FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5562, 787 aa 1>>>pF1KB5562 787 - 787 aa - 787 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3384+/-0.00102; mu= 1.7983+/- 0.061 mean_var=212.6032+/-44.036, 0's: 0 Z-trim(111.0): 56 B-trim: 72 in 1/50 Lambda= 0.087961 statistics sampled from 11953 (12002) to 11953 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16 Scan time: 4.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS65642.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 787) 5327 689.4 6e-198 CCDS970.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 789) 5313 687.6 2.1e-197 CCDS65641.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 775) 5205 673.9 2.7e-193 CCDS971.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 774) 4802 622.8 6.8e-178 CCDS32307.1 ARNT2 gene_id:9915|Hs108|chr15 ( 717) 2160 287.5 5.4e-77 CCDS31430.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 625) 1134 157.2 7.5e-38 CCDS73259.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 626) 1130 156.7 1.1e-37 CCDS44543.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 582) 1129 156.6 1.1e-37 CCDS76387.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 583) 1125 156.1 1.6e-37 CCDS58219.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 622) 617 91.6 4.2e-18 CCDS8712.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 636) 614 91.2 5.6e-18 CCDS58222.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 540) 605 90.1 1.1e-17 CCDS58220.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 588) 605 90.1 1.1e-17 CCDS58221.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 599) 605 90.1 1.2e-17 >>CCDS65642.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (787 aa) initn: 5327 init1: 5327 opt: 5327 Z-score: 3667.2 bits: 689.4 E(32554): 6e-198 Smith-Waterman score: 5327; 100.0% identity (100.0% similar) in 787 aa overlap (1-787:1-787) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 RCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 RCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 PHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 PHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 SGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 SGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRT 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 SQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 SQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEG 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 VGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 VGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLT 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 MFPPFSE ::::::: CCDS65 MFPPFSE >>CCDS970.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (789 aa) initn: 5313 init1: 4056 opt: 5313 Z-score: 3657.6 bits: 687.6 E(32554): 2.1e-197 Smith-Waterman score: 5313; 99.7% identity (99.7% similar) in 789 aa overlap (1-787:1-789) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 RCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 PHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 PHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 --SGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RNSGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKT 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 RTSQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RTSQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTA 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 EGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 EGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPD 730 740 750 760 770 780 780 pF1KB5 LTMFPPFSE ::::::::: CCDS97 LTMFPPFSE >>CCDS65641.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (775 aa) initn: 5211 init1: 2074 opt: 5205 Z-score: 3583.7 bits: 673.9 E(32554): 2.7e-193 Smith-Waterman score: 5205; 99.1% identity (99.1% similar) in 780 aa overlap (10-787:1-775) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 MTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 RCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 RCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 PHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP :::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 PHFVVVHCTGYIKAWPPA-----DDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 pF1KB5 --SGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 RNSGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKT 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 RTSQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 RTSQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTA 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 EGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS65 EGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPD 710 720 730 740 750 760 780 pF1KB5 LTMFPPFSE ::::::::: CCDS65 LTMFPPFSE 770 >>CCDS971.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (774 aa) initn: 4785 init1: 3528 opt: 4802 Z-score: 3307.3 bits: 622.8 E(32554): 6.8e-178 Smith-Waterman score: 5180; 97.8% identity (97.8% similar) in 789 aa overlap (1-787:1-774) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 RCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS :::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RCDDDQMSNDKERFAR---------------ENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCS 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 ALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 CETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLK 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 TGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGE 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 PHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 PHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQP 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 TEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKG 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 QVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQ 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSK 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 PLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENF 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 pF1KB5 --SGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RNSGLAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKT 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 RTSQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 RTSQFGVGSFQTPSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTA 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 EGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS97 EGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPD 710 720 730 740 750 760 780 pF1KB5 LTMFPPFSE ::::::::: CCDS97 LTMFPPFSE 770 >>CCDS32307.1 ARNT2 gene_id:9915|Hs108|chr15 (717 aa) initn: 2344 init1: 2147 opt: 2160 Z-score: 1495.8 bits: 287.5 E(32554): 5.4e-77 Smith-Waterman score: 2900; 59.1% identity (76.7% similar) in 798 aa overlap (3-787:5-717) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAATTANPEMTSDVP-SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGN :.. :::.::.: :. .: . .. .::. :. ::: :.:::: :::: CCDS32 MATPAAVNPPEMASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 SKFLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMV ::: .:::::::::::::::: ::::::::: CCDS32 SKF------------------------------SRENHSEIERRRRNKMTQYITELSDMV 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 PTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFL :::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::: CCDS32 PTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFL 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 FIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRI :.:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..:::: CCDS32 FVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRI 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 LDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSV ::::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: : CCDS32 LDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPV 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 KDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSN :.:: ...:::::::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::.. CCDS32 KEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNG 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 VCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVV . ::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.:::::: CCDS32 MSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVV 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 KLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLS ::::::::::.:::.::.::. .:::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVK----------- 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 NTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTG- :: ::::.::. : ::::.::. ::: : .: CCDS32 ------QL-------------------QQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGV 440 450 460 470 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPR : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: . . CCDS32 HEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-SGH 480 490 500 510 520 530 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 PAENFSGLA---PPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVAT .. ::. . : :. .: :.:.:: ..::::. : .: : :: . : : .::. . CCDS32 SGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQIPS 540 550 560 570 580 660 670 680 690 700 pF1KB5 QATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQ : ..::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.:: CCDS32 Q-SSKTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQ 590 600 610 620 630 640 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 TAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQS ..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .: :::: ::::.:: : :: . CCDS32 SSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPGQTEVFQDMLPMPGDPT 650 660 670 680 690 770 780 pF1KB5 N---SYNNEEFPDLTMFPPFSE . .:: :.: :: ::::::: CCDS32 QGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE 700 710 >>CCDS31430.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (625 aa) initn: 1138 init1: 625 opt: 1134 Z-score: 793.0 bits: 157.2 E(32554): 7.5e-38 Smith-Waterman score: 1143; 39.7% identity (67.2% similar) in 478 aa overlap (46-518:32-485) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFA :.: . .:.: : : : : .. CCDS31 ADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSST-----DYQESMDTDKDD 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 RSDDEQSSADKERL--ARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILR . . . :. ::: ::.::.:::.::...: ::...::::.:..:: ::::.:: CCDS31 PHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLR 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 MAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSV :::.:::.:::. : :...:::.::.:.:::::::.:::::::.:.:. :....::.:: CCDS31 MAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESV 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 TPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGT-VKKEGQQSS .:: :.. .:..:.: .:: :. :..::::.:..: :..: ::: :: . . CCDS31 FKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGP 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 MRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYI :.: :.::::.:::.:. :: .:. .: . : : : . : ..: :::. CCDS31 SRLCSGARRSFFCRMKCNRPSV---KVEDKDFP-STC-----SKKKDRKSFCTIHSTGYL 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 KAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKF-CLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEG :.:::. ..: .:. ..: .. ::::::::. :. .. . :..::: :.: CCDS31 KSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDG 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 IFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRS :.:::.: .: ..: :::::: . :. : .: : . .::.. . .. . ..:. CCDS31 KFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKI 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 KNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNV-KNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTANL :. .. .:. :.:.::.. :.:::. ::: : : . ::. . :. . . : CCDS31 KDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPH-SMDSML 410 420 430 440 450 460 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 PLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSKPLEKSDGLFA : ::. .:.. . ::: : CCDS31 P----SGEGGPKRTH-----PTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCG 470 480 490 500 510 >>CCDS73259.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (626 aa) initn: 1138 init1: 625 opt: 1130 Z-score: 790.3 bits: 156.7 E(32554): 1.1e-37 Smith-Waterman score: 1139; 39.5% identity (67.4% similar) in 478 aa overlap (46-518:32-486) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 SLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFA :.: . .:.: : : : : .. CCDS73 ADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSST-----DYQESMDTDKDD 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 RSDDEQSSADKERL--ARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILR . . . :. ::: ::.::.:::.::...: ::...::::.:..:: ::::.:: CCDS73 PHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLR 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 MAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSV :::.:::.:::. : :...:::.::.:.:::::::.:::::::.:.:. :....::.:: CCDS73 MAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESV 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 TPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGT-VKKEGQQSS .:: :.. .:..:.: .:: :. :..::::.:..: :..: ::: :: . . CCDS73 FKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGP 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 MRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYI :.: :.::::.:::.:. :: .:. .: . : .. : . : ..: :::. CCDS73 SRLCSGARRSFFCRMKCNRPSV---KVEDKDFP-STC----SKKKADRKSFCTIHSTGYL 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 KAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKF-CLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEG :.:::. ..: .:. ..: .. ::::::::. :. .. . :..::: :.: CCDS73 KSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDG 290 300 310 320 330 340 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 IFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRS :.:::.: .: ..: :::::: . :. : .: : . .::.. . .. . ..:. CCDS73 KFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKI 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 KNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNV-KNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTANL :. .. .:. :.:.::.. :.:::. ::: : : . ::. . :. . . : CCDS73 KDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPH-SMDSML 410 420 430 440 450 460 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 PLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSKPLEKSDGLFA : ::. .:.. . ::: : CCDS73 P----SGEGGPKRTH-----PTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCG 470 480 490 500 510 >>CCDS44543.