Result of FASTA (omim) for
pF1KB5485
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5485, 517 aa
1>>>pF1KB5485 517 - 517 aa - 517 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4614+/-0.000412; mu= 16.9223+/- 0.025
mean_var=61.8474+/-12.353, 0's: 0 Z-trim(110.6): 74 B-trim: 42 in 1/54
Lambda= 0.163085
statistics sampled from 18880 (18957) to 18880 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 8.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydroge ( 517) 3456 822.2 0
NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydr ( 470) 2652 633.0 5.9e-181
NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, ( 517) 2569 613.5 4.9e-175
XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde de ( 517) 2569 613.5 4.9e-175
NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 518) 2371 566.9 5.2e-161
NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [ ( 501) 2352 562.4 1.1e-159
NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase ( 497) 2345 560.7 3.5e-159
NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydroge ( 512) 2254 539.3 9.9e-153
NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 422) 2083 499.1 1.1e-140
XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1525 367.9 6.2e-101
XP_016874378 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1525 367.9 6.2e-101
NP_001029345 (OMIM: 613584) mitochondrial 10-formy ( 923) 1525 367.9 7.2e-101
NP_001257294 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 801) 1521 367.0 1.2e-100
XP_011510657 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1521 367.0 1.3e-100
XP_006713544 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1521 367.0 1.3e-100
NP_036322 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltetrah ( 902) 1521 367.0 1.3e-100
NP_001257293 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 912) 1521 367.0 1.4e-100
NP_001280744 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydr ( 405) 1347 325.9 1.4e-88
NP_000687 (OMIM: 602733) 4-trimethylaminobutyralde ( 518) 1262 305.9 1.8e-82
NP_733797 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 480) 1201 291.6 3.6e-78
XP_011507596 (OMIM: 602733) PREDICTED: 4-trimethyl ( 424) 1191 289.2 1.6e-77
NP_072090 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 487) 1135 276.1 1.7e-73
XP_016861103 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 828) 1116 271.7 6.1e-72
XP_016861102 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 838) 1116 271.7 6.1e-72
NP_001071 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 535) 906 222.2 3.1e-57
NP_001180409 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase ( 437) 741 183.3 1.2e-45
NP_005580 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate-sem ( 535) 716 177.5 8.8e-44
NP_001188306 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadip ( 511) 706 175.1 4.3e-43
NP_001173 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadipic ( 539) 706 175.1 4.5e-43
NP_001265522 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 522) 624 155.8 2.8e-37
XP_016864982 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 608 152.0 3.1e-36
XP_011541719 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 608 152.0 3.1e-36
NP_001265523 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 381) 606 151.6 4e-36
XP_016876820 (OMIM: 603178,614105) PREDICTED: meth ( 381) 606 151.6 4e-36
NP_733936 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 548) 602 150.7 1.1e-35
XP_011536290 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 622) 562 141.3 8.1e-33
NP_001128639 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453) 555 139.6 1.9e-32
NP_001128640 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453) 555 139.6 1.9e-32
NP_000682 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase, d ( 453) 555 139.6 1.9e-32
NP_001317079 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 380) 504 127.6 6.7e-29
XP_011522033 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 380) 504 127.6 6.7e-29
XP_011524743 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773) 495 125.5 5.5e-28
XP_011524744 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773) 495 125.5 5.5e-28
NP_699160 (OMIM: 613358) aldehyde dehydrogenase fa ( 802) 495 125.6 5.7e-28
XP_005256579 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 570) 437 111.9 5.4e-24
XP_005256580 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 570) 437 111.9 5.4e-24
XP_005256581 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 570) 437 111.9 5.4e-24
NP_001154976 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroli ( 503) 432 110.7 1.1e-23
NP_003739 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroline- ( 563) 432 110.7 1.2e-23
NP_733844 (OMIM: 239510,606811) delta-1-pyrroline- ( 563) 432 110.7 1.2e-23
>>NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogenase (517 aa)
initn: 3456 init1: 3456 opt: 3456 Z-score: 4391.4 bits: 822.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3456; 100.0% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
490 500 510
>>NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogen (470 aa)
initn: 3134 init1: 2652 opt: 2652 Z-score: 3369.7 bits: 633.0 E(85289): 5.9e-181
Smith-Waterman score: 3044; 90.9% identity (90.9% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
:::::::::::::
NP_001 TGEVICQVAEGDK-----------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
380 390 400 410 420 430
490 500 510
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
440 450 460 470
>>NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, mit (517 aa)
initn: 2565 init1: 2565 opt: 2569 Z-score: 3263.5 bits: 613.5 E(85289): 4.9e-175
Smith-Waterman score: 2569; 73.6% identity (89.2% similar) in 518 aa overlap (7-517:3-517)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
:: .::: :: : :::: .:.: .:.. ::.::::::.::::.::
NP_000 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIE
::::::.::::: .:::::. :::.:::::: ::.:::::::::::.:::::::::::.:
NP_000 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
:::.:::.:::::::::. :: .::: :.: ::.::::::.::::::.::. : .:::
NP_000 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
NP_000 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
NP_000 VVNIITGYGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
NP_000 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
:.::::::. ::...::::. :..::::::::: ..::.::.::::: ::: : ::
NP_000 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
::::::::. ..::: ::::: ::::. :::::::::.::::: :..::::::::::: :
NP_000 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KB5 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
.. ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
NP_000 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
480 490 500 510
>>XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde dehydr (517 aa)
initn: 2565 init1: 2565 opt: 2569 Z-score: 3263.5 bits: 613.5 E(85289): 4.9e-175
Smith-Waterman score: 2569; 73.6% identity (89.2% similar) in 518 aa overlap (7-517:3-517)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLRAAARF-GPRL----GR--RLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKT
:: .::: :: : :::: .:.: .:.. ::.::::::.::::.::
XP_011 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAA---LPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIE
::::::.::::: .:::::. :::.:::::: ::.:::::::::::.:::::::::::.:
XP_011 FPTVNPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RDRTYLAALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRH
:::.:::.:::::::::. :: .::: :.: ::.::::::.::::::.::. : .:::
XP_011 RDRVYLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPG
::::::::::::::::.::.:::.:::::::.:::::::::::.:::.:.::::::::::
XP_011 EPVGVCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VVNIVPGFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNI
::::. :.:::::::::.: ::::::::::::.:..:: :::.:::::::::::::::.:
XP_011 VVNIITGYGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 IMSDADMDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFD
...::::. :::: : :::::.::::::::::::.:.::.::.::.: .::.: :::::.
XP_011 VLADADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SKTEQGPQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIA
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XP_011 LDTQQGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KEEIFGPVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCY
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XP_011 KEEIFGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KB5 DVFGAQSPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
.. ..::::.: ::.:::::: ::.:::::::::.:::::::
XP_011 NIVTCHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
480 490 500 510
>>NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (518 aa)
initn: 2347 init1: 2347 opt: 2371 Z-score: 3011.7 bits: 566.9 E(85289): 5.2e-161
Smith-Waterman score: 2371; 67.3% identity (89.0% similar) in 498 aa overlap (20-517:21-518)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNP
:. . .:.:. . :. ..:::::::... : ..::. ::
NP_003 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 STGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYL
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NP_003 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVC
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NP_003 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GQIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVP
:::::::::::: :::..::: ::.::.: ::::::.:::.. :::::::::::.::.:
NP_003 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GFGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDAD
:.::::::::::: .::.:::::::.:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::
NP_003 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 MDWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQG
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NP_003 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PQVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFG
::.:. :..::: :..: ::::: ::: . .:.::.::::..: : : ::::::::
NP_003 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PVMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQ
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NP_003 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 SPFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
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NP_003 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
490 500 510
>>NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [Homo (501 aa)
initn: 2344 init1: 2344 opt: 2352 Z-score: 2987.8 bits: 562.4 E(85289): 1.1e-159
Smith-Waterman score: 2352; 68.1% identity (86.8% similar) in 501 aa overlap (17-517:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
.:...: .:. . .. ..:::::::::.:: : ::. ::.
NP_000 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
: : .::: ::::::::::::::: :::.::::: ::::.::::: .::::::::: ::
NP_000 TEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
..:....:: : .:: :: .: ::: :::::: .:.::::::.::.::::::.::::
NP_000 TMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
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NP_000 QIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
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NP_000 YGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
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NP_000 DNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
:.:. :. ::: :..::.::::: :::: ...:::.:::::..: : : :::::::::
NP_000 QIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
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NP_000 VQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQC
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
::::.::::.::::::::.. ::::::::::. ::::
NP_000 PFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
470 480 490 500
>>NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 is (497 aa)
initn: 2345 init1: 2345 opt: 2345 Z-score: 2978.9 bits: 560.7 E(85289): 3.5e-159
Smith-Waterman score: 2345; 69.1% identity (89.8% similar) in 479 aa overlap (39-517:19-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 GPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPSTGEVICQV
:::::::... : ..::. ::.::: .:.:
NP_001 MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPATGEQVCEV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDNG
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NP_001 QEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESLNGG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPWNFP
::.. .. :::. :.: .::::::::: :: :::.:::.:..:::::.::::::::::::
NP_001 KPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPWNFP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTAGAA
::: :::..::: ::.::.: ::::::.:::.. :::::::::::.::.::.:::::::
NP_001 LLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTAGAA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVEQAH
:::: .::.:::::::.:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::.:.::::::
NP_001 IASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVEQAH
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDETQFK
..:::::::: :::: ::.:.::.:::.::: ::: ::::.::: ::::::.:. :..
