Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5383
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5383, 539 aa
1>>>pF1KB5383 539 - 539 aa - 539 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6836+/-0.00121; mu= 16.9284+/- 0.072
mean_var=73.5345+/-14.714, 0's: 0 Z-trim(101.7): 44 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.149565
statistics sampled from 6588 (6622) to 6588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 3355 733.8 1.2e-211
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 2782 610.2 1.8e-174
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 1177 263.9 3.5e-70
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 1175 263.4 4.5e-70
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 1164 261.1 2.3e-69
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 1039 234.1 3.2e-61
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 1005 226.8 5.2e-59
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 909 206.0 8.3e-53
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 874 198.5 1.7e-50
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 867 197.0 4.5e-50
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 857 194.8 1.8e-49
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 857 194.8 1.9e-49
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 843 191.8 1.7e-48
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 815 185.8 1.1e-46
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 815 185.8 1.1e-46
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 813 185.3 1.5e-46
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 805 183.6 5e-46
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 760 173.9 3.9e-43
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 715 164.2 3.1e-40
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 658 151.9 1.6e-36
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 550 128.6 1.7e-29
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 537 125.8 1.2e-28
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 532 124.6 2.1e-28
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 519 121.8 1.3e-27
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 425 101.6 2.3e-21
>>CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (539 aa)
initn: 3355 init1: 3355 opt: 3355 Z-score: 3913.4 bits: 733.8 E(32554): 1.2e-211
Smith-Waterman score: 3355; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
490 500 510 520 530
>>CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (509 aa)
initn: 2779 init1: 2779 opt: 2782 Z-score: 3245.6 bits: 610.2 E(32554): 1.8e-174
Smith-Waterman score: 3091; 94.4% identity (94.4% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ------------------------------LVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KB5 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
460 470 480 490 500
>>CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (541 aa)
initn: 1067 init1: 427 opt: 1177 Z-score: 1373.5 bits: 263.9 E(32554): 3.5e-70
Smith-Waterman score: 1177; 38.6% identity (70.5% similar) in 536 aa overlap (10-535:5-533)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRF-----SNISAAKAVADAIRTSLGPK
:. : :: .:.:. ... :.: ::::::...::::::.
CCDS38 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGS
:.:::. : ::::.::::::::..:.: : :...:::::.:: : :::::.::..::.
CCDS38 GLDKMMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPV--ELSDRETLLNSATTSLNS
::. .::..:::: :......: . .:: : .: : ...: : :...: :.:.:
CCDS38 LLEEAEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKV
:::.. .. ..::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... .
CCDS38 KVVNSCHRQMAEIAVNAVLTVAD-MERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SNSGITR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKK
:. . . :: :::... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.
CCDS38 SHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFT
:: :. . : . ..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....:
CCDS38 TGANLAICQWG-----FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELT
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 ADMLGSAELAEEVNLNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCV
:. :: : :..:.... . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.::::::
CCDS38 AEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGL
:: :.. .. :::: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.
CCDS38 IRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGM
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NPISTVTELRNRHAQGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSIL
:::.:.::.: :... . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::
CCDS38 NPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMIL
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 KIDDVVNTR
::::.
CCDS38 KIDDIRKPGESEE
530 540
>>CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 1069 init1: 429 opt: 1175 Z-score: 1371.5 bits: 263.4 E(32554): 4.5e-70
Smith-Waterman score: 1175; 39.5% identity (72.1% similar) in 509 aa overlap (32-535:11-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 PENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMI
.. :.: ::::::...::::::.:.:::.
CCDS82 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCT
: ::::.::::::::..:.: : :...:::::.:: : :::::.::..::.::.
CCDS82 VDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 KLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPV--ELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQY
.::..:::: :......: . .:: : .: : ...: : :...: :.:.::::..
CCDS82 QLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSC
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SSLLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT
.. ..::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... . :. .
CCDS82 HRQMAEIAVNAVLTVAD-MERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 R-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVL
. :: :::... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.:: :.
CCDS82 KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGS
. : . ..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....::. ::
CCDS82 ICQWG-----FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AELAEEVNLNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVK
: :..:.... . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.:::::::: :..
CCDS82 AGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTV
.. :::: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.:::.:.
CCDS82 DNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTM
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TELRNRHAQGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
::.: :... . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::::::.
CCDS82 TEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIR
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 NTR
CCDS82 KPGESEE
520
>>CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (503 aa)
initn: 1058 init1: 423 opt: 1164 Z-score: 1358.8 bits: 261.1 E(32554): 2.3e-69
Smith-Waterman score: 1164; 39.7% identity (72.3% similar) in 501 aa overlap (40-535:2-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 GATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVT
::::::...::::::.:.:::. : ::::
CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQKGIH
.::::::::..:.: : :...:::::.:: : :::::.::..::.::. .::..:::
CCDS77 VTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPV--ELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMS
: :......: . .:: : .: : ...: : :...: :.:.::::.. .. ..
