FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5444, 724 aa 1>>>pF1KB5444 724 - 724 aa - 724 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2527+/-0.00137; mu= 2.4054+/- 0.082 mean_var=216.2792+/-43.364, 0's: 0 Z-trim(106.8): 26 B-trim: 103 in 1/49 Lambda= 0.087210 statistics sampled from 9203 (9212) to 9203 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16 Scan time: 4.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6 ( 724) 4664 600.5 2.9e-171 CCDS9967.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 732) 4122 532.3 9.9e-151 CCDS32160.1 HSP90AA1 gene_id:3320|Hs108|chr14 ( 854) 4122 532.4 1.1e-150 CCDS9094.1 HSP90B1 gene_id:7184|Hs108|chr12 ( 803) 1823 243.1 1.3e-63 CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 651) 628 92.7 1.9e-18 CCDS10508.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 ( 704) 628 92.7 2.1e-18 >>CCDS4909.1 HSP90AB1 gene_id:3326|Hs108|chr6 (724 aa) initn: 4664 init1: 4664 opt: 4664 Z-score: 3188.2 bits: 600.5 E(32554): 2.9e-171 Smith-Waterman score: 4664; 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CCDS90 KTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESDDPMAYIHFTAEGEV 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 EFRALLFIPRRAPFDLFEN--KKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSED :...::.: :: ::.. .::.. :::::::::: :. ...:.::::..:::::.: CCDS90 TFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFVKGVVDSDD 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 LPLNISREMLQQSKILKVIRKNIVKKCLELFSELAEDKENYKKFYEAFSKNLKLGIHEDS ::::.::: ::: :.::::::..:.: :......:.:: : :.. :. :.:::. :: CCDS90 LPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKYN-DTFWKEFGTNIKLGVIEDH 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 pF1KB5 TNRRRLSELLRYHTSQSGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRK .:: ::..:::...:. ..:::..:: :::: : .::...: :.... .: ::::. : CCDS90 SNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLK 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 pF1KB5 RGFEVVYMTEPIDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGLELPEDEEEKKKMEESKAKFENLCK .:.::.:.:::.::::.: : ::::: . .:.:::... :.:. :.. : . .:: : . CCDS90 KGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKESREAVEKEFEPLLN 570 580 590 600 610 620 570 580 590 600 610 620 pF1KB5 LMKE-ILDKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQAL---RDNSTMGYMM ::. : :.::...:.::. ::: .:.: :::..:::::::::: .: :: : CCDS90 WMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYAS 630 640 650 660 670 680 630 640 650 660 670 680 pF1KB5 AKKHLEINPDHPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIY :: .:::: ::... . .. . :..::.: ::.:.::::: : ::. : : .....:: CCDS90 QKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIE 690 700 710 720 730 740 690 700 710 720 pF1KB5 RMIKLGLGIDED----EVAAEEPNAAVPDEIPPLEGDEDASRMEEVD ::..:.:.:: : : :::. .. : : ::: ::.: CCDS90 RMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDED----EEMDVGTDEEEETAKES 750 760 770 780 790 CCDS90 TAEKDEL 800 >>CCDS61824.1 TRAP1 gene_id:10131|Hs108|chr16 (651 aa) initn: 895 init1: 289 opt: 628 Z-score: 444.5 bits: 92.7 E(32554): 1.9e-18 Smith-Waterman score: 1122; 31.3% identity (63.1% similar) in 683 aa overlap (17-684:37-644) 10 20 30 40 pF1KB5 MPEEVHHGEEEVETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIFLRELISN :::: .:.... ..::.::.:.:::::: CCDS61 ALLLWGRRLRPLLRAPALAAVPGGSTSKHEFQAETKKLLDIVARSLYSEKEVFIRELISN 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 ASDALDKIRYESLTDPSKLDSGKELKIDIIPNPQERTLTLVDTGIGMTKADLINNLGTIA :::::.:.:.. ..: . : :..: . : .. :.:. :::::::. .:..:::::: CCDS61 ASDALEKLRHKLVSDGQALP---EMEIHLQTNAEKGTITIQDTGIGMTQEELVSNLGTIA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 KSGTKAFMEALQAGADIS--MIGQFGVGFYSAYLVAEKVVVITKHNDDEQ--YAWESSAG .::.:::..::: :. : .:::::::::::..::..: : .. . : : :... 