FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5549, 1380 aa 1>>>pF1KB5549 1380 - 1380 aa - 1380 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1630+/-0.000431; mu= 25.0519+/- 0.027 mean_var=83.8167+/-16.961, 0's: 0 Z-trim(111.9): 36 B-trim: 1127 in 1/50 Lambda= 0.140091 statistics sampled from 20650 (20679) to 20650 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16 Scan time: 12.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001295 (OMIM: 603102) carboxypeptidase D isofor (1380) 9255 1881.6 0 NP_001186704 (OMIM: 603102) carboxypeptidase D iso (1133) 7591 1545.3 0 NP_938079 (OMIM: 114860) carboxypeptidase M precur ( 443) 1245 262.3 5.7e-69 NP_001865 (OMIM: 114860) carboxypeptidase M precur ( 443) 1245 262.3 5.7e-69 NP_001005502 (OMIM: 114860) carboxypeptidase M pre ( 443) 1245 262.3 5.7e-69 NP_001864 (OMIM: 114855) 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKD 640 650 660 670 680 690 940 950 960 970 980 990 pF1KB5 LSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAP 700 710 720 730 740 750 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB5 VGTELLLALAEFLCLNYKKNPAVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSKIGQTNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VGTELLLALAEFLCLNYKKNPAVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSKIGQTNA 760 770 780 790 800 810 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB5 RGKDLDTDFTNNASQPETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYDKPVQTVENKET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RGKDLDTDFTNNASQPETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPYDKPVQTVENKET 820 830 840 850 860 870 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB5 LKHLASLYANNHPSMHMGQPSCPNKSDENIPGGVMRGAEWHSHLGSMKDYSVTYGHCPEI 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LLSHEFQDETDTEEETLYSSKH 1120 1130 >>NP_938079 (OMIM: 114860) carboxypeptidase M precursor (443 aa) initn: 1260 init1: 1019 opt: 1245 Z-score: 1359.2 bits: 262.3 E(85289): 5.7e-69 Smith-Waterman score: 1245; 50.7% identity (77.1% similar) in 363 aa overlap (500-856:19-377) 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 TTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSL ::..:. :: ::. :..: ..:.:.:. NP_938 MDFPCLWLGLLLPLVAALDFNYHRQEGMEAFLKTVAQNYSSVTHLHSI 10 20 30 40 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 GKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGTDP ::::..:.:.:. .. : :. : :::::..::::.:.:::::::.::.:: . : :: NP_938 GKSVKGRNLWVLVVGRFPKEHRIGIPEFKYVANMHGDETVGRELLLHLIDYLVTSDGKDP 50 60 70 80 90 100 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFPDQFVQITDPTQ :.:.:...::::.::::::::.: .. : :::.: :..:::::::: : . : NP_938 EITNLINSTRIHIMPSMNPDGFEAVKKPDCYYSIGRENYNQYDLNRNFPDAFEYNNVSRQ 110 120 130 140 150 160 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGL-ATYSKS--PDDAVFQQIALS :::.:::.:.:. ::::::::::.::..::::. :. : ::.: ::: ::: .: . NP_938 PETVAVMKWLKTETFVLSANLHGGALVASYPFDNGVQATGALYSRSLTPDDDVFQYLAHT 170 180 190 200 210 220 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 YSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCV :...: .: .: ::: . ::.:.::: ::: . :::::.::. ..:::.:.::.: NP_938 YASRNPNMKKGDECKN---KMNFPNGVTNGYSWYPLQGGMQDYNYIWAQCFEITLELSCC 230 240 250 260 270 280 770 780 790 800 810 820 pF1KB5 KYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINH--PVT ::: :..::.::..:. :::...:::: ::.: :.: .: . :. . : . .: : NP_938 KYPREEKLPSFWNNNKASLIEYIKQVHLGVKGQVFDQ-NGNPLPNVIVEVQDRKHICPYR 290 300 310 320 330 340 830 840 850 860 870 880 pF1KB5 TYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNP-VTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKK : : :.:. ::.::.: :.... :..: .:: . NP_938 TNKYGEYYLLLLPGSYIINVTVPGHDPHITKVIIPEKSQNFSALKKDILLPFQGQLDSIP 350 360 370 380 390 400 890 900 910 920 930 940 pF1KB5 GKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFL NP_938 VSNPSCPMIPLYRNLPDHSAATKPSLFLFLVSLLHIFFK 410 420 430 440 >>NP_001865 (OMIM: 114860) carboxypeptidase M precursor (443 aa) initn: 1260 init1: 1019 opt: 1245 Z-score: 1359.2 bits: 262.3 E(85289): 5.7e-69 Smith-Waterman score: 1245; 50.7% identity (77.1% similar) in 363 aa overlap (500-856:19-377) 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 TTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSL ::..:. :: ::. :..: ..:.:.:. NP_001 MDFPCLWLGLLLPLVAALDFNYHRQEGMEAFLKTVAQNYSSVTHLHSI 10 20 30 40 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 GKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGTDP ::::..:.:.:. .. : :. : :::::..::::.:.:::::::.::.:: . : :: NP_001 GKSVKGRNLWVLVVGRFPKEHRIGIPEFKYVANMHGDETVGRELLLHLIDYLVTSDGKDP 50 60 70 80 90 100 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFPDQFVQITDPTQ :.:.:...::::.::::::::.: .. : :::.: :..:::::::: : . : NP_001 EITNLINSTRIHIMPSMNPDGFEAVKKPDCYYSIGRENYNQYDLNRNFPDAFEYNNVSRQ 110 120 130 140 150 160 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGL-ATYSKS--PDDAVFQQIALS :::.:::.:.:. ::::::::::.::..::::. :. : ::.: ::: ::: .: . 