Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5387
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5387, 543 aa
1>>>pF1KB5387 543 - 543 aa - 543 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2684+/-0.00099; mu= 18.8039+/- 0.060
mean_var=67.6596+/-13.009, 0's: 0 Z-trim(104.7): 23 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155923
statistics sampled from 8008 (8026) to 8008 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 543) 3538 805.2 0
CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 719) 3538 805.3 0
CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 ( 734) 981 230.1 7.1e-60
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CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 818) 949 222.9 1.1e-57
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CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 ( 904) 932 219.1 1.8e-56
CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143) 906 213.3 1.2e-54
CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 ( 821) 894 210.5 6.1e-54
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CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 840) 624 149.8 1.2e-35
CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 880) 559 135.2 3.1e-31
CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 793) 461 113.1 1.2e-24
CCDS5121.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 ( 391) 359 90.0 5.6e-18
>>CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (543 aa)
initn: 3538 init1: 3538 opt: 3538 Z-score: 4299.0 bits: 805.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3538; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRI
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TFV
:::
CCDS56 TFV
>>CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (719 aa)
initn: 3538 init1: 3538 opt: 3538 Z-score: 4297.2 bits: 805.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3538; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:177-719)
10 20 30
pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RVIREVRADSVGKLVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 PGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQ
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 IAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IAEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRGMKIRGNINICLMGDPGVA
330 340 350 360 370 380
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 KSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDE
390 400 410 420 430 440
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 FDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQ
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 LPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPLDMKLMRRYIAMC
510 520 530 540 550 560
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 REKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 REKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVE
570 580 590 600 610 620
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 KEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVS
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520 530 540
pF1KB5 RGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV
690 700 710
>>CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 (734 aa)
initn: 863 init1: 602 opt: 981 Z-score: 1188.4 bits: 230.1 E(32554): 7.1e-60
Smith-Waterman score: 992; 37.0% identity (65.9% similar) in 481 aa overlap (8-464:172-647)
10 20 30
pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQT
: .: . . : . . : ..:.:
CCDS13 SDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYAL-P-RKCNT
150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 NRSG------GRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQP
...: ... . . :: .:.:: : :: :..:: . . . . :
CCDS13 DQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVP
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140
pF1KB5 GDHVSVTGIFLPILRTGF-----RQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELT--
:..:.. ::. : . :. :. : . .:... : ... . . .: :: ..
CCDS13 GNRVTIMGIY-SIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGI-QVDTDGSGRSFAGAVSPQ
260 270 280 290 300 310
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 -REELRQIAE-EDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQS-PRGMKIRGNINI
.::.:..: . :: .. :::: :.: :.:::. :: :: . : :. ::.::.
CCDS13 EEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINL
320 330 340 350 360 370
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 CLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLA
..::::.::::::..... .: . ::.:.:::..::::.:.:: : .. .::::.:::
CCDS13 LMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLA
380 390 400 410 420 430
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 DQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNP
: :: :::::::: : ::.::::.::::::::::::: ::::.:::.::::: ..::..
CCDS13 DGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDE
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 RRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFE-PLDM
.. :.::.. ..:::::......:. ... :. ::.:. .: . . : .:.
CCDS13 TKG-EDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDL
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430
pF1KB5 KLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREA-WASKDATYTSA-----RTLLAI
....::.:: : : . :. . :. :: : .:. :. : : ::
CCDS13 AKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAI
560 570 580 590 600 610
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 LRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELV
.:.. ::..... . . ::.::.::...:
CCDS13 VRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIE
620 630 640 650 660 670
500 510 520 530 540
pF1KB5 SGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV
CCDS13 KQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
680 690 700 710 720 730
>>CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 (863 aa)
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Smith-Waterman score: 1079; 38.4% identity (68.3% similar) in 542 aa overlap (1-524:299-826)
10 20 30
pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC
: : . :. :. : .. . .:
CCDS61 KNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVC
270 280 290 300 310 320
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ
.:.:..: . : : : : .:.:: ...:.:. :... ...... . .:
CCDS61 --GRCHTTHS---MALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQ
330 340 350 360 370 380
100 110 120 130 140
pF1KB5 PGDHVSVTGIFLPI-LRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSED---DESGAGELTRE
:::.:.::::. . .:.. : . .:.... . : . .. :: . .: :
CCDS61 PGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHYRKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSE
390 400 410 420 430 440
150 160 170 180 190
pF1KB5 E----LRQIAEE-DFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGV--DQSPRGM-KIRGN
. :...... :.::.::...:: :: :::.::..:: : ::. : : : :.:..
