Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5298
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5298, 634 aa
1>>>pF1KB5298 634 - 634 aa - 634 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0012+/-0.00098; mu= 15.3091+/- 0.059
mean_var=78.8689+/-15.883, 0's: 0 Z-trim(105.7): 176 B-trim: 41 in 1/49
Lambda= 0.144418
statistics sampled from 8392 (8581) to 8392 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 3.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 4330 912.3 0
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CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 1177 255.3 1.8e-67
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 1177 255.4 1.8e-67
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 1177 255.4 1.8e-67
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 1172 254.3 3.6e-67
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 1127 244.9 2.4e-64
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 1097 238.7 1.8e-62
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 940 206.0 1.3e-52
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 866 190.5 5.5e-48
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 829 182.9 1.4e-45
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 823 181.6 2.6e-45
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 823 181.6 3.1e-45
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 823 181.6 3.3e-45
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 789 174.5 3.7e-43
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 768 170.1 7.5e-42
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 764 169.3 1.3e-41
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 763 169.1 1.8e-41
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 762 168.9 2.1e-41
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 762 168.9 2.1e-41
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 754 167.2 5.5e-41
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 751 166.6 9e-41
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 752 166.8 9e-41
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 743 164.9 2.7e-40
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 740 164.3 4.3e-40
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 739 164.1 4.7e-40
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 738 163.9 5.7e-40
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 732 162.6 1.4e-39
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 732 162.6 1.4e-39
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 730 162.2 1.9e-39
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 721 160.3 7.2e-39
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 710 158.0 3.2e-38
CCDS32813.1 KLHL14 gene_id:57565|Hs108|chr18 ( 628) 659 147.4 5.4e-35
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 648 145.1 2.6e-34
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 646 144.7 3.5e-34
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 628 140.9 4.3e-33
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 617 138.6 1.9e-32
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 612 137.6 4.6e-32
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 605 136.1 1.1e-31
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14 ( 533) 561 127.0 6.6e-29
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 554 125.5 2.1e-28
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 549 124.5 4.3e-28
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 540 122.6 1.5e-27
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 539 122.4 1.7e-27
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 524 119.3 1.5e-26
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 509 116.1 1.3e-25
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 498 113.9 6.4e-25
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 486 111.4 5.1e-24
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 479 109.9 1e-23
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 464 106.8 9.4e-23
>>CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 (634 aa)
