Result of FASTA (ccds) for pF1KB5499
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5499, 1609 aa
  1>>>pF1KB5499 1609 - 1609 aa - 1609 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0832+/-0.0017; mu= 2.7440+/- 0.101
 mean_var=423.5359+/-84.311, 0's: 0 Z-trim(108.5): 163  B-trim: 36 in 1/50
 Lambda= 0.062320
 statistics sampled from 10093 (10228) to 10093 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.314), width:  16
 Scan time:  4.640

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1           (1609) 11174 1021.5       0
CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9          (1575) 4558 426.7  3e-118
CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1          (1111) 2508 242.2 7.4e-63
CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1           (1193) 2508 242.2 7.7e-63
CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17          ( 604) 1548 155.5 4.8e-37
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7           (1786) 1209 125.6 1.4e-27
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7         (1761) 1186 123.5 5.9e-27
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3           (1798) 1103 116.1 1.1e-24
CCDS10469.1 NTN3 gene_id:4917|Hs108|chr16          ( 580) 1055 111.2   1e-23
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18       (3075)  925 100.4 9.8e-20
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1          (4391)  840 92.9 2.4e-17
CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20         (3695)  808 90.0 1.6e-16
CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1           (1172)  668 76.8 4.8e-13
CCDS1516.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1           (1546)  642 74.6 2.9e-12
CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1          (5202)  642 75.2 6.2e-12
CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (3277)  602 71.4 5.6e-11
CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18         (3333)  602 71.4 5.7e-11


>>CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1                (1609 aa)
 initn: 11174 init1: 11174 opt: 11174  Z-score: 5451.1  bits: 1021.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11174; 99.9% identity (99.9% similar) in 1609 aa overlap (1-1609:1-1609)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 GLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKIRGTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKIRGTY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 SERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPNLGPYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPNLGPYSP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 CVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGSS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 CAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDPNAVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDPNAVG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 NCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNPYGTMKQQSSCNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS13 NCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQSSCNP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 VTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQCECQPGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQCECQPGI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB5 TGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQCEENYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQCEENYF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB5 YNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKEAER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKEAER
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB5 EVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVEN
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB5 TERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB5 AKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB5 GDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB5 VKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDN
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB5 KTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB5 TSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB5 INARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600         
pF1KB5 LENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP
             1570      1580      1590      1600         

>>CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9               (1575 aa)
 initn: 4385 init1: 2442 opt: 4558  Z-score: 2236.4  bits: 426.7 E(32554): 3e-118
Smith-Waterman score: 4898; 44.2% identity (72.0% similar) in 1598 aa overlap (21-1600:10-1571)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFN
                           ::.::  ::.    :.:  : : .::::::.: : ::::.
CCDS69            MAAAALLLGLALLAPRAAG----AGMGACYDGAGRPQRCLPVFENAAFG
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         . :..:::.:::..: ..:..:.   :. :::..:. .:.:..:::...: ..:::::
CCDS69 RLAQASHTCGSPPEDFCPHVGAAGAGAHCQRCDAADPQRHHNASYLTDFHSQDESTWWQS
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pF1KB5 QTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSG
        .:  :::::.:.:.::.::::..:::::::::::::::::::::.: :::: :::.::.
CCDS69 PSMAFGVQYPTSVNITLRLGKAYEITYVRLKFHTSRPESFAIYKRSRADGPWEPYQFYSA
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pF1KB5 SCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVL
       ::..::.. .  ..: : ::. :.::.::::::::.::::::::::::::::::..:: :
CCDS69 SCQKTYGRPEGQYLRPGEDERVAFCTSEFSDISPLSGGNVAFSTLEGRPSAYNFEESPGL
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pF1KB5 QEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF
       :::::.:.. ..:.:::::::..:.:::::.:::::.:::.::::::::::::::  .  
CCDS69 QEWVTSTELLISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGRCKCNGHASECGPDVA
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pF1KB5 DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRS
        .:.: :.::: :.:::.:::::.:::: :.:::.: :::::.:.:::.:: :: ::.::
CCDS69 GQLACRCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRS
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pF1KB5 TGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLSTQCDSYGRCSCKP
       :::::.: .:.:.: : :::::.:::..      :. : :. .:::  :::. : :.:::
CCDS69 TGHGGRCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQCDDTGTCACKP
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pF1KB5 GVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPG
        : : ::::: ::::::.:.:::::.:.:.::.: :. ..::: ::.::::  :.::.::
CCDS69 TVTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLDTCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG
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pF1KB5 FFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEW
        :::.  :: ::. :::.:::.::.... ..:. : : :.   .:: :..  :::   .:
CCDS69 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW
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pF1KB5 SSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA
       : .    .:. .    . . :: :::: : .:::: : ..:::   :. : .. : :::.