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CCDS61 RKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRYE 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 TSQ--SGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEP .: :: ..::::::.:::. ..:::. . ... . .: . : ..:. ::.. : CCDS61 SSALPSG-QLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFEQ 420 430 440 450 460 470 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 IDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGL--ELPEDE-EEKKKMEE--SKAKFENLCKLMKEIL .:: . .:.::: :.:.:: . . . :.. :... : :. . :.: :...: CCDS61 FDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRNVL 480 490 500 510 520 530 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 DKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPD ..: .: .. :: . : ... .: ..... : : .. .. . ::::: CCDS61 GSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMG---AARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINPR 540 550 560 570 580 590 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 HPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGID : ... : : .. . .. :: ..:.:....:. ..::.. .:. ... 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CCDS10 RSGSKAFLDALQNQAEASSKIIGQFGVGFYSAFMVADRVEVYSRSAAPGSLGYQWLSDGS 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 GSFTVRADHGEPIGRGTKVILHLKEDQTEYLEERRVKEVVKKHSQFIGYPITLYLEKERE : : . : . :::.:.::: : :. : ::..:: :.:.:...: :::. .: CCDS10 GVFEIAEASG--VRTGTKIIIHLKSDCKEFSSEARVRDVVTKYSNFVSFP--LYLNGRR- 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 KEISDDEAEEEKGEKEEEDKDDEEKPKIEDVGSDEEDDSGKDKKKKTKKIKEKYIDQEEL . CCDS10 -----------------------------------------------------------M 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 NKTKPIWTRNPDDITQEEYGEFYKSLTNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRALLFIPRRAPFD : . :: .: :. . .. :::. ... . . :..... :..:.....: : . CCDS10 NTLQAIWMMDPKDVREWQHEEFYRYVAQAHDKPRYTLHYKTDAPLNIRSIFYVPDMKP-S 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 LFE-NKKKKNNIKLYVRRVFIMDSCDELIPEYLNFIRGVVDSEDLPLNISREMLQQSKIL .:. ... ... :: :.:.:. . ...:..: ::::::::::.:::.:::.::.: .. CCDS10 MFDVSRELGSSVALYSRKVLIQTKATDILPKWLRFIRGVVDSEDIPLNLSRELLQESALI 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KB5 KVIRKNIVKKCLELFSELAE-DKENYKKFYEAFSKNLKLGI--HEDSTNRRRLSELLRYH . .: . .. ...: . .. : :.: ::.: .. .. :: .. .. ...::::. CCDS10 RKLRDVLQQRLIKFFIDQSKKDAEKYAKFFEDYGLFMREGIVTATEQEVKEDIAKLLRYE 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 TSQ--SGDEMTSLSEYVSRMKETQKSIYYITGESKEQVANSAFVERVRKRGFEVVYMTEP .: :: ..::::::.:::. ..:::. . ... . .: . : ..:. ::.. : CCDS10 SSALPSG-QLTSLSEYASRMRAGTRNIYYLCAPNRHLAEHSPYYEAMKKKDTEVLFCFEQ 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 IDEYCVQQLKEFDGKSLVSVTKEGL--ELPEDE-EEKKKMEE--SKAKFENLCKLMKEIL .:: . .:.::: :.:.:: . . . :.. :... : :. . :.: :...: CCDS10 FDELTLLHLREFDKKKLISVETDIVVDHYKEEKFEDRSPAAECLSEKETEELMAWMRNVL 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 DKKVEKVTISNRLVSSPCCIVTSTYGWTANMERIMKAQALRDNSTMGYMMAKKHLEINPD ..: .: .. :: . : ... .: ..... : : .. .. . ::::: CCDS10 GSRVTNVKVTLRLDTHPAMVTVLEMG---AARHFLRMQQLAKTQEERAQLLQPTLEINPR 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 HPIVETLRQKAEADKNDKAVKDLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNRIYRMIKLGLGID : ... : : .. . .. :: ..:.:....:. ..::.. .:. ... CCDS10 HALIKKLNQLRASEPG--LAQLLVDQIYENAMIAAGL-VDDPRAMVGRLNELLVKALERH 650 660 670 680 690 700 700 710 720 pF1KB5 EDEVAAEEPNAAVPDEIPPLEGDEDASRMEEVD 724 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 22:32:36 2016 done: Thu Nov 3 22:32:36 2016 Total Scan time: 4.100 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]