FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5369, 524 aa 1>>>pF1KB5369 524 - 524 aa - 524 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4599+/-0.00045; mu= 17.2889+/- 0.028 mean_var=65.8646+/-13.318, 0's: 0 Z-trim(110.1): 34 B-trim: 493 in 1/52 Lambda= 0.158033 statistics sampled from 18404 (18413) to 18404 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16 Scan time: 8.660 The best scores are: opt bits E(85289) XP_006710609 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) P ( 524) 3489 804.8 0 XP_005245875 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) P ( 524) 3489 804.8 0 NP_000469 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) alka ( 524) 3489 804.8 0 NP_001120973 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) a ( 469) 3135 724.1 2.2e-208 XP_016856392 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) P ( 472) 3018 697.4 2.4e-200 NP_001170991 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) a ( 447) 2845 658.0 1.7e-188 NP_001622 (OMIM: 171740) intestinal-type alkaline ( 528) 1902 443.0 1e-123 NP_112603 (OMIM: 171810) alkaline phosphatase, pla ( 532) 1890 440.3 6.9e-123 NP_001623 (OMIM: 171800) alkaline phosphatase, pla ( 535) 1854 432.1 2e-120 >>XP_006710609 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) PREDI (524 aa) initn: 3489 init1: 3489 opt: 3489 Z-score: 4297.6 bits: 804.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3489; 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99.8% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (100-524:23-447) 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 ARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVG :::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MPWSFRSSTPTWLRMSSCSWEMTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVG 10 20 30 40 50 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 VSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSD ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VSAATERSRCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSD 60 70 80 90 100 110 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 NEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDEKARGTRLDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDEKARGTRLDG 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 LDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNVTDPSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELLTLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNVTDPSL 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 SEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIGQAGSLTSSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIGQAGSLTSSE 240 250 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 DTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERE 300 310 320 330 340 350 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 NVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAAC 360 370 380 390 400 410 490 500 510 520 pF1KB5 IGANLGHCAPASSAGSLAAGPLLLALALYPLSVLF ::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 IGANLGHCAPASSAGSLAAGPLLLALALYPLSVLF 420 430 440 >>NP_001622 (OMIM: 171740) intestinal-type alkaline phos (528 aa) initn: 1298 init1: 715 opt: 1902 Z-score: 2342.1 bits: 443.0 E(85289): 1e-123 Smith-Waterman score: 1902; 56.1% identity (79.2% similar) in 529 aa overlap (1-524:1-521) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MISPFLVLAIGTCLTNSL--VPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFL : .:...: .: : :: .: .:..: .: :: :.: : .:: .. .::::.:.:: NP_001 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQ-KVAKNLILFL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYL :::.:: ::::.:::::: . . : :: : ::.::..:::::::.. ::::::.:::::: NP_001 GDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 CGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAY :::::: :.:.:::.. ..::::.:::: :... ::.::::::.::::::.::.:...: NP_001 CGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 AHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYES ::...:.:::: .:: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::.: . : :: . NP_001 AHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 DEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQ : . : :::: .::. : . ... . ..::::::. .:: ..: .:.::::::: . NP_001 DASQNGIRLDGKNLVQEWLA---KHQGAWYVWNRTELMQASLD-QSVTHLMGLFEPGDTK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 YELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMD ::..:. . :::: ::. .:...: .::.::.:.::::::::::::: : ::: ::: .: NP_001 YEIHRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 RAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYG :: .::.::: :::::.:::::::::.::::: ::.::::::: .. :.: .:.:::: NP_001 DAIERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQ-DSKAYTSILYG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 NGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHE ::::: .: : .:. . . .:: :.:::: :::::::::::..::.:::.:::.: NP_001 NGPGYVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 QNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSL-AAGPLLLALALYPLSVLF :..: ::::.:::. . : : : . :: :. .: : ..:. NP_001 QSFVAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP 480 490 500 