CCDS69 SPN----GVLLSPEDEEELTAPEKFLGDQRFSYGQPLILTFRVPPGDSPLPVQ-LRLEGT
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pF1KB5 GLRVSVPLIA----QGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKI
       :: .:.   .    :  ..: :. ..  :.:.:...    : : ::.::.:: ::::...
CCDS69 GLALSLRHSSLSGPQDAGHPREVELR--FHLQETSE-DVAPPLPPFHFQRLLANLTSLRL
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       : . .   ::  .: .: :.::::: . ::.::: :.::.:: ::::: :  ::.:: :.
CCDS69 RVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARPGLSPPASWVEICSCPTGYTGQFCESCAPGYKREMPQ
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        :::. :: :.:: :. ::::.::.: :  .: :: ::.:  :.::.  :: ..::::::
CCDS69 GGPYASCVPCTCNQHG-TCDPNTGICVCSHHTEGPSCERCLPGFYGNPFAGQADDCQPCP
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       ::: :.:...:...:::::.:: :  :.:::.::::.::::::  :  . :. :::: :.
CCDS69 CPGQSACTTIPESREVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDPLGLFGHPQPCHQCQCSGNV
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       ::::::::. :.:.::.:..::.: .:..:..::.:. ::: :::::  :.:.: :....
CCDS69 DPNAVGNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALAPRPADKCMPCSCHPQGSVSE
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pF1KB5 QSSCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQC
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CCDS69 QMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRSCKCHPLGSQEDQCHPKTGQC
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pF1KB5 ECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGRCECREGFVGNRCDQ
        :.::.::: :.::... :::. .::. : : : :. : ::...: : :: :: : .::.
CCDS69 TCRPGVTGQACDRCQLGFFGFSIKGCRACRCSPLGAASAQCHENGTCVCRPGFEGYKCDR
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pF1KB5 CEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDR
       :..:.: . .   ::.::.:: :::...:  ...:   :. . .   :.       ..  
CCDS69 CHDNFFLTADGTHCQQCPSCYALVKEEAAKLKARLTLTEGWLQGSDCGSPW---GPLDIL
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pF1KB5 LKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQA
       : :: :   :. .  . .  . . ...... .......   .:: . .  . .   ....
CCDS69 LGEAPRG--DVYQGHHLLPGAREAFLEQMMSLEGAVKAAREQLQRLNKGARCAQAGSQKT
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pF1KB5 RAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEA
        ... . : ..: . .:. .: .  :.. . : :. ..:.. . :: ::: ::. :.. :
CCDS69 CTQLADLEAVLESSEEEILHAAAILASLEIPQ-EGPSQPTKWSHLATEARALARSHRDTA
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pF1KB5 DDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIE-ELNRKYEQAKNISQDLEKQAARV
         :. .:  :  .:. .: ::   : :  ..:.: . .:. .:....  .. :.  .:.:
CCDS69 TKIAATAWRALLASNTSYALLWNLLEG--RVALETQRDLEDRYQEVQAAQKALRTAVAEV
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pF1KB5 HEEAKRAGDKAVEIYASVAQ-LSPLDSE---TLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYED
         ::. .   . .. :..:  :. : :      ...:... ..:. ::. .     ... 
CCDS69 LPEAESVLATVQQVGADTAPYLALLASPGALPQKSRAEDLGLKAKALEKTV----ASWQH
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pF1KB5 L-REDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILN
       .  :  :  .  ..  :.  .::  :  .:  .: :: . :  ... .  :.. :  .: 
CCDS69 MATEAARTLQTAAQATLR--QTEPLT--KLHQEARAALTQASSSVQAATVTVMGARTLLA
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pF1KB5 NLKDFDRRVNDNKTAAEEAL-RKIPAI-NQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKA
       .:. .  .    :  :  :: ::  .. .. .... .::..:.. ::.::  .. ::.:.
CCDS69 DLEGMKLQFPRPKDQA--ALQRKADSVSDRLLADTRKKTKQAERMLGNAAPLSSSAKKKG
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pF1KB5 HEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQL-QEAEKELKRKQDDADQD
       .::: .:.   : : .   : ...  ... : ....  :.:  :..     :.:.  . .
CCDS69 REAEVLAKDSAKLAKALLRERKQAHRRASRLTSQTQATLQQASQQVLASEARRQELEEAE
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pF1KB5 MMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDT--VDLNKLNEIEGTLN
        . ::..     : : . :... :. . .  ...:: .::.:::  .  . ::: . .:.
CCDS69 RVGAGLS-----EMEQQIRESRISLEKDIETLSELLARLGSLDTHQAPAQALNETQWALE
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pF1KB5 KAKDEM-KVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFN
       . . .. . ..:.::.: ::.:...::  :. .. :. ::  : .::: : ..:: .:  
CCDS69 RLRLQLGSPGSLQRKLSLLEQESQQQELQIQGFESDLAEIRADKQNLEAILHSLPENCAS
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pF1KB5 TPSIEKP
              
CCDS69 WQ     
              

>>CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1               (1111 aa)
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                                     :: :    :  :::  :  :   :::::.:
CCDS44                       MPALWLGCCLCFSLLLPAARAT--SRREV--CDCNGKS
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pF1KB5 QECYFDPELYRSTGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLST
       ..: :: ::.:.::.: .: ::.::::: :::.:...:.:  . . :  :.:.  ::::.
CCDS44 RQCIFDRELHRQTGNGFRCLNCNDNTDGIHCEKCKNGFYRHRERDRCLPCNCNSKGSLSA
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       .::. ::::::::: : .:::: :::: ::.:::          :.:::.:    :..  
CCDS44 RCDNSGRCSCKPGVTGARCDRCLPGFHMLTDAGCTQDQRLLDSKCDCDPAGIAGPCDA--
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       ::::::  : :  :.::. :..::...::.::: :::.:::. : ... :::..:.:::.
CCDS44 GRCVCKPAVTGERCDRCRSGYYNLDGGNPEGCTQCFCYGHSASCRSSAEYSVHKITSTFH
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CCDS44 QDVDGWKAVQRNGSPAKLQWSQRHQDVFSSAQRLDPVYFVAPAKFLGNQQVSYGQSLSFD
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CCDS44 SMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDKTQQAERALG
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CCDS13                       MPALWLGCCLCFSLLLPAARAT--SRREV--CDCNGKS
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pF1KB5 EEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTL---AGENQTAFE---IEELNR
       .:: .::: : . :... .... ..: : .: .:. ..:   .: .. . .   .. : .
CCDS13 QEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQGLVE
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pF1KB5 KYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLE-NEANNIKMEA
       : :..:...:.: ..:.... :: :. ......  ::..:. ....... .::. ::..:
CCDS13 KLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLLDSVSRLQGVSDQSFQVEEAKRIKQKA
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       ..: .:. ... ...  .... . . :...::..::. .. .::::.::. ::. :.:: 
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       . :  :. :...::.::..:: .:.. :. ::::....  :.: ...:..::..:..:::
CCDS13 SMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDKTQQAERALG
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       :::::: .::: : :: .:.: ....  : . ::. :   .  ... . .. ....:.: 
CCDS13 SAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAMEKGLASLKSEMREVEG
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       ::.::. . : .:  . :.   ::...  :..:  .. . :. .. ::. . :  .:: .
CCDS13 ELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLLHLMDQPLSVDEE
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pF1KB5 KLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIR
        :  .:  :..:: ... :.:   .:.::..:..:.. .   . .:. :. :..:::.::
CCDS13 GLVLLEQKLSRAKTQIN-SQLRPMMSELEERARQQRGHLHLLETSIDGILADVKNLENIR
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pF1KB5 KTLPSGCFNTPSIEKP
        .:: ::.:: ..:. 
