Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5507
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5507, 596 aa
1>>>pF1KB5507 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5848+/-0.000891; mu= 12.8776+/- 0.054
mean_var=88.4685+/-17.669, 0's: 0 Z-trim(108.1): 116 B-trim: 215 in 2/49
Lambda= 0.136358
statistics sampled from 9850 (9972) to 9850 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41483.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 ( 596) 3947 786.6 0
CCDS7067.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 ( 542) 3393 677.6 1.1e-194
CCDS46854.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 558) 1957 395.1 1.2e-109
CCDS74948.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 532) 1936 391.0 2e-108
CCDS2878.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 526) 1873 378.6 1.1e-104
CCDS46855.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 532) 1867 377.4 2.5e-104
CCDS82664.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1716) 366 82.3 5.5e-15
CCDS33545.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1721) 366 82.3 5.5e-15
CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1670) 316 72.5 4.9e-12
CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1697) 316 72.5 5e-12
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8 (1606) 305 70.3 2.1e-11
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 293 67.9 6.3e-11
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 912) 293 67.9 6.6e-11
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 927) 293 67.9 6.7e-11
>>CCDS41483.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 (596 aa)
initn: 3947 init1: 3947 opt: 3947 Z-score: 4197.2 bits: 786.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3947; 100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB5 VSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPGIRRARDKALSGGKRKETLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPGIRRARDKALSGGKRKETLV
550 560 570 580 590
>>CCDS7067.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 (542 aa)
initn: 3393 init1: 3393 opt: 3393 Z-score: 3608.8 bits: 677.6 E(32554): 1.1e-194
Smith-Waterman score: 3393; 97.5% identity (98.3% similar) in 529 aa overlap (68-596:14-542)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 SELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLAR
:: . :: . : . .::::::::::::
CCDS70 MVAHDETGGLLPIKRTIRVLDVNNQSFREQEEPSNKRVRPLAR
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 VTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWS
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 DQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQ
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 LLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKS
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFS
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 NSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 NSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPE
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 LHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPG
470 480 490 500 510 520
580 590
pF1KB5 IRRARDKALSGGKRKETLV
:::::::::::::::::::
CCDS70 IRRARDKALSGGKRKETLV
530 540
>>CCDS46854.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 (558 aa)
initn: 1918 init1: 1693 opt: 1957 Z-score: 2081.9 bits: 395.1 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1957; 62.5% identity (87.3% similar) in 456 aa overlap (47-499:25-479)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 SRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN-WDFT-LKRKRREKDD
.: ..: . :.:. :.: :::. .:.
CCDS46 MDSSTAMNQCSCRGMEENKERPKRQRQNNFP-MFPSPKAWNFRGRKRKQSTQDE
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 DVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPA
:.::: :::..:::::::.::.::::::::: ::. ..::.::.: :...:.. :
CCDS46 DAVSLCSLDISEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDI
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 SAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDL
: . ::...:. .:::.: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.::::::
CCDS46 LAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 KLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHIL
:::.:::::::::::::.:.::..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: ::
CCDS46 KLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPIL
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRS
:.::: :..: .:::::.:::::::.:::: :::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS46 VGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRS
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 RLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLD
:::::::::.:::.:::...:: : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.
CCDS46 RLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLE
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 EKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPV
: :.: :..:.:: :::::... : ::..::::..::.:: ::.::. ::.:::::::
CCDS46 EGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPV
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 QELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWF
..:.:::::::.::.:::.::::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.
CCDS46 KDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWL
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 NCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENA
:::: :
CCDS46 NCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSE
480 490 500 510 520 530
>>CCDS74948.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 (532 aa)
initn: 1918 init1: 1693 opt: 1936 Z-score: 2059.9 bits: 391.0 E(32554): 2e-108
Smith-Waterman score: 1936; 64.1% identity (88.5% similar) in 435 aa overlap (66-499:19-453)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 SGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPL
:::. .:.:.::: :::..:::::::.::
CCDS74 MRSERPMVWCCLFVRSQRKRKQSTQDEDAVSLCSLDISEPSNKRVKPL
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSA
.::::::::: ::. ..::.::.: :...:.. : : . ::...:. .:::.:
CCDS74 SRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSK
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEE
:::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.:.:
CCDS74 LWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQE
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAK
:..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: :::.::: :..: .:::::.:::
CCDS74 LNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAK
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 ALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHP
::::.:::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.:::...:
CCDS74 ALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNP
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 DVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELR
: : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.: :.: :..:.:: :::::.
