Result of FASTA (omim) for
pF1KB5390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5390, 920 aa
1>>>pF1KB5390 920 - 920 aa - 920 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4868+/-0.000367; mu= 15.9515+/- 0.023
mean_var=100.2061+/-19.968, 0's: 0 Z-trim(116.6): 216 B-trim: 1709 in 2/54
Lambda= 0.128123
statistics sampled from 27666 (27920) to 27666 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 12.370
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004642 (OMIM: 300050) ubiquitin carboxyl-termin ( 963) 6318 1178.8 0
XP_011542290 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin c ( 690) 4769 892.4 0
XP_005272731 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin c ( 690) 4769 892.4 0
NP_955475 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-termin ( 916) 2651 501.0 1.1e-140
NP_003354 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-termin ( 963) 2241 425.2 7.4e-118
XP_006719781 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 775) 1461 281.0 1.5e-74
XP_016875773 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 860) 1461 281.0 1.7e-74
XP_016875774 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 860) 1461 281.0 1.7e-74
NP_006304 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-termin ( 952) 1461 281.1 1.8e-74
NP_001239007 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-ter ( 981) 1461 281.1 1.9e-74
XP_005269318 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 648) 1169 227.0 2.4e-58
XP_016880723 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1288) 938 184.5 3e-45
XP_011523681 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1327) 938 184.5 3.1e-45
XP_016880722 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1558) 938 184.5 3.5e-45
XP_011523680 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1572) 938 184.5 3.5e-45
XP_011523678 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1601) 938 184.5 3.6e-45
NP_115971 (OMIM: 607740) ubiquitin carboxyl-termin (1604) 938 184.5 3.6e-45
XP_011523677 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1608) 938 184.5 3.6e-45
XP_011523676 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1615) 938 184.5 3.6e-45
XP_011523675 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1618) 938 184.5 3.6e-45
XP_011523674 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1620) 938 184.5 3.6e-45
XP_011523673 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1634) 938 184.5 3.6e-45
XP_016861124 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c ( 871) 886 174.8 1.7e-42
XP_005264888 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1268) 886 174.9 2.3e-42
XP_016861123 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1270) 886 174.9 2.3e-42
XP_016861122 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1281) 886 174.9 2.3e-42
XP_016861120 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1283) 886 174.9 2.3e-42
XP_016861121 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1283) 886 174.9 2.3e-42
XP_016861119 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1285) 886 174.9 2.3e-42
XP_016861118 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1303) 886 174.9 2.4e-42
XP_016861117 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1305) 886 174.9 2.4e-42
XP_016861116 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1307) 886 174.9 2.4e-42
XP_016861115 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1318) 886 174.9 2.4e-42
NP_006668 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-termin (1318) 886 174.9 2.4e-42
XP_016861114 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1320) 886 174.9 2.4e-42
XP_005264887 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1322) 886 174.9 2.4e-42
XP_016861113 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1332) 886 174.9 2.4e-42
XP_006713015 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1367) 886 174.9 2.5e-42
XP_006713014 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1368) 886 174.9 2.5e-42
XP_006713013 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1369) 886 174.9 2.5e-42
XP_016861112 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1369) 886 174.9 2.5e-42
XP_016861110 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1371) 886 174.9 2.5e-42
XP_016861111 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1371) 886 174.9 2.5e-42
NP_001186091 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-ter (1372) 886 174.9 2.5e-42
XP_006713012 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1373) 886 174.9 2.5e-42
XP_016861109 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1381) 886 174.9 2.5e-42
XP_006713011 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1382) 886 174.9 2.5e-42
XP_016861108 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1383) 886 174.9 2.5e-42
NP_001186090 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-ter (1384) 886 174.9 2.5e-42
XP_016861107 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1384) 886 174.9 2.5e-42
>>NP_004642 (OMIM: 300050) ubiquitin carboxyl-terminal h (963 aa)
initn: 6318 init1: 6318 opt: 6318 Z-score: 6309.8 bits: 1178.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6318; 100.0% identity (100.0% similar) in 920 aa overlap (1-920:44-963)
10 20 30
pF1KB5 MATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RFRDQNPEVAVEGRLPISHSCVGCRRERTAMATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHE
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINN
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIELPNIQKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIELPNIQKVE
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 VYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDR
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKGQPGICGLTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKGQPGICGLTN
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 LGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGH
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 HRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGR
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 PDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHK
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKL
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 YQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLF
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 GHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTG
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 GSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTS
680 690 700 710 720 730
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 PEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQECIELFTTVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQECIELFTTVET
740 750 760 770 780 790
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 LEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLD
800 810 820 830 840 850
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 FSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVN
860 870 880 890 900 910
880 890 900 910 920
pF1KB5 ENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
920 930 940 950 960
>>XP_011542290 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin carbo (690 aa)
initn: 4769 init1: 4769 opt: 4769 Z-score: 4764.5 bits: 892.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4769; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (231-920:1-690)
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 AKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 METRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 NNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEED
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
400 410 420 430 440 450
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 SNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQE
460 470 480 490 500 510
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 CIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDT
520 530 540 550 560 570
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 LVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHY
580 590 600 610 620 630
870 880 890 900 910 920
pF1KB5 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
640 650 660 670 680 690
>>XP_005272731 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin carbo (690 aa)
initn: 4769 init1: 4769 opt: 4769 Z-score: 4764.5 bits: 892.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4769; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (231-920:1-690)
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 AKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 METRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 NNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEED
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
400 410 420 430 440 450
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 SNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQE
460 470 480 490 500 510
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 CIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDT
520 530 540 550 560 570
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pF1KB5 LVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHY
580 590 600 610 620 630
870 880 890 900 910 920
pF1KB5 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
640 650 660 670 680 690
>>NP_955475 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-terminal h (916 aa)
initn: 2506 init1: 1343 opt: 2651 Z-score: 2646.8 bits: 501.0 E(85289): 1.1e-140
Smith-Waterman score: 2711; 48.1% identity (72.6% similar) in 910 aa overlap (36-909:12-901)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
:.. .. : : : :. : .:.:....
NP_955 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
10 20 30 40
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:.:::. :: : :. . . ::: :.:. ::.: . ::: :.. ::::.:.
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pF1KB5 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
::. :..::: .:: :: :::.: . . ::::: .:: : ...: . . .::..
NP_955 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
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pF1KB5 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
:.:. . . :. : . ...:::: : .. ..: :: ::.: ::....: ..
NP_955 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
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pF1KB5 KDGTWPSAQLHVMNNNMS-----EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQL
.::::: :. ....: .: . . :::.::: :::::::::::::::::. :
NP_955 EDGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPL
220 230 240 250 260 270
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pF1KB5 TEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQF
:.:::.. : :.: ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: ::
NP_955 TDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQF
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::::.::::::.:::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. :::::
NP_955 SGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSV
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pF1KB5 IVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHR
::::::::::::::::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:
NP_955 IVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYR
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pF1KB5 LVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYE
..:: : .:::: :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::
NP_955 VTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYE
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 VSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN
: . ...:: : ...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::.
NP_955 VCS--TSVDGS-ECVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQ
520 530 540 550 560 570
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pF1KB5 VLMYRLSRYVTKPNSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQA
.. :.:::: .: :. .:... . ::.... : .. :
NP_955 AVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETE
580 590 600 610 620 630
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pF1KB5 GPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHA
: . . : . .: :.: :::.. ::: ::.: .. . ...
NP_955 GSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNS
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pF1KB5 QPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLE
. .:.::. : .. :::: :.:.: :: :.... ::. : :..:::::::.:::
NP_955 RSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLG
690 700 710 720 730 740
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pF1KB5 KENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFS
...:::::.::.:: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:
NP_955 EHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMS
750 760 770 780 790 800
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pF1KB5 EFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNEN
::: . . . : : :::::::::::.: ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.
NP_955 EFVCNLS--ARP--YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASED
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pF1KB5 QIESKAAYVLFYQRQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
:: .::::::::::.: :: .::: . . :. :
NP_955 QIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
870 880 890 900 910
>>NP_003354 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-terminal h (963 aa)
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Smith-Waterman score: 2618; 46.0% identity (69.3% similar) in 957 aa overlap (36-909:12-948)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
:.. .. : : : :. : .:.:....