CCDS13 DNLPPGCYNTQALEQQ
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>>CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17               (604 aa)
 initn: 1008 init1: 564 opt: 1548  Z-score: 778.5  bits: 155.5 E(32554): 4.8e-37
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                       .: .::.:::.:  .: .           :::. : :.::.:.:
CCDS11             MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQPDPCSDENGHP
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pF1KB5 QRCMPEFVNAAFNVTVVATNTCGTPPEEYCV--QTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAF
       .::.:.::::::.  : ...::: :: .:::  . :   . .:::::.:..:.  :  ::
CCDS11 RRCIPDFVNAAFGKDVRVSSTCGRPPARYCVVSERGEERL-RSCHLCNASDPKKAHPPAF
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pF1KB5 LTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKR
       ::: ::  . : :::...:   :.: ...::: ::: :..::: :.: . ::::.:::: 
CCDS11 LTDLNNPHNLTCWQSENYL---QFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKS
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pF1KB5 TREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTL
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CCDS11 MDYGRTWVPFQFYSTQCRKMYNRPHRAPI-TKQNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTL
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pF1KB5 EGRPSAYNFDNSPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLK-SYYYAISDFAVGG
       .:::::..::::::::.:::::::::...::.:::::  .: .. . ::.::.::. :::
CCDS11 DGRPSAHDFDNSPVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGG
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pF1KB5 RCKCNGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDC
       ::::::::..:.... :.:::.:.::: : .:..: ::  ::::.::::. :.::. :.:
CCDS11 RCKCNGHAARCVRDRDDSLVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREANECVACNC
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pF1KB5 NGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR-LG----NNEACSS
       : ....: :. :::. .:.  :: : ::. :: : ::. :.:...: .:    . .::..
CCDS11 NLHARRCRFNMELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKA
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pF1KB5 CHCSPVGSLSTQCD-SYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDEC
       : : :::. .  :. . :.: :: :: :  :.::  :... ...   ::           
CCDS11 CDCHPVGAAGKTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ-SRSPIAPCIKIPVAPPTTA
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pF1KB5 NVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSIS
                                                                   
CCDS11 ASSVEEPEDCDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVNIISVYK
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>>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7                (1786 aa)
 initn: 1222 init1: 363 opt: 1209  Z-score: 608.5  bits: 125.6 E(32554): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 2018; 27.6% identity (53.7% similar) in 1701 aa overlap (132-1596:120-1761)

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pF1KB5 GAAFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFA
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CCDS57 NPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAML
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pF1KB5 IYKRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVA
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CCDS57 IERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDD---IICDSRYSDIEPSTEGEVI
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pF1KB5 FSTLEGRPSAYNFDN--SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDP-KVLKSYYYAIS
       : .:.  : :.....  :: .:. .  :..:. . .:.:.::.....  .. ..::::. 
CCDS57 FRALD--P-AFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVY
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pF1KB5 DFAVGGRCKCNGHASEC-----MKNEFDKLV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRR
       :..: : : : ::::::     ...: . .:   : :.::: :..:: :. :..: ::: 
CCDS57 DMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRP
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pF1KB5 ATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR
       : ..... :  :.:: .:  :.::  .: .::.  :: : .:: :: : .::.:.  ...
CCDS57 AEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQ
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pF1KB5 -----LGNNEACSSCHCSPVGSLSTQ-CDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPG
            . . . :  : :.:.:: .   ::::         :.: :: .: :..:: :. :
CCDS57 HPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEG
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pF1KB5 FHSLTEA---GCRPCSCDPSGSI---DECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESS
       :..:.     ::. :.:.: :.:   . :. :::.: ::  : : .:..: :  ..: :.
CCDS57 FYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGL-SN
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pF1KB5 NPRGCTPC----------FCFGHSSVCT---NAVGYSVYSISSTFQ---IDEDGWRAEQR
       .  :: ::           ::..:. :.   . .: .   .   .    .:.  ..::. 
CCDS57 DLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEA
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pF1KB5 D-GSEASLEWSSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVD---RRD
       . :  .:.    ::: :     :.    :.   .  :  .  . .:. .:.. :   : .
CCDS57 NLGPGVSI---VERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPE--GAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYE
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pF1KB5 TRLSAEDLVLEGAGLRVS----VPLIAQ-GNSYPS-----------------------ET
        .:  .    : : . :.    .:  .. ::. :.                       : 
CCDS57 PQLPDH---WEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEK
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pF1KB5 TVKYVFRL----HEATD---------------YPWRPALTPFE----------------F
        ..:. ::    . ..:               .:.  .:  :                 :
CCDS57 GTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETF
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pF1KB5 QK---LLNNLTSIKIRGTYSERSA--------------------GYLDDV----------
       :.   : :. . .:   :   :.                     : :..:          
CCDS57 QRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQC
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pF1KB5 -------TLASARPGP-GVPATWVESCTCPV-GYGGQFCE------MCLSG-YRRETPNL
              :     ::  :   .  . : : . :  . ::.       :..: : :.    
