Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5514
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5514, 447 aa
1>>>pF1KB5514 447 - 447 aa - 447 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1318+/-0.00105; mu= 12.9834+/- 0.062
mean_var=72.0855+/-14.131, 0's: 0 Z-trim(103.0): 32 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.151060
statistics sampled from 7197 (7216) to 7197 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34867.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 ( 447) 2998 663.0 1.7e-190
CCDS55213.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 ( 457) 2986 660.4 1.1e-189
CCDS73224.1 PPP2R2D gene_id:55844|Hs108|chr10 ( 453) 2739 606.6 1.7e-173
CCDS64282.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 449) 2679 593.5 1.4e-169
CCDS4283.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 446) 2606 577.6 8.9e-165
CCDS64281.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 501) 2606 577.6 9.9e-165
CCDS4284.2 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 509) 2606 577.6 1e-164
CCDS43380.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 432) 2601 576.5 1.8e-164
CCDS3387.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 447) 2495 553.4 1.7e-157
CCDS56304.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 430) 2484 551.0 8.6e-157
CCDS56305.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 440) 2484 551.0 8.8e-157
CCDS3388.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 447) 2484 551.0 9e-157
>>CCDS34867.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 (447 aa)
initn: 2998 init1: 2998 opt: 2998 Z-score: 3533.5 bits: 663.0 E(32554): 1.7e-190
Smith-Waterman score: 2998; 100.0% identity (100.0% similar) in 447 aa overlap (1-447:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 MTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKIL
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB5 HTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
430 440
>>CCDS55213.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 (457 aa)
initn: 2986 init1: 2986 opt: 2986 Z-score: 3519.2 bits: 660.4 E(32554): 1.1e-189
Smith-Waterman score: 2986; 100.0% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (3-447:13-457)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MFPKFSLRSMFHGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 RVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVIT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 AAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCW
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 NGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISV
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KB5 DSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
430 440 450
>>CCDS73224.1 PPP2R2D gene_id:55844|Hs108|chr10 (453 aa)
initn: 2814 init1: 2728 opt: 2739 Z-score: 3228.3 bits: 606.6 E(32554): 1.7e-173
Smith-Waterman score: 2739; 87.9% identity (96.9% similar) in 453 aa overlap (1-447:1-453)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAGAGGG------NDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVI
::::::: ::.::::::::::.:.::::::::::::::.::.:::::::::::::
CCDS73 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLST
::.::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::
CCDS73 FQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLST
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 NDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFAN
:::::::::::::::: ::::::.:::: ::: .:.::::...::::::::::::::::
CCDS73 NDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFAN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 HPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFS
::..::.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS73 HPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 HSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
:::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLD
:..::::::::::::::.:.::.:::::::..:::. :::::::..:::.::::::::::
CCDS73 SAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLD
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KB5 FNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
:::::::::::: .:.::::.::::::::::.:
CCDS73 FNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
430 440 450
>>CCDS64282.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (449 aa)
initn: 2679 init1: 2679 opt: 2679 Z-score: 3157.7 bits: 593.5 E(32554): 1.4e-169
Smith-Waterman score: 2679; 87.7% identity (97.5% similar) in 439 aa overlap (9-447:11-449)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQE
: ::::::::... ..::::::::::::.:::::::::::::::::.:
CCDS64 MIPGIGTLTQDTLWCFSQVKGTIEIGTTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQRE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKT
::.: : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::
CCDS64 QESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTNDKT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTY
.::::.:::::::::::::.:.:: :::.:.:::::::.:::::::::.:::.:::::::
CCDS64 VKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAHTY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 HINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNS
::::::.:::::::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::.