NP_003 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA
:.:::. :: : :. . . ::: :.:. ::.: . ::: :.. ::::.:.
NP_003 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
::. :..::: .:: :: :::.: . . ::::: .:: : ...: . . .::..
NP_003 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
:.:. . . :. : . ...:::: : .. ..: :: ::.: ::....: ..
NP_003 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
160 170 180 190 200 210
240 250
pF1KB5 KDGTWP------------------------------SAQLHVMNNNMS------------
.::::: ::.: . ... :
NP_003 EDGTWPRQTLQSKSSTAPSRNFTTSPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRG
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300
pF1KB5 ----------EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEEL
.: . . :::.::: :::::::::::::::::. ::.:::.. : :.
NP_003 GSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEI
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLS
: ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: ::::.::::::.
NP_003 NRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLA
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 FLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTL
:::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. ::::::::::::::::::
NP_003 FLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTL
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLC
:::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:..:: : .::::
NP_003 VCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLC
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSRE
:::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::: . ...:: :
NP_003 EALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCS--TSVDGS-E
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 DIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKP
...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::... :.:::: .:
NP_003 CVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQP
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650
pF1KB5 NSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFL
:. .:... . ::.... : .. : : . . :
NP_003 LPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETEGSGEDEPGNDPSE
640 650 660 670 680 690
660 670 680 690 700
pF1KB5 LDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHAQPYIAIDWEPEMK
. .: :.: :::.. ::: ::.: .. . .... .:.::. : .
NP_003 TTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETR
700 710 720 730 740
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 KRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQH
. :::: :.:.: :: :.... ::. : :..:::::::.::: ...:::::.::.:
NP_003 RLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKH
750 760 770 780 790 800
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 QLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPE
: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:::: . . . :
NP_003 QQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLS--ARP-
810 820 830 840 850 860
830 840 850 860 870 880
pF1KB5 LYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQ
: :::::::::::.: ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.:: .:::::::::
NP_003 -YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQ
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890 900 910 920
pF1KB5 RQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
:.: :: .::: . . :. :
NP_003 RRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
930 940 950 960
>>XP_006719781 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin carbo (775 aa)
initn: 1932 init1: 1308 opt: 1461 Z-score: 1459.2 bits: 281.0 E(85289): 1.5e-74
Smith-Waterman score: 1943; 42.9% identity (66.9% similar) in 758 aa overlap (53-721:24-770)
30 40 50 60 70
pF1KB5 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV--------
:: :..:.::...:.:::. ::
XP_006 MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
10 20 30 40 50
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pF1KB5 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
: :::. ..:: :.:. :..: ::: :.. ::.:::. .:. ::::: : .::
XP_006 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
:: :::.: . : :::: .:: : ....... : .::..:.: . . :. : .
XP_006 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KB5 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWP----------
...:::: : .... : :. ::.: ::....: ...:::::
XP_006 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPG
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KB5 ---------------SAQLHVMNN-NMSE-----------EDEDFK--G----QPGICGL
: . . ::: :... .. :.. : :::.:::
XP_006 ASNFSTLPKISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGL
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS
.:::::::::::.:::::.: :::::::. : ::::: :::::.::::..::.:.:: ::
XP_006 SNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWS
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA
:. ..:..::..::.:: :: ::::.: ::::.::::::::::::..:: :..: ::
XP_006 GKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDAD
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS
::::. ::.:::.:: .::::.::: ::::::::::::.:...::::::::::..:::..
XP_006 GRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMK
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFY
..:.:::... ::: :: :...:::: :.: :::.::: .:: ..:.:.:...:::.
XP_006 KERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFH
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 KLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLM
... ..: ::::..::::.:.:.. :. : . : ...:: :::. .:.. . :
XP_006 RIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INRTEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSS
540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KB5 LFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGD----------------
:::.:.:..:::. : . :::.:. :. ::: . .: .:.