CCDS57 RPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRC
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pF1KB5 GP----YSPCVLCACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDC
        :    .  :  : ::::.. ::: :: : ::.: : : .::.:  :::::   :... :
CCDS57 LPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHC
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CCDS57 MAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKE---LAEQLE-FIKNSDIRGALD
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CCDS57 ELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHN
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CCDS57 AWQKAMDLDQDVLSALAEV-----EQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMD
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CCDS57 KSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADL-----DSIEAVANEVLKM---EMPSTPQQLQNLTED
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CCDS57 IRERV-ESLSQVEVILQHSAA---DIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA
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CCDS57 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEE---LK
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CCDS57 RKAAQNSGEAEY-IEKVVYTVKQSAEDVKKTLD--GELD----EKYKKVENLIAKKTEE-
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CCDS57 -SADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRS
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CCDS57 LLKDISQKVAVYSTCL
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CCDS34 KVLD--PS-FEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDS--LDKYYYA
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CCDS34 LYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQD
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CCDS34 APWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCR
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CCDS34 PLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCD
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CCDS34 QCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWG
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CCDS34 L-GNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYE
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CCDS34 AEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLP-GAGLRFAVNN
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CCDS34 IPFPVDFTIAIHYETQ-SAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLL
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CCDS34 HNCVEIASAM-GPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCK
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CCDS34 PLVVGRCCDRCSTGSYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGRRCDRCL
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CCDS34 AGYFGFPSCHPCPCNRFAELCDPETGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPSSG--QPCR
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pF1KB5 PCPCPG--------GSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVR
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CCDS34 PCLCPDDPSSNQYFAHSCYQNLWSSDVIC-NCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAP--
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pF1KB5 LCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKA
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CCDS34 -CQPCACNNNIDVTDPESCSRVTGECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSALNQT----CRR
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CCDS34 AANMEDKRETLPVCEADFKD-LRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQL
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       :. :.. . ..:....:::.. :   .:   .:. .. :.. :  :. :..: .. .. .
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CCDS34 PDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEA
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CCDS34 KSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKL-G------NIRNQSDSEEENI
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CCDS34 NLFIKKV---KNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDY
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CCDS34 RTDENRLNEEADGAQKLLVKAKA-AEKAANILLNLDKTLNQLQQ-AQITQGRANSTITQL
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        :..: . ..: .  .: .:  .: :: ....  .. . .     :  :.  .::.    
CCDS34 TANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDHAVNAKVQAE
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       .:.... :: . . .: .: .  :  :   .  .:  : ... ::         : :.  
CCDS34 SAQHQAGSLEKEFVELKKQYAILQRKTSTTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRR
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CCDS34 ITDLERKIQDL-NLSRQAKA---DQLRILEDQVVAIKNEIVEQEKKYARCYS       
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CCDS27 NPHSHRIQNVVTSFAPQRRAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAML
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CCDS27 YRVLD--PAIPIPDPYSSRIQNLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLL-DPRREIREKYYYALY
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CCDS27 AEDGHSHACRKCECHGHTHSCHFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYR
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CCDS27 FFGLSISDRLGCRRCQCNARGTVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGL-SH
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CCDS27 WAELELIVQRPGPVPAHSLCGHLVPKDDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLK
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CCDS27 LVRTGGSAQPETPYSGPGLLIDSLVLLPRVLVLEMFSGGDAAALERQATFERYQCHEEGL
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CCDS27 --VPSKTSPSEACAPLLISLSTLIYNGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRR
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pF1KB5 CEMCLSGYRRETPN---------------------------LGPYS-------------P
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CCDS27 CDLCAPGYYGFGPTGCQACQCSHEGALSSLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFP
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pF1KB5 -CVLCACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGG
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CCDS27 SCRPCVCNGHADECNTHTGACLGCRDHTGGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEG
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pF1KB5 --------SSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQC
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CCDS27 PGSQRHFATSCHQDEYSQQIVC-HCRAGYTGLRCEACAPGHFGDP---SRPGGRCQLCEC
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CCDS27 SGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCLHHTEGPHCAHCKPGFHGQA----ARQSCHRCTCNLLG
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       : :  : ::::: ...  .  .:.:. : ::.    :.:.: .:  .:.  . :::..  