510 520 >>NP_112603 (OMIM: 171810) alkaline phosphatase, placent (532 aa) initn: 1728 init1: 705 opt: 1890 Z-score: 2327.2 bits: 440.3 E(85289): 6.9e-123 Smith-Waterman score: 1890; 56.0% identity (79.5% similar) in 527 aa overlap (1-520:1-518) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MISPFLVLAIGTCLTNSL--VPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFL : .:...: .: : :: .: .:..: .: :: :.: : .:: .: .:::.:.:: NP_112 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNRQAAEALGAAKKLQPAQT-AAKNLIIFL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYL :::::::::::::::::: . . : :: : ::.::.:::::::... .::::..:::::: NP_112 GDGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPETFLAMDRFPYVALSKTYSVDKHVPDSGATATAYL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 CGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAY ::::.: :.:.:::.. ..::::.:::: :... :: ::::::.::::::.::.:..:: NP_112 CGVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAGAY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 AHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYES ::...:.:::: ..: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::.: . : :: . NP_112 AHTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 DEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQ : . :::::: .::. : . ... ....::::::: .::: .: .:.::::::::. NP_112 DYSQGGTRLDGKNLVQEWLA---KHQGARYVWNRTELLQASLDP-SVTHLMGLFEPGDMK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 YELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMD ::..:... :::: ::. .:. .: .::.::::.::::::::::::..: .:: :.. .: NP_112 YEIHRDSTLDPSLMEMTEAALLLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 RAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYG :: .::.::: ::::..:::::::::.:::: ::.::::::: . :.: .:..::: NP_112 DAIERAGQLTSEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYPLRGSSIFGLAPG-KARDRKAYTVLLYG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 NGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHE ::::: . : : .:. . . .:. :::::: :::.:::::::..::.:::.:::.: NP_112 NGPGYVLKDGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDGETHAGEDVAVFARGPQAHLVHGVQE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 QNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSLAA---GPLLLALALYPLSVLF :... ::::.:::. . : : ::. : :: .. :: :: NP_112 QTFIAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPRAGTTDAAHPGPSVVP-ALLPLLAGTLLLLGTATA 480 490 500 510 520 530 NP_112 P >>NP_001623 (OMIM: 171800) alkaline phosphatase, placent (535 aa) initn: 1762 init1: 700 opt: 1854 Z-score: 2282.8 bits: 432.1 E(85289): 2e-120 Smith-Waterman score: 1854; 55.0% identity (79.8% similar) in 524 aa overlap (1-520:6-521) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MISPFLVLAIGTCLTNSLVPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVI :. .:.:.. :. ...: .:..: .: .: :.: : .:: .: .:::.: NP_001 MLGPCMLLLLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNREAAEALGAAKKLQPAQT-AAKNLI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 MFLGDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTAT .:::::::::::::::::::: . . : : : ::.::.::::::::.. .::::..::: NP_001 IFLGDGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPEIPLAMDRFPYVALSKTYNVDKHVPDSGATAT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AYLCGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILHWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPS :::::::.: :.:.:::.. ..::::.:::: :... :: ::::::.::::::.::.:. NP_001 AYLCGVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 AAYAHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVE ..:::...:.:::: ..: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::. . : : NP_001 GTYAHTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFRMGTPDPE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 YESDEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPG : .: . :::::: .::. : . . . ....::::::. .::: .: .:.:::::: NP_001 YPDDYSQGGTRLDGKNLVQEWLA---KRQGARYVWNRTELMQASLDP-SVTHLMGLFEPG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 DMQYELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAV ::.::..:... :::: ::. .:...: .::.::::.::::::::::::..: .:: :.. NP_001 DMKYEIHRDSTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 EMDRAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAI .: :: .::.::: ::::..:::::::::.:::: ::.::::::: . :.: .:.. NP_001 MFDDAIERAGQLTSEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYPLRGSSIFGLAPG-KARDRKAYTVL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 LYGNGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHG :::::::: . : : .:. . . .:. :::::: .:::.:::::::..::.:::.:: NP_001 LYGNGPGYVLKDGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDEETHAGEDVAVFARGPQAHLVHG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 VHEQNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSL-AAGPLLLAL-ALYPLSVLF :.::... ::::.:::. . : : ::. :: : .. :: :: NP_001 VQEQTFIAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPPAGTTDAAHPGRSVVPALLPLLAGTLLLLETA 480 490 500 510 520 530 NP_001 TAP 524 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 23:51:45 2016 done: Fri Nov 4 23:51:46 2016 Total Scan time: 8.660 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]