FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5499, 1609 aa 1>>>pF1KB5499 1609 - 1609 aa - 1609 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0832+/-0.0017; mu= 2.7440+/- 0.101 mean_var=423.5359+/-84.311, 0's: 0 Z-trim(108.5): 163 B-trim: 36 in 1/50 Lambda= 0.062320 statistics sampled from 10093 (10228) to 10093 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16 Scan time: 4.640 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609) 11174 1021.5 0 CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9 (1575) 4558 426.7 3e-118 CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1111) 2508 242.2 7.4e-63 CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1193) 2508 242.2 7.7e-63 CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 ( 604) 1548 155.5 4.8e-37 CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786) 1209 125.6 1.4e-27 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CCDS44 QEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQGLVE 760 770 780 790 800 810 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KB5 KYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLE-NEANNIKMEA : :..:...:.: ..:.... :: :. ...... ::..:. ....... .::. ::..: CCDS44 KLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLLDSVSRLQGVSDQSFQVEEAKRIKQKA 820 830 840 850 860 870 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KB5 ENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAA ..: .:. ... ... .... . . :...::..::. .. .::::.::. ::. :.:: CCDS44 DSLSSLVTRHMDEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRANLAKSRAQEAL 880 890 900 910 920 930 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KB5 KKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALG . : :. :...::.::..:: .:.. :. ::::.... :.: ...:..::..:..::: CCDS44 SMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDKTQQAERALG 940 950 960 970 980 990 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KB5 SAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEK :::::: .::: : :: .:.: .... : . ::. : . ... . .. ....:.: CCDS44 SAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAMEKGLASLKSEMREVEG 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KB5 ELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLN ::.::. . : .: . :. ::... :..: .. . :. .. ::. .: CCDS44 ELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLLHLMGM 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KB5 KLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIR >>CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1193 aa) initn: 3178 init1: 1100 opt: 2508 Z-score: 1241.6 bits: 242.2 E(32554): 7.7e-63 Smith-Waterman score: 3369; 39.9% identity (68.4% similar) in 1305 aa overlap (319-1608:9-1192) 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 NGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRS :: : : ::: : : :::::.: CCDS13 MPALWLGCCLCFSLLLPAARAT--SRREV--CDCNGKS 10 20 30 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 QECYFDPELYRSTGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHCSPVGSLST ..: :: ::.:.::.: .: ::.::::: :::.:...:.: . . : :.:. ::::. 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CCDS13 ------------------------------CPACYNQVKIQMDQFMQQLQRMEALISKAQ 610 620 630 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB5 TGDEMVTDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLMDRLQRVNNTLSSQISRLQNI :: .: : .: :...::. ..:.::.:: . ....: .: .: . .: :::... CCDS13 GGDGVVPDTELEGRMQQAEQALQDILRDAQISEGASRSLGLQLAKVRSQENSYQSRLDDL 640 650 660 670 680 690 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB5 RNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLA . :.:.. :. : . .:..:.::: . : ..... .:... . ::.. :: CCDS13 KMTVERVRALGSQYQNRVRDTHRLITQMQLSLAESEASLGNTNIPASDHYVGPNGFKSLA 700 710 720 730 740 750 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KB5 EEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTL---AGENQTAFE---IEELNR .:: .::: : . :... .... ..: : .: .:. ..: .: .. . . .. : . CCDS13 QEATRLAESHVESASNMEQLTRETEDYSKQALSLVRKALHEGVGSGSGSPDGAVVQGLVE 760 770 780 790 800 810 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KB5 KYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLE-NEANNIKMEA : :..:...:.: ..:.... :: :. ...... ::..:. ....... .::. ::..: CCDS13 KLEKTKSLAQQLTREATQAEIEADRSYQHSLRLLDSVSRLQGVSDQSFQVEEAKRIKQKA 820 830 840 850 860 870 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KB5 ENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAA ..: .:. ... ... .... . . :...::..::. .. .::::.::. ::. :.:: CCDS13 DSLSSLVTRHMDEFKRTQKNLGNWKEEAQQLLQNGKSGREKSDQLLSRANLAKSRAQEAL 880 890 900 910 920 930 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KB5 KKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALG . : :. :...::.::..:: .:.. :. ::::.... :.: ...:..::..:..::: CCDS13 SMGNATFYEVESILKNLREFDLQVDNRKAEAEEAMKRLSYISQKVSDASDKTQQAERALG 940 950 960 970 980 990 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KB5 SAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEK :::::: .::: : :: .:.: .... : . ::. : . ... . .. ....:.: CCDS13 SAAADAQRAKNGAGEALEISSEIEQEIGSLNLEANVTADGALAMEKGLASLKSEMREVEG 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KB5 ELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLN ::.::. . : .: . :. ::... :..: .. . :. .. ::. . : .:: . CCDS13 ELERKELEFDTNMDAVQMVITEAQKVDTRAKNAGVTIQDTLNTLDGLLHLMDQPLSVDEE 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KB5 KLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIR : .: :..:: ... :.: .:.::..:..:.. . . .:. :. :..:::.:: CCDS13 GLVLLEQKLSRAKTQIN-SQLRPMMSELEERARQQRGHLHLLETSIDGILADVKNLENIR 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1600 pF1KB5 KTLPSGCFNTPSIEKP .:: ::.:: ..:. CCDS13 DNLPPGCYNTQALEQQ 1180 1190 >>CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 (604 aa) initn: 1008 init1: 564 opt: 1548 Z-score: 778.5 bits: 155.5 E(32554): 4.8e-37 Smith-Waterman score: 1555; 48.6% identity (74.6% similar) in 453 aa overlap (17-445:5-451) 10 20 30 40 pF1KB5 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAA-AGCA-----------QAAM-DECTDEGGRP .: .::.:::.: .: . :::. : :.::.:.: CCDS11 MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQPDPCSDENGHP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 QRCMPEFVNAAFNVTVVATNTCGTPPEEYCV--QTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQHGAAF .::.:.::::::. : ...::: :: .::: . : . .:::::.:..:. : :: CCDS11 RRCIPDFVNAAFGKDVRVSSTCGRPPARYCVVSERGEERL-RSCHLCNASDPKKAHPPAF 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 LTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKR ::: :: . : :::...: :.: ...::: ::: :..::: :.: . ::::.:::: CCDS11 LTDLNNPHNLTCWQSENYL---QFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKS 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 TREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTL :.:.:.:: .:.. :.. .:. : : .::.:.::: .:. ::.:: .::::: CCDS11 MDYGRTWVPFQFYSTQCRKMYNRPHRAPI-TKQNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 EGRPSAYNFDNSPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLK-SYYYAISDFAVGG .:::::..::::::::.:::::::::...::.::::: .: .. . ::.::.::. ::: CCDS11 DGRPSAHDFDNSPVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGG 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 RCKCNGHASECMKNEFDKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDC ::::::::..:.... :.:::.:.::: : .:..: :: ::::.::::. :.::. :.: CCDS11 RCKCNGHAARCVRDRDDSLVCDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREANECVACNC 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 NGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR-LG----NNEACSS : ....: :. :::. .:. :: : ::. :: : ::. :.:...: .: . .::.. CCDS11 NLHARRCRFNMELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKACKA 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 CHCSPVGSLSTQCD-SYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDEC : : :::. . :. . :.: :: :: : :.:: :... ... :: CCDS11 CDCHPVGAAGKTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ-SRSPIAPCIKIPVAPPTTA 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 NVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGHSSVCTNAVGYSVYSIS CCDS11 ASSVEEPEDCDSYCKASKGKLKINMKKYCKKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVNIISVYK 470 480 490 500 510 520 >>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786 aa) initn: 1222 init1: 363 opt: 1209 Z-score: 608.5 bits: 125.6 E(32554): 1.4e-27 Smith-Waterman score: 2018; 27.6% identity (53.7% similar) in 1701 aa overlap (132-1596:120-1761) 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 GAAFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFA .... : : : .:.. . :.: :: .. CCDS57 NPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAML 90 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 IYKRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVA : . . : :.:.. .:: .. . : .. : .: ...::: : : :.: CCDS57 IERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDD---IICDSRYSDIEPSTEGEVI 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 pF1KB5 FSTLEGRPSAYNFDN--SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDP-KVLKSYYYAIS : .:. : :..... :: .:. . :..:. . .:.:.::..... .. ..::::. CCDS57 FRALD--P-AFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVY 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 DFAVGGRCKCNGHASEC-----MKNEFDKLV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRR :..: : : : :::::: ...: . .: : :.::: :..:: :. :..: ::: CCDS57 DMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRP 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 pF1KB5 ATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGH--GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFR : ..... : :.:: .: :.:: .: .::. :: : .:: :: : .::.:. ... CCDS57 AEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQ 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 -----LGNNEACSSCHCSPVGSLSTQ-CDSY---------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPG . . . : : :.:.:: . :::: :.: :: .: :..:: :. : CCDS57 HPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEG 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 pF1KB5 FHSLTEA---GCRPCSCDPSGSI---DECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESS :..:. ::. :.:.: :.: . :. :::.: :: : : .:..: : ..: :. CCDS57 FYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGL-SN 450 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 pF1KB5 NPRGCTPC----------FCFGHSSVCT---NAVGYSVYSISSTFQ---IDEDGWRAEQR . :: :: ::..:. :. . .: . . . .:. ..::. CCDS57 DLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEA 510 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 pF1KB5 D-GSEASLEWSSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVD---RRD . : .:. ::: : :. :. . : . . .:. .:.. : : . CCDS57 NLGPGVSI---VERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPE--GAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYE 570 580 590 600 610 590 600 610 pF1KB5 TRLSAEDLVLEGAGLRVS----VPLIAQ-GNSYPS-----------------------ET .: . : : . :. .: .. ::. :. : CCDS57 PQLPDH---WEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEK 620 630 640 650 660 670 620 630 640 pF1KB5 TVKYVFRL----HEATD---------------YPWRPALTPFE----------------F ..:. :: . ..: .:. .: : : CCDS57 GTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETF 680 690 700 710 720 730 650 660 670 pF1KB5 QK---LLNNLTSIKIRGTYSERSA--------------------GYLDDV---------- :. : :. . .: : :. : :..: CCDS57 QRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQC 740 750 760 770 780 790 680 690 700 710 pF1KB5 -------TLASARPGP-GVPATWVESCTCPV-GYGGQFCE------MCLSG-YRRETPNL : :: : . . : : . : . ::. :..: : :. CCDS57 RPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRC 800 810 820 830 840 850 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 GP----YSPCVLCACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDC : . : : ::::.. ::: :: : ::.: : : .::.: ::::: :... : CCDS57 LPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHC 860 870 880 890 900 910 780 790 800 810 820 pF1KB5 QPCPCPGGS--------SCAVVPKTKEVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPV .::::: : :: : : ...:. : : :.::. : .::::.: .: CCDS57 RPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACV-CDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGS- 920 930 940 950 960 970 830 840 850 860 870 880 pF1KB5 RLCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCK :. ::: .::: . :.. ::.::::.:.: : .:. :. :..:. : . :. CCDS57 --CQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALQQD----CR 980 990 1000 1010 1020 890 900 910 920 930 pF1KB5 ACNCNPYGTMKQQSS-----CNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDC : :: ::.... . :. .:::: :::.: ::.: : :. ..: :: ::. :.: CCDS57 KCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNC 1030 1040 1050 1060 1070 1080 940 950 960 970 980 990 pF1KB5 HALGSTNGQCDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQC-K .: : . .:. ::::.:.::. :. : .:. .: :. ::: :.: . :: . CCDS57 NAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQ 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB5 DDGRCECREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVAD-----HRVKLQE . :.: : :: : :::.: .. :. .: : : :. : .:. :: :.. CCDS57 STGQCVCVEGVEGPRCDKCTRG--YSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF-LEK 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1060 1070 1080 1090 pF1KB5 LESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKE----------AE--REVMDLLREAQD-VKDVDQ- ..: . : : .. : ...: :: ... .:..::. .::: . CCDS57 AKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEM 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB5 ------NLMDRLQRVNNT---LSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTE-R-LIE .: : .. :.: :.: .. ... ::..: :::: . ..:.. : .. CCDS57 MAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKE---LAEQLE-FIKNSDIRGALD 1270 1280 1290 1300 1310 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB5 IASRELEKAKVAA--ANVSVTQPESTGDPNNMT------LLAEEARKLAERHKQEADDIV .. .. . : .:.:.:.:.:: . . . .. :. .. :.....: . CCDS57 SITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLD 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KB5 RVA-KTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQA--KNISQDLEKQAARVHE ..: : . . : .. : : . . : : . ... : . .. .:. CCDS57 ELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHN 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KB5 EAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMR ..: : .. ...:.. : : . ... :..:.. .: .. : . .: : CCDS57 AWQKAMDLDQDVLSALAEV-----EQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMD 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KB5 GKELEVKNLLEKGKT--EQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNL-KD .. :..::... .. :..:: :. .:.:.:. : . . . :.:: .: CCDS57 KSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADL-----DSIEAVANEVLKM---EMPSTPQQLQNLTED 1500 1510 1520 1530 1540 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KB5 FDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITEANEKTREAQQALGSAA---ADATEAKNKAHEA . .:: .. . .: :.. : :..:. .::..: ::. . : .:. .:: CCDS57 IRERV-ESLSQVEVILQHSAA---DIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KB5 ERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMA :. :..: .. . . : .:....:. . : .: ..... . .... . CCDS57 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEE---LK 1610 1620 1630 1640 1650 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KB5 GMASQAAQEAEINARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEM :.: . ::: .:. .: . .. :. :.:: .: ...:. . : .: CCDS57 RKAAQNSGEAEY-IEKVVYTVKQSAEDVKKTLD--GELD----EKYKKVENLIAKKTEE- 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KB5 