initn: 4330 init1: 4330 opt: 4330 Z-score: 4875.2 bits: 912.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4330; 100.0% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAEEQEFTQLCKLPAQPSHPHCVNNTYRSAQHSQALLRGLLALRDSGILFDVVLVVEGRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAEEQEFTQLCKLPAQPSHPHCVNNTYRSAQHSQALLRGLLALRDSGILFDVVLVVEGRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IEAHRILLAASCDYFRGMFAGGLKEMEQEEVLIHGVSYNAMCQILHFIYTSELELSLSNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IEAHRILLAASCDYFRGMFAGGLKEMEQEEVLIHGVSYNAMCQILHFIYTSELELSLSNV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QETLVAACQLQIPEIIHFCCDFLMSWVDEENILDVYRLAELFDLSRLTEQLDTYILKNFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QETLVAACQLQIPEIIHFCCDFLMSWVDEENILDVYRLAELFDLSRLTEQLDTYILKNFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AFSRTDKYRQLPLEKVYSLLSSNRLEVSCETEVYEGALLYHYSLEQVQADQISLHEPPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AFSRTDKYRQLPLEKVYSLLSSNRLEVSCETEVYEGALLYHYSLEQVQADQISLHEPPKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LETVRFPLMEAEVLQRLHDKLDPSPLRDTVASALMYHRNESLQPSLQSPQTELRSDFQCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LETVRFPLMEAEVLQRLHDKLDPSPLRDTVASALMYHRNESLQPSLQSPQTELRSDFQCV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VGFGGIHSTPSTVLSDQAKYLNPLLGEWKHFTASLAPRMSNQGIAVLNNFVYLIGGDNNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VGFGGIHSTPSTVLSDQAKYLNPLLGEWKHFTASLAPRMSNQGIAVLNNFVYLIGGDNNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QGFRAESRCWRYDPRHNRWFQIQSLQQEHADLSVCVVGRYIYAVAGRDYHNDLNAVERYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QGFRAESRCWRYDPRHNRWFQIQSLQQEHADLSVCVVGRYIYAVAGRDYHNDLNAVERYD
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pF1KB5 PATNSWAYVAPLKREVYAHAGATLEGKMYITCGRRGEDYLKETHCYDPGSNTWHTLADGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PATNSWAYVAPLKREVYAHAGATLEGKMYITCGRRGEDYLKETHCYDPGSNTWHTLADGP
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pF1KB5 VRRAWHGMATLLNKLYVIGGSNNDAGYRRDVHQVACYSCTSGQWSSVCPLPAGHGEPGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VRRAWHGMATLLNKLYVIGGSNNDAGYRRDVHQVACYSCTSGQWSSVCPLPAGHGEPGIA
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550 560 570 580 590 600
pF1KB5 VLDNRIYVLGGRSHNRGSRTGYVHIYDVEKDCWEEGPQLDNSISGLAACVLTLPRSLLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLDNRIYVLGGRSHNRGSRTGYVHIYDVEKDCWEEGPQLDNSISGLAACVLTLPRSLLLE
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610 620 630
pF1KB5 PPRGTPDRSQADPDFASEVMSVSDWEEFDNSSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PPRGTPDRSQADPDFASEVMSVSDWEEFDNSSED
610 620 630
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 1248 init1: 397 opt: 1177 Z-score: 1325.1 bits: 255.3 E(32554): 1.7e-67
Smith-Waterman score: 1177; 34.8% identity (65.2% similar) in 597 aa overlap (27-613:27-609)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAEEQEFTQLCKLPAQPSHPHCVNNTYRSAQHSQALLRGLLALRDSGILFDVVLVVEGRH
. : ::...:.:. :: :.: ::.:. :
CCDS55 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLM-PGDT
10 20 30 40 50
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pF1KB5 IEA---HRILLAASCDYFRGMFAGGLKEMEQEEVLIHGVSYNAMCQILHFIYTSELELSL
.: ::...:.. :::..::.::.::.. . .:::: .. .:. ::::..: :..
CCDS55 DDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNM
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pF1KB5 SNVQETLVAACQLQIPEIIHFCCDFLMSWVDEENILDVYRLAELFDLSRLTEQLDTYILK
.:.:.:: :: ::: .. :: ::.: : .: ..: :.:. ..:... . .....::
CCDS55 DNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLK
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pF1KB5 NFVAFSRTDKYRQLPLEKVYSLLSSNRLEVSCETEVYEGALLYHYSLEQVQADQISLHEP
:: :. : .. .::.:.. .:::: :. : :... : ::. . : .
CCDS55 NFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFK-ATCRWLRLEEPRMDFAA----
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 PKLLETVRFPLMEAEVLQRLHDKLDPSPLRDTVASALM----YHRNESLQPSLQSPQTEL
::....::::: . : . .: .: .. :. :. .:: .:: .: .
CCDS55 -KLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 RSDFQCVVGFGGIHSTPSTVLSDQAKYLNPLLGEWKHFTASLAPRMSNQGIAVLNNFVYL
::: .: .::. . :.: . .. . ::: .. :::... ::::..::.:.
CCDS55 RSDTTHLVTLGGVLRQ-QLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQH-GIAVIGNFLYV
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pF1KB5 IGGDNN--VQGFRAESRCWRYDPRHNRWFQIQSLQQEHADLSVCVVGRYIYAVAGRDYHN
.::..: ..: : . .:.:::.:.:.:. ::..... . . .. :.:::.::. .
CCDS55 VGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAG
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pF1KB5 DLNAVERYDPATNSWAYVAPLKREVYAHAGATLEGKMYITCGRRGEDYLKETHCYDPGSN
.: .:: :.: :: :.::: ... :.:::.. : :::. : . . :: :.:: ..
CCDS55 ELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTD
420 430 440 450 460 470
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pF1KB5 TWHTLADGPVRRAWHGMATLLNKLYVIGGSN-NDAGYRRDVHQVACYSCTSGQWSSVCPL
: : . :. : : :. ..::::::.. .. :: . :: ::. . .
