Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5311
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5311, 466 aa
1>>>pF1KB5311 466 - 466 aa - 466 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7352+/-0.00101; mu= 11.1832+/- 0.060
mean_var=130.8008+/-26.916, 0's: 0 Z-trim(107.9): 87 B-trim: 347 in 1/51
Lambda= 0.112142
statistics sampled from 9757 (9844) to 9757 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 3.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14762.1 MPP1 gene_id:4354|Hs108|chrX ( 466) 3072 508.8 4.9e-144
CCDS55544.1 MPP1 gene_id:4354|Hs108|chrX ( 436) 2856 473.8 1.5e-133
CCDS55545.1 MPP1 gene_id:4354|Hs108|chrX ( 446) 1903 319.6 4e-87
CCDS48094.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 897) 1403 239.0 1.5e-62
CCDS48095.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 898) 1353 230.9 4.2e-60
CCDS14257.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 921) 1351 230.6 5.4e-60
CCDS5388.1 MPP6 gene_id:51678|Hs108|chr7 ( 540) 1066 184.3 2.7e-46
CCDS62207.1 MPP2 gene_id:4355|Hs108|chr17 ( 541) 1040 180.1 5e-45
CCDS11471.1 MPP2 gene_id:4355|Hs108|chr17 ( 552) 1040 180.1 5.1e-45
CCDS62208.1 MPP2 gene_id:4355|Hs108|chr17 ( 569) 1040 180.1 5.2e-45
CCDS62209.1 MPP2 gene_id:4355|Hs108|chr17 ( 576) 1040 180.1 5.3e-45
CCDS62210.1 MPP2 gene_id:4355|Hs108|chr17 ( 597) 1040 180.1 5.4e-45
CCDS62206.1 MPP2 gene_id:4355|Hs108|chr17 ( 413) 993 172.4 8e-43
CCDS44692.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 334) 476 88.7 1e-17
CCDS44691.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 749) 478 89.3 1.5e-17
CCDS73357.1 DLG2 gene_id:1740|Hs108|chr11 ( 852) 478 89.3 1.7e-17
CCDS58325.1 MPP5 gene_id:64398|Hs108|chr14 ( 641) 428 81.1 3.7e-15
CCDS9779.1 MPP5 gene_id:64398|Hs108|chr14 ( 675) 428 81.2 3.8e-15
CCDS7158.1 MPP7 gene_id:143098|Hs108|chr10 ( 576) 407 77.7 3.5e-14
CCDS42344.1 MPP3 gene_id:4356|Hs108|chr17 ( 585) 402 76.9 6.3e-14
CCDS82135.1 MPP3 gene_id:4356|Hs108|chr17 ( 610) 402 76.9 6.5e-14
CCDS46491.1 MPP4 gene_id:58538|Hs108|chr2 ( 637) 399 76.4 9.4e-14
CCDS45600.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17 ( 721) 392 75.4 2.3e-13
CCDS82050.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17 ( 724) 392 75.4 2.3e-13
CCDS45599.1 DLG4 gene_id:1742|Hs108|chr17 ( 767) 392 75.4 2.4e-13
>>CCDS14762.1 MPP1 gene_id:4354|Hs108|chrX (466 aa)
initn: 3072 init1: 3072 opt: 3072 Z-score: 2699.4 bits: 508.8 E(32554): 4.9e-144
Smith-Waterman score: 3072; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTLKASEGESGGSMHTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MTLKASEGESGGSMHTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQSRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQSRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EAGLKFATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASMAQSAPSEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EAGLKFATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASMAQSAPSEAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ALLSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALLSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TKFETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TKFETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB5 AIRSQYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AIRSQYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
430 440 450 460
>>CCDS55544.1 MPP1 gene_id:4354|Hs108|chrX (436 aa)
initn: 2856 init1: 2856 opt: 2856 Z-score: 2511.0 bits: 473.8 E(32554): 1.5e-133
Smith-Waterman score: 2856; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (35-466:5-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 ASEGESGGSMHTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQVKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MESWAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQVKGQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQSRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQSRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KFATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASMAQSAPSEAPSCSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KFATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASMAQSAPSEAPSCSP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSEAIRS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460
pF1KB5 QYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
400 410 420 430
>>CCDS55545.1 MPP1 gene_id:4354|Hs108|chrX (446 aa)
initn: 1894 init1: 1894 opt: 1903 Z-score: 1677.5 bits: 319.6 E(32554): 4e-87
Smith-Waterman score: 2873; 95.7% identity (95.7% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTLKASEGESGGSMHTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MTLKASEGESGGSMHTALSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKGQEVRKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQSRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPNQQSRLPALQ--------------------
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EAGLKFATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASMAQSAPSEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EAGLKFATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVASMAQSAPSEAP
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKN
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ALLSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALLSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TKFETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TKFETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIAPTDQGTQTEALQQLQKDSE
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460
pF1KB5 AIRSQYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AIRSQYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
410 420 430 440
>>CCDS48094.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX (897 aa)
initn: 1531 init1: 747 opt: 1403 Z-score: 1236.2 bits: 239.0 E(32554): 1.5e-62
Smith-Waterman score: 1791; 58.1% identity (85.1% similar) in 437 aa overlap (48-466:461-897)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQVKGQEVRKVRLIQFEKV
: ::. .. ... ..: .:::.::.:
CCDS48 FMALLQTHDVVAHEVYSDEALRVTPPPTSPYLNGDSPESANGDMDMENVTRVRLVQFQKN
440 450 460 470 480 490
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 TEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAM
:.::::::::.:: . : ::::.:::::::::.::::::: :::: .:.:..:.:::: .