CCDS27 RPGVSGVRCDQCARGF--SGIFPACHPCHACFGDWDRVVQDLAARTQRLEQRAQELQQTG
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pF1KB5 -----------LIANLGTGDEMV----TDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQD-VKDVDQN
                  .  .::  . .:    :. :   .: :: .:.   . :: . . ... .
CCDS27 VLGAFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTSAASTAQLVEATEELRREIGEATEHLTQLEAD
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pF1KB5 LMDRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTE--------RLIEIASR
       : : .:  : . .  .: :.  : ... :    .:    .....        :  .  : 
CCDS27 LTD-VQDENFNANHALSGLERDRLALNLTLRQLDQHLDLLKHSNFLGAYDSIRHAHSQSA
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pF1KB5 ELEKAKVAAANVSVTQPES---TGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDT
       : :. .. .. ..: .: :   ..   . .:.  . . .  .:  .   . ...  ..  
CCDS27 EAER-RANTSALAVPSPVSNSASARHRTEALMDAQKEDFNSKHMANQRALGKLSAHTHTL
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       :    : :.    :.   :          .: ..        ..   . ::    :: ..
CCDS27 SLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDEDGQPRCGGLSCNGAAATADLALGRARHTQ
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        : .::  ..  : . ::.     ::. .      ..::    ....  ..:..:: :..
CCDS27 AELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRAQAALDKANASRGQVEQANQELQELI-QSV
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       ::. . .  :  . :. .  .:: .   .    : :: : :  ...::.  :  .: :. 
CCDS27 KDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQIQHLAGAIAERVRSLADVDAILAR-TVG
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pF1KB5 EANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAAADATE
       ..    . :.:  ::.   .. ::.  .:  ... .. ::..    :: :. .:.::. .
CCDS27 DVRRAEQLLQD-ARRA---RSWAEDEKQKAETVQAALEEAQRAQGIAQGAIRGAVADTRD
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pF1KB5 AKNKAHEA-ERIASAVQKNATSTKAEAER---TFAEVTDLDNEVNNMLKQL-QEAEKELK
       ...  ... ::.:.:  . : :. .:  :   .. :.  :    :..  .  .:.    .
CCDS27 TEQTLYQVQERMAGA--ERALSSAGERARQLDALLEALKLKRAGNSLAASTAEETAGSAQ
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pF1KB5 RKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSI--INDLLEQLGQLDTVDLNK
        . ..:.: .. . ...:      .  :::.. ...      . :  ..: :     :..
CCDS27 GRAQEAEQ-LLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQARAEQLRDEARDLLQAAQDKLQR
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pF1KB5 LNEIEGTL--NKAKDEMKVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDI
       :.:.:::   :.   : :...::                                     
CCDS27 LQELEGTYEENERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQVQIYNTCQ             
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>>CCDS10469.1 NTN3 gene_id:4917|Hs108|chr16               (580 aa)
 initn: 1075 init1: 408 opt: 1055  Z-score: 539.2  bits: 111.2 E(32554): 1e-23
Smith-Waterman score: 1172; 39.1% identity (63.0% similar) in 465 aa overlap (18-466:4-446)

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                        ::   .:.:    :: .    :  : : :::: :. :.: .::
CCDS10               MPGWPWGLLLTAGTLFAALSPGPPAPADPCHDEGGAPRGCVPGLVN
                             10        20        30        40      

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pF1KB5 AAFNVTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTT
       ::..  :.:..::: :            .:..:   ::..:.  :. :.::. .. :.  
CCDS10 AALGREVLASSTCGRP------------ATRAC---DASDPRRAHSPALLTSPGGTASPL
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pF1KB5 WWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQ
        :.:...    . : ...::. :::::....: :.: .. : : :. :   .   : :  
CCDS10 CWRSESL---PRAPLNVTLTVPLGKAFELVFVSLRFCSAPPASVALLKSQDHGRSWAPLG
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       ..:. :.  :..        .:   .:::       .:  .: .:::  .. : . ..:.
CCDS10 FFSSHCDLDYGRLPAPANGPAGPGPEALCFPA-PLAQPDGSGLLAFSMQDSSPPGLDLDS
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pF1KB5 SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECM
       :::::.::::::.::.:.: .: ::    : ...  : :: .:. ::::::::::::.:.
