FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5527, 756 aa
1>>>pF1KB5527 756 - 756 aa - 756 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6568+/-0.000914; mu= 18.9696+/- 0.055
mean_var=82.6522+/-16.294, 0's: 0 Z-trim(107.0): 74 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.141074
statistics sampled from 9214 (9290) to 9214 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS53654.1 PLCB3 gene_id:5331|Hs108|chr11 (1167) 539 120.1 2e-26
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CCDS42020.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 (1185) 527 117.7 1.1e-25
>>CCDS2671.1 PLCD1 gene_id:5333|Hs108|chr3 (756 aa)
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Smith-Waterman score: 5114; 99.9% identity (100.0% similar) in 756 aa overlap (1-756:1-756)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TPESQLFSIEDIQEVRMGHRTEGLEKFARDVPEDRCFSIVFKDQRNTLDLIAPSPADAQH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 VTNSLPSPEQLKGKILLKGKKLGGLLPPGGEGGPEATVVSDEDEAAEMEDEAVRSRVQHK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 PKEDKLRLAQELSDMVIYCKSVHFGGFSSPGTPGQAFYEMASFSENRALRLLQESGNGFV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 YVLKPAFLRDPNGTFNPRALAQGPWWARKRLNIRVISGQQLPKVNKNKNSIVDPKVTVEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 HGVSRDVASRQTAVITNNGFNPWWDTEFAFEVVVPDLALIRFLVEDYDASSKNDFIGQST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 IPLNSLKQGYRHVHLMSKNGDQHPSATLFVKISLQD
730 740 750
>>CCDS46793.1 PLCD1 gene_id:5333|Hs108|chr3 (777 aa)
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Smith-Waterman score: 5038; 99.9% identity (100.0% similar) in 745 aa overlap (12-756:33-777)
10 20 30 40
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AGSGETLSVDQLVTFLQHQQREEAAGPALALSLIERYEPSETAKAQRQMTKDGFLMYLLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FLVEDYDASSKNDFIGQSTIPLNSLKQGYRHVHLMSKNGDQHPSATLFVKISLQD
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: :.:: . .: . ::.:.::.. :...::.: :.:. .:.. :
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. ::: :.. .: :: .: :...:...: .. :.:::. .:..:::.: : .::
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:. ::. .. :::....:..:. . ....:::.:.::::.:.: .:. .:...:. :
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: ..:. : ::. .:: ::. ::: ::.:.:... : ...:. :.. ... :::..
CCDS46 AFSLFQAADTSQSGTLEGEEFVQFYKALTKRAEVQELFESFSADGQKLTLLEFLDFLQEE
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:.:. ::: ::.:::::...: .. .. :::: :: : ::. :. : .:::: :
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::.::.. :::::::. ::: : ::.:.::::: .::::.:.: ::::. ::..:::.:.
CCDS46 PLNHYFICSSHNTYLVGDQLCGQSSVEGYIRALKRGCRCVEVDVWDGPSGEPVVYHGHTL
300 310 320 330 340 350
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::.::: ::. .. .:::..: ::::::::.::. :::..::::: ::: .::. :::
CCDS46 TSRILFKDVVATVAQYAFQTSDYPVILSLETHCSWEQQQTMARHLTEILGEQLLSTTLDG
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: . :::::.:. :::.::::: : :. :: .:.: : : : :
CCDS46 VLPTQLPSPEELRRKILVKGKKLTLEEDLEYEEEEAEPEL----EESELALESQFETEPE
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pF1KB5 AVRSRVQHKPKEDKLR--LAQELSDMVIYCKSVHFGGFSSPGTPGQAFYEMASFSENRAL
.. .:.: :. : . : ::..::: ::: : .:. . :::..::::..:
CCDS46 PQEQNLQNKDKKKKSKPILCPALSSLVIYLKSVSFRSFTH-SKEHYHFYEISSFSETKAK
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 RLLQESGNGFVRHNVGHLSRIYPAGWRTDSSNYSPVEMWNGGCQIVALNFQTPGPEMDVY
::..:.:: ::.::. .:::.::.: :::::::.: :.::.:::.::.:.:: : :::.
CCDS46 RLIKEAGNEFVQHNTWQLSRVYPSGLRTDSSNYNPQELWNAGCQMVAMNMQTAGLEMDIC
530 540 550 560 570 580
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pF1KB5 QGRFQDNGACGYVLKPAFLRDPNGTFNPRALAQGPWWARKRLNIRVISGQQLPKVNKNKN
.:.:..::.::::::: :::: ...:.:. .:. : . : :.::::::::::.:.:.