KVSDLDRKVSDLENEAKK---QEAAIMDYNRDIEEIMKDI-RNLEDIRKTLPSGCFNTPS .: ::. :.:::: : . .. .:.:. ..: : ::: . : CCDS57 -SADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRS 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KB5 IEKP CCDS57 LLKDISQKVAVYSTCL 1780 >>CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761 aa) initn: 1091 init1: 450 opt: 1186 Z-score: 597.4 bits: 123.5 E(32554): 5.9e-27 Smith-Waterman score: 1931; 27.4% identity (53.5% similar) in 1688 aa overlap (133-1588:114-1747) 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 AAFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAI ... : : : .... : :.: :: .. . CCDS34 PNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLV 90 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 YKRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAF . : : ..:.. .: ... . . : . :: .: ...::: : :::.:.. CCDS34 ERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSGQAQGVGD---IVCDSKYSDIEPSTGGEVVL 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 pF1KB5 STLEGRPSAYNFDN--SPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVF----NDPKVLKSYYYA ..:. :: ....: :: .:. :: :..:.....:.:.:: .. :: : .:::: CCDS34 KVLD--PS-FEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKLHTLGDALLGRRQNDS--LDKYYYA 210 220 230 240 250 280 290 300 310 320 pF1KB5 ISDFAVGGRCKCNGHASEC-----MKNE-FDK--LV---CNCKHNTYGVDCEKCLPFFND . .. : : : :::::::: :... :. .: : :.::: : .::.: ::.: CCDS34 LYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQD 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 RPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTG--HGGHCTNCQDNTDGAHCERCR ::: :. . . : :.::..:..:.:: : ..: :: : .:: ::.: ::.::: CCDS34 APWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCR 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 pF1KB5 ENFFR-----LGNNEACSSCHCSPVGSLSTQ-CDSY---------GRCSCKPGVMGDKCD :.: ... :: :.:.: :..: : :. :.: :: .: : ::: CCDS34 PLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCD 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 RCQPGFHSLTEA---GCRPCSCDPSGSID--ECNVETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFN .:.:. ..:. . ::.::.:.: ::. :.:.::.:.: . : : .::.: :... 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CCDS34 AANMEDKRETLPVCEADFKD-LRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB5 NNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQ :. :.. . ..:....:::.. : .: .:. .. :.. : :. :..: .. .. . CCDS34 NEQLKA-VYEFQDLKDTIERAKN---EADLLLEDLQEEIDLQSSVLN-ASIADSSENIKK 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB5 PESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRVAKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTA .. . . .:. . . . .:.. . :: : :: :. : .. CCDS34 YYHISSSAEKKI--NETSSTINTSANTRNDLLTIL----DTLTSKGNLSLERL--KQIKI 1320 1330 1340 1350 1360 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KB5 FEIEELNRKYE-QAKNISQ-DLEKQAA-----RVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDS .:. ::.: . :. : .: . :.. . : .. .. : . .. CCDS34 PDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGALCTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KB5 ET----LENEANNIKMEAENLEQLIDQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTA .. :.... ..: . :.. . . . .. .::: . : :. ... .:... CCDS34 KSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVSKNNALQLREKL-G------NIRNQSDSEEENI 1430 1440 1450 1460 1470 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KB5 DQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILN-NLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAI . .. .. : . : .: . :: .:. .: .. ..:. . .. .. CCDS34 NLFIKKV---KNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPIPSQNLTDELVKIQKHMQLCEDY 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KB5 NQTITEANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTF--- .. ::.. ::. : .: : : .: : . .. . .:. : :...:. :. CCDS34 RTDENRLNEEADGAQKLLVKAKA-AEKAANILLNLDKTLNQLQQ-AQITQGRANSTITQL 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KB5 -AEVTDLDNEVNNMLKQLQE--AEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAEINAR---- :..: . ..: . .: .: .: :: .... .. . . : :. .::. CCDS34 TANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQRSGLEDGLSLLQTKLQRHQDHAVNAKVQAE 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KB5 KAKNSVTSLLSIINDLLEQLG--QLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKD---------EMKV-- .:.... :: . . .: .: . : : . .: : ... :: : :. CCDS34 SAQHQAGSLEKEFVELKKQYAILQRKTSTTGLTKETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRR 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KB5 -SDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGCFNTPSIEKP .::.::..:: : ... .: : : .:. . :.: CCDS34 ITDLERKIQDL-NLSRQAKA---DQLRILEDQVVAIKNEIVEQEKKYARCYS 1720 1730 1740 1750 1760 >>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798 aa) initn: 1084 init1: 362 opt: 1103 Z-score: 556.9 bits: 116.1 E(32554): 1.1e-24 Smith-Waterman score: 1856; 26.8% identity (51.0% similar) in 1673 aa overlap (132-1555:132-1774) 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 GAAFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFA .... : : : .:.. . :.: :: .. 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