CCDS64 HINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPHH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 CNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGR
:::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 YMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVM
:.::::::.::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS64 YIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSVIM
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 TGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKK
::::::::::::::::::.::::::::.:::..:::::::..:::.:::::::::::.::
CCDS64 TGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFSKK
370 380 390 400 410 420
420 430 440
pF1KB5 ILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
::::::::.:::::::.::::::::::::
CCDS64 ILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
430 440
>>CCDS4283.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (446 aa)
initn: 2606 init1: 2606 opt: 2606 Z-score: 3071.8 bits: 577.6 E(32554): 8.9e-165
Smith-Waterman score: 2606; 89.3% identity (98.3% similar) in 421 aa overlap (27-447:26-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQE
::::::::::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS42 MKCFSRYLPYIFRPPNTILSSSCHTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQREQE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIK
.: : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::.:
CCDS42 SKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTNDKTVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHI
:::.:::::::::::::.:.:: :::.:.:::::::.:::::::::.:::.:::::::::
CCDS42 LWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAHTYHI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCN
::::.:::::::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::. ::
CCDS42 NSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPHHCN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYM
:::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS42 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 MTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTG
::::::.::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :::::::.:::
CCDS42 MTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSVIMTG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKIL
::::::::::::::::.::::::::.:::..:::::::..:::.:::::::::::.::::
CCDS42 SYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFSKKIL
360 370 380 390 400 410
430 440
pF1KB5 HTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
::::::.:::::::.::::::::::::
CCDS42 HTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
420 430 440
>>CCDS64281.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (501 aa)
initn: 2606 init1: 2606 opt: 2606 Z-score: 3070.9 bits: 577.6 E(32554): 9.9e-165
Smith-Waterman score: 2606; 89.3% identity (98.3% similar) in 421 aa overlap (27-447:81-501)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQ
::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS64 PTQVSLLSMEEDIDTRKINNSFLRDHSYATEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQ
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTND
.:::.: : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::
CCDS64 REQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTND
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAH
::.::::.:::::::::::::.:.:: :::.:.:::::::.:::::::::.:::.:::::
CCDS64 KTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAH
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
::::::::.:::::::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS
. :::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSV
:::.::::::.::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS64 GRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSV
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFN
.:::::::::::::::::::.::::::::.:::..:::::::..:::.:::::::::::.
CCDS64 IMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFS
420 430 440 450 460 470
420 430 440
pF1KB5 KKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
::::::::::.:::::::.::::::::::::
CCDS64 KKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
480 490 500
>>CCDS4284.2 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (509 aa)
initn: 2606 init1: 2606 opt: 2606 Z-score: 3070.8 bits: 577.6 E(32554): 1e-164
Smith-Waterman score: 2606; 89.3% identity (98.3% similar) in 421 aa overlap (27-447:89-509)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQ
::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS42 PTQVSLLSMEEDIDTRKINNSFLRDHSYATEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQ
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTND
.:::.: : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::
CCDS42 REQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTND
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAH
::.::::.:::::::::::::.:.:: :::.:.:::::::.:::::::::.:::.:::::
CCDS42 KTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAH
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
::::::::.:::::::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS
. :::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSV
:::.::::::.::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS42 GRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSV
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFN
.:::::::::::::::::::.::::::::.:::..:::::::..:::.:::::::::::.
