Result of FASTA (omim) for
pF1KB5565
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5565, 737 aa
1>>>pF1KB5565 737 - 737 aa - 737 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6036+/-0.000448; mu= 23.4253+/- 0.028
mean_var=56.8636+/-12.084, 0's: 0 Z-trim(107.9): 26 B-trim: 692 in 1/52
Lambda= 0.170082
statistics sampled from 15922 (15941) to 15922 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 10.570
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000926 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine ( 737) 5083 1256.3 0
NP_891988 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine ( 758) 3408 845.3 0
NP_001075 (OMIM: 603066,612394) procollagen-lysine ( 738) 3173 787.7 0
NP_000293 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine ( 727) 3165 785.7 0
NP_001303249 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lys ( 774) 3155 783.3 0
XP_005247592 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: proc ( 666) 2779 691.0 4.2e-198
XP_016862114 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: proc ( 666) 2779 691.0 4.2e-198
XP_011517065 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 517) 226 64.4 1.3e-09
NP_001273689 (OMIM: 616626) probable inactive glyc ( 517) 226 64.4 1.3e-09
XP_011517064 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595) 226 64.5 1.4e-09
NP_057258 (OMIM: 616626) probable inactive glycosy ( 595) 226 64.5 1.4e-09
XP_016870283 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595) 226 64.5 1.4e-09
XP_005252092 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable in ( 595) 226 64.5 1.4e-09
>>NP_000926 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine,2-o (737 aa)
initn: 5083 init1: 5083 opt: 5083 Z-score: 6732.4 bits: 1256.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5083; 100.0% identity (100.0% similar) in 737 aa overlap (1-737:1-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 KEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSRIS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 RSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEG
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 LPVKNGTRYIAVSFIDP
:::::::::::::::::
NP_000 LPVKNGTRYIAVSFIDP
730
>>NP_891988 (OMIM: 601865,609220) procollagen-lysine,2-o (758 aa)
initn: 5069 init1: 3408 opt: 3408 Z-score: 4511.0 bits: 845.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5031; 97.2% identity (97.2% similar) in 758 aa overlap (1-737:1-758)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB5 YFVRDKLDPDMALCRNAREM---------------------GVFMYISNRHEFGRLLSTA
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_891 YFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730
pF1KB5 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
730 740 750
>>NP_001075 (OMIM: 603066,612394) procollagen-lysine,2-o (738 aa)
initn: 3163 init1: 2219 opt: 3173 Z-score: 4199.5 bits: 787.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3173; 58.6% identity (84.9% similar) in 734 aa overlap (8-737:8-738)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSS---IPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQ
:..::: .: : : .: :..: . . .::::::::: :..:. ::..
NP_001 MTSSGPGPRFLLLLPLLLP--PAASA-SDRPRGRDPVNPEKLLVITVATAETEGYLRFLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SAKYFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVI
::..:::::..:: :::::::: ..::::::: .:. ::.:::..:...::.. .:::
NP_001 SAEFFNYTVRTLGLGEEWRGGDVARTVGGGQKVRWLKKEