Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5549
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5549, 1380 aa
1>>>pF1KB5549 1380 - 1380 aa - 1380 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9844+/- 0.001; mu= 20.0638+/- 0.061
mean_var=80.6938+/-16.339, 0's: 0 Z-trim(105.3): 30 B-trim: 313 in 1/50
Lambda= 0.142776
statistics sampled from 8321 (8341) to 8321 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380) 9255 1917.0 0
CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133) 7591 1574.2 0
CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12 ( 443) 1245 266.8 9.5e-71
CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 ( 476) 828 180.9 7.3e-45
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 676 149.7 2.8e-35
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 676 149.7 2.9e-35
CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 515) 661 146.6 1.8e-34
CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 641) 661 146.6 2.1e-34
CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 652) 661 146.6 2.2e-34
CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 ( 458) 572 128.2 5.3e-29
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 492 111.9 1.1e-23
>>CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380 aa)
initn: 9255 init1: 9255 opt: 9255 Z-score: 10292.9 bits: 1917.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9255; 100.0% identity (100.0% similar) in 1380 aa overlap (1-1380:1-1380)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASGRDERPPWRLGRLLLLMCLLLLGSSARAAHIKKAEATTTTTSAGAEAAEGQFDRYYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MASGRDERPPWRLGRLLLLMCLLLLGSSARAAHIKKAEATTTTTSAGAEAAEGQFDRYYH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EEELESALREAAAAGLPGLARLFSIGRSVEGRPLWVLRLTAGLGSLIPEGDAGPDAAGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EEELESALREAAAAGLPGLARLFSIGRSVEGRPLWVLRLTAGLGSLIPEGDAGPDAAGPD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AAGPLLPGRPQVKLVGNMHGDETVSRQVLIYLARELAAGYRRGDPRLVRLLNTTDVYLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAGPLLPGRPQVKLVGNMHGDETVSRQVLIYLARELAAGYRRGDPRLVRLLNTTDVYLLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SLNPDGFERAREGDCGFGDGGPSGASGRDNSRGRDLNRSFPDQFSTGEPPALDEVPEVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLNPDGFERAREGDCGFGDGGPSGASGRDNSRGRDLNRSFPDQFSTGEPPALDEVPEVRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LIEWIRRNKFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGIYSKTSDDEVFKYLAKAYASNHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIEWIRRNKFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGIYSKTSDDEVFKYLAKAYASNHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IMKTGEPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQDYNYVWANCFEITLELSCCKYPPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IMKTGEPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQDYNYVWANCFEITLELSCCKYPPAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGLENATISVAGINHNITTGRFGDFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGLENATISVAGINHNITTGRFGDFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPATEVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPATEVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 AIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLGKSVESRELYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLGKSVESRELYV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 MEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGTDPEVTDLVHNTRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGTDPEVTDLVHNTRI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 HLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFPDQFVQITDPTQPETIAVMSWMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFPDQFVQITDPTQPETIAVMSWMK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 SYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGLATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGLATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 KNMYPNEYFPHGITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNMYPNEYFPHGITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 NRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 KITASARGYNPVTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KITASARGYNPVTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 EFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB5 QSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAPVGTELLLALAEFLCLNYKKNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAPVGTELLLALAEFLCLNYKKNPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 VTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSKIGQTNARGKDLDTDFTNNASQPETKAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSKIGQTNARGKDLDTDFTNNASQPETKAII
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB5 ENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYDKPVQTVENKETLKHLASLYANNHPSMHMGQPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYDKPVQTVENKETLKHLASLYANNHPSMHMGQPSC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB5 PNKSDENIPGGVMRGAEWHSHLGSMKDYSVTYGHCPEITVYTSCCYFPSAARLPSLWADN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PNKSDENIPGGVMRGAEWHSHLGSMKDYSVTYGHCPEITVYTSCCYFPSAARLPSLWADN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB5 KRSLLSMLVEVHKGVHGFVKDKTGKPISKAVIVLNEGIKVQTKEGGYFHVLLAPGVHNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KRSLLSMLVEVHKGVHGFVKDKTGKPISKAVIVLNEGIKVQTKEGGYFHVLLAPGVHNII
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB5 AIADGYQQQHSQVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AIADGYQQQHSQVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIW
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB5 CICSIKSNRHKDGFHRLRQHHDEYEDEIRMMSTGSKKSLLSHEFQDETDTEEETLYSSKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CICSIKSNRHKDGFHRLRQHHDEYEDEIRMMSTGSKKSLLSHEFQDETDTEEETLYSSKH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
>>CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133 aa)
initn: 7591 init1: 7591 opt: 7591 Z-score: 8441.9 bits: 1574.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7591; 99.9% identity (100.0% similar) in 1132 aa overlap (249-1380:2-1133)
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 SFPDQFSTGEPPALDEVPEVRALIEWIRRNKFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGI
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MRFVLSGNLHGGSVVASYPFDDSPEHKATGI
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YSKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIMKTGEPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQDYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YSKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIMKTGEPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQDYN
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 YVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGSGLE
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 NATISVAGINHNITTGRFGDFYRLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPATEVDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NATISVAGINHNITTGRFGDFYRLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPATEVDFS
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 LRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFAN
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 EYPNITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EYPNITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLI
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 EYLCKNFGTDPEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EYLCKNFGTDPEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFP
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 DQFVQITDPTQPETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGLATYSKSPDDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQFVQITDPTQPETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGLATYSKSPDDA
400 410 420 430 440 450
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 VFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFE
460 470 480 490 500 510
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 VTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAE
520 530 540 550 560 570
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 INHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 INHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSN
580 590 600 610 620 630
880 890 900 910 920 930
pF1KB5 NESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKD
640 650 660 670 680 690
940 950 960 970 980 990
pF1KB5 LSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAP
700 710 720 730 740 750
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB5 VGTELLLALAEFLCLNYKKNPAVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSKIGQTNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VGTELLLALAEFLCLNYKKNPAVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSKIGQTNA
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB5 RGKDLDTDFTNNASQPETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYDKPVQTVENKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RGKDLDTDFTNNASQPETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYDKPVQTVENKET
820 830 840 850 860 870
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB5 LKHLASLYANNHPSMHMGQPSCPNKSDENIPGGVMRGAEWHSHLGSMKDYSVTYGHCPEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LKHLASLYANNHPSMHMGQPSCPNKSDENIPGGVMRGAEWHSHLGSMKDYSVTYGHCPEI
880 890 900 910 920 930
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB5 TVYTSCCYFPSAARLPSLWADNKRSLLSMLVEVHKGVHGFVKDKTGKPISKAVIVLNEGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TVYTSCCYFPSAARLPSLWADNKRSLLSMLVEVHKGVHGFVKDKTGKPISKAVIVLNEGI
940 950 960 970 980 990
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB5 KVQTKEGGYFHVLLAPGVHNIIAIADGYQQQHSQVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KVQTKEGGYFHVLLAPGVHNIIAIADGYQQQHSQVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB5 ELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFHRLRQHHDEYEDEIRMMSTGSKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHKDGFHRLRQHHDEYEDEIRMMSTGSKKS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1360 1370 1380
pF1KB5 LLSHEFQDETDTEEETLYSSKH
::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLSHEFQDETDTEEETLYSSKH
1120 1130
>>CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12 (443 aa)
initn: 1260 init1: 1019 opt: 1245 Z-score: 1383.6 bits: 266.8 E(32554): 9.5e-71
Smith-Waterman score: 1245; 50.7% identity (77.1% similar) in 363 aa overlap (500-856:19-377)
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 TTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSL
::..:. :: ::. :..: ..:.:.:.
CCDS89 MDFPCLWLGLLLPLVAALDFNYHRQEGMEAFLKTVAQNYSSVTHLHSI
10 20 30 40
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 GKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGTDP
::::..:.:.:. .. : :. : :::::..::::.:.:::::::.::.:: . : ::
CCDS89 GKSVKGRNLWVLVVGRFPKEHRIGIPEFKYVANMHGDETVGRELLLHLIDYLVTSDGKDP
50 60 70 80 90 100
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFPDQFVQITDPTQ
:.:.:...::::.::::::::.: .. : :::.: :..:::::::: : . :
CCDS89 EITNLINSTRIHIMPSMNPDGFEAVKKPDCYYSIGRENYNQYDLNRNFPDAFEYNNVSRQ
110 120 130 140 150 160
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGL-ATYSKS--PDDAVFQQIALS
:::.:::.:.:. ::::::::::.::..::::. :. : ::.: ::: ::: .: .