CCDS77 PIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR-VEKAKI
::::. : : .::.. ::. :.:: ..: .:..:... . :. . . :: :::
CCDS77 VNAVLTVAD-MERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILR
... . :: ... :.. .. . . :. . ....:::.:: :. . : .
CCDS77 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWG---
220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVN
..: : :.: . .. ... . .::.: . : . : .....::. :: : :..:..
CCDS77 --FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEIS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LNGS-GKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRALIAGG
.. . :.: : : . ...::: .::.::..::::.::.:::::::: :.. .. ::
CCDS77 FGTTKDKMLVIEQCKN-SRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGG
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHA
:: :: :: ... . .:.: .::::::.:::: .:.::.:.:::.:.::.: :..
CCDS77 GAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQV
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530
pF1KB5 QGEKTA-GINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNTR
. . : ::. . : ... .. :.. :. . . ..:::. :: ::::::.
CCDS77 KEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
450 460 470 480 490 500
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10 20 30 40 50 60
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:.. ... .::.:::..:: ::: ::::.: ::
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10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
. : : ...:::: .::...:: ::::. ..:.:..:: :.:::::::.:.:: .:.
CCDS11 LLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVA
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130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
..:.. .:::.. ...:::. : : .: ::..:: . .:: ..:...:..:..:
CCDS11 EHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWS
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pF1KB5 SLLSPMSVNAVMKV-IDPATATSVDLRDIKIVKKL-GGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGI
:: ....:: : .. .:.. :.:. :: :.: ...:..... :.. .
CCDS11 SLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRM
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pF1KB5 TR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNV
: ... .: :.. : : . ...: .. .. :.:. :. :: .: ..: . .:
CCDS11 RRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV
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pF1KB5 LLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLG
.. .:.: :::: :.: . .: .:. ... : . : .. :.. :.. ... : .:
CCDS11 VITEKGI-----SDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVG
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pF1KB5 SAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVK
.. :.. :. . :: : .: :. ::..::..: .. :.::...::. : : ..
CCDS11 TGAGLLEIKKIGDEYFTFITDCKDP-KACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLL
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pF1KB5 KRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTV
:. :::: :. .: ::: :....:.:.. :: :.:.:::: :: .: : . : .
CCDS11 DPQLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLL
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pF1KB5 TELRNRHAQGE-KTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
: :: .:.: . .: :.: . : . .. : . .:: :.... :.::. .:.:::.:
CCDS11 TSLRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIV
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 NTR
.
CCDS11 SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
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10 20 30 40 50 60
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::::: ...:.:.::.:::.::::.: ::.
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pF1KB5 GDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQ
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CCDS46 GKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVE
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pF1KB5 KGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSD----RETLLNSATTSLNSKVVSQYSS
.:.:: :: ..:. : . ... . ... :. .: :. : . : :.:.::..:: ..
CCDS46 EGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKA
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pF1KB5 LLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT--
... : :.::: . : ..:. : : : ::...: .:: :... . : .:.
CCDS46 FFAKMVVDAVMMLDD-----LLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQ
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pF1KB5 --RVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDN-QIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCN
. .. ::.:.. : :.. :: .: : ... .. : . . ...:...: .
CCDS46 PKKYHNPKIALLNVELEL-KAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 VLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADML
:.: . : .:.: ... .. . .::.. . : . . .. ..::.:
CCDS46 VVLSKLPI-----GDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVL
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pF1KB5 GSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLV
: .. ::....: . .::: . .:: :...::. . .::.:::.:::. ..: .
CCDS46 GRCQVFEETQIGGE-RYNFFTGCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAI
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pF1KB5 KKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPIST
:. ...::::: :.::. : .::::. : .. . :.: :.:.:: : .:::.. .
CCDS46 KNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNI
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pF1KB5 VTELRNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
...:: ::::: :... . :.. .: .: .: .: ..::: :.:.. :...:...
CCDS46 LNKLRARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETI
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 -NTR
: :
CCDS46 KNPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
530 540
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CCDS54 MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
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pF1KB5 AARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIE
::. ::...:.:: :.:::::::...:. .: . ...:.:: :: ..:. : . ...
CCDS54 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 ILTDMSRPVELSD----RETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMKVIDPATATS
. ... :. .: :. : . : :.:.::..:: ..... : :.::: . :
CCDS54 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLDD-----L
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pF1KB5 VDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT----RVEKAKIGLIQFCLSAPKT
..:. : : : ::...: .:: :... . : .:. . .. ::.:.. : :.
