FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5550, 654 aa
1>>>pF1KB5550 654 - 654 aa - 654 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3237+/-0.000464; mu= 16.1138+/- 0.029
mean_var=128.3228+/-24.760, 0's: 0 Z-trim(112.7): 39 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.113220
statistics sampled from 21704 (21741) to 21704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 8.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated ( 654) 4177 694.5 3.2e-199
NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 646) 2668 448.0 5.1e-125
XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock ( 646) 2668 448.0 5.1e-125
NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein ( 641) 2618 439.8 1.4e-122
NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein ( 641) 2618 439.8 1.4e-122
NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein ( 641) 2601 437.0 9.9e-122
NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa ( 639) 2596 436.2 1.7e-121
NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein ( 643) 2552 429.0 2.5e-119
NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 493) 2102 355.4 2.8e-97
NP_004125 (OMIM: 182170,600548,616854) stress-70 p ( 679) 2010 340.5 1.2e-92
NP_057383 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa protein ( 509) 1062 185.5 4e-46
NP_002145 (OMIM: 601113) heat shock 70 kDa protein ( 840) 911 161.1 1.5e-38
XP_016875852 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 807) 882 156.3 3.9e-37
NP_001273432 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 814) 882 156.3 3.9e-37
XP_016875850 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 851) 882 156.4 4.1e-37
NP_006635 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 kD ( 858) 882 156.4 4.1e-37
XP_016875851 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 809) 789 141.1 1.5e-32
XP_005266293 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 816) 789 141.1 1.5e-32
XP_011533189 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 853) 789 141.2 1.5e-32
NP_001273433 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 860) 789 141.2 1.5e-32
NP_008879 (OMIM: 601100) heat shock 70 kDa protein ( 471) 718 129.3 3.1e-29
NP_006380 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated prot ( 999) 383 74.9 1.6e-12
XP_016872585 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999) 383 74.9 1.6e-12
NP_001124463 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated p ( 999) 383 74.9 1.6e-12
XP_016872586 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999) 383 74.9 1.6e-12
XP_005271449 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 383 74.9 1.6e-12
XP_016872584 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 383 74.9 1.6e-12
XP_005271451 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 383 74.9 1.6e-12
XP_005271450 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 383 74.9 1.6e-12
XP_016875853 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 736) 322 64.8 1.3e-09
XP_011533190 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 780) 322 64.9 1.3e-09
NP_001265134 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa prot ( 143) 238 50.4 5.2e-06
NP_001273434 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 782) 229 49.7 4.9e-05
>>NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated prot (654 aa)
initn: 4177 init1: 4177 opt: 4177 Z-score: 3697.6 bits: 694.5 E(85289): 3.2e-199
Smith-Waterman score: 4177; 100.0% identity (100.0% similar) in 654 aa overlap (1-654:1-654)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEEIER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 MVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKAVEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB5 KIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
610 620 630 640 650
>>NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro (646 aa)
initn: 2008 init1: 1048 opt: 2668 Z-score: 2365.5 bits: 448.0 E(85289): 5.1e-125
Smith-Waterman score: 2668; 66.1% identity (86.6% similar) in 620 aa overlap (28-644:4-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
: .:::::::::::::::..:.:::::::::::
NP_006 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. :: :::::::::::: ..: ::.:.: :: ::
NP_006 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. .: .::. : .::.: :::.:.:::::::: ::::::: ::.:::::::::::.:
NP_006 NDAGRPKVQVEYKG-ETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREG-EKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
:::::::::::::::.:::::::::::::::::. : :.:.:.:::::::::::.:::..
NP_006 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
:.::: .: :::::::::::.:...::: .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
NP_006 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
::. :: :::.:.::: :: ..:::.::::: ::::.:. ::.:.:.:. : ::.: .:
NP_006 SSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
:::::::::::::.:...:::::: ...:::::::::::::::..::::. .. ::.::
NP_006 VLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.:::::.::::: :: :::..:::..: :.: ::::: : :.:::::: .::::.
