Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5555
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5555, 452 aa
1>>>pF1KB5555 452 - 452 aa - 452 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0999+/-0.000743; mu= 15.0489+/- 0.045
mean_var=97.7054+/-19.685, 0's: 0 Z-trim(111.0): 73 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.129752
statistics sampled from 11993 (12066) to 11993 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44768.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 452) 3132 596.4 1.9e-170
CCDS53725.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 419) 2923 557.2 1.1e-158
CCDS59231.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 386) 2610 498.6 4.5e-141
CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 455) 2057 395.2 7.4e-110
CCDS13657.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 462) 2047 393.3 2.7e-109
CCDS59230.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 259) 1776 342.4 3.2e-94
CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 363) 1731 334.1 1.5e-91
CCDS46649.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 387) 1274 248.5 8.6e-66
CCDS13658.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 479) 1274 248.6 1e-65
CCDS46648.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 486) 1274 248.6 1e-65
CCDS2428.1 FEV gene_id:54738|Hs108|chr2 ( 238) 623 126.5 2.8e-29
CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 225) 465 96.9 2.2e-20
CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 441) 465 97.1 3.7e-20
CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 485) 465 97.2 4e-20
CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21 ( 469) 461 96.4 6.5e-20
CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 354) 425 89.6 5.6e-18
CCDS12600.1 ERF gene_id:2077|Hs108|chr19 ( 548) 410 86.9 5.5e-17
CCDS44250.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1 ( 512) 401 85.2 1.7e-16
CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21 ( 454) 400 85.0 1.7e-16
CCDS74341.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 249) 395 83.9 2.1e-16
CCDS32995.2 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 342) 395 84.0 2.7e-16
CCDS1164.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1 ( 143) 389 82.6 2.9e-16
CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3 ( 510) 393 83.7 4.7e-16
CCDS77281.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 155) 383 81.5 6.8e-16
CCDS30893.1 ETV3L gene_id:440695|Hs108|chr1 ( 361) 384 81.9 1.2e-15
CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 374) 384 81.9 1.2e-15
CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 419) 384 82.0 1.3e-15
CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 437) 384 82.0 1.3e-15
CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 454) 384 82.0 1.4e-15
CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 459) 384 82.0 1.4e-15
CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 477) 384 82.0 1.4e-15
CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 207) 365 78.2 8.8e-15
CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 445) 365 78.4 1.6e-14
CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 484) 365 78.5 1.7e-14
CCDS9060.1 ELK3 gene_id:2004|Hs108|chr12 ( 407) 360 77.5 2.9e-14
CCDS59165.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 95) 351 75.3 2.9e-14
CCDS14283.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 428) 359 77.3 3.4e-14
CCDS1457.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 405) 344 74.5 2.3e-13
CCDS1456.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 431) 344 74.5 2.4e-13
>>CCDS44768.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 3132 init1: 3132 opt: 3132 Z-score: 3173.3 bits: 596.4 E(32554): 1.9e-170
Smith-Waterman score: 3132; 100.0% identity (100.0% similar) in 452 aa overlap (1-452:1-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSAYGAAAHLPKADMTASGSPDYGQPHKINPLPPQQEWINQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSAYGAAAHLPKADMTASGSPDYGQPHKINPLPPQQEWINQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMNSGLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMNSGLNK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB5 QYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
430 440 450
>>CCDS53725.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 2923 init1: 2923 opt: 2923 Z-score: 2962.4 bits: 557.2 E(32554): 1.1e-158
Smith-Waterman score: 2923; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (34-452:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 TIKEALSVVSDDQSLFDSAYGAAAHLPKADMTASGSPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTASGSPDYGQPHKINPLPPQQEWINQPVR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 TEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMNSGLNKSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMNSGLNKSPP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFH
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYW
340 350 360 370 380 390
430 440 450
pF1KB5 TSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
400 410
>>CCDS59231.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 (386 aa)
initn: 2610 init1: 2610 opt: 2610 Z-score: 2646.2 bits: 498.6 E(32554): 4.5e-141
Smith-Waterman score: 2610; 99.7% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (76-452:10-386)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 HKINPLPPQQEWINQPVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSY
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MEGGLAGERARESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSY
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 MDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 ELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSV
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 RRGAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RRGAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQ
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 FLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDK
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 NIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHP
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450
pF1KB5 SSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
340 350 360 370 380
>>CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (455 aa)
initn: 1951 init1: 1172 opt: 2057 Z-score: 2085.8 bits: 395.2 E(32554): 7.4e-110
Smith-Waterman score: 2057; 67.0% identity (84.3% similar) in 460 aa overlap (1-452:1-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSAYGAAAHLPKADMTASGSPDYGQPHKINPLPPQQEWINQ
: .::::::::::.:::::. :::. :: :..::::.: :::: :..: :::.:..:
CCDS82 MASTIKEALSVVSEDQSLFECAYGTP-HLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVPQQDWLSQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 P-VRVNVKREYD--HMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNM
: .::..: : . ..::::.:: .:::.: .:.::. .. :::.:::.::. ::: ::
CCDS82 PPARVTIKMECNPSQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKHMPPP-NM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLR
::::::::::::::::. .:::::::::.:::.: ... .:::.::::::::.:.:: :
CCDS82 TTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLFQNIDGKELCKMTKDDFQR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ATTLYNTEVLLSHLSYLRESSL--LAYNTTSHTDQSS-RL--SVKEDPSYDSVRRGAWGN
: ::...::::: ::::. : :. . .... :.: :: . . : :. ::.:: .
