Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5550
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5550, 654 aa
1>>>pF1KB5550 654 - 654 aa - 654 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5175+/-0.00111; mu= 14.5910+/- 0.067
mean_var=118.2332+/-23.452, 0's: 0 Z-trim(105.2): 32 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.117952
statistics sampled from 8279 (8304) to 8279 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 3.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 ( 654) 4177 722.6 4.1e-208
CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 646) 2668 465.8 8.1e-131
CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 ( 641) 2618 457.3 2.9e-128
CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 ( 641) 2618 457.3 2.9e-128
CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 ( 641) 2601 454.4 2.2e-127
CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 ( 639) 2596 453.6 3.9e-127
CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 ( 643) 2552 446.1 7e-125
CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 493) 2102 369.4 6.4e-102
CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 ( 679) 2010 353.9 4.3e-97
CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 ( 509) 1062 192.5 1.2e-48
CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs108|chr5 ( 840) 911 166.9 9.9e-41
CCDS66525.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 814) 882 162.0 3e-39
CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 858) 882 162.0 3.1e-39
CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 839) 843 155.4 3e-37
CCDS66526.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 860) 789 146.2 1.8e-34
CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 813) 754 140.2 1.1e-32
CCDS13567.1 HSPA13 gene_id:6782|Hs108|chr21 ( 471) 718 133.9 4.9e-31
CCDS8408.1 HYOU1 gene_id:10525|Hs108|chr11 ( 999) 383 77.2 1.3e-13
>>CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 (654 aa)
initn: 4177 init1: 4177 opt: 4177 Z-score: 3849.8 bits: 722.6 E(32554): 4.1e-208
Smith-Waterman score: 4177; 100.0% identity (100.0% similar) in 654 aa overlap (1-654:1-654)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 MVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB5 KIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
610 620 630 640 650
>>CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 (646 aa)
initn: 2008 init1: 1048 opt: 2668 Z-score: 2462.1 bits: 465.8 E(32554): 8.1e-131
Smith-Waterman score: 2668; 66.1% identity (86.6% similar) in 620 aa overlap (28-644:4-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
: .:::::::::::::::..:.:::::::::::
CCDS84 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. :: :::::::::::: ..: ::.:.: :: ::
CCDS84 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. .: .::. : .::.: :::.:.:::::::: ::::::: ::.:::::::::::.:
CCDS84 NDAGRPKVQVEYKG-ETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREG-EKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
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CCDS84 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
:.::: .: :::::::::::.:...::: .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
CCDS84 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
::. :: :::.:.::: :: ..:::.::::: ::::.:. ::.:.:.:. : ::.: .:
CCDS84 SSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
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CCDS84 VLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
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CCDS84 DVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: :.::::::::::::::::::.::.:::: :.: ::.::..::::::::..::. :.
CCDS84 LLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKED
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
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CCDS84 IERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVED-EKLQGKINDEDKQKILDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: :.::...: :. :.:. ..::::.. .:::.::: ::: : :
CCDS84 CNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPS
580 590 600 610 620 630
CCDS84 GGASSGPTIEEVD
640
>>CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 1544 init1: 1041 opt: 2618 Z-score: 2416.2 bits: 457.3 E(32554): 2.9e-128
Smith-Waterman score: 2618; 64.4% identity (86.2% similar) in 618 aa overlap (31-644:7-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
.::::::::::::::..:.:::::::::::
CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. ::.:::::::::::: ..:: ::.:.: ::.:.
CCDS34 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. :: .::. : .::.: :::::.:::::::: :::::: ::.::.::::::::.:
CCDS34 NDGDKPKVQVSYKG-ETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKR-EGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
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CCDS34 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
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CCDS34 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
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CCDS34 SSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
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CCDS34 VLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
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CCDS34 DVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: :.:.::::::::::::::::.::.:::: ::: ::.::. ::::::::..::. ::
CCDS34 LLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEE
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
:::::..:::. ::. .::....: :::::...:. . : : : ::.: ::. .