CCDS42 IMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFS
420 430 440 450 460 470
420 430 440
pF1KB5 KKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
::::::::::.:::::::.::::::::::::
CCDS42 KKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
480 490 500
>>CCDS43380.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (432 aa)
initn: 2601 init1: 2601 opt: 2601 Z-score: 3066.1 bits: 576.5 E(32554): 1.8e-164
Smith-Waterman score: 2601; 89.1% identity (98.3% similar) in 421 aa overlap (27-447:12-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQE
.:::::::::::.:::::::::::::::::.:::
CCDS43 MNYPDENTYGNKADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQREQE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIK
.: : : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::.:
CCDS43 SKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTNDKTVK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHI
:::.:::::::::::::.:.:: :::.:.:::::::.:::::::::.:::.:::::::::
CCDS43 LWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAHTYHI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCN
::::.:::::::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::. ::
CCDS43 NSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPHHCN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYM
:::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS43 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 MTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTG
::::::.::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :::::::.:::
CCDS43 MTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSVIMTG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKIL
::::::::::::::::.::::::::.:::..:::::::..:::.:::::::::::.::::
CCDS43 SYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFSKKIL
350 360 370 380 390 400
430 440
pF1KB5 HTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
::::::.:::::::.::::::::::::
CCDS43 HTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
410 420 430
>>CCDS3387.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 (447 aa)
initn: 2495 init1: 2495 opt: 2495 Z-score: 2941.0 bits: 553.4 E(32554): 1.7e-157
Smith-Waterman score: 2495; 84.6% identity (96.7% similar) in 423 aa overlap (25-447:21-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQE
:.::::::::::::.:::::::::::::::::.: :
CCDS33 MGEDTDTRKINHSFLRDHSYVTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQREPE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIK
.: ::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.::::.:::. ::::::::::
CCDS33 SKNAPHSQGEYDVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIKWLPQQNAAHSLLSTNDKTIK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHI
::::.::::::::::::.:.:. .: .:::.:.:::..:::::::.::::::::.:::::
CCDS33 LWKITERDKRPEGYNLKDEEGKLKDLSTVTSLQVPVLKPMDLMVEVSPRRIFANGHTYHI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCN
::::.::: :::.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::.::::. ::
CCDS33 NSISVNSDCETYMSADDLRINLWHLAITDRSFNIVDIKPANMEDLTEVITASEFHPHHCN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYM
::::::::..:::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS33 LFVYSSSKGSLRLCDMRAAALCDKHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSVSDVKFSHSGRYM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 MTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTG
.:::::.::.:::::: ::.::::::.::::::::::::::::::::: :::::::.:::
CCDS33 LTRDYLTVKVWDLNMEARPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECAWNGSDSVIMTG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKIL
.:::::::::::::::.:::::::..:::.:::::.::..:::..:.::::::::.::::
CCDS33 AYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRESSKPRAVLKPRRVCVGGKRRRDDISVDSLDFTKKIL
360 370 380 390 400 410
430 440
pF1KB5 HTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
:::::: :::::.:.::::::::::::
CCDS33 HTAWHPAENIIAIAATNNLYIFQDKVNSDMH
420 430 440
>>CCDS56304.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 (430 aa)
initn: 2484 init1: 2484 opt: 2484 Z-score: 2928.3 bits: 551.0 E(32554): 8.6e-157
Smith-Waterman score: 2484; 84.8% identity (96.7% similar) in 420 aa overlap (28-447:7-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVIFQQEQE
:::::::::::.:::::::::::::::::.: :
CCDS56 MGKRDTADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQREPE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLSTNDKTIK
.: ::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.::::.:::. ::::::::::
CCDS56 SKNAPHSQGEYDVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIKWLPQQNAAHSLLSTNDKTIK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFANAHTYHI
::::.::::::::::::.:.:. .: .:::.:.:::..:::::::.::::::::.:::::
CCDS56 LWKITERDKRPEGYNLKDEEGKLKDLSTVTSLQVPVLKPMDLMVEVSPRRIFANGHTYHI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCN
::::.::: :::.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::.::::. ::
CCDS56 NSISVNSDCETYMSADDLRINLWHLAITDRSFNIVDIKPANMEDLTEVITASEFHPHHCN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHSGRYM
::::::::..:::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS56 LFVYSSSKGSLRLCDMRAAALCDKHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSVSDVKFSHSGRYM
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 MTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSVVMTG
.:::::.::.:::::: ::.::::::.::::::::::::::::::::: :::::::.:::
CCDS56 LTRDYLTVKVWDLNMEARPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECAWNGSDSVIMTG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLDFNKKIL
.:::::::::::::::.:::::::..:::.:::::.::..:::..:.::::::::.::::
CCDS56 AYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRESSKPRAVLKPRRVCVGGKRRRDDISVDSLDFTKKIL
340 350 360 370 380 390
430 440
pF1KB5 HTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
:::::: :::::.:.::::::::::::
CCDS56 HTAWHPAENIIAIAATNNLYIFQDKVNSDMH
400 410 420 430
447 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:36:49 2016 done: Thu Nov 3 22:36:49 2016
Total Scan time: 2.280 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]