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (582 aa) initn: 1138 init1: 625 opt: 1129 Z-score: 790.1 bits: 156.6 E(32554): 1.1e-37 Smith-Waterman score: 1138; 40.3% identity (68.5% similar) in 457 aa overlap (65-518:5-442) 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 AIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENH ..:..::. . . . ::: : CCDS44 MINIESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAH 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 SEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSY :.::.:::.::...: ::...::::.:..:: ::::.:::::.:::.:::. : :...: CCDS44 SQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANY 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 KPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVH ::.::.:.:::::::.:::::::.:.:. :....::.:: .:: :.. .:..:.: .: CCDS44 KPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLH 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 PDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGT-VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSS : :. :..::::.:..: :..: ::: :: . . :.: :.::::.:::.:. : CCDS44 PKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPS 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 VDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGS : .:. .: . : : : . : ..: :::.:.:::. ..: .:. ..: CCDS44 V---KVEDKDFP-STC-----SKKKDRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGC 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 KF-CLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELL .. ::::::::. :. .. . :..::: :.: :.:::.: .: ..: ::::: CCDS44 NLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELL 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 GKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSD : . :. : .: : . .::.. . .. . ..:. :. .. .:. :.:.::.. CCDS44 GTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTK 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 EIEYIICTNTNV-KNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELD :.:::. ::: : : . ::. . :. . . :: ::. .:.. . CCDS44 EVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPH-SMDSMLP----SGEGGPKRTH-----P 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 MVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKG ::: : CCDS44 TVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKK 440 450 460 470 480 490 >>CCDS76387.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (583 aa) initn: 1138 init1: 625 opt: 1125 Z-score: 787.3 bits: 156.1 E(32554): 1.6e-37 Smith-Waterman score: 1134; 40.0% identity (68.5% similar) in 457 aa overlap (65-518:5-443) 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 AIVQRAIKRRPGLDFDDDGEGNSKFLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENH ..:..::. . . . ::: : CCDS76 MINIESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAH 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 SEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSY :.::.:::.::...: ::...::::.:..:: ::::.:::::.:::.:::. : :...: CCDS76 SQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANY 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 KPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVH ::.::.:.:::::::.:::::::.:.:. :....::.:: .:: :.. .:..:.: .: CCDS76 KPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLH 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 PDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGT-VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSS : :. :..::::.:..: :..: ::: :: . . :.: :.::::.:::.:. : CCDS76 PKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPS 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 VDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGS :.:. .: . : . : . : ..: :::.:.:::. ..: .:. ..: CCDS76 ---VKVEDKDFP-STCSKK----KADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGC 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 KF-CLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELL .. ::::::::. :. .. . :..::: :.: :.:::.: .: ..: ::::: CCDS76 NLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELL 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 GKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSD : . :. : .: : . .::.. . .. . ..:. :. .. .:. :.:.::.. CCDS76 GTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTK 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 EIEYIICTNTNV-KNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELD :.:::. ::: : : . ::. . :. . . :: ::. .:.. . CCDS76 EVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPH-SMDSMLP----SGEGGPKRTH-----P 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 MVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTGPEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKG ::: : CCDS76 TVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKK 440 450 460 470 480 490 >>CCDS58219.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 (622 aa) initn: 964 init1: 554 opt: 617 Z-score: 438.5 bits: 91.6 E(32554): 4.2e-18 Smith-Waterman score: 1038; 37.9% identity (68.0% similar) in 462 aa overlap (15-471:23-464) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAATTANPEMTSDVPSLGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDDD : .. .. :. .. . .. . . ..: : : : . CCDS58 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GEG--NSKFLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYIT : . : . ...:.. . : . ::.. .:: ::. :.:::.::. : CCDS58 QSGIMTEKVV----EKLSQNPLTYLLSTRIEISASSG--SREAHSQTEKRRRDKMNNLIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 ELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILE ::: :.: :. .::: ::::.:::::.:..::.: :. . ..:.:::: :.::.::::. CCDS58 ELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 AADGFLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSEN .:.::::.:.:: :....:: ::. .:: :. :..:.: .:: :: :..::::. . CCDS58 TAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 ALTGRILDLKTGT-VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMR-CGSSSVDPVSVNRLSFVRNR . ...: ::: :... . . :. ::::::.::.. : .::.. .. CCDS58 SPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSC------KISVKE----EHG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 CRNGLGSVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKF-CLVAIGRLQVTS : . : : . .: ..:::::...::: :.. .. ..:.: ::::::::: CCDS58 CLPN--SKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYI 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SPNCTDMSNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQL :. . :: .:::::.: ..: :..::.: .: .:: :::::: . :. : .:.. CCDS58 VPQNSGEINV-KPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNN 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 LRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNS : :. . :.. : ..:. ..::.:. .. .... :.: ::.. :.:::. .:: : . CCDS58 LTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGH 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 SQEPRPTLSNTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQV : :: CCDS58 S-EPGEASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSS 470 480 490 500 510 520 787 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 17:35:54 2016 done: Thu Nov 3 17:35:55 2016 Total Scan time: 4.430 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]