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NP_001 TNKYGEYYLLLLPGSYIINVTVPGHDPHITKVIIPEKSQNFSALKKDILLPFQGQLDSIP 350 360 370 380 390 400 890 900 910 920 930 940 pF1KB5 GKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFL NP_001 VSNPSCPMIPLYRNLPDHSAATKPSLFLFLVSLLHIFFK 410 420 430 440 >>NP_001005502 (OMIM: 114860) carboxypeptidase M precurs (443 aa) initn: 1260 init1: 1019 opt: 1245 Z-score: 1359.2 bits: 262.3 E(85289): 5.7e-69 Smith-Waterman score: 1245; 50.7% identity (77.1% similar) in 363 aa overlap (500-856:19-377) 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 TTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSL ::..:. :: ::. :..: ..:.:.:. NP_001 MDFPCLWLGLLLPLVAALDFNYHRQEGMEAFLKTVAQNYSSVTHLHSI 10 20 30 40 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 GKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGTDP ::::..:.:.:. .. : :. : :::::..::::.:.:::::::.::.:: . : :: NP_001 GKSVKGRNLWVLVVGRFPKEHRIGIPEFKYVANMHGDETVGRELLLHLIDYLVTSDGKDP 50 60 70 80 90 100 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVIGRNNSNNFDLNRNFPDQFVQITDPTQ :.:.:...::::.::::::::.: .. : :::.: :..:::::::: : . : NP_001 EITNLINSTRIHIMPSMNPDGFEAVKKPDCYYSIGRENYNQYDLNRNFPDAFEYNNVSRQ 110 120 130 140 150 160 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGL-ATYSKS--PDDAVFQQIALS :::.:::.:.:. ::::::::::.::..::::. :. : ::.: ::: ::: .: . NP_001 PETVAVMKWLKTETFVLSANLHGGALVASYPFDNGVQATGALYSRSLTPDDDVFQYLAHT 170 180 190 200 210 220 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 YSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCV :...: .: .: ::: . ::.:.::: ::: . :::::.::. ..:::.:.::.: NP_001 YASRNPNMKKGDECKN---KMNFPNGVTNGYSWYPLQGGMQDYNYIWAQCFEITLELSCC 230 240 250 260 270 280 770 780 790 800 810 820 pF1KB5 KYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINH--PVT ::: :..::.::..:. :::...:::: ::.: :.: .: . :. . : . .: : NP_001 KYPREEKLPSFWNNNKASLIEYIKQVHLGVKGQVFDQ-NGNPLPNVIVEVQDRKHICPYR 290 300 310 320 330 340 830 840 850 860 870 880 pF1KB5 TYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNP-VTKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKK : : :.:. ::.::.: :.... :..: .:: . NP_001 TNKYGEYYLLLLPGSYIINVTVPGHDPHITKVIIPEKSQNFSALKKDILLPFQGQLDSIP 350 360 370 380 390 400 890 900 910 920 930 940 pF1KB5 GKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFL NP_001 VSNPSCPMIPLYRNLPDHSAATKPSLFLFLVSLLHIFFK 410 420 430 440 >>NP_001864 (OMIM: 114855) carboxypeptidase E preproprot (476 aa) initn: 1132 init1: 366 opt: 828 Z-score: 903.3 bits: 178.1 E(85289): 1.4e-43 Smith-Waterman score: 1316; 49.6% identity (74.6% similar) in 421 aa overlap (496-883:43-461) 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 VIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKD---FHHHHFPDMEIFLRRFANEYPN .: .: :..:..:... : . NP_001 CGALAACGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTA 20 30 40 50 60 70 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 ITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLC :.:.:..:.: :.::: :.:.::::::::::::::::::::::::.::::::. : .::: NP_001 ISRIYTVGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLC 80 90 100 110 120 130 590 600 610 620 630 pF1KB5 KNFGTDPE-VTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEK--SQEGDSIS-VIGRNNSNNFDLNRNFP ... : ...:.:.::::.:::.::::.:: :: :. . .::.:....::::::: NP_001 NEYQKGNETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFP 140 150 160 170 180 190 640 650 660 670 pF1KB5 D--QFVQITD----PTQ-----------------PETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSL : ..: ... :.. ::: ::. :. . :::::::::::.: NP_001 DLDRIVYVNEKEGGPNNHLLKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDL 200 210 220 230 240 250 680 690 700 710 720 730 pF1KB5 VVNYPFDDDEQGLA-TYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQ-GRP-CKNMYPNEYFPHG :.:::.:. ..: : ::.:::::.::..: .::. : : . .:: :.. . : : NP_001 VANYPYDETRSGSAHEYSSSPDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDG 260 270 280 290 300 310 740 750 760 770 780 790 pF1KB5 ITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQV :::..::.:::::::.:::..::::.:.::.: :.: :. : ..::.:. :::....:. NP_001 TTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQI 320 330 340 350 360 370 800 810 820 830 840 850 pF1KB5 HQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPV :.::.::: : .: : :::::: :.: ::. : :::::::.::.::.:::: :: . NP_001 HRGVKGFVRD-LQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAI 380 390 400 410 420 430 860 870 880 890 900 910 pF1KB5 TKNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAE ::.:.: : :.: : .: .. ..: :. NP_001 TKKVAVPYSPAAGVDFEL-ESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF 440 450 460 470 920 930 940 950 960 970 pF1KB5 NGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITNLTNLGQSTEYRHIWSLE >>NP_062555 (OMIM: 609555) probable carboxypeptidase X1 (734 aa) initn: 968 init1: 627 opt: 676 Z-score: 734.9 bits: 147.5 E(85289): 3.4e-34 Smith-Waterman score: 1163; 45.6% identity (68.4% similar) in 434 aa overlap (477-873:273-703) 450 460 470 480 490 500 pF1KB5 VKEGPATEVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHF : :. :: : . . .: ::.::.. NP_062 LPEPQVARFIRLLPQTWLQGGAPCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDPLDFQHHNY 250 260 270 280 290 300 510 520 530 540 550 560 pF1KB5 PDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGN :. .... .. :::::.::.::: .. .:::::.::.:: :: :::: .:...:::: NP_062 KAMRKLMKQVQEQCPNITRIYSIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGN 310 320 330 340 350 360 570 580 590 600 610 620 pF1KB5 EVVGRELLLNLIEYLCKNFGT-DPEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYEKSQEGDSISVI-- :..:::::: :...::..: .:.:: :. . ::::.::::::::: . . : : NP_062 EALGRELLLLLMQFLCHEFLRGNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWA 370 380 390 400 410 420 630 640 650 pF1KB5 -GRNNSNNFDLNRNFPD---QFVQITD---------------PTQ---------PETIAV :: :....:::.:: : . . : :: ::: :: NP_062 EGRWNNQSIDLNHNFADLNTPLWEAQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTLPNATVAPETRAV 430 440 450 460 470 480 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 MSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNYPFDDDEQGLATY--SKSPDDAVFQQIALSYSKENSQ ..::: ::::::::::: :::.:::: . :. . .::::::. .. :. : NP_062 IKWMKRIPFVLSANLHGGELVVSYPFDMTRTPWAARELTPTPDDAVFRWLSTVYAGSNLA 490 500 510 520 530 540 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 M--FQGRPCKNMYPNEYFPHG-ITNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPL : . :::... .. :: : :::.:..:::.:.:..::.:::::::.::.: :.: NP_062 MQDTSRRPCHSQ---DFSVHGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFPH 550 560 570 580 590 780 790 800 810 820 830 pF1KB5 EKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVHQGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGD :.:::. ::.:. .:. ...::..:. : : : :: .:.:.: ::: ::: :: NP_062 ENELPQEWENNKDALLTYLEQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGGD 600 610 620 630 640 650 840 850 860 870 880 pF1KB5 YWRLLVPGTYKITASARGYNPVTKNVTVK-SEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASS :::::.:: : .::::.::. ::.: : :: . ::.:... NP_062 YWRLLTPGDYMVTASAEGYHSVTRNCRVTFEEGPFPCNFVLTKTPKQRLRELLAAGAKVP 660 670 680 690 700 710 890 900 910 920 930 940 pF1KB5 STNDASDPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMN NP_062 PDLRRRLERLRGQKD 720 730 >>NP_001014448 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z isoform (515 aa) initn: 1065 init1: 308 opt: 664 Z-score: 723.7 bits: 144.9 E(85289): 1.4e-33 Smith-Waterman score: 1092; 42.3% identity (68.0% similar) in 435 aa overlap (501-897:48-479) 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 TEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPNITRLYSLG : :: . .: ::: :.. ...: ::.: NP_001 EGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYSIG 20 30 40 50 60 70 540 550 560 570 580 pF1KB5 KSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLCKNFGT-DP .: ..::: :.:.:. :: :: ::: : :::.:::::.:::.:. : .:::... .: NP_001 RSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLGNP 80 90 100 110 120 130 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 EVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFPD---QFVQ .. :...:::::.::::::::: . :: . . . ::.:..:.:::::::: .. . 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