CCDS89 PETVAVMKWLKTETFVLSANLHGGALVASYPFDNGVQATGALYSRSLTPDDDVFQYLAHT
170 180 190 200 210 220
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 YSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCV
:...: .: .: ::: . ::.:.::: ::: . :::::.::. ..:::.:.::.:
CCDS89 YASRNPNMKKGDECKN---KMNFPNGVTNGYSWYPLQGGMQDYNYIWAQCFEITLELSCC
230 240 250 260 270 280
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 KYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINH--PVT
::: :..::.::..:. :::...:::: ::.: :.: .: . :. . : . .: :
CCDS89 KYPREEKLPSFWNNNKASLIEYIKQVHLGVKGQVFDQ-NGNPLPNVIVEVQDRKHICPYR
290 300 310 320 330 340
830 840 850 860 870 880
pF1KB5 TYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNP-VTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKK
: : :.:. ::.::.: :.... :..: .:: .
CCDS89 TNKYGEYYLLLLPGSYIINVTVPGHDPHITKVIIPEKSQNFSALKKDILLPFQGQLDSIP
350 360 370 380 390 400
890 900 910 920 930 940
pF1KB5 GKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFL
CCDS89 VSNPSCPMIPLYRNLPDHSAATKPSLFLFLVSLLHIFFK
410 420 430 440
>>CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 (476 aa)
initn: 1132 init1: 366 opt: 828 Z-score: 919.0 bits: 180.9 E(32554): 7.3e-45
Smith-Waterman score: 1316; 49.6% identity (74.6% similar) in 421 aa overlap (496-883:43-461)
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 VIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKD---FHHHHFPDMEIFLRRFANEYPN
.: .: :..:..:... : .
CCDS38 CGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTA
20 30 40 50 60 70
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 ITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLC
:.:.:..:.: :.::: :.:.::::::::::::::::::::::::.::::::. : .:::
CCDS38 ISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLC
80 90 100 110 120 130
590 600 610 620 630
pF1KB5 KNFGTDPE-VTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEK--SQEGDSIS-VIGRNNSNNFDLNRNFP
... : ...:.:.::::.:::.::::.:: :: :. . .::.:....:::::::
CCDS38 NEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFP
140 150 160 170 180 190
640 650 660 670
pF1KB5 D--QFVQITD----PTQ-----------------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSL
: ..: ... :.. ::: ::. :. . :::::::::::.:
CCDS38 DLDRIVYVNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDL
200 210 220 230 240 250
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 VVNYPFDDDEQGLA-TYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQ-GRP-CKNMYPNEYFPHG
:.:::.:. ..: : ::.:::::.::..: .::. : : . .:: :.. . : :
CCDS38 VANYPYDETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDG
260 270 280 290 300 310
740 750 760 770 780 790
pF1KB5 ITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQV
:::..::.:::::::.:::..::::.:.::.: :.: :. : ..::.:. :::....:.
CCDS38 TTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQI
320 330 340 350 360 370
800 810 820 830 840 850
pF1KB5 HQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPV
:.::.::: : .: : :::::: :.: ::. : :::::::.::.::.:::: :: .
CCDS38 HRGVKGFVRD-LQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAI
380 390 400 410 420 430
860 870 880 890 900 910
pF1KB5 TKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE
::.:.: : :.: : .: .. ..: :.
CCDS38 TKKVAVPYSPAAGVDFEL-ESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
440 450 460 470
920 930 940 950 960 970
pF1KB5 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE
>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 (734 aa)
initn: 968 init1: 627 opt: 676 Z-score: 746.9 bits: 149.7 E(32554): 2.8e-35
Smith-Waterman score: 1163; 45.6% identity (68.4% similar) in 434 aa overlap (477-873:273-703)
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 VKEGPATEVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHF
: :. :: : . . .: ::.::..