CCDS82 LTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTDLPYEPPRRSAWTG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLS
. . ... . .:. :. .:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVH
::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DSSNSSCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTS
::::::::::::::::::::: :::.::::::. :: ::::: ::.::: ::: ..::::
CCDS82 GKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSYHAHPQKMNFVAPHPPALPVTS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KB5 SSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
::::.: . ::.::::::::: : :..:.:::::.::
CCDS82 SSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNT---RLPTSHMPSHLGTYY
420 430 440 450
>>CCDS13657.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (462 aa)
initn: 1951 init1: 1172 opt: 2047 Z-score: 2075.5 bits: 393.3 E(32554): 2.7e-109
Smith-Waterman score: 2047; 67.0% identity (83.8% similar) in 457 aa overlap (5-452:12-462)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSAYGAAAHLPKADMTASGSPDYGQPHKINPLPP
:::::::::.:::::. :::. :: :..::::.: :::: :..: :
CCDS13 MIQTVPDPAAHIKEALSVVSEDQSLFECAYGTP-HLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QQEWINQP-VRVNVKREYD--HMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKN
::.:..:: .::..: : . ..::::.:: .:::.: .:.::. .. :::.:::.::.
CCDS13 QQDWLSQPPARVTIKMECNPSQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKM
::: ::::::::::::::::::. .:::::::::.:::.: ... .:::.::::::::
CCDS13 MPPP-NMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLFQNIDGKELCKM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB5 NKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQ----SSRL--SVKEDPSYDS
.:.:: : : ::...::::: ::::. : . :.. .:. : :: . . : :.
CCDS13 TKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPL-PHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTDLPYEP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VRRGAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLW
::.:: .. . ... . .:. :. .:::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLW
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYD
::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QFLLELLSDSSNSSCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPH
::::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::. :: ::::: ::.::: ::
CCDS13 KNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSYHAHPQKMNFVAPH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB5 PSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
: ..::::::::.: . ::.::::::::: : :..:.:::::.::
CCDS13 PPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNT---RLPTSHMPSHLGTYY
420 430 440 450 460
>>CCDS59230.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 (259 aa)
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Smith-Waterman score: 1776; 100.0% identity (100.0% similar) in 255 aa overlap (198-452:5-259)
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 CKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDPGSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRR
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFL
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNI
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 MTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSS
160 170 180 190 200 210
410 420 430 440 450
pF1KB5 MPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
220 230 240 250
>>CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (363 aa)
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Smith-Waterman score: 1731; 69.0% identity (84.2% similar) in 368 aa overlap (91-452:1-363)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTN
.::. .. :::.:::.::. ::: :::::
CCDS58 MVGSPDTVGMNYGSYMEEKHMPPP-NMTTN
10 20
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATT
:::::::::::::. .:::::::::.:::.: ... .:::.::::::::.:.:: : :
CCDS58 ERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTP
30 40 50 60 70 80
190 200 210 220 230
pF1KB5 LYNTEVLLSHLSYLRESSLLAYNTTSHTDQ----SSRL--SVKEDPSYDSVRRGAWGNNM
::...::::: ::::. : . :.. .:. : :: . . : :. ::.:: ..
CCDS58 SYNADILLSHLHYLRETPL-PHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTDLPYEPPRRSAWTGHG
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDS
. ... . .:. :. .:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDS
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGK
.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SNSSCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGK
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSS
::::::::::::::::::: :::.::::::. :: ::::: ::.::: ::: ..::::::
CCDS58 RYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSYHAHPQKMNFVAPHPPALPVTSSS
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450
pF1KB5 FFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSYY
::.: . ::.::::::::: : :..:.:::::.::
CCDS58 FFAAPNPYWNSPTGGIYPNT---RLPTSHMPSHLGTYY
330 340 350 360
>>CCDS46649.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (387 aa)
initn: 1682 init1: 1210 opt: 1274 Z-score: 1294.6 bits: 248.5 E(32554): 8.6e-66
Smith-Waterman score: 1707; 64.7% identity (79.8% similar) in 391 aa overlap (91-452:1-387)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PVRVNVKREYDHMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTN
.::. .. :::.:::.::. ::: :::::
CCDS46 MVGSPDTVGMNYGSYMEEKHMPPP-NMTTN
10 20
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATT
:::::::::::::. .:::::::::.:::.: ... .:::.::::::::.:.:: : :
CCDS46 ERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTP
30 40 50 60 70 80
190 200 210
pF1KB5 LYNTEVLLSHLSYLRESSL--------------------------LAY---NTTSHTDQS
::...::::: ::::. : :. ::. . . .