CCDS61 KRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAE
450 460 470 480 490 500
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 INICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGAL
::: : ::::..:::::.:. :.::.:::.:.:::.::::: :..: . .:.:. :::
CCDS61 INILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGAL
510 520 530 540 550 560
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGR
::.:.:.::::::::: :. :...::::::::.:::::::. :::: :.:::::: ..
CCDS61 VLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQ
570 580 590 600 610 620
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 YNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPL
.::... .::::: .:::::::..:. : :. : :::.:.. .. .:.. .. : :
CCDS61 WNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLLLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQ-AEEELL
630 640 650 660 670 680
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 DMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLS
:: ... :::. . .: . : .. . :::.::. .:. . . : : ...::.
CCDS61 DMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRK-IGSSRGMVSAYPRQLESLIRLA
690 700 710 720 730 740
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 TALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA--DV-IFATVRELVS
: :..:. . :: ::.:: :: ...: :.: : . :. :..: .:
CCDS61 EAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLH---REAL----KQSATDPRTGIVDISILTTGMSATS
750 760 770 780 790
500 510 520 530 540
pF1KB5 GGRSVRFSEAEQRCV-SRGFTPA-QFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV
:. ...:: .. . :.: ::: ..: ...
CCDS61 RKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLT
800 810 820 830 840 850
CCDS61 VTGKTVRLL
860
>>CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (818 aa)
initn: 821 init1: 735 opt: 949 Z-score: 1148.8 bits: 222.9 E(32554): 1.1e-57
Smith-Waterman score: 1017; 38.8% identity (65.3% similar) in 510 aa overlap (27-479:175-679)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTR-G-SRFI
:. ::. ... :.:. : : .
CCDS75 SLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYK
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIF--LPILRTGFRQV
: . .:: ...:.:..:::. :... . . :.:::.:.:.: . :: . :.
CCDS75 DHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGY---
210 220 230 240 250 260
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTR-EELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGH
..: . .: : : . .:.:. . .: .... ... . .:....:: :.:: :.::
CCDS75 TSGTF-RTVLIACNVKQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHGH
270 280 290 300 310 320
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EDVKKALLLLLVGGVDQS-PRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTG
. ::::.: ::.:::... : .:::.::: :.:::.::::::: :. :::. :::
CCDS75 DYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTG
330 340 350 360 370 380
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQT
:::::::::::: :. .:: ::.::.::::.:: ::::::::.. :::::::::::
CCDS75 RGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGR
390 400 410 420 430 440
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPD
..:::::: . ::::::.::::::.::::. .. .:: : .::::::::... :. :
CCDS75 VTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMD
450 460 470 480 490 500
360 370 380
pF1KB5 RDNDLRLAQHITYVHQHSRQP--------P---------------SQFEPLDMKL-----
..: ....:. .:.. : : : :: . : ..
CCDS75 PEQDREISDHVLRMHRY-RAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHD
510 520 530 540 550
390 400 410 420
pF1KB5 ------------------MRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATY
:..:: . . .:.. . : ::. : ..: . :.:..
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:: :::: ...::.:: :. :: .:. .:..::..:.... : : .: . :..
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CCDS49 PEQDREISDHVLRMHRY-RAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHD
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pF1KB5 ------------------MRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATY
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CCDS49 NLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKIIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTAR
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pF1KB5 TS---ARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS--KDSLLGDKGQTARTQ
:: :::: ...::.:: :. :: .:. .:..::..:.... : : .: . :..
CCDS49 TSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSE
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CCDS49 DESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQ
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10 20
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pF1KB5 LRQIA----EEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRG-MKIRGNINIC
...:. .... ::. ::::: ::::::.:..: : : :: ..: : :.::.::.