CCDS13 LPEPQVARFIRLLPQTWLQGGAPCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDPLDFQHHNY
250 260 270 280 290 300
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 PDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGN
:. .... .. :::::.::.::: .. .:::::.::.:: :: :::: .:...::::
CCDS13 KAMRKLMKQVQEQCPNITRIYSIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGN
310 320 330 340 350 360
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 EVVGRELLLNLIEYLCKNFGT-DPEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVI--
:..:::::: :...::..: .:.:: :. . ::::.::::::::: . . : :
CCDS13 EALGRELLLLLMQFLCHEFLRGNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWA
370 380 390 400 410 420
630 640 650
pF1KB5 -GRNNSNNFDLNRNFPD---QFVQITD---------------PTQ---------PETIAV
:: :....:::.:: : . . : :: ::: ::
CCDS13 EGRWNNQSIDLNHNFADLNTPLWEAQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTLPNATVAPETRAV
430 440 450 460 470 480
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 MSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGLATY--SKSPDDAVFQQIALSYSKENSQ
..::: ::::::::::: :::.:::: . :. . .::::::. .. :. :
CCDS13 IKWMKRIPFVLSANLHGGELVVSYPFDMTRTPWAARELTPTPDDAVFRWLSTVYAGSNLA
490 500 510 520 530 540
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 M--FQGRPCKNMYPNEYFPHG-ITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPL
: . :::... .. :: : :::.:..:::.:.:..::.:::::::.::.: :.:
CCDS13 MQDTSRRPCHSQ---DFSVHGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFPH
550 560 570 580 590
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 EKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGD
:.:::. ::.:. .:. ...::..:. : : : :: .:.:.: ::: ::: ::
CCDS13 ENELPQEWENNKDALLTYLEQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGGD
600 610 620 630 640 650
840 850 860 870 880
pF1KB5 YWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTVK-SEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASS
:::::.:: : .::::.::. ::.: : :: . ::.:...
CCDS13 YWRLLTPGDYMVTASAEGYHSVTRNCRVTFEEGPFPCNFVLTKTPKQRLRELLAAGAKVP
660 670 680 690 700 710
890 900 910 920 930 940
pF1KB5 STNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMN
CCDS13 PDLRRRLERLRGQKD
720 730
>>CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 (756 aa)
initn: 960 init1: 493 opt: 676 Z-score: 746.7 bits: 149.7 E(32554): 2.9e-35
Smith-Waterman score: 1108; 43.8% identity (71.0% similar) in 411 aa overlap (500-874:315-722)
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 TTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSL
::.::.. .:. ... . :::::.:..
CCDS76 CMRMEILGCPLPDPNNYYHRRNEMTTTDDLDFKHHNYKEMRQLMKVVNEMCPNITRIYNI
290 300 310 320 330 340
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 GKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNF-GTD
::: .. .::..::::.:: :: :::::.::.. :::::.:::::: :....:... . .
CCDS76 GKSHQGLKLYAVEISDHPGEHEVGEPEFHYIAGAHGNEVLGRELLLLLVQFVCQEYLARN
350 360 370 380 390 400
590 600 610 620 630
pF1KB5 PEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSIS---VIGRNNSNNFDLNRNFPD------
... ::..::::..::.:::::::. :: : .:: . ...:.: ::::
CCDS76 ARIVHLVEETRIHVLPSLNPDGYEKAYEGGSELGGWSLGRWTHDGIDINNNFPDLNTLLW
410 420 430 440 450 460
640 650 660 670
pF1KB5 --------------QFVQITD-------PTQPETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVN
... : . . :: ::..::.. ::::..::.:: :::
CCDS76 EAEDRQNVPRKVPNHYIAIPEWFLSENATVAAETRAVIAWMEKIPFVLGGNLQGGELVVA
470 480 490 500 510 520
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 YPFDDDEQGLAT--YSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPH--GIT
::.: .. : .. .::: ::. .: ::.. . : ..: . . .: : . : .
CCDS76 YPYDLVRSPWKTQEHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDAR--RRVCHTEDFQKEEGTV
530 540 550 560 570 580
740 750 760 770 780 790
pF1KB5 NGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQ
:::::..: :...:..::.:::::..: .:: ::: :..::. ::.::.::: ::.:::.
CCDS76 NGASWHTVAGSLNDFSYLHTNCFELSIYVGCDKYPHESQLPEEWENNRESLIVFMEQVHR
590 600 610 620 630 640
800 810 820 830 840 850
pF1KB5 GVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTK
:..:.: : . :.:: :: ::: ::: . : . ::::::: :: : .::.:.:.. ::
CCDS76 GIKGLVRD-SHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPGEYVVTAKAEGFTASTK
650 660 670 680 690 700
860 870 880 890 900 910
pF1KB5 NVTVKSE-GAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAEN
: : . :: . .::: ...