NP_006 DVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: :.::::::::::::::::::.::.:::: :.: ::.::..::::::::..::. :.
NP_006 LLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKED
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
:::::..:::. ::.: .......: :::::...: . : ::: ::...:::. .
NP_006 IERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVED-EKLQGKINDEDKQKILDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: :.::...: :. :.:. ..::::.. .:::.::: ::: : :
NP_006 CNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPS
580 590 600 610 620 630
NP_006 GGASSGPTIEEVD
640
>>XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock cogn (646 aa)
initn: 2008 init1: 1048 opt: 2668 Z-score: 2365.5 bits: 448.0 E(85289): 5.1e-125
Smith-Waterman score: 2668; 66.1% identity (86.6% similar) in 620 aa overlap (28-644:4-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
: .:::::::::::::::..:.:::::::::::
XP_011 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. :: :::::::::::: ..: ::.:.: :: ::
XP_011 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. .: .::. : .::.: :::.:.:::::::: ::::::: ::.:::::::::::.:
XP_011 NDAGRPKVQVEYKG-ETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREG-EKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
:::::::::::::::.:::::::::::::::::. : :.:.:.:::::::::::.:::..
XP_011 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
:.::: .: :::::::::::.:...::: .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
XP_011 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
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XP_011 SSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
:::::::::::::.:...:::::: ...:::::::::::::::..::::. .. ::.::
XP_011 VLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.:::::.::::: :: :::..:::..: :.: ::::: : :.:::::: .::::.
XP_011 DVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: :.::::::::::::::::::.::.:::: :.: ::.::..::::::::..::. :.
XP_011 LLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKED
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
:::::..:::. ::.: .......: :::::...: . : ::: ::...:::. .
XP_011 IERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVED-EKLQGKINDEDKQKILDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: :.::...: :. :.:. ..::::.. .:::.::: ::: : :
XP_011 CNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPS
580 590 600 610 620 630
XP_011 GGASSGPTIEEVD
640
>>NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein 1B (641 aa)
initn: 1544 init1: 1041 opt: 2618 Z-score: 2321.4 bits: 439.8 E(85289): 1.4e-122
Smith-Waterman score: 2618; 64.4% identity (86.2% similar) in 618 aa overlap (31-644:7-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
.::::::::::::::..:.:::::::::::
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. ::.:::::::::::: ..:: ::.:.: ::.:.
NP_005 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. :: .::. : .::.: :::::.:::::::: :::::: ::.::.::::::::.:
NP_005 NDGDKPKVQVSYKG-ETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKR-EGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
::::::::.::::::.::::::::::::::::. .::.:.:.:::::::::::.::::.
NP_005 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
:.::: :: :::::::::::.:...::.. .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
NP_005 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
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NP_005 SSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
:::::::::::.:.:...::::.. ...:::::::::::::::..: ::. .. ::.::
NP_005 VLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
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NP_005 DVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
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NP_005 LLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEE
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
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NP_005 IERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVED-EGLKGKISEADKKKVLDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLY-GSAGPPPTGEEDTAEKDEL
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NP_005 CQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGS
580 590 600 610 620 630
NP_005 GPTIEEVD
640
>>NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein 1A (641 aa)
initn: 1544 init1: 1041 opt: 2618 Z-score: 2321.4 bits: 439.8 E(85289): 1.4e-122
Smith-Waterman score: 2618; 64.4% identity (86.2% similar) in 618 aa overlap (31-644:7-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
.::::::::::::::..:.:::::::::::
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. ::.:::::::::::: ..:: ::.:.: ::.:.
NP_005 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVI
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. :: .::. : .::.: :::::.:::::::: :::::: ::.::.::::::::.:
NP_005 NDGDKPKVQVSYKG-ETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKR-EGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
::::::::.::::::.::::::::::::::::. .::.:.:.:::::::::::.::::.