NP_001 QGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKKQYN
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQILKFK
::: :..: ::::: ::: . .:.::.::::..: : : ::::::::::..::.::
NP_001 KILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEILRFK
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGYKMS
:..::. ::::: .::.:::::.:..:: .:.:.::::::.:::....:::::::.:::
NP_001 TMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGFKMS
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KB5 GSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
:.:::.::.::. :.::::::::.:::::
NP_001 GNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
470 480 490
>>NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydrogenase (512 aa)
initn: 2236 init1: 2236 opt: 2254 Z-score: 2863.0 bits: 539.3 E(85289): 9.9e-153
Smith-Waterman score: 2254; 66.1% identity (86.4% similar) in 493 aa overlap (24-516:19-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
:.: : .. :: ..::::::::.. : : : : :::
NP_000 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
: : ::.: :::: ::::::.::..::: ::::::.:: :::::..::::.::::. ::
NP_000 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
::::.:.:::.. ....::. .. :::.:::::: .::::: : . .:::::.::::
NP_000 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
: :::::::: .:::.::: ::..:.: ::::::::::...:::::::::::::::::
NP_000 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
::::.::::.:: ...:.:::::::.:.... ::. :::::::::::::.: :. .:::.
NP_000 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
: ::: :: ..:::::::: :.::.::.:..:.:::.::: ::.: ::.::: ::::::
NP_000 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
:.:. :: ::: :..::.::::: :::. :.: ::.::::..: :.: :::::::::
NP_000 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
:. :::::.::::. :::.. :::.::::::.:::: :..::..::::.:::... ::.
NP_000 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
420 430 440 450 460 470
490 500 510
pF1KB5 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
::::.::::.:::::::.: ::::::::.:. .::
NP_000 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
480 490 500 510
>>NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (422 aa)
initn: 2083 init1: 2083 opt: 2083 Z-score: 2646.9 bits: 499.1 E(85289): 1.1e-140
Smith-Waterman score: 2083; 69.9% identity (90.3% similar) in 422 aa overlap (96-517:1-422)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETL
::::.:::::..::::.::::. ::..:.:
NP_733 MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCGQIIPW
..:::.. .. :::. :.: .::::::::: :: :::.:::.:..:::::.:::::::::
NP_733 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTA
:::::: :::..::: ::.::.: ::::::.:::.. :::::::::::.::.::.::::
NP_733 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADMDWAVE
::::::: .::.:::::::.:..:: ::: ::::::::::::::::::..:::.:.:::
NP_733 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGPQVDET
::: ..:::::::: :::: ::.:.::.:::.::: ::: ::::.::: ::::::.:.
NP_733 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQIL
:..::: :..: ::::: ::: . .:.::.::::..: : : ::::::::::..::
NP_733 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGY
.:::..::. ::::: .::.:::::.:..:: .:.:.::::::.:::....:::::::.
NP_733 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
340 350 360 370 380 390
490 500 510
pF1KB5 KMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
::::.:::.::.::. :.::::::::.:::::
NP_733 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
400 410 420
>>XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondrial 1 (777 aa)
initn: 1521 init1: 894 opt: 1525 Z-score: 1933.1 bits: 367.9 E(85289): 6.2e-101
Smith-Waterman score: 1525; 48.8% identity (76.9% similar) in 480 aa overlap (38-511:298-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 FGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPSTGEVICQ
: :::... :: . ::. :.::. : .::.
XP_011 RKLRGEDQEVELVVDYISKEVNEIMVKMPYQCFINGQFTDADDGKTYDTINPTDGSTICK
270 280 290 300 310 320
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLAALETLDN
:. .. :::::: ::. ::. : : ::.: .::::. :::::.:... ::..:.::.
XP_011 VSYASLADVDKAVAAAKDAFENGE-WGRMNARERGRLMYRLADLLEENQEELATIEALDS
330 340 350 360 370 380
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPID----GDFFSYTRHEPVGVCGQII
: :... . . : .. .::.::: :: .:.::::. . ...:..::.:::. ::
XP_011 GAVYTLALKTHIGMSVQTFRYFAGWCDKIQGSTIPINQARPNRNLTFTKKEPLGVCAIII
390 400 410 420 430 440
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPGFGP
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