Result of FASTA (omim) for
pF1KB5513
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5513, 700 aa
1>>>pF1KB5513 700 - 700 aa - 700 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2304+/-0.000399; mu= 20.8093+/- 0.025
mean_var=80.6271+/-15.758, 0's: 0 Z-trim(112.0): 134 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.142835
statistics sampled from 20571 (20724) to 20571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 10.940
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subun ( 700) 4732 985.5 0
NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic su ( 622) 4207 877.3 0
NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalyti ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
NP_001185798 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
XP_011542588 (OMIM: 114230) PREDICTED: calpain-2 c ( 447) 3009 630.3 4.8e-180
NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens] ( 739) 2642 554.9 4.1e-157
XP_006715047 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 740) 2642 554.9 4.1e-157
XP_011512577 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 743) 2642 554.9 4.1e-157
XP_011512576 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 744) 2642 554.9 4.1e-157
XP_006715048 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 724) 2571 540.2 1e-152
NP_775110 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 729) 2496 524.8 4.6e-148
NP_006606 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 1 [Homo ( 690) 2440 513.2 1.3e-144
XP_011542319 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 721) 2409 506.9 1.1e-142
XP_006715050 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 650) 2301 484.6 5.3e-136
NP_001306605 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 3 [H ( 627) 1985 419.4 2.1e-116
XP_011542321 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 658) 1954 413.1 1.8e-114
XP_016855588 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 495) 1696 359.8 1.5e-98
XP_011542322 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 526) 1665 353.4 1.3e-96
XP_011531165 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
NP_001138594 (OMIM: 610229) calpain-14 isoform 1 [ ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
XP_011531167 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
XP_011531166 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
XP_016881846 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 699) 1538 327.4 1.2e-88
XP_016881847 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 698) 1505 320.6 1.3e-86
XP_016881845 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 702) 1467 312.7 3e-84
XP_016881854 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 503) 1362 291.0 7.7e-78
XP_016881852 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 565) 1362 291.0 8.4e-78
XP_016881851 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 590) 1362 291.0 8.7e-78
XP_016881850 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 604) 1362 291.0 8.8e-78
XP_016881849 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 652) 1362 291.1 9.4e-78
XP_016881848 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 676) 1362 291.1 9.6e-78
NP_653292 (OMIM: 608839) calpain-12 [Homo sapiens] ( 719) 1362 291.1 1e-77
XP_016881844 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 723) 1362 291.1 1e-77
NP_057536 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 2 [Homo ( 664) 1144 246.1 3.2e-64
XP_011542320 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 695) 1144 246.2 3.3e-64
XP_011531168 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 508) 1008 218.0 7.1e-56
NP_001308199 (OMIM: 610229) calpain-14 isoform 2 [ ( 508) 1008 218.0 7.1e-56
XP_016855587 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 693) 925 201.0 1.3e-50
XP_011531465 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 433) 903 196.3 2e-49
XP_016860755 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 665) 903 196.5 2.8e-49
XP_016860754 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 903 196.5 2.8e-49
NP_653176 (OMIM: 610228) calpain-13 [Homo sapiens] ( 669) 903 196.5 2.8e-49
XP_011531463 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 903 196.5 2.8e-49
XP_016860753 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 903 196.5 2.8e-49
XP_011531462 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 903 196.5 2.8e-49
XP_011531461 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 903 196.5 2.8e-49
NP_077320 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 815) 886 193.1 3.7e-48
>>NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subunit i (700 aa)
initn: 4732 init1: 4732 opt: 4732 Z-score: 5269.6 bits: 985.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4732; 99.7% identity (99.7% similar) in 700 aa overlap (1-700:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSAL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYESKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 LEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 MDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYIL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 WTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVARFADDQLIIDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVARFADDQLIIDFD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB5 NFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
670 680 690 700
>>NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subuni (622 aa)
initn: 4207 init1: 4207 opt: 4207 Z-score: 4685.6 bits: 877.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4207; 99.7% identity (99.7% similar) in 621 aa overlap (80-700:2-622)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 SFPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 AIASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVH
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVH
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 SAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYESKKPPPNLFKIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_001 SAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQ
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 KALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWG
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 EVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLT
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 SDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLV
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 GLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLR
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 EVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDD
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 IDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGS
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 GKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVAR
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 FADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
580 590 600 610 620
>>NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic su (714 aa)
initn: 3153 init1: 1962 opt: 3179 Z-score: 3540.0 bits: 665.5 E(85289): 1.9e-190
Smith-Waterman score: 3179; 62.5% identity (86.7% similar) in 701 aa overlap (3-700:13-713)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPS
:..:.. :.: ::: :: :::::.:::: :: .::..::::.: .
NP_005 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAA
:: .:..::.:.::: :::: ::.::::::. ..::::. ::::::::::::::::::::
NP_005 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHS
:::::::. .: :::: .: ::..::::::::.::.::::.::::: :: :::.:.::::
NP_005 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYESKKPPPNLFKIIQK
:::.:::::::::::::.:: :::::::.:.:::::::::..:::: .: : .:..:: :
NP_005 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGE
::..::::::::::.:. : :::::.:::::::::::::..:. :.. .:::.::::::
NP_005 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTS
::::: :.:. ::..:: ::..: . ::::::::: ::.:...::::::::::.: :
NP_005 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB5 DTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDG--ESGCTFL
: .::. : ..:.:::::::::::::: :::.:::. :.:.: :. .. : ::::.:.
NP_005 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 VGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINL
..:.::::::.:..:.::.::::..:::: :: :: .::...:::.: .: ::. ::::
NP_005 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 REVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDI-SE
::: .::.::::::..:::::::::.::: .: ::::.: .::.:.::: . .. ::
NP_005 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
490 500 510 520 530 540
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XP_011 KELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEI
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:::::::::::::::::::
XP_011 KMGEDMHTIGFGIYEVPEEEKTESGKR
430 440
>>NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens] (739 aa)
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10 20 30
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: :. :.:.:.. :: ::.:.::. :. :..: ...:::: .: ::.:... ..::.
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NP_008 WELDEVNYAEQLQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIKFKSFK
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. ::....:. :....:.:::::::: :: ::: :..:.. :.:: : :.:::.::::::
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pF1KB5 LDLISWLCFSVL
:.: .::
NP_008 LSLEQWLQMTMWG
730
>>XP_006715047 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 isof (740 aa)
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XP_006 SPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQSFKKNYAGIFHFQIWQFGQWVNV
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XP_006 QSFQLQRPPQNLLRLLRKAVERSSLMGCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDV
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pF1KB5 ESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFL
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XP_006 HYRGKMETLIRVRNPWGRIEWNGAWSDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
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450 460 470 480 490 500
pF1KB5 KNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADY
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pF1KB5 KALEEAGFKMPCQLHQVIVARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIE
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XP_006 LSLEQWLQMTMWG
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700 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]