CCDS54 LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELEL-KA
150 160 170 180 190 200
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pF1KB5 DMDN-QIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFL
. :: .: : ... .. : . . ...:...: .:.: . : .:.: ...
CCDS54 EKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPI-----GDVATQYF
210 220 230 240 250
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pF1KB5 NKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKIT
.. . .::.. . : . . .. ..::.:: .. ::....: . .:
CCDS54 ADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGE-RYNFFT
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pF1KB5 GCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLT
:: . .:: :...::. . .::.:::.:::. ..: .:. ...::::: :.::. :
CCDS54 GCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLR
320 330 340 350 360 370
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pF1KB5 EYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGEKTAGINVRK
.::::. : .. . :.: :.:.:: : .:::.. . ...:: ::::: :... .
CCDS54 DYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGTWYGVDINN
380 390 400 410 420 430
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pF1KB5 GGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV-NTR
:.. .: .: .: .: ..::: :.:.. :...:... : :
CCDS54 EDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRGR
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CCDS54 PH
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pF1KB5 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
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CCDS52 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKM
10 20 30 40
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pF1KB5 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
. : :::::::::::::: ..: ::::..: ::. :: :.:::::::::::. :: .
CCDS52 LVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNA
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pF1KB5 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTD--MSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQ
.:... :::: . ... : ..... ... . ::. :. :.:.: ::..::...
CCDS52 DELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYINENLIVNTDELG-RDCLINAAKTSMSSKIIGI
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pF1KB5 YSSLLSPMSVNAVM--KVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNS
..... : :.::. : : . ...:.: : . . :. : .:. :...
CCDS52 NGDFFANMVVDAVLAIKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQ
170 180 190 200 210 220
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pF1KB5 GIT-RVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGC
:. :. .:::. ..: :. : . :.:..: ..:.. ..: . ...: ::
CCDS52 GMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGA
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 NVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHI------D
::.: .: .:. :... . :... . ..:.. : :. :. .. . .
CCDS52 NVILTTGGI-----DDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEE
290 300 310 320 330
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pF1KB5 QFTADMLGSAE-LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDA
: : :::.:: ...: . :.: : . ...:..::.: .. .: :::.:::
CCDS52 TFEAAMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKART---SASIILRGANDFMCDEMERSLHDA
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pF1KB5 LCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAEN
:::.. ........ :::: : :.. : .:. .... :. . :: .. :::.::: :
CCDS52 LCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVN
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pF1KB5 AGLNPISTVTELRNRHAQGE--------KTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALT
:. . . :..:: : ... : :... .: . . : .: .:.:..:
CCDS52 AAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLK
460 470 480 490 500 510
530
pF1KB5 LATETVRSILKIDDVVNTR
.:::.. .::.:::..
CCDS52 FATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGSYEDAVHSGALND
520 530 540 550
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pF1KB5 TSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSV
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CCDS30 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSV
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pF1KB5 VIIAGSLLDSCTKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATT
.:.:: .:. ..:.. .:::.. ...:::. : : .: ::..:: . .:: ..
CCDS30 IILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINS
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pF1KB5 SLNSKVVSQYSSLLSPMSVNAVMKV-IDPATATSVDLRDIKIVKKL-GGTIDDCELVEGL
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CCDS30 SITTKAISRWSSLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGV
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pF1KB5 VLTQKVSNSGITR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNL
.... :.. . : ... .: :.. : : . ...: .. .. :.:. :. :: .:
CCDS30 MINKDVTHPRMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQL
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pF1KB5 VKQIKKTGCNVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVA
..: . .:.. .:.: :::: :.: . .: .:. ... : . : .. :.. :.
CCDS30 CEDIIQLKPDVVITEKGI-----SDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVS
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pF1KB5 HIDQFTADMLGSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIH
. ... : .:.. :.. :. . :: : .: :. ::..::..: .. :.::...
CCDS30 RPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYFTFITDCKDP-KACTILLRGASKEILSEVERNLQ
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pF1KB5 DALCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLA
::. : : .. :. :::: :. .: ::: :....:.:.. :: :.:.:::: ::
CCDS30 DAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLI
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pF1KB5 ENAGLNPISTVTELRNRHAQGE-KTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATET
.: : . : .: :: .:.: . .: :.: . : . .. : . .:: :.... :.::
CCDS30 QNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVET
420 430 440 450 460 470
530
pF1KB5 VRSILKIDDVVNTR
. .:.:::.:.
CCDS30 AVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
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539 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]