CCDS48 TDEPMGITLKMNELNHCIVARIMHGGMIHRQGTLHVGDEIREINGISVANQTVEQLQKML
500 510 520 530 540 550
140 150 160 170 180
pF1KB5 KETKGMISLKVIPNQQSR------LPAL------QMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLK
.: .: :..:..:. ... ::. :...::::.::: ::.::::::::..
CCDS48 REMRGSITFKIVPSYRTQSSSCEDLPSTTQPKGRQIYVRAQFEYDPAKDDLIPCKEAGIR
560 570 580 590 600 610
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVA--SMAQSAPSEAPSCS
: .:::::::.::: :::::..:.:.. .::::::::::::::: .: .. . ::.
CCDS48 FRVGDIIQIISKDDHNWWQGKLENSKNGTAGLIPSPELQEWRVACIAMEKTKQEQQASCT
620 630 640 650 660 670
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PFGKKKK-YKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNAL
:::::: :::::::::...:::::.:.:::::.:::::::::::.:: :::: ::::.:
CCDS48 WFGKKKKQYKDKYLAKHNAVFDQLDLVTYEEVVKLPAFKRKTLVLLGAHGVGRRHIKNTL
680 690 700 710 720 730
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFGTK
....:..:.::.:.:::::.:.::.::.:.:.: ..: ..:: ::.::.::.. :.:::
CCDS48 ITKHPDRFAYPIPHTTRPPKKDEENGKNYYFVSHDQMMQDISNNEYLEYGSHEDAMYGTK
740 750 760 770 780 790
370 380 390 400 410
pF1KB5 FETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIA-PT-DQG-TQTEALQQLQKDS
.::...::.:. :::::.:::.::..::::..::.:::: :: : .. :.::.:::.:
CCDS48 LETIRKIHEQGLIAILDVEPQALKVLRTAEFAPFVVFIAAPTITPGLNEDESLQRLQKES
800 810 820 830 840 850
420 430 440 450 460
pF1KB5 EAIRSQYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
. .. :::::::...:: .:::...:.:: . .:..::::::::::
CCDS48 DILQRTYAHYFDLTIINNEIDETIRHLEEAVELVCTAPQWVPVSWVY
860 870 880 890
>>CCDS48095.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX (898 aa)
initn: 1478 init1: 631 opt: 1353 Z-score: 1192.5 bits: 230.9 E(32554): 4.2e-60
Smith-Waterman score: 1739; 57.2% identity (84.0% similar) in 437 aa overlap (48-466:467-898)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQVKGQEVRKVRLIQFEKV
: ::. .. ... ..: .:::.::.:
CCDS48 FMALLQTHDVVAHEVYSDEALRVTPPPTSPYLNGDSPESANGDMDMENVTRVRLVQFQKN
440 450 460 470 480 490
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 TEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAM
:.::::::::.:: . : ::::.:::::::::.::::::: :::: .:.:..:.:::: .
CCDS48 TDEPMGITLKMNELNHCIVARIMHGGMIHRQGTLHVGDEIREINGISVANQTVEQLQKML
500 510 520 530 540 550
140 150 160 170 180
pF1KB5 KETKGMISLKVIPNQQSR------LPAL------QMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLK
.: .: :..:..:. ... ::. :...::::.::: ::.::::::::..
