Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5522
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5522, 382 aa
1>>>pF1KB5522 382 - 382 aa - 382 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5107+/-0.00114; mu= 15.4021+/- 0.067
mean_var=210.2084+/-78.939, 0's: 0 Z-trim(103.8): 297 B-trim: 904 in 2/48
Lambda= 0.088460
statistics sampled from 7072 (7593) to 7072 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 2478 330.2 1.9e-90
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 1262 175.0 9.9e-44
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 1030 145.4 8.3e-35
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 828 119.6 4.6e-27
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 828 119.6 4.7e-27
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 814 117.8 1.6e-26
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 727 106.7 3.4e-23
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 714 105.0 1.1e-22
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 444 70.5 2.5e-12
CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 362) 416 67.0 3.1e-11
CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 377) 416 67.0 3.1e-11
>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 2478 init1: 2478 opt: 2478 Z-score: 1737.3 bits: 330.2 E(32554): 1.9e-90
Smith-Waterman score: 2478; 100.0% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (1-382:1-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFII
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CCDS77 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLR
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CCDS77 LENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIM
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CCDS77 EGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKN
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CCDS77 GWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLA
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CCDS77 ISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDNSSH
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CCDS77 VLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDNSSH
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB5 PQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
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CCDS77 PQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
370 380
>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa)
initn: 1295 init1: 816 opt: 1262 Z-score: 898.6 bits: 175.0 E(32554): 9.9e-44
Smith-Waterman score: 1275; 55.8% identity (81.6% similar) in 353 aa overlap (28-375:21-362)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLN--ISADKENSIKLTSVVFILICCF
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CCDS66 MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGKLAGRLKEASEGST-LTTVLFLVICSF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 IILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWF
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CCDS66 IVLENLMVLIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLP
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CCDS66 LREGSMFVALGASTCSLLAIAIERHLTMIKMRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFTLGALP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IMGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFR
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CCDS66 ILGWNCLHNLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAILVTIVILYARIYFLVKSSSRKVANH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLV
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CCDS66 NN-------SERSMALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLIDVACRVQACPILFKAQWFIV
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKS---
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CCDS66 LAVLNSAMNPVIYTLASKEMRRAFFRLV--CNCLV-RGRGARASPIQPALDPSRSKSSSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380
pF1KB5 DNSSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
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CCDS66 NNSSHSPKVKEDLPHTAPSSCIMDKNAALQNGIFCN
350 360 370
>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa)
initn: 1074 init1: 663 opt: 1030 Z-score: 738.4 bits: 145.4 E(32554): 8.3e-35
Smith-Waterman score: 1071; 47.5% identity (72.1% similar) in 373 aa overlap (23-376:13-383)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENS-IKLTSVVFILICCFI
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CCDS12 MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLAVCAFI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 ILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFL
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CCDS12 VLENLAVLLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 REGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPI
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CCDS12 REGGVFVALTASVLSLLAIALERSLTMARRGPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLPA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 MGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRK
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CCDS12 LGWNCLGRLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPARP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NI----SKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEY
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CCDS12 GTAGTTSTRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLDVACPARTCPVLLQADP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB5 FLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCC---KC---PSG--------DSAGKFK
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CCDS12 FLGLAMANSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLV-CCGRHSCGRDPSGSQQSASAAEASGGLR
300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KB5 RPIIAGMEFSRSKSDNSSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
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CCDS12 RCLPPGLDGSFSGSERSS-PQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
350 360 370 380 390
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 790 init1: 538 opt: 828 Z-score: 599.4 bits: 119.6 E(32554): 4.6e-27
Smith-Waterman score: 828; 38.2% identity (72.6% similar) in 343 aa overlap (4-338:6-340)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGPTSVPLVKAHRSSVSD----YVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFIL
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CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYN-ESIAFFYNRSGK-HLATEWNTVSKLVMGLGIT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 ICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTP
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CCDS67 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AQWFLREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLIL
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CCDS67 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GGLPIMGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSI-VILYCRIYSLVRTRSR
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CCDS67 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRA
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CCDS67 RMS--RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCP--QCDVLAYE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCK---CPSGDSAGKFKRPIIAGMEF
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CCDS67 KFFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQIL-CCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTI
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB5 SRSKSDNSSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
CCDS67 LAGVHSNDHSVV
360
>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa)
initn: 722 init1: 333 opt: 828 Z-score: 599.2 bits: 119.6 E(32554): 4.7e-27
Smith-Waterman score: 828; 41.0% identity (72.8% similar) in 334 aa overlap (1-331:1-326)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENS-IKLTSVVFILICCFI
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CCDS12 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGRLAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCLV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 ILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFL
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CCDS12 VLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 REGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNF-RLFLLISACWVISLILGGLP
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CCDS12 REGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGMLP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IMGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFR
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CCDS12 LLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASG-----Q
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDV-GCKVKTCDILFRAEYFL
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CCDS12 KAPRPAAR--RKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWIL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDN
.::::::..:::::.. ..:. :: . .. :: :
CCDS12 ALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFL-CCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTD
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB5 SSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
CCDS12 SSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
360 370 380
>>CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 1101 init1: 747 opt: 814 Z-score: 589.9 bits: 117.8 E(32554): 1.6e-26
Smith-Waterman score: 1091; 48.4% identity (78.6% similar) in 345 aa overlap (14-358:3-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFII
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CCDS12 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYT-KETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLR
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CCDS12 VENLLVLIAVARNSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIM
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CCDS12 EGSAFITLSASVFSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPIL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKN
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CCDS12 GWNCLGHLEACSTVLPLYAKHYVLCVVTIFSIILLAIVALYVRIYCVVRS----------
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRAEYFLVLA
:.:. .. ..::::::: :::.:::.:: : : .:::: .: :..: ::..:.::....
CCDS12 -SHADMAAPQTLALLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLDYACPVHSCPILYKAHYFFAVS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDNSSH
.::: ::.::: ....:: .: ..: . :. :. .: : .. .:..:
CCDS12 TLNSLLNPVIYTWRSRDLRREVLRPLQCWR-PGVGVQGR-RRGGTPGHHLLPLRSSSSLE
280 290 300 310 320 330
370 380
pF1KB5 PQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
CCDS12 RGMHMPTSPTFLEGNTVV
340 350
>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 589 init1: 468 opt: 727 Z-score: 529.9 bits: 106.7 E(32554): 3.4e-23
Smith-Waterman score: 727; 37.8% identity (69.7% similar) in 304 aa overlap (29-331:17-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFII
:: .:: ..:. . . .. .. . . ...
CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGK-ELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLR
: :..:. .: ....::.:.::..:::: .::.::::: .. .: : .:. ::::
CCDS12 LTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIM
.: . ..:.::: .:::::.::. ... ..::. :. .:: . :: .: :: ::
CCDS12 QGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKN
.:.:. ::. :: . :: . :. . :..: .: .: ::. :: : .:.. ..
CCDS12 SWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA--EH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB5 ISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLD-VGCKVKTCDILFRAEYFLVL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]