CCDS76 NCMVGYDMGATRCDFTLSKTNMARIREIMEKFGKQPVSLPARRLKLRGQKRRQRG
710 720 730 740 750
>>CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (515 aa)
initn: 1065 init1: 305 opt: 661 Z-score: 732.5 bits: 146.6 E(32554): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 1089; 42.3% identity (67.8% similar) in 435 aa overlap (501-897:48-479)
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLG
: :: . .: ::: :.. ...: ::.:
CCDS43 EGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYSIG
20 30 40 50 60 70
540 550 560 570 580
pF1KB5 KSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGT-DP
.: ..::: :.:.:. :: :: ::: : :::.:::::.:::.:. : .:::... .:
CCDS43 RSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNP
80 90 100 110 120 130
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFPD---QFVQ
.. :...:::::.::::::::: . :: . . . ::.:..:.:::::::: .. .
CCDS43 RIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYR
140 150 160 170 180 190
650 660 670 680
pF1KB5 ITD-----------PTQ-------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFD--D
... : . ::: :.:.::.. ::::::.::::.:::.::::
CCDS43 LAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSK
200 210 220 230 240 250
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 DEQGLATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHG-ITNGASWYNV
: .: .::. .:. .. .:. . :.. : .: .... .: : :::.::.
CCDS43 HPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYA-DVHPMMMDRS-ENRCGGNFLKRGSIINGADWYSF
260 270 280 290 300 310
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 PGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLD
:::.:.:::.:::::.:.::::::.: :. : .:..:..::..:.. ::.:..: : :
CCDS43 TGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTD
320 330 340 350 360 370
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 ATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTV--KS
:. . :: ::: : : .:: ::::::: :: . . :.: :: : :.: . .
CCDS43 KF-GKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPARM
380 390 400 410 420 430
870 880 890 900 910
pF1KB5 EGAIQVNFTLVRSSTDSNNE----SKKGK----GASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE
. : .:.: : . .: . : :..:: ..:..:
CCDS43 KRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSK
440 450 460 470 480 490
920 930 940 950 960 970
pF1KB5 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE
CCDS43 PWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
500 510
>>CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (641 aa)
initn: 1065 init1: 305 opt: 661 Z-score: 731.1 bits: 146.6 E(32554): 2.1e-34
Smith-Waterman score: 1089; 42.3% identity (67.8% similar) in 435 aa overlap (501-897:174-605)
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLG
: :: . .: ::: :.. ...: ::.:
CCDS34 EGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYSIG
150 160 170 180 190 200
540 550 560 570 580
pF1KB5 KSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGT-DP
.: ..::: :.:.:. :: :: ::: : :::.:::::.:::.:. : .:::... .:
CCDS34 RSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNP
210 220 230 240 250 260
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFPD---QFVQ
.. :...:::::.::::::::: . :: . . . ::.:..:.:::::::: .. .
CCDS34 RIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYR
270 280 290 300 310 320
650 660 670 680
pF1KB5 ITD-----------PTQ-------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFD--D
... : . ::: :.:.::.. ::::::.::::.:::.::::
CCDS34 LAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSK
330 340 350 360 370 380
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 DEQGLATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHG-ITNGASWYNV
: .: .::. .:. .. .:. . :.. : .: .... .: : :::.::.
CCDS34 HPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYA-DVHPMMMDRS-ENRCGGNFLKRGSIINGADWYSF
390 400 410 420 430 440
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 PGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLD
:::.:.:::.:::::.:.::::::.: :. : .:..:..::..:.. ::.:..: : :
CCDS34 TGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTD
450 460 470 480 490 500
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 ATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTV--KS
:. . :: ::: : : .:: ::::::: :: . . :.: :: : :.: . .