CCDS30 VKMITSLSKDQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVL
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CCDS30 LTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGS
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CCDS30 AAEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSI
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pF1KB5 TYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA
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CCDS30 PIT-VRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFA
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CCDS30 RYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSA
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CCDS56 GDDLTIYGIVMQRWKP-FQQDVRCEV-EIVLKANYI-QVN----NEQSSGIIMDEEV-QK
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CCDS56 EFEDFWEYYKSDPFAGRNVILASLCPQVFGMYLVKLAVAMVLAGGIQRTDATGTRVRGES
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.. :.::::..:::.:.: ...::: ::: ::...:::.....: ::: .::.::::
CCDS56 HLLLVGDPGTGKSQFLKYAAKITPRSVLTTGIGSTSAGLTVTAVKD--SGEWNLEAGALV
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::: :.::::::... : :::.:::.:::::::.::::.. ::.: .::::.:: :.:
CCDS56 LADAGLCCIDEFNSLKEHDRTSIHEAMEQQTISVAKAGLVCKLNTRTTILAATNPK-GQY
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pF1KB5 NPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPL-
.:..:. :: : . :::::::. .. : ..: : ... : ... ::. : :
CCDS56 DPQESVSVNIALGSPLLSRFDLILVLLDTKNEDWDRIISSFIL----ENKGYPSKSEKLW
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pF1KB5 DMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLST
.:. :. :. . :. :: . . ... . : .:.:.. ..:. :. : : ...::.
CCDS56 SMEKMKTYFCLIRNLQPTLSD-VGNQVLLRYYQMQRQS-DCRNAARTTIRLLESLIRLAE
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: ::: . :.: ::. .. .:: :. .:::
CCDS56 AHARLMFRDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGALLGGVNALHTSFPENPGEQYQRQCELILE
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CCDS56 KLELQSLLSEELRRLERLQNQSVHQSQPRVLEVETTPGSLRNGPGEESNFRTSSQQEINY
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CCDS21 VRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAE
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pF1KB5 -------VQGLLSETY--LEA-------HRIV---------------KMNKSEDD--ESG
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CCDS21 TNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESI
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CCDS21 KNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTS
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CCDS21 LRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIE
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.:::.:::.::::::::::: :..::::.::::::::.:::. .::::: ::::::::
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CCDS21 ISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRI--VDLHSRIEESI
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CCDS21 DRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLES
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..::: :.::.. : :. . :.::.::.. :
CCDS21 MIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGI
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CCDS21 NGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKVEEEEDESAL
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CCDS13 VRANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAFLCAACGEIQSFPLPDGKYSLPTKCPVPVC
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pF1KB5 QTNRSGGRLYLQTRGSRF---IKFQEMKMQE--HSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ
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CCDS13 R-----GRSFTALRSSPLTVTMDWQSIKIQELMSDDQREAGRIPRTIECELVHDLVDSCV
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pF1KB5 PGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDD-ESGA-GELTREEL
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CCDS13 PGDTVTITGIVK----------VSNAEEANSISNSKGQKTKSSEDGCKHGMLMEFSLKDL
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CCDS13 YAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLALALFGGSQKYADDKNR-IPIRGDPH
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pF1KB5 ICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVL
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CCDS13 ILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLSKDSSSGDFALEAGALVL
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pF1KB5 ADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYN
.:::.: :::::::.. .. :. :.::::.::.::::.. .: :: ::.:::::. :.::
CCDS13 GDQGICGIDEFDKMGN-QHQALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYN
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CCDS13 KAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEHHDHLLSEHVIAIRAGKQRTISSATVARM
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pF1KB5 -------------SRQPPSQ---------FEPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADY
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CCDS13 NSQDSNTSVLEVVSEKPLSERLKVVPGETIDPIPHQLLRKYIGYARQYVYPRLSTEAARV
620 630 640 650 660 670
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pF1KB5 ITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS
. :.:.:... ... :. : : ...::. : :::.. . . :::... ...:
CCDS13 LQDFYLELRKQSQRLNSSPITT-RQLESLIRLTEARARLELREEATKEDAEDIVEIM---
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pF1KB5 KDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDE
: :.::
CCDS13 KYSMLGTYSDEFGNLDFERSQHGSGMSNRSTAKRFISALNNVAERTYNNIFQFHQLRQIA
730 740 750 760 770 780
543 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]