Result of FASTA (omim) for
pF1KB5346
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5346, 618 aa
1>>>pF1KB5346 618 - 618 aa - 618 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6366+/-0.000484; mu= -1.9433+/- 0.030
mean_var=229.7505+/-46.403, 0's: 0 Z-trim(115.7): 25 B-trim: 41 in 1/53
Lambda= 0.084615
statistics sampled from 26318 (26339) to 26318 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 10.630
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001123579 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 ( 618) 4011 503.4 9.5e-142
NP_891553 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 iso ( 573) 3600 453.2 1.1e-126
NP_005543 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 iso ( 560) 3590 452.0 2.6e-126
XP_005274241 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kine ( 600) 2614 332.8 2e-90
NP_001305663 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_073733 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chai ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_001128248 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
XP_005274240 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kine ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_001128247 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_001128246 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 545) 2055 264.6 6.5e-70
NP_803136 (OMIM: 601334) kinesin light chain 3 [Ho ( 504) 1691 220.1 1.5e-56
XP_016873622 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kine ( 425) 1576 206.0 2.1e-52
NP_694972 (OMIM: 208540,267010,604387,608002) neph (1330) 464 70.6 3.9e-11
>>NP_001123579 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 isof (618 aa)
initn: 4011 init1: 4011 opt: 4011 Z-score: 2665.8 bits: 503.4 E(85289): 9.5e-142
Smith-Waterman score: 4011; 100.0% identity (100.0% similar) in 618 aa overlap (1-618:1-618)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN
::::::::::::::::::
NP_001 LFVENDSSSSGLEDATAN
610
>>NP_891553 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 isoform (573 aa)
initn: 3600 init1: 3600 opt: 3600 Z-score: 2395.1 bits: 453.2 E(85289): 1.1e-126
Smith-Waterman score: 3600; 97.0% identity (98.1% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
:::::::::: .: . :. .. . ::
NP_891 EVSMSVEWNGGVSGRASFCGKRQQQQWPGRRHR
550 560 570
610
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN
>>NP_005543 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 isoform (560 aa)
initn: 3590 init1: 3590 opt: 3590 Z-score: 2388.7 bits: 452.0 E(85289): 2.6e-126
Smith-Waterman score: 3590; 100.0% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
::::::::::
NP_005 EVSMSVEWNGMRKMKLGLVN
550 560
>>XP_005274241 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kinesin (600 aa)
initn: 2552 init1: 1778 opt: 2614 Z-score: 1744.3 bits: 332.8 E(85289): 2e-90
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
:. ::. .: :::.::::. :: ::::::.:..:: ..: :. . .
XP_005 MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
.:. ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
XP_005 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
:.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.: : :. :::::
XP_005 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
:: ::..:. . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
XP_005 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
XP_005 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
:::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
XP_005 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
. .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
XP_005 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
.:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.: . ..: ::. . . ::
XP_005 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
:.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. . :: :: .
XP_005 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
530 540 550 560 570
600 610
pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
: : : :
XP_005 ASSLNFLNKSVEEPTQQGPLP
580 590 600
>>NP_001305663 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chain (622 aa)
initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614 Z-score: 1744.1 bits: 332.8 E(85289): 2.1e-90
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
:. ::. .: :::.::::. :: ::::::.:..:: ..: :. . .
NP_001 MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
.:. ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
NP_001 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
:.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.: : :. :::::
NP_001 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
:: ::..:. . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
NP_001 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
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: : : :
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
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NP_001 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
: : : :
XP_005 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
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>>NP_001128247 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chain (622 aa)
initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614 Z-score: 1744.1 bits: 332.8 E(85289): 2.1e-90
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)
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NP_001 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
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NP_001 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
.:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.: . ..: ::. . . ::
NP_001 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
470 480 490 500 510 520
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pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
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NP_001 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
530 540 550 560 570
600 610
pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
: : : :
NP_001 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
580 590 600 610 620
>>NP_001128246 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chain (545 aa)
initn: 2147 init1: 1778 opt: 2055 Z-score: 1376.1 bits: 264.6 E(85289): 6.5e-70
Smith-Waterman score: 2073; 59.6% identity (73.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-512)
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pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
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NP_001 ----------------------EEKG-----------------------DVPKDTLDDLF
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NP_001 PNEDEQSPA----PSPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
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NP_001 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
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NP_001 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
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NP_001 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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NP_001 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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NP_001 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
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: : : :
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