CCDS34 IERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVED-EGLKGKISEADKKKVLDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLY-GSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: : ::... :. ..:. :.::::.. .:::: :: :..:: : :
CCDS34 CQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGS
580 590 600 610 620 630
CCDS34 GPTIEEVD
640
>>CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 1544 init1: 1041 opt: 2618 Z-score: 2416.2 bits: 457.3 E(32554): 2.9e-128
Smith-Waterman score: 2618; 64.4% identity (86.2% similar) in 618 aa overlap (31-644:7-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
.::::::::::::::..:.:::::::::::
CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. ::.:::::::::::: ..:: ::.:.: ::.:.
CCDS34 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. :: .::. : .::.: :::::.:::::::: :::::: ::.::.::::::::.:
CCDS34 NDGDKPKVQVSYKG-ETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKR-EGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
::::::::.::::::.::::::::::::::::. .::.:.:.:::::::::::.::::.
CCDS34 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
:.::: :: :::::::::::.:...::.. .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
CCDS34 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
::. :: .::.:..:: :: ..:::.:::: ::::::..::.:.:.:. : :..: ..
CCDS34 SSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
:::::::::::.:.:...::::.. ...:::::::::::::::..: ::. .. ::.::
CCDS34 VLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.::.::.::::: :: ::...:::..:::.: ::::: : :.:::::: .::::.
CCDS34 DVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: :.:.::::::::::::::::.::.:::: ::: ::.::. ::::::::..::. ::
CCDS34 LLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEE
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
:::::..:::. ::. .::....: :::::...:. . : : : ::.: ::. .
CCDS34 IERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVED-EGLKGKISEADKKKVLDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLY-GSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: : ::... :. ..:. :.::::.. .:::: :: :..:: : :
CCDS34 CQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGS
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CCDS34 GPTIEEVD
640
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10 20 30 40 50 60
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::::::::.::::::.::::::::::::::::: .::...:.:::::::::::.::::.
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:.::: :: :::::::::::.:.. ::.. .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
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:::::::::::.:.:....:::.. ...:::::::::::::::..: ::.. . ::.::
CCDS34 VLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLL
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:: ::.::.::.::::: :: ::...:::..:::.: ::::: : :.:::::: .::::.
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::: ::::::::::::::::::::.::.:::: ::: ::.::. ::::::::..::. ::
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::::: ::::. ::. .:.: ..: :::::...:. ..: : : ::.: ::. .
CCDS34 IERMVLDAEKYKAEDEVQREKIAAKNALESYAFNMKSVVSD-EGLKGKISESDKNKILDK
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pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLY--GSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: . ::: .: :. ..: :.::::.. .:::.::: : .::
CCDS34 CNELLSWLEVNQLAEKDEFDHKRKELEQMCNPIITKLYQGGCTGPACGTGYVPGRPATGP
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CCDS34 TIEEVD
640
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
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CCDS97 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
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CCDS97 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVV
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. :: .::. : .:::: :::::.:::::::: :::::: :: ::.::::::::.:
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CCDS97 RQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTI
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..:.::: .: :::::::::::.:.. :. . .:.: ::. ..:::..:: :.:::
CCDS97 EDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKR
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pF1KB5 ALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDID
.:::. :: :::.:.::: :: ..:::.::::: ::::.:..::.:.:.:. : :..:.
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CCDS97 EIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLL
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:::: ::.:::::.::::: :: :::..:::..: :.: :::: .: ..:::::: .:::
CCDS97 LLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKD
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CCDS97 NNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSK
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pF1KB5 EEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETME
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CCDS97 DDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVAAKNALESYTYNIKQTVED-EKLRGKISEQDKNKIL
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CCDS97 DKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQKELERVCNPIISKLY-QGGPGGGSGGGGSGASGGP
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CCDS97 TIEEVD
>>CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 (643 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
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CCDS12 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNR
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pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
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CCDS12 TTPSYVAFT-DTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVV
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pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. :: ..: : . ::: :::::.:::.:::::::::::. : :::.::::::::.:
CCDS12 SEGGKPKVRVCYRG-EDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQ
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pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKR-EGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
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CCDS12 RQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDA
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::::: :: :::::::::::.:...::.. ...: :::. ..::...:: :.:::.:
CCDS12 GVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTL
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pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
::. :: .::.:..:: :: ..:::.:::: ::::::..::.:.:.:. : :..: ..