CCDS34 KF-GKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPARM
510 520 530 540 550 560
870 880 890 900 910
pF1KB5 EGAIQVNFTLVRSSTDSNNE----SKKGK----GASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE
. : .:.: : . .: . : :..:: ..:..:
CCDS34 KRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSK
570 580 590 600 610 620
920 930 940 950 960 970
pF1KB5 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE
CCDS34 PWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
630 640
>>CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (652 aa)
initn: 1065 init1: 305 opt: 661 Z-score: 730.9 bits: 146.6 E(32554): 2.2e-34
Smith-Waterman score: 1089; 42.3% identity (67.8% similar) in 435 aa overlap (501-897:185-616)
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLG
: :: . .: ::: :.. ...: ::.:
CCDS33 EGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYSIG
160 170 180 190 200 210
540 550 560 570 580
pF1KB5 KSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGT-DP
.: ..::: :.:.:. :: :: ::: : :::.:::::.:::.:. : .:::... .:
CCDS33 RSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNP
220 230 240 250 260 270
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFPD---QFVQ
.. :...:::::.::::::::: . :: . . . ::.:..:.:::::::: .. .
CCDS33 RIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEYYR
280 290 300 310 320 330
650 660 670 680
pF1KB5 ITD-----------PTQ-------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFD--D
... : . ::: :.:.::.. ::::::.::::.:::.::::
CCDS33 LAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDFSK
340 350 360 370 380 390
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 DEQGLATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHG-ITNGASWYNV
: .: .::. .:. .. .:. . :.. : .: .... .: : :::.::.
CCDS33 HPQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYA-DVHPMMMDRS-ENRCGGNFLKRGSIINGADWYSF
400 410 420 430 440 450
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 PGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLD
:::.:.:::.:::::.:.::::::.: :. : .:..:..::..:.. ::.:..: : :
CCDS33 TGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKGVVTD
460 470 480 490 500 510
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 ATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTV--KS
:. . :: ::: : : .:: ::::::: :: . . :.: :: : :.: . .
CCDS33 KF-GKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGYAKVIKKVIIPARM
520 530 540 550 560 570
870 880 890 900 910
pF1KB5 EGAIQVNFTLVRSSTDSNNE----SKKGK----GASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE
. : .:.: : . .: . : :..:: ..:..:
CCDS33 KRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSADGSK
580 590 600 610 620 630
920 930 940 950 960 970
pF1KB5 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE
CCDS33 PWWWSYFTSLSTHRPRWLLKY
640 650
>>CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 (458 aa)
initn: 1095 init1: 368 opt: 572 Z-score: 634.2 bits: 128.2 E(32554): 5.3e-29
Smith-Waterman score: 1289; 49.0% identity (73.2% similar) in 410 aa overlap (493-873:15-418)
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 VTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPN
.. . : :.::.. :. : . :: :.
CCDS74 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPG
10 20 30 40
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 ITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLC
:::.::.:.:::.:.:::.:.::.::.::: ::: ::.:::::::..::::.:.: :.::
CCDS74 ITRVYSIGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLC
50 60 70 80 90 100
590 600 610 620 630
pF1KB5 KNF-GTDPEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFP
..: . . ....:...::::..::::::::: . .: . ..::::.:. :::::::
CCDS74 EEFRNRNQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFP
110 120 130 140 150 160
640 650 660 670
pF1KB5 D---------------QFVQITD----PTQPETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNY
: . . . : ..::: ::. ::.:. ::::::::::..:.::
CCDS74 DLNTYIYYNEKYGGPNHHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANY
170 180 190 200 210 220
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 PFDDDEQ----GL--ATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGI
:.: . . :. .. . .::: .::..: :: .. :::: : ..::: ::
CCDS74 PYDKSFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNC-----GDYFPDGI
230 240 250 260 270
740 750 760 770 780 790
pF1KB5 TNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVH
:::::::.. ::::.:::.:::::.:.::.: :.: :.:: : ::..::::..:::
CCDS74 TNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVH
280 290 300 310 320 330
800 810 820 830 840 850
pF1KB5 QGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVT
::..:.::: . .. ::.:::. ::: ::. :::.:::.:: : ..:.: ::.: :
CCDS74 QGIKGMVLDE-NYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPET
340 350 360 370 380 390
860 870 880 890 900 910
pF1KB5 KNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAEN
.::: ::: : ::
CCDS74 VTVTVGPAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
400 410 420 430 440 450
1380 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 23:01:45 2016 done: Wed Nov 2 23:01:45 2016
Total Scan time: 3.120 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]