CCDS46 DGHFRQNGGCGYVLKPDFLRDIQSSFHPEK-PISPFKA-QTLLIQVISGQQLPKVDKTKE
590 600 610 620 630 640
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pF1KB5 -SIVDPKVTVEIHGVSRDVASRQTAVITNNGFNPWWDTEFAFEVVVPDLALIRFLVEDYD
::::: : :.: :: :.: ..: . ::::::.: . :.:.::.::..::.: :::
CCDS46 GSIVDPLVKVQIFGVRLDTARQETNYVENNGFNPYWGQTLCFRVLVPELAMLRFVVMDYD
650 660 670 680 690 700
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pF1KB5 ASSKNDFIGQSTIPLNSLKQGYRHVHLMSKNGDQHPSATLFVKISLQD
.:.:::::: :.: . ..:::::.::.::.: . :..:: : .:.
CCDS46 WKSRNDFIGQYTLPWTCMQQGYRHIHLLSKDGISLRPASIFVYICIQEGLEGDES
710 720 730 740 750 760
>>CCDS74077.1 PLCD3 gene_id:113026|Hs108|chr17 (789 aa)
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Smith-Waterman score: 2572; 51.3% identity (78.7% similar) in 748 aa overlap (12-755:55-787)
10 20 30 40
pF1KB5 MDSGRDFLTLHGLQDDEDLQALLKGSQLLKVKSSSWRRERF
:: .:::..:.:.::.: :..: .:..::.
CCDS74 QVAAPVALPSPPTPSDGGTKRPGLRALKKMGLTEDEDVRAMLRGSRLRKIRSRTWHKERL
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50 60 70 80 90 100
pF1KB5 YKLQEDCKTIWQESRKVMRTPESQLFSIEDIQEVRMGHRTEGLEKFARDVPEDRCFSIVF
:.:::: ..: . :.. :.: ...: .. :. :: ::..:::..:. ::..:.:
CCDS74 YRLQEDGLSVWFQ-RRIPRAPSQHIFFVQHIEAVREGHQSEGLRRFGGAFAPARCLTIAF
90 100 110 120 130 140
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pF1KB5 KDQRNTLDLIAPSPADAQHWVLGLHKIIHHSGSMDQRQKLQHWIHSCLRKADKNKDNKMS
: .:..::: ::. .::.:: :: :. . .:.::..:.::::: :..::.:.:.:::
CCDS74 KGRRKNLDLAAPTAEEAQRWVRGLTKLRARLDAMSQRERLDHWIHSYLHRADSNQDSKMS
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FKELQNFLKELNIQVDDSYARKIFRECDHSQTDSLEDEEIEAFYKMLTQRVEIDRTFAEA
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CCDS74 FKEIKSLLRMVNVDMNDMYAYLLFKECDHSNNDRLEGAEIEEFLRRLLKRPELEEIFHQY
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 AGSGETLSVNQLVTFLQHQQREEAAGPALALSLIERYEPSETAKAQRQMTKDGFLMYLLS
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CCDS74 SGEDRVLSAPELLEFLE-DQGEEGATLARAQQLIQTYELNETAKQHELMTLDGFMMYLLS
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pF1KB5 ADGSAFSLAHRRVYQDMGQPLSHYLVSSSHNTYLLEDQLAGPSSTEAYIRALCKGCRCLE
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CCDS74 PEGAALDNTHTCVFQDMNQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGPSSTEAYVRAFAQGCRCVE
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pF1KB5 LDCWDGPNQEPIIYHGYTFTSKILFCDVLRAIRDYAFKASPYPVILSLENHCTLEQQRVM
::::.::. ::.::::.:.:::::: ::..:.::.:: ::::::::::::: :::: .:
CCDS74 LDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVVQAVRDHAFTLSPYPVILSLENHCGLEQQAAM
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CCDS74 ARHLCTILGDMLVTQALDSPNPEELPSPEQLKGRVLVKGKKL----PAARSEDGRALSDR
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460 470 480 490 500 510
pF1KB5 SDEDEAAEMEDEAVRSRVQHKPKEDKLRLAQELSDMVIYCKSVHFGGFS-SPGTPGQAFY
.:.: : :.: :.. .:.. . ... ::: ...::..... . .:..:
CCDS74 EEEEEDDEEEEEEVEAAAQRRLAK---QISPELSALAVYCHATRLRTLHPAPNAPQPC--
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 EMASFSENRALRLLQESGNGFVRHNVGHLSRIYPAGWRTDSSNYSPVEMWNGGCQIVALN
...:.:: .: .:..:.::.:::::. .:.:.:: : : .:.:::: ::::.:::.::::