XP_006 LFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNG
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KB5 --EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQW
:. . : . : : .. . . : : :. : : : : :.: : :
XP_006 IHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QL
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710
pF1KB5 PPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEEVHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYY
...: :::.: : ..:. . . : . ..:.::.:..::::.
XP_006 TGHKKR--LFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYF
710 720 730 740 750 760
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLD
:: :: :
XP_006 DENAAEKYFSLGL
770
>>XP_016875773 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin carbo (860 aa)
initn: 2336 init1: 1308 opt: 1461 Z-score: 1458.5 bits: 281.0 E(85289): 1.7e-74
Smith-Waterman score: 2409; 46.5% identity (69.5% similar) in 848 aa overlap (148-915:7-841)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AAWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIELPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDS
::::: .:: : ....... : .::..:.
XP_016 MFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADT
10 20 30
180 190 200 210 220 230
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: . . :. : . ...:::: : .... : :. ::.: ::....: ...:
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:::: : . . ::: :... .. :..
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::..::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: ::::.: ::::.:::::::::::
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:::::::..:::....:.:::... ::: :: :...:::: :.: :::.::: .::
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..:.:.:...:::.... ..: ::::..::::.:.:.. :. : . : ...:: :::.
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: :.: : : ...: :::.: : ..:. . . : . .
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pF1KB5 GTWP-------------------------SAQLHVMNN-NMSE-----------EDEDFK
:::: : . . ::: :... .. :..
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pF1KB5 CPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQP
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pF1KB5 QNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKA
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pF1KB5 AYVLFYQRQDV-ARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
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XP_016 AYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
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:: :::.: . : :::: .:: : ....... : .::..:.: . . :. : .
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pF1KB5 NNM------SEEDEDFK--G----QPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNN
.:. . .. :.. : :::.:::.:::::::::::.:::::.: :::::::.
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pF1KB5 CYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHD
: ::::: :::::.::::..::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: ::::.:
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:::::::::.:...::::::::::..:::....:.:::... ::: :: :...:::: :
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.: :::.::: .:: ..:.:.:...:::.... ..: ::::..::::.:.:.. :.
NP_006 NILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INR
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: . : ...:: :::. .:.. . : :::.:.:..:::. : . :::.:. :.
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::: . .: .:. :. . : . : : .. . . :
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: :. : : : : :.: : : ...: :::.: : ..:. . .
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pF1KB5 VHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAP-VRLQEC
: . ..:.::.:..::::.:: :: . ::. : : : : :.:..:
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pF1KB5 IELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTL
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NP_006 IELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTL
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pF1KB5 VEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYF
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NP_006 VDFPINDLDMSEFLINP--NAGPC--RYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYF
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pF1KB5 DDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDV-ARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
::.::: ..:.:: :::::::::::::. . . : :: : . : :.
NP_006 DDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSND
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>>NP_001239007 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-termina (981 aa)
initn: 2578 init1: 1308 opt: 1461 Z-score: 1457.6 bits: 281.1 E(85289): 1.9e-74
Smith-Waterman score: 2692; 46.1% identity (69.1% similar) in 954 aa overlap (53-915:24-962)
30 40 50 60 70
pF1KB5 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV--------
:: :..:.::...:.:::. ::
NP_001 MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
10 20 30 40 50
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pF1KB5 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
: :::. ..:: :.:. :..: ::: :.. ::.:::. .:. ::::: : .::
NP_001 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
:: :::.: . : :::: .:: : ....... : .::..:.: . . :. : .
NP_001 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240
pF1KB5 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWP----------
...:::: : .... : :. ::.: ::....: ...:::::
NP_001 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPG
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 ---------------SAQLHVMNN-NMSE-----------EDEDFK--G----QPGICGL
: . . ::: :... .. :.. : :::.:::
NP_001 ASNFSTLPKISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGL
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pF1KB5 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS
.:::::::::::.:::::.: :::::::. : ::::: :::::.::::..::.:.:: ::
NP_001 SNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWS
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pF1KB5 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA
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NP_001 GKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDAD
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS
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NP_001 GRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMK
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