CCDS55 KWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAM
480 490 500 510 520 530
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pF1KB5 PAGHGEPGIAVLDNRIYVLGGRSHNRGSRTGYVHIYDVEKDCWEEGPQLDNSISGLAACV
:... :.::..:.:::.:: : : . :. :: .:: :.. .: .:..:. ::.
CCDS55 LRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACT
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pF1KB5 LTLPRSLLLEPPRGTPDRSQADPDFASEVMSVSDWEEFDNSSED
::. . : . ::. :. .:
CCDS55 LTV-----FPPEETTPSPSRESPLSAP
600 610
>>CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (639 aa)
initn: 1312 init1: 397 opt: 1177 Z-score: 1324.8 bits: 255.3 E(32554): 1.8e-67
Smith-Waterman score: 1177; 34.8% identity (65.2% similar) in 597 aa overlap (27-613:53-635)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAEEQEFTQLCKLPAQPSHPHCVNNTYRSAQHSQALLRGLLALRDSGILFDVVLVV
. : ::...:.:. :: :.: ::.:.
CCDS55 EDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLM-
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EGRHIEA---HRILLAASCDYFRGMFAGGLKEMEQEEVLIHGVSYNAMCQILHFIYTSEL
: .: ::...:.. :::..::.::.::.. . .:::: .. .:. ::::..:
CCDS55 PGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKL
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ELSLSNVQETLVAACQLQIPEIIHFCCDFLMSWVDEENILDVYRLAELFDLSRLTEQLDT
:...:.:.:: :: ::: .. :: ::.: : .: ..: :.:. ..:... . ...
CCDS55 SLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNS
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 YILKNFVAFSRTDKYRQLPLEKVYSLLSSNRLEVSCETEVYEGALLYHYSLEQVQADQIS
..:::: :. : .. .::.:.. .:::: :. : :... : ::. . : .
CCDS55 FVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFK-ATCRWLRLEEPRMDFAA
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280
pF1KB5 LHEPPKLLETVRFPLMEAEVLQRLHDKLDPSPLRDTVASALM----YHRNESLQPSLQSP
::....::::: . : . .: .: .. :. :. .:: .::
CCDS55 -----KLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSD
270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QTELRSDFQCVVGFGGIHSTPSTVLSDQAKYLNPLLGEWKHFTASLAPRMSNQGIAVLNN
.: .::: .: .::. . :.: . .. . ::: .. :::... ::::..:
CCDS55 RTAIRSDTTHLVTLGGVLRQ-QLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQH-GIAVIGN
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FVYLIGGDNN--VQGFRAESRCWRYDPRHNRWFQIQSLQQEHADLSVCVVGRYIYAVAGR
:.:..::..: ..: : . .:.:::.:.:.:. ::..... . . .. :.:::.::
CCDS55 FLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGR
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 DYHNDLNAVERYDPATNSWAYVAPLKREVYAHAGATLEGKMYITCGRRGEDYLKETHCYD
. ..: .:: :.: :: :.::: ... :.:::.. : :::. : . . :: :.:
CCDS55 NAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFD
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PGSNTWHTLADGPVRRAWHGMATLLNKLYVIGGSN-NDAGYRRDVHQVACYSCTSGQWSS
: .. : : . :. : : :. ..::::::.. .. :: . :: ::.
CCDS55 PDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTP
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 VCPLPAGHGEPGIAVLDNRIYVLGGRSHNRGSRTGYVHIYDVEKDCWEEGPQLDNSISGL
. . :... :.::..:.:::.:: : : . :. :: .:: :.. .: .:..:.
CCDS55 IAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGI
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630
pF1KB5 AACVLTLPRSLLLEPPRGTPDRSQADPDFASEVMSVSDWEEFDNSSED
::.::. . : . ::. :. .:
CCDS55 RACTLTV-----FPPEETTPSPSRESPLSAP
620 630
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CCDS65 TVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
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CCDS12 IACAPVLLPRAGTRR
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CCDS10 EQRVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDG
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