CCDS74 QVSSLSERKAKKLIREAGNSFVRHNARQLTRVYPLGLRMNSANYSPQEMWNSGCQLVALN
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580 590 600 610 620 630
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CCDS74 FQTPGYEMDLNAGRFLVNGQCGYVLKPACLRQPDSTFDPE--YPGP--PRTTLSIQVLTA
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:::::.: .: .::::: : .::::: : : ..: . :::::: : . :.. .:.:
CCDS74 QQLPKLNAEKPHSIVDPLVRIEIHGVPADCARQETDYVLNNGFNPRWGQTLQFQLRAPEL
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CCDS74 ALVRFVVEDYDATSPNDFVGQFTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLSPATLFIQIRIQRS
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CCDS86 IRCSYIHVKQIFKDNDRLKQGRITIEEFRAIYRIITHREEIIEIFNTYSENRKILLASNL
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CCDS86 VYHGYTLTSKLLFKTVIQAIHKYAFMTSDYPVVLSLENHCSTAQQEVMADNLQATFGESL
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CCDS86 --MLFKKKKTRKLKIALALSDLVIYTKAEKFKSFQHSRLY-QQFNENNSIGETQARKLSK
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pF1KB5 QDNGACGYVLKPAFLRDPNGTFNPRALAQGPWWARKRLNIRVISGQQLPKVNKNKNSIVD
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CCDS86 LDNGGSGYILKPHFLRESKSYFNPSNIKEG---MPITLTIRLISGIQLPLTHSSSNKG-D
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pF1KB5 PKVTVEIHGVSRDVASRQTAVITNNGFNPWWDTEFAFEVVVPDLALIRFLVEDYDASSKN
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CCDS86 SLVIIEVFGVPNDQMKQQTRVIKKNAFSPRWNETFTFIIHVPELALIRFVVEGQGLIAGN
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pF1KB5 DFIGQSTIPLNSLKQGYRHVHLMSKNGDQHPSATLFVKISLQD
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CCDS86 EFLGQYTLPLLCMNKGYRRIPLFSRMGESLEPASLFVYVWYVR
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pF1KB5 RTPESQLFSIEDIQEVRMGHRTEGLEK--FARDVPEDRCFSIVFKDQRNTLDLIAPSPAD
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CCDS33 -DSEKAKIDIKSIKEVRTGKNTDIFRSNGISDQISEDCAFSVIYGENYESLDLVANSADV
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pF1KB5 AQHWVLGLHKIIHHSG-SMDQRQKLQH-----WIHSCLRKADKNKDNKMSFKELQNFLKE
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CCDS33 ANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWVSQMFSEIDVDNLGHITLCNAVQCIRN
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CCDS33 LNPGLKTSKIELKFKELHKSKDKAGTEVTKEEFIEVFHELCT-RPEIYFLLVQFSSNKEF
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pF1KB5 LSVNQLVTFLQHQQREEAAGPALALSLIERYEPSETAKAQRQMTKDGFLMYLLSADGSAF
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CCDS33 DPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSDITGYIRALKMGCRSVELDVWDG
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pF1KB5 PNQEPIIYHGYTFTSKILFCDVLRAIRDYAFKASPYPVILSLENHCTLEQQRVMARHLHA
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CCDS33 PDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYPLILCLENHCSIKQQKVMVQHMKK
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.:: : . . . ::::. ::::::.:.:::.. : :: :.::::.::
CCDS33 LLGDKLYTTSPNVEESYLPSPDVLKGKILIKAKKLSSNCS-GVEGD-----VTDEDEGAE
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: .. . .. .:.. ...: .:::..: ::::.: :. . : ..:. ::.
