FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5420, 434 aa 1>>>pF1KB5420 434 - 434 aa - 434 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5159+/-0.000415; mu= 15.7487+/- 0.026 mean_var=58.4179+/-11.511, 0's: 0 Z-trim(108.2): 35 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.167804 statistics sampled from 16206 (16232) to 16206 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16 Scan time: 7.260 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001419 (OMIM: 172430) alpha-enolase isoform 1 [ ( 434) 2823 692.2 6.6e-199 XP_006710496 (OMIM: 172430) PREDICTED: alpha-enola ( 434) 2772 679.9 3.4e-195 NP_001966 (OMIM: 131360) gamma-enolase [Homo sapie ( 434) 2437 598.8 8.9e-171 XP_011522031 (OMIM: 131370,612932) PREDICTED: beta ( 434) 2416 593.7 3e-169 NP_001967 (OMIM: 131370,612932) beta-enolase isofo ( 434) 2416 593.7 3e-169 XP_016879835 (OMIM: 131370,612932) PREDICTED: beta ( 434) 2416 593.7 3e-169 NP_443739 (OMIM: 131370,612932) beta-enolase isofo ( 434) 2416 593.7 3e-169 XP_005256578 (OMIM: 131370,612932) PREDICTED: beta ( 443) 2416 593.7 3.1e-169 NP_001188412 (OMIM: 172430) c-myc promoter-binding ( 341) 2244 552.1 8.3e-157 NP_001180432 (OMIM: 131370,612932) beta-enolase is ( 391) 1909 471.0 2.4e-132 XP_006717898 (OMIM: 131375) PREDICTED: enolase 4 i ( 598) 216 61.2 8.6e-09 XP_006717899 (OMIM: 131375) PREDICTED: enolase 4 i ( 582) 215 60.9 1e-08 NP_001229628 (OMIM: 131375) enolase 4 [Homo sapien ( 625) 215 60.9 1.1e-08 XP_011538099 (OMIM: 131375) PREDICTED: enolase 4 i ( 583) 151 45.4 0.00046 >>NP_001419 (OMIM: 172430) alpha-enolase isoform 1 [Homo (434 aa) initn: 2823 init1: 2823 opt: 2823 Z-score: 3692.0 bits: 692.2 E(85289): 6.6e-199 Smith-Waterman score: 2823; 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NP_001 QENGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEELGDE 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK :.:::.::::: NP_001 ARFAGHNFRNPSVL 430 >>XP_011522031 (OMIM: 131370,612932) PREDICTED: beta-eno (434 aa) initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 3159.5 bits: 593.7 E(85289): 3e-169 Smith-Waterman score: 2416; 83.4% identity (96.1% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-434) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK :.. :: ::::.:::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.:: ::.:: XP_011 MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKGRYLGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK :: ::::.::.:..:::..:::.:..:::.::.:::.::::::::::::::::::::::: XP_011 GVLKAVENINNTLGPALLQKKLSVVDQEKVDKFMIELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE :::.:::::::::::::::: ..::::::::::::::::::::::::::::::::..:.: XP_011 AGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGASSFKE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV ::::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::: ::: XP_011 AMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENNEALELLKTAIQAAGYPDKV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD :::::::::::.:.:::::::::::::.:.:. ..:..:::::::.:::::::::::::: XP_011 VIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKSFIKNYPVVSIEDPFDQDD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA :..: .: ....::.::::::::::::::.::..:.:::::::::::::::::.:::::: XP_011 WATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.: XP_011 QSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGDK 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK : ::::.:::: :: XP_011 AIFAGRKFRNPKAK 430 >>NP_001967 (OMIM: 131370,612932) beta-enolase isoform 1 (434 aa) initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 3159.5 bits: 593.7 E(85289): 3e-169 Smith-Waterman score: 2416; 83.4% identity (96.1% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-434) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK :.. :: ::::.:::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.:: ::.:: NP_001 MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKGRYLGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK :: ::::.::.:..:::..:::.:..:::.::.:::.::::::::::::::::::::::: NP_001 GVLKAVENINNTLGPALLQKKLSVVDQEKVDKFMIELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE :::.:::::::::::::::: ..::::::::::::::::::::::::::::::::..:.: NP_001 AGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGASSFKE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV ::::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::: ::: NP_001 AMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENNEALELLKTAIQAAGYPDKV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD :::::::::::.:.:::::::::::::.:.:. ..:..:::::::.:::::::::::::: NP_001 VIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKSFIKNYPVVSIEDPFDQDD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA :..: .: ....::.::::::::::::::.::..:.:::::::::::::::::.:::::: NP_001 WATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.: NP_001 QSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGDK 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK : ::::.:::: :: NP_001 AIFAGRKFRNPKAK 430 >>XP_016879835 (OMIM: 131370,612932) PREDICTED: beta-eno (434 aa) initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 3159.5 bits: 593.7 E(85289): 3e-169 Smith-Waterman score: 2416; 83.4% identity (96.1% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-434) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK :.. :: ::::.:::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.:: ::.:: XP_016 MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKGRYLGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK :: ::::.::.:..:::..:::.:..:::.::.:::.::::::::::::::::::::::: XP_016 GVLKAVENINNTLGPALLQKKLSVVDQEKVDKFMIELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE :::.:::::::::::::::: ..::::::::::::::::::::::::::::::::..:.: XP_016 AGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGASSFKE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV ::::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::: ::: XP_016 AMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENNEALELLKTAIQAAGYPDKV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD :::::::::::.:.:::::::::::::.:.:. ..:..:::::::.:::::::::::::: XP_016 VIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKSFIKNYPVVSIEDPFDQDD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA :..: .: ....::.::::::::::::::.::..:.:::::::::::::::::.:::::: XP_016 WATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.: XP_016 QSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGDK 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK : ::::.:::: :: XP_016 AIFAGRKFRNPKAK 430 >>NP_443739 (OMIM: 131370,612932) beta-enolase isoform 1 (434 aa) initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 3159.5 bits: 593.7 E(85289): 3e-169 Smith-Waterman score: 2416; 83.4% identity (96.1% similar) in 434 aa overlap (1-434:1-434) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRDNDKTRYMGK :.. :: ::::.:::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.:: ::.:: NP_443 MAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKGRYLGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 GVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK :: ::::.::.:..:::..:::.:..:::.::.:::.::::::::::::::::::::::: NP_443 GVLKAVENINNTLGPALLQKKLSVVDQEKVDKFMIELDGTENKSKFGANAILGVSLAVCK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 AGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGAANFRE :::.:::::::::::::::: ..::::::::::::::::::::::::::::::::..:.: NP_443 AGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMILPVGASSFKE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 AMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAIGKAGYTDKV ::::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::: ::: NP_443 AMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENNEALELLKTAIQAAGYPDKV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 VIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDD :::::::::::.:.:::::::::::::.:.:. ..:..:::::::.:::::::::::::: NP_443 VIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKSFIKNYPVVSIEDPFDQDD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 WGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLA :..: .: ....::.::::::::::::::.::..:.:::::::::::::::::.:::::: NP_443 WATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVTESIQACKLA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 QANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGSK :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::.: NP_443 QSNGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLMRIEEALGDK 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 AKFAGRNFRNPLAK : ::::.:::: :: NP_443 AIFAGRKFRNPKAK 430 >>XP_005256578 (OMIM: 131370,612932) PREDICTED: beta-eno (443 aa) initn: 2416 init1: 2416 opt: 2416 Z-score: 3159.4 bits: 593.7 E(85289): 3.1e-169 Smith-Waterman score: 2416; 83.4% identity (96.1% similar) in 434 aa overlap (1-434:10-443) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MSILKIHAREIFDSRGNPTVEVDLFTSKGLFRAAVPSGASTGIYEALELRD :.. :: ::::.:::::::::::: :.:: ::::::::::::::::::::: XP_005 MAVMRTLRAMAMQKIFAREILDSRGNPTVEVDLHTAKGRFRAAVPSGASTGIYEALELRD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 NDKTRYMGKGVSKAVEHINKTIAPALVSKKLNVTEQEKIDKLMIEMDGTENKSKFGANAI .:: ::.:::: ::::.::.:..:::..:::.:..:::.::.:::.:::::::::::::: XP_005 GDKGRYLGKGVLKAVENINNTLGPALLQKKLSVVDQEKVDKFMIELDGTENKSKFGANAI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 LGVSLAVCKAGAVEKGVPLYRHIADLAGNSEVILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMIL ::::::::::::.:::::::::::::::: ..:::::::::::::::::::::::::::: XP_005 LGVSLAVCKAGAAEKGVPLYRHIADLAGNPDLILPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQEFMIL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 PVGAANFREAMRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGFAPNILENKEGLELLKTAI ::::..:.:::::::::::.::.::: ::::::::::::::::::::::.:.:::::::: XP_005 PVGASSFKEAMRIGAEVYHHLKGVIKAKYGKDATNVGDEGGFAPNILENNEALELLKTAI 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 GKAGYTDKVVIGMDVAASEFFRSGKYDLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVS ::: ::::::::::::::.:.:::::::::::::.:.:. ..:..:::::::.::::: XP_005 QAAGYPDKVVIGMDVAASEFYRNGKYDLDFKSPDDPARHITGEKLGELYKSFIKNYPVVS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 IEDPFDQDDWGAWQKFTASAGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVNEKSCNCLLLKVNQIGSVT ::::::::::..: .: ....::.::::::::::::::.::..:.::::::::::::::: XP_005 IEDPFDQDDWATWTSFLSGVNIQIVGDDLTVTNPKRIAQAVEKKACNCLLLKVNQIGSVT 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 ESLQACKLAQANGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQLL ::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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