CCDS12 SSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDV
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:::::::::::.:.:...:::::: ...:::::::::::::::.:: ::. . ::.::
CCDS12 VLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLL
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pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.::.::.::::: :: ::...:::..: :.: ::::: : :.:::::: .::::.
CCDS12 DVAPLSLGLETAGGVMTTLIQRNATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGERAMTKDNN
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pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
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CCDS12 LLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILSVTATDRSTGKANKITITNDKGRLSKEE
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pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
.::::..::.. ::. ..:. ..: ::.... .:... ..:.: :. ::.. :.
CCDS12 VERMVHEAEQYKAEDEAQRDRVAAKNSLEAHVFHVKGSL-QEESLRDKIPEEDRRKMQDK
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pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: . ::: .: :. :... .:.:::.: .::.:.:::. : :
CCDS12 CREVLAWLEHNQLAEKEEYEHQKRELEQICRPIFSRLYGGPGVPGGSSCGTQARQGDPST
580 590 600 610 620 630
CCDS12 GPIIEEVD
640
>>CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 (493 aa)
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CCDS44 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
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pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. :: :::::::::::: ..: ::.:.: :: ::
CCDS44 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVV
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pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
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CCDS44 NDAGRPKVQVEYKG-ETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
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pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREG-EKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
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CCDS44 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
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:.::: .: :::::::::::.:...::: .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
CCDS44 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTL
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pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
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CCDS44 SSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDI
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
:::::::::::::.:...:::::: ...:::::::::::::::..::::. .. ::.::
CCDS44 VLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLL
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pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.:::::.::::: :: :::..:::..: :.: ::::: : :.:::::: .::::.
CCDS44 DVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 LLGTFDLTGIPPA-PRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPE
::: :.:::.: . : : :
CCDS44 LLGKFELTGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD
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>>CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 (679 aa)
initn: 1029 init1: 682 opt: 2010 Z-score: 1856.7 bits: 353.9 E(32554): 4.3e-97
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQ
:.::::::::: :::.:... ..... : .
CCDS42 AARHQDSWNGLSHEAFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAE
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPF
: : ::: :::: .::::.: :: : ..::.:: . .:::::: ..:: ::.::: .::
CCDS42 GARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPF
90 100 110 120 130 140
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pF1KB5 KVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFN
:.: . .. :. : : ..: .:.:.:: ::::::: :::. . .::.:::::::
CCDS42 KIV-RASNGDAWVEAHG---KLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFN
150 160 170 180 190
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pF1KB5 DAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTI
:.::::::::: :.::::.:.::::::::.:::::: : .: : :.::::::::.:.: :
CCDS42 DSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSE-DKVIAVYDLGGGTFDISILEI
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKR
..::::: .::::: :::::::: ...:..: .:..:: :. ::: :.:..:. .::::
CCDS42 QKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKC
260 270 280 290 300 310
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pF1KB5 ALSSQHQARIEIESFYEG----EDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKK
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CCDS42 ELSSSVQTDINLPYLTMDSSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSK
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pF1KB5 SDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGD
::: :..:::: ::.::.:: :...: :. ::...::::::: :::.:.:::.:: . :
CCDS42 SDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLF-GRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGD--VTD
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LVLLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLT
..:::: ::.:::::.:::.:::: :::..::::::.::::.:.: : ::: .::: ..
CCDS42 VLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQGEREMA
440 450 460 470 480 490
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