NP_005 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
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pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
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NP_005 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
::. :: .::.:..:: :: ..:::.:::: ::::::..::.:.:.:. : :..: ..
NP_005 SSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
:::::::::::.:.:...::::.. ...:::::::::::::::..: ::. .. ::.::
NP_005 VLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.::.::.::::: :: ::...:::..:::.: ::::: : :.:::::: .::::.
NP_005 DVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
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pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: :.:.::::::::::::::::.::.:::: ::: ::.::. ::::::::..::. ::
NP_005 LLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEE
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
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NP_005 IERMVQEAEKYKAEDEVQRERVSAKNALESYAFNMKSAVED-EGLKGKISEADKKKVLDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLY-GSAGPPPTGEEDTAEKDEL
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NP_005 CQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRKELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGS
580 590 600 610 620 630
NP_005 GPTIEEVD
640
>>NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein 1-l (641 aa)
initn: 2002 init1: 1034 opt: 2601 Z-score: 2306.4 bits: 437.0 E(85289): 9.9e-122
Smith-Waterman score: 2601; 64.4% identity (85.9% similar) in 618 aa overlap (28-640:6-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
: ..::::::::::::::..:.:::::::::::
NP_005 MATAKGIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. ::.:::::::::::: .::: :: :.:. ::.:.
NP_005 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVI
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
.. :: . :. : ..:.: :::::.:::::.::::::.::. ::.::.::::::::.:
NP_005 NEGGKPKVLVSYKG-ENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
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pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKR-EGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
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NP_005 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGGQGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
:.::: :: :::::::::::.:.. ::.. .:.: ::. ...:::..:: :.:::.:
NP_005 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
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pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
::. :: .::.:.::: :: ..:::.:::: ::::.:..::.:.:.:. . :. : .:
NP_005 SSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDI
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQD--TGDLVLL
:::::::::::.:.:....:::.. ...:::::::::::::::..: ::.. . ::.::
NP_005 VLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.::.::.::::: :: ::...:::..:::.: ::::: : :.:::::: .::::.
NP_005 DVAPLSLGLETAGGVMTALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: ::::::::::::::::::::.::.:::: ::: ::.::. ::::::::..::. ::
NP_005 LLGRFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTATDKSTGKVNKITITNDKGRLSKEE
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
::::: ::::. ::. .:.: ..: :::::...:. ..: : : ::.: ::. .
NP_005 IERMVLDAEKYKAEDEVQREKIAAKNALESYAFNMKSVVSD-EGLKGKISESDKNKILDK
520 530 540 550 560 570
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pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLY--GSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: . ::: .: :. ..: :.::::.. .:::.::: : .::
NP_005 CNELLSWLEVNQLAEKDEFDHKRKELEQMCNPIITKLYQGGCTGPACGTGYVPGRPATGP
580 590 600 610 620 630
NP_005 TIEEVD
640
>>NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa pro (639 aa)
initn: 2201 init1: 844 opt: 2596 Z-score: 2302.0 bits: 436.2 E(85289): 1.7e-121
Smith-Waterman score: 2596; 64.7% identity (86.1% similar) in 618 aa overlap (28-640:5-618)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
: ..::::::::::::::..:.:::::::::::
NP_068 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::::::::::.. :: ::.::::::::: ..: .::.:.: ::.::
NP_068 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVV
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pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. :: .::. : .:::: :::::.:::::::: :::::: :: ::.::::::::.:
NP_068 SEGGKPKVQVEYKG-ETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
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pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKRE---GEKNILVFDLGGGTFDVSLLTI
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NP_068 RQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTI
160 170 180 190 200 210
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pF1KB5 DNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKR
..:.::: .: :::::::::::.:.. :. . .:.: ::. ..:::..:: :.:::
NP_068 EDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKR
220 230 240 250 260 270
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pF1KB5 ALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDID
.:::. :: :::.:.::: :: ..:::.::::: ::::.:..::.:.:.:. : :..:.