CCDS33 MSQRMGKENME-QPNNVPVKRFQLCKELSELVSICKSVQFKEFQV-SFQVQKYWEVCSFN
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pF1KB5 ENRALRLLQESGNGFVRHNVGHLSRIYPAGWRTDSSNYSPVEMWNGGCQIVALNFQTPGP
: : . .:. . :: .: :.:..:. : ::::..: ..:. ::::::.::::::
CCDS33 EVLASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDFWKCGCQIVAMNFQTPGL
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pF1KB5 EMDVYQGRFQDNGACGYVLKPAFLRDPNGTFNPRALAQGPWWARKRLNIRVISGQQLPKV
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CCDS33 MMDLNIGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVSPQLLHIKIISGQNFPKP
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pF1KB5 NKN--KNSIVDPKVTVEIHGVSRDVASRQTAVITNNGFNPWWDTEFAFEVVVPDLALIRF
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CCDS33 KGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDAPIFDESFEFQINLPELAMVRF
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CCDS33 VVLDDDYIG-DEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLFVHVAITNRRGGGK
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CCDS33 PHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDATDLRENMQNAVVSFKELC
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CCDS74 DGTKQKRERKKTVSFSSMPTEKKISSASDCINSMVEGSELKKVRSNSRIYHRYFLLDADM
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CCDS74 QSLRWEPSKK---DSEKAKIDIKSIKEVRTGKNTDIFRSNGISDQISEDCAFSVIYGENY
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pF1KB5 NTLDLIAPSPADAQHWVLGLHKIIHHSG-SMDQRQKLQH-----WIHSCLRKADKNKDNK
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CCDS74 ESLDLVANSADVANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWVSQMFSEIDVDNLGH
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pF1KB5 MSFKELQNFLKELNIQVDDSYARKIFREC----DHSQTDSLEDEEIEAFYKMLTQRVEID
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CCDS74 ITLCNAVQCIRNLNPGLKTSKIELKFKELHKSKDKAGTEVTKEEFIEVFHELCT-RPEIY
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pF1KB5 RTFAEAAGSGETLSVNQLVTFLQHQQREEAAGPALALSLIERYEPSETAKAQRQMTKDGF
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CCDS74 FLLVQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQEKGWLSIDGF
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CCDS74 TNYLMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSDITGYIRALKM
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pF1KB5 GCRCLELDCWDGPNQEPIIYHGYTFTSKILFCDVLRAIRDYAFKASPYPVILSLENHCTL
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CCDS74 GCRSVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYPLILCLENHCSI
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pF1KB5 EQQRVMARHLHAILGPMLLNRPLDGVTNSLPSPEQLKGKILLKGKKLGGLLPPGGEGGPE
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CCDS74 KQQKVMVQHMKKLLGDKLYTTSPNVEESYLPSPDVLKGKILIKAKKLSSNCS-GVEGD--
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pF1KB5 ATVVSDEDEAAEMEDEAVRSRVQHKPKE---DKLRLAQELSDMVIYCKSVHFGGFSSPGT
:.::::.::: .. . .. .:.. ...: .:::..: ::::.: :. .
CCDS74 ---VTDEDEGAEMSQRMGKENME-QPNNVPVKRFQLCKELSELVSICKSVQFKEFQV-SF
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pF1KB5 PGQAFYEMASFSENRALRLLQESGNGFVRHNVGHLSRIYPAGWRTDSSNYSPVEMWNGGC
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CCDS74 QVQKYWEVCSFNEVLASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDFWKCGC
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pF1KB5 QIVALNFQTPGPEMDVYQGRFQDNGACGYVLKPAFLRDPNGTFNPRALAQGPWWARKRLN
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CCDS74 QIVAMNFQTPGLMMDLNIGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVSPQLLH
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pF1KB5 IRVISGQQLPKVNKN--KNSIVDPKVTVEIHGVSRDVASRQTAVITNNGFNPWWDTEFAF
:..::::..:: . . :...::: : :::::. : : ..: .. .:: : .: : :
CCDS74 IKIISGQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDAPIFDESFEF
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pF1KB5 EVVVPDLALIRFLVEDYDASSKNDFIGQSTIPLNSLKQGYRHVHLMSKNGDQHPSATLFV
.. .:.::..::.: : : . ..:::: :::.. :. ::::: :.: .:. :.:::
CCDS74 QINLPELAMVRFVVLDDDYIG-DEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLFV
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 KISLQD
.... .
CCDS74 HVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDATDLREN
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pF1KB5 MDSGRDFLTLHGLQDDEDLQALLKGSQLLKVKSSSWRRERFYKLQEDC
. :. .: :..:....: ::: :.:
CCDS59 VAWLAEVLLWVGGSVVLSSEWQLGPLVERCMGAMQEGMQMVKLRGGSKGLVRFYYLDEHR
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50 60 70 80 90 100
pF1KB5 KTI-WQESRKVMRTPESQLFSIEDIQEVRMGHRTEGLEKFAR-DVPEDRCFSIVFKDQRN
. : :. ::: :. .::..:::: :...: .... . . :::: ..:.
CCDS59 SCIRWRPSRK----NEKAKISIDSIQEVSEGRQSEVFQRYPDGSFDPNCCFSIYHGSHRE
80 90 100 110 120 130
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pF1KB5 TLDLIAPSPADAQHWVLGLHKI---IHHSGSMDQRQKLQ-HWIHSCLRKADKNKDNKMSF
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CCDS59 SLDLVSTSSEVARTWVTGLRYLMAGISDEDSLARRQRTRDQWLKQTFDEADKNGDGSLSI
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CCDS33 IIGLPVDCCKDQTRVVDDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIALVRFLVWDHDPIGRDFVGQRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]