . ....:. :.: . ..: . . .: .. :.:. ..: . ::
CCDS11 LALGAQNHTLQRLQQVLHAG--SGPCLPHLLSRLCQDL-GPGA-FRLAARMYLQKGFPIK
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160 170 180 190 200 210
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.:. :. .:..: :::. . :: .::.::. .::. . . .:.. .:::..
CCDS11 EDFLEQSEQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 HFKGQWVTKFDSRKTSLEDFYLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLSCKIAQLPLTGS
::.: : .::: :. ..:.:::. :: : ::. ::. : . ..:..:. ..
CCDS11 HFQGFWRNKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 MSIIFFLPLKVTQNLTLIEESLTSEFIHDIDRELKTVQAVLTVPKLKLSYEGEVTKSLQE
::.. ..: . :.. . .:. . .: . ... : ::: :... ... .:..
CCDS11 MSFVVLVPTHFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWERPTKVRL--PKLYLKHQMDLVATLSQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 MKLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTTPSPGLQPAHLTFPLDYHLN
. :: ::..::. :. . . .. :.:.. .: .: :. .. . .. ..... .. .:
CCDS11 LGLQELFQAPDLRGISEQSLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLS-SFSVN
360 370 380 390 400 410
400 410
pF1KB5 QPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGP
.::.: . . :: ::.:.. .:
CCDS11 RPFLFFIFEDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGP
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>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 (418 aa)
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Smith-Waterman score: 567; 28.1% identity (63.1% similar) in 417 aa overlap (13-415:11-415)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MQALVLLLCIGALLGHSSCQNPASPPEEGSPDP-DSTGALVEEED-PFFKVPVNKLAAAV
::. : :.: :. . : ..: . ...: : : ::.. .
CCDS99 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTF----NKITPNL
10 20 30 40 50
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pF1KB5 SNFGYDLYRVRSSMSPTTNVLLSPLSVATALSALSLGAEQRTESIIHRALYYDLISSPD-
..:...::: . .: .::...::.:.:::.. ::::.. :.. : ..: ..: :.
CCDS99 AEFAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEA
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pF1KB5 -IHGTYKELLDTVTAP--QKNLKSASRIVFEKKLRIKSSFVAPLEKSYGTRPRVLT-GNP
:: ..::: :.. : : .: ... . . . :.. ..:. ..: : .. ... :.
CCDS99 QIHEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDT
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pF1KB5 RLDLQEINNWVQAQMKGKLARSTKEIPDEISILLLGVAHFKGQWVTKFDSRKTSLEDFYL
. ..::..:. .::.. .::. . . :.. :::.: :. . : :::..
CCDS99 EEAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 DEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLSCK-----IAQLPLTGSMSIIFFLPLKVTQNLTL
:. ::.::::. : :. . :: . . :. . ::::: . .:
CCDS99 DQVTTVKVPMMK------RLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDE--GKLQH
240 250 260 270 280
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pF1KB5 IEESLTSEFIHDIDRELKTVQAVLTVPKLKLSYEGEVTKSLQEMKLQSLF-DSPDFSKIT
.:. :: ..: . .. .: : .:::... .. . : .. . ..: .. :.: .:
CCDS99 LENELTHDIITKFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVT
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 GK-PIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTTPSPGLQPAHLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGAL
. :.::... :.: . .: :. .. . :. ...: . ..:.::.:.. . .: .
CCDS99 EEAPLKLSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSP
350 360 370 380 390 400
410
pF1KB5 LFIGKILDPRGP
::.::...:
CCDS99 LFMGKVVNPTQK
410
>>CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 (405 aa)
initn: 401 init1: 155 opt: 538 Z-score: 636.0 bits: 126.6 E(32554): 4.2e-29
Smith-Waterman score: 538; 29.4% identity (64.4% similar) in 371 aa overlap (54-415:39-404)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 SPPEEGSPDPDSTGALVEEEDPFFKVPVNKLAAAVSNFGYDLYRVRSSMSPTTNVLLSPL
::.: .:...::. ..:: :...::.
CCDS99 LLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISPV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 SVATALSALSLGAEQRTESIIHRALYYDLI--SSPDIHGTYKELLDTVTAPQKNLKSA--
:.. ::. ::::. .:.. . ..: ..: : .:: ...: . . . .:. .
CCDS99 SISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTMG
70 80 90 100 110 120
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pF1KB5 SRIVFEKKLRIKSSFVAPLEKSYGTRPRVLTGNPR---LDLQEINNWVQAQMKGKLARST
. . .. .:.. :: : ... : .. ::. : . ..::..:. . .::..
CCDS99 NALFLDGSLELLESFSADIKHYYESE--VLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLF
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 KEIPDEISILLLGVAHFKGQWVTKFDSRKTSLEDFYLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLD
. . . ..:.. ::: :. :: .: :.::.:: .:.:::: . ... : :
CCDS99 SGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTI-SYLHD
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 SDLSCKIAQLPLTGSMSIIFFLPLKVTQNLTLIEESLTSEFIHDIDRELKTVQAVLTVPK
:.: :...:. .:. ...:.:: : .: :.: .:. . :. . : . :. : .::
CCDS99 SELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMN-TVIA-ALSRDTINRWSAGLTSSQVDLYIPK
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LKLSYEGEVTKSLQEMKLQSLF-DSPDFSKIT-GKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTTPS
. .: .. :.:: . .:: .. .::.:: .: ..: :.: .. ::.:. :. :
CCDS99 VTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGS
310 320 330 340 350 360
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pF1KB5 PGLQPAHLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGP
:. . :. ..:::::... : : . ::......:
CCDS99 TGVTLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
370 380 390 400
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 393 init1: 220 opt: 527 Z-score: 622.7 bits: 124.2 E(32554): 2.3e-28
Smith-Waterman score: 527; 28.0% identity (61.7% similar) in 428 aa overlap (1-416:1-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQALVLLLCIGALLGHSSCQNPASPPEEGSPDPDSTGALVEEEDPFFKVPVNKLAAAVSN
:. .. :: .: ::. . : :: . .:: : . :..: .: .. ::.: .
CCDS32 MERMLPLLALG-LLAAGFC--PAVLCHPNSPL-DEENLTQENQDRGTHVDLG-LASANVD
10 20 30 40 50
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pF1KB5 FGYDLYRVRSSMSPTTNVLLSPLSVATALSALSLGAEQRTESIIHRALYYDLI--SSPDI
:...::. .: ::..::::..:::. :::::.. : . : ..: ..: : .:
CCDS32 FAFSLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEI
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pF1KB5 HGTYKELLDTVTAPQKNLK-SASRIVFEK-KLRIKSSFVAPLEKSYGTRPRVLTGNPRLD
: ....:: :.. . .:. : . .: : .: . . :. .. ::.. . .
CCDS32 HQSFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAA
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 LQE-INNWVQAQMKGKLARSTKEIPDEISILLLGVAHFKGQWVTKFDSRKTSLEDFYLDE
.. ::..:. .::.. :.. .. ..:.. ::..: :: . : :::..
CCDS32 AKKLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSK
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 ERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLSCKIAQLPLTGSMSIIFFLPLKVTQNLTLIEESLTS
.. : ::::: . .. : : .::: ...: ::. : .:.:: . ... .: :
CCDS32 KKWVMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQ--DKMEEVEAMLLP
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CCDS41 VAFFVLPSK--GKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKM
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CCDS41 GIQNVFDKNADFSGIAKRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]