CCDS10 SPVLQDWVTATDVRVVLTRPSTAGDP--RDMEAVVPYSYAATDLQVGGRCKCNGHASRCL
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pF1KB5 KNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPE
        .   .:.:.:.:.: : :: .: ::. ::::.::::. .  :: :.:::....: :. :
CCDS10 LDTQGHLICDCRHGTEGPDCGRCKPFYCDRPWQRATARESHACLACSCNGHARRCRFNME
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pF1KB5 LYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR-----LGNNEACSSCHCSPVGSLSTQ
       ::: .:.  :: : ::. :: : ::. :::.:.:     :.. .:: .: : :::. .  
CCDS10 LYRLSGRRSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCREGFYRDPGRALSDRRACRACDCHPVGAAGKT
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pF1KB5 CD-SYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDP--SGSIDECNVETGRCV--
       :. . :.: :: :: :  :.:: :::.. ...   ::   :  . . :   :.   :   
CCDS10 CNQTTGQCPCKDGVTGLTCNRCAPGFQQ-SRSPVAPCVKTPIPGPTEDSSPVQPQDCDSH
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pF1KB5 CKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDED
       ::                                                          
CCDS10 CKPARGSYRISLKKFCKKDYAVQVAVGARGEARGAWTRFPVAVLAVFRSGEERARRGSSA
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>>CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18            (3075 aa)
 initn: 940 init1: 271 opt: 925  Z-score: 467.8  bits: 100.4 E(32554): 9.8e-20
Smith-Waterman score: 2342; 36.6% identity (61.6% similar) in 1067 aa overlap (40-1031:12-1044)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB5 ALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFNVTVVATNTC
                                     :.    : .  .: ..: : :. . .. ::
CCDS32                    MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATC
                                  10        20        30        40 

      70          80           90         100       110       120  
pF1KB5 GTP-PEEYC-VQTGVTGV---TKSCHLCD--AGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQSQT
       :   :: .: .   : :    . .:..::  ...:. .:  .   : .:.    :::: .
CCDS32 GEKGPEMFCKLVEHVPGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNN----WWQSPS
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pF1KB5 MLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKF-HTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSGS
       .  : .:   ...:: : ..:...:: .:  .. :: .. : .:. .   . :.:::. :
CCDS32 IQNGREY-HWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNW-ILERSLDGTTFSPWQYYAVS
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pF1KB5 ---CENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSP
          : . :. . :    :   .....::. .: . ::  :..  : ..:::::   : ::
CCDS32 DSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSAD--DLSP
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pF1KB5 VLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFN---------DPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCN
        : :...:  ::. :.:. :.. ....         :: : . :::.:.:..::: : : 
CCDS32 KLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICY
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pF1KB5 GHASECMKNEFDK-LVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRS
       :::: :  .:  : : :.:.::: : .:..: : ....::: .:. :.. :  :.:....
CCDS32 GHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKA
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pF1KB5 QECYFDPELYR------STGH---GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGN-----NEA
       ..::.:  . .      ..:.   :: : :: .:: : .:: : ....:  .     .: 
CCDS32 KDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEP
           340       350       360       370       380       390   

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pF1KB5 CSSCHCSPVGSLSTQC--DSY----------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGC
       :  :.:.::::::. :  :.           :.: :: :  :.:::::: :...     :
CCDS32 CRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPT--C
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pF1KB5 RPCSCDPSGSI-DE-CNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGH
         :.:.: ::  :: :   :: ::::.::::  :.::::::.::. .:::::. ::::: 
CCDS32 VSCGCNPVGSASDEPC---TGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGV
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pF1KB5 SSVCTN---AVGYSVYSISSTFQIDEDGWRA--EQRDGSEASLEWSSERQDIAVISDSYF
       :.::..    :: .: :.:. .  :  . :    :.:.  .  . :   .. ::..    
CCDS32 SDVCSSLSWPVG-QVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSI--NNTAVMQ-RLA
      510       520        530       540       550         560     

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pF1KB5 PRYF-IAPAKFLGKQVLSYG----QNLSFSFRVDRRDTRL-SAEDLVLEGAGLRVSVPLI
       :.:.  ::  .::... ..:     ..:... :.  :. : :  :....: :: .:.   
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