CCDS48 REMRGSITFKIVPSYRTQSSSCEDLPSTTQPKGRQIYVRAQFEYDPAKDDLIPCKEAGIR
560 570 580 590 600 610
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPELQEWRVA--SMAQSAPSEAPSCS
: .:::::::.::: :::::..:.:.. .::::::::::::::: .: .. . ::.
CCDS48 FRVGDIIQIISKDDHNWWQGKLENSKNGTAGLIPSPELQEWRVACIAMEKTKQEQQASCT
620 630 640 650 660 670
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PFGKKKK-YKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTLVLIGASGVGRSHIKNAL
:::::: :::::::::.. :.:.:::::.:::::::::::.:: :::: ::::.:
CCDS48 WFGKKKKQYKDKYLAKHNA-----DLVTYEEVVKLPAFKRKTLVLLGAHGVGRRHIKNTL
680 690 700 710 720 730
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISANEFLEFGSYQGNMFGTK
....:..:.::.:.:::::.:.::.::.:.:.: ..: ..:: ::.::.::.. :.:::
CCDS48 ITKHPDRFAYPIPHTTRPPKKDEENGKNYYFVSHDQMMQDISNNEYLEYGSHEDAMYGTK
740 750 760 770 780 790
370 380 390 400 410
pF1KB5 FETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFIA-PT-DQG-TQTEALQQLQKDS
.::...::.:. :::::.:::.::..::::..::.:::: :: : .. :.::.:::.:
CCDS48 LETIRKIHEQGLIAILDVEPQALKVLRTAEFAPFVVFIAAPTITPGLNEDESLQRLQKES
800 810 820 830 840 850
420 430 440 450 460
pF1KB5 EAIRSQYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQEAFDQACSSPQWVPVSWVY
. .. :::::::...:: .:::...:.:: . .:..::::::::::
CCDS48 DILQRTYAHYFDLTIINNEIDETIRHLEEAVELVCTAPQWVPVSWVY
860 870 880 890
>>CCDS14257.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX (921 aa)
initn: 1485 init1: 631 opt: 1351 Z-score: 1190.6 bits: 230.6 E(32554): 5.4e-60
Smith-Waterman score: 1696; 54.8% identity (79.6% similar) in 460 aa overlap (48-466:467-921)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LSDLYLEHLLQKRSRPEAVSHPLNTVTEDMYTNGSPAPGSPAQVKGQEVRKVRLIQFEKV
: ::. .. ... ..: .:::.::.:
CCDS14 FMALLQTHDVVAHEVYSDEALRVTPPPTSPYLNGDSPESANGDMDMENVTRVRLVQFQKN
440 450 460 470 480 490
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 TEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGSLHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAM
:.::::::::.:: . : ::::.:::::::::.::::::: :::: .:.:..:.:::: .
CCDS14 TDEPMGITLKMNELNHCIVARIMHGGMIHRQGTLHVGDEIREINGISVANQTVEQLQKML
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140 150 160
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.: .: :..:..: :. : ::. :..
CCDS14 REMRGSITFKIVPSYRTQSSSCERDSPSTSRQSPANGHSSTNNSVSDLPSTTQPKGRQIY
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pF1KB5 MRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFATGDIIQIINKDDSNWWQGRVEGSSKESAGLIPSPE
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CCDS14 VRAQFEYDPAKDDLIPCKEAGIRFRVGDIIQIISKDDHNWWQGKLENSKNGTAGLIPSPE
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CCDS14 LQEWRVACIAMEKTKQEQQASCTWFGKKKKQYKDKYLAKHNA-----DLVTYEEVVKLPA
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pF1KB5 FKRKTLVLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEM
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CCDS14 FKRKTLVLLGAHGVGRRHIKNTLITKHPDRFAYPIPHTTRPPKKDEENGKNYYFVSHDQM
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pF1KB5 TRNISANEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVF
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CCDS14 MQDISNNEYLEYGSHEDAMYGTKLETIRKIHEQGLIAILDVEPQALKVLRTAEFAPFVVF
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CCDS14 IAAPTITPGLNEDESLQRLQKESDILQRTYAHYFDLTIINNEIDETIRHLEEAVELVCTA
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460
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CCDS14 PQWVPVSWVY
920
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80 90 100 110 120 130
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CCDS53 KRAGEPLGVTFRV-ENNDLVIARILHGGMIDRQGLLHVGDIIKEVNGHEVGNNP-KELQE
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140 150 160 170 180 190
pF1KB5 AMKETKGMISLKVIPNQQSRLPALQMFMRAQFDYDPKKDNLIPCKEAGLKFATGDIIQII
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CCDS53 LLKNISGSVTLKILPSYRDTITPQQVFVKCHFDYNPYNDNLIPCKEAGLKFSKGEILQIV
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200 210 220 230 240 250
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CCDS53 NREDPNWWQASHVKEGGS---AGLIPSQFLEEKRKAFVRRDWDNSGPFCGTISSKKKKKM
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260 270 280 290 300 310
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CCDS53 MYLTTRNAEFDRHEIQIYEEVAKMPPFQRKTLVLIGAQGVGRRSLKNRFIVLNPTRFGTT
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CCDS53 VPFTSRKPREDEKDGQAYKFVSRSEMEADIKAGKYLEHGEYEGNLYGTKIDSILEVVQTG
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CCDS53 RTCILDVNPQALKVLRTSEFMPYVVFIAAPELETLRAMHKAVVDAGITTKLLTDSDLKKT
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CCDS53 VDESARIQRAYNHYFDLIIINDNLDKAFEKLQTAIEKLRMEPQWVPISWVY
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120 130 140 150 160
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230 240 250 260 270 280
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290 300 310 320 330 340
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350 360 370 380 390 400
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...:: : :.::..::...... . .:. .::..::..:..::::. :..::: ::
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410 420 430 440
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CCDS62 TAMEKLRTEPQWVPVSWVY
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pF1KB5 PAPGSPAQVKGQEV--RKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGS
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CCDS11 PSPGLDPTFSNQPVPPDAVRMVGIRKTAGEHLGVTFRV-EGGELVIARILHGGMVAQQGL
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CCDS11 ETLRAMNRAALESGISTKQLTEADLRRTVEESSRIQRGYGHYFDLCLVNSNLERTFRELQ
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CCDS11 TAMEKLRTEPQWVPVSWVY
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CCDS62 EAVRDNNLELVQEILRDLAQLAEQSSTAAELAHILQE-PHFQSLLETHDSVASKTYETPP
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pF1KB5 PAPGSPAQVKGQEV--RKVRLIQFEKVTEEPMGITLKLNEKQSCTVARILHGGMIHRQGS
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CCDS62 PSPGLDPTFSNQPVPPDAVRMVGIRKTAGEHLGVTFRV-EGGELVIARILHGGMVAQQGL
140 150 160 170 180 190
120 130 140 150 160
pF1KB5 LHVGDEILEINGTNVTNHSVDQLQKAMKETKGMISLKVIPN-QQSRLPALQMFMRAQFDY
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CCDS62 LHVGDIIKEVNGQPVGSDP-RALQELLRNASGSVILKILPSYQEPHLPR-QVFVKCHFDY
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 DPKKDNLIPCKEAGLKFATGDIIQIINKDDSNWWQG-RVEGSSKESAGLIPSPELQEWRV
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CCDS62 DPARDSLIPCKEAGLRFNAGDLLQIVNQDDANWWQACHVEGGS---AGLIPSQLLEEKRK
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 ASMAQS---APSEAPSCSPFGKKKKYKDKYLAKHSSIFDQLDVVSYEEVVRLPAFKRKTL
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CCDS62 AFVKRDLELTPNSGTLCGSLSGKKKKRMMYLTTKNAEFDRHELLIYEEVARMPPFRRKTL
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VLIGASGVGRSHIKNALLSQNPEKFVYPVPYTTRPPRKSEEDGKEYHFISTEEMTRNISA
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CCDS62 VLIGAQGVGRRSLKNKLIMWDPDRYGTTVPYTSRRPKDSEREGQGYSFVSRGEMEADVRA
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 NEFLEFGSYQGNMFGTKFETVHQIHKQNKIAILDIEPQTLKIVRTAELSPFIVFI-APT-
...:: : :.::..::...... . .:. .::..::..:..::::. :..::: ::
CCDS62 GRYLEHGEYEGNLYGTRIDSIRGVVAAGKVCVLDVNPQAVKVLRTAEFVPYVVFIEAPDF
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440
pF1KB5 -----------DQGTQTEALQQ--LQK---DSEAIRSQYAHYFDLSLVNNGVDETLKKLQ
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CCDS62 ETLRAMNRAALESGISTKQLTEADLRRTVEESSRIQRGYGHYFDLCLVNSNLERTFRELQ
500 510 520 530 540 550
450 460
pF1KB5 EAFDQACSSPQWVPVSWVY
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CCDS62 TAMEKLRTEPQWVPVSWVY
560
466 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:34:23 2016 done: Fri Nov 4 03:34:24 2016
Total Scan time: 3.210 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]