NP_068 TLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQ
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pF1KB5 EIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLV
:::::::::::::::.:...:::::: ...:::::::::::::::..: ::. .. ::.
NP_068 EIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLL
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 LLDVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKD
:::: ::.:::::.::::: :: :::..:::..: :.: :::: .: ..:::::: .:::
NP_068 LLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKD
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 NHLLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTP
:.::: ::::::::::::::::::::.::.:::: ::: ::.::..::::::::..::.
NP_068 NNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSK
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 EEIERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETME
..:.:::..::.. ::. ..:. ..: ::::.:..:. . : ::: ::.: .::. .
NP_068 DDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVAAKNALESYTYNIKQTVED-EKLRGKISEQDKNKIL
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 KAVEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: :.::. .: :. .... :.::::.. .::::::: ..::
NP_068 DKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQKELERVCNPIISKLY-QGGPGGGSGGGGSGASGGP
580 590 600 610 620 630
NP_068 TIEEVD
>>NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein 6 [ (643 aa)
initn: 1926 init1: 1015 opt: 2552 Z-score: 2263.2 bits: 429.0 E(85289): 2.5e-119
Smith-Waterman score: 2552; 63.0% identity (85.7% similar) in 614 aa overlap (31-641:9-619)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
:::::::::::::::..:::::.:::::::
NP_002 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
:::::::: . :::.:::::.: . ::.:::::::::::: . : .::.:.: ::.::
NP_002 TTPSYVAFT-DTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVV
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 EKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQ
. :: ..: : . ::: :::::.:::.:::::::::::. : :::.::::::::.:
NP_002 SEGGKPKVRVCYRG-EDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KB5 RQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKR-EGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDN
::::::::.::::::.::::::::::::::::.: ::.:.:.:::::::::::.:.::
NP_002 RQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDA
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRAL
::::: :: :::::::::::.:...::.. ...: :::. ..::...:: :.:::.:
NP_002 GVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEI
::. :: .::.:..:: :: ..:::.:::: ::::::..::.:.:.:. : :..: ..
NP_002 SSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDV
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQ--DTGDLVLL
:::::::::::.:.:...:::::: ...:::::::::::::::.:: ::. . ::.::
NP_002 VLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DVCPLTLGIETVGGVMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNH
:: ::.::.::.::::: :: ::...:::..: :.: ::::: : :.:::::: .::::.
NP_002 DVAPLSLGLETAGGVMTTLIQRNATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGERAMTKDNN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 LLGTFDLTGIPPAPRGVPQIEVTFEIDVNGILRVTAEDKGTGNKNKITITNDQNRLTPEE
::: :.:.::::::::::::::::.::.:::: ::: :..::. ::::::::..::. ::
NP_002 LLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILSVTATDRSTGKANKITITNDKGRLSKEE
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IERMVNDAEKFAEEDKKLKERIDTRNELESYAYSLKNQIGDKEKLGGKLSSEDKETMEKA
.::::..::.. ::. ..:. ..: ::.... .:... ..:.: :. ::.. :.
NP_002 VERMVHEAEQYKAEDEAQRDRVAAKNSLEAHVFHVKGSL-QEESLRDKIPEEDRRKMQDK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 VEEKIEWLESHQDADIEDFKAKKKELEEIVQPIISKLYGSAGPPPTGEEDTAEKDEL
.: . ::: .: :. :... .:.:::.: .::.:.:::. : :
NP_002 CREVLAWLEHNQLAEKEEYEHQKRELEQICRPIFSRLYGGPGVPGGSSCGTQARQGDPST
580 590 600 610 620 630
NP_002 GPIIEEVD
640
>>NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro (493 aa)
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Smith-Waterman score: 2102; 69.1% identity (87.1% similar) in 472 aa overlap (28-495:4-473)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]