CCDS74 DQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELK
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRG
.. : ::..::::..::.:: ::.::. ::.:::::::..:.:::::::.::.:::.::
CCDS74 NNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRG
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 AFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQG
::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.:::: :
CCDS74 AFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLD
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 LPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQT
CCDS74 SEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHG
470 480 490 500 510 520
>>CCDS2878.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 (526 aa)
initn: 1853 init1: 1693 opt: 1873 Z-score: 1993.0 bits: 378.6 E(32554): 1.1e-104
Smith-Waterman score: 1873; 62.3% identity (86.5% similar) in 438 aa overlap (63-499:10-447)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRV
.:.:: . .: . : .:::::::
CCDS28 MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRV
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 RPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRR
.::.::::::::: ::. ..::.::.: :...:.. : : . ::...:. .:::
CCDS28 KPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRR
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 SSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMS
.: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.
CCDS28 DSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMT
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQL
:.::..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: :::.::: :..: .:::::.
CCDS28 EQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 AAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPK
:::::::.:::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.:::.
CCDS28 AAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPN
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 EHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHG
..:: : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.: :.: :..:.:: :::
CCDS28 DNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHG
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 ELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGS
::... : ::..::::..::.:: ::.::. ::.:::::::..:.:::::::.::.:::
CCDS28 ELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGS
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 FRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPE
.::::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.:::: :
CCDS28 LRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAG
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520 530 540 550 560 570
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CCDS28 VLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNS
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.:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.:.::..::: ::: :::::.::
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: ::.::. ::.:::::::..:.:::::::.::.:::.::::::.:. ::.::. :..
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: .:.:.:::::.:.::::.:::: :
CCDS46 SQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGET
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: : .. :: :. :. . .... . . : :..... : . :.::
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. . . .: : :: :. .. . .. ...: : : . : .
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..:.:.. :: . : . :: . : .: :..:: :: . ::... : .
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pF1KB5 CSNQLAAKALLDQKKQD-PRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEI
:: :: . ::..:: .. : ..:..: .: . . : ::. : .:...:::..:.:
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CCDS33 ILIRKKN-----PGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALA
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110 120 130 140
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. . . .: : :: :. .. . .. ...: : : . : .
CCDS33 AVCQVIGMYDYTAQNDDELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPS-NYVKLTTD
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CCDS33 CSRQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKRLAMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNI
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CCDS33 LENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQVNEGVREKENS---DRLEWIQAHVQCEGLSEQL
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CCDS33 VFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLLTQITKPLGSSGTDKVFSPKS
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CCDS33 LRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKP
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:. ... : .:: :.:. . :. . ::.:. .... : . ....: :..
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:::.:: .: ..::.. .: . . : ::: : .:...::::.. ::..::. :
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. :: ..:.... : :..: .:.: : . .::.....
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pF1KB5 HKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQV
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CCDS17 ERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKS
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10 20 30 40
pF1KB5 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADT-SGSELDGRCSLRR
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CCDS17 GSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSE---QLSLAP
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pF1KB5 GSSFTFLTPGPN--WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRV----RPLARVTSLA
:. . .: . . :. :. . .... : . : ::..:. .:. .: ..
CCDS17 GQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMY
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pF1KB5 NLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRS-----SALWS
. . .. :: :. .. : . ... . . :. . . : :
CCDS17 DYAANNEDELSFSKGQLIN--VMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWC
1140 1150 1160 1170 1180 1190
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
:. ... : .:: :.:. . :. . ::.:. .... : . ....: :..
CCDS17 A--DLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMAL
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KB5 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGT---VEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAK
:: . : . :: . : : :..:: ::.. : ...:: .:: :: .
CCDS17 IFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGA
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pF1KB5 ALLDQKK-QDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEH
:::.:: .: ..::.. .: . . : ::: : .:...::::.. ::..::. :
CCDS17 ALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESH
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pF1KB5 PDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLD-----EKQRDPRIEAS----
: . :. :. . . :..: :.: . :.::... : . : :
CCDS17 ADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENS---DRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNC
1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KB5 ---KVLLCHGEL-RSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTR------NER-------HSYQVY
. :: :.: ..::...:. :::.:.:.:: : . .:. ....:
CCDS17 LGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMY
1430 1440 1450 1460 1470 1480
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pF1KB5 RQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVF
. :: ..:.... : :..: .:.: : . .::.....
CCDS17 KTPIFLNEVLVKLPTDP------------SSDEP---VFHISHID----RVYTLRTDNIN
1490 1500 1510 1520 1530
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pF1KB5 HKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQV
.. : . :.::
CCDS17 ERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKS
1540 1550 1560 1570 1580 1590
596 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 21:36:37 2016 done: Sat Nov 5 21:36:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]