CCDS46 SYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTGGAAFIFPNTSVYPEAT
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 SRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSS
.:.... : :. ::.:: .. . ... . .:. :. .:::: :::::::::::
CCDS46 QRITTRPDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGPTSS
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 RLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMN
:::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSSNSSCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMN
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 YDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::. :: ::
CCDS46 YDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSY
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 HAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHLGSY
::: ::.::: ::: ..::::::::.: . ::.::::::::: : :..:.:::::.:
CCDS46 HAHPQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNT---RLPTSHMPSHLGTY
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 Y
:
CCDS46 Y
>>CCDS13658.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (479 aa)
initn: 1819 init1: 1210 opt: 1274 Z-score: 1293.3 bits: 248.6 E(32554): 1e-65
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSAYGAAAHLPKADMTASGSPDYGQPHKINPLPPQQEWINQ
: .::::::::::.:::::. :::. :: :..::::.: :::: :..: :::.:..:
CCDS13 MASTIKEALSVVSEDQSLFECAYGTP-HLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVPQQDWLSQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 P-VRVNVKREYD--HMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNM
: .::..: : . ..::::.:: .:::.: .:.::. .. :::.:::.::. ::: ::
CCDS13 PPARVTIKMECNPSQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKHMPPP-NM
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 TTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLR
::::::::::::::::. .:::::::::.:::.: ... .:::.::::::::.:.:: :
CCDS13 TTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLFQNIDGKELCKMTKDDFQR
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB5 ATTLYNTEVLLSHLSYLRESSL--------------------------LAY---NTTSHT
: ::...::::: ::::. : :. ::. .
CCDS13 LTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTGGAAFIFPNTSVYP
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 DQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGP
. ..:.... : :. ::.:: .. . ... . .:. :. .:::: ::::::::
CCDS13 EATQRITTRPDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQILGP
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 TSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKP
::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSSNSSCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKP
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 NMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::. ::
CCDS13 NMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYM
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 PSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPNTHVPSHL
::::: ::.::: ::: ..::::::::.: . ::.::::::::: : :..:.::::
CCDS13 GSYHAHPQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNT---RLPTSHMPSHL
420 430 440 450 460 470
450
pF1KB5 GSYY
:.::
CCDS13 GTYY
>>CCDS46648.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 (486 aa)
initn: 1819 init1: 1210 opt: 1274 Z-score: 1293.2 bits: 248.6 E(32554): 1e-65
Smith-Waterman score: 2023; 63.5% identity (80.2% similar) in 480 aa overlap (5-452:12-486)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDGTIKEALSVVSDDQSLFDSAYGAAAHLPKADMTASGSPDYGQPHKINPLPP
:::::::::.:::::. :::. :: :..::::.: :::: :..: :
CCDS46 MIQTVPDPAAHIKEALSVVSEDQSLFECAYGTP-HLAKTEMTASSSSDYGQTSKMSPRVP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QQEWINQP-VRVNVKREYD--HMNGSRESPVDCSVSKCSKLVGGGESNPMNYNSYMDEKN
::.:..:: .::..: : . ..::::.:: .:::.: .:.::. .. :::.:::.::.
CCDS46 QQDWLSQPPARVTIKMECNPSQVNGSRNSPDECSVAKGGKMVGSPDTVGMNYGSYMEEKH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYSLMEIDTSFFQNMDGKELCKM
::: ::::::::::::::::::. .:::::::::.:::.: ... .:::.::::::::
CCDS46 MPPP-NMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYGLPDVNILLFQNIDGKELCKM
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB5 NKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYLRESSL--------------------------LAY--
.:.:: : : ::...::::: ::::. : :.
CCDS46 TKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTGGAAFIF
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 -NTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMNSGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPD
::. . . ..:.... : :. ::.:: .. . ... . .:. :. .:::: :
CCDS46 PNTSVYPEATQRITTRPDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLD
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRW
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSSNSSCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRW
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 GERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::
CCDS46 GERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPPESSLYKY
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 PSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSFFGAASQYWTSPTGGIYPNPNVPRHPN
:::. :: ::::: ::.::: ::: ..::::::::.: . ::.::::::::: : :.
CCDS46 PSDLPYMGSYHAHPQKMNFVAPHPPALPVTSSSFFAAPNPYWNSPTGGIYPNT---RLPT
420 430 440 450 460 470
450
pF1KB5 THVPSHLGSYY
.:.:::::.::
CCDS46 SHMPSHLGTYY
480
452 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:34:10 2016 done: Thu Nov 3 17:34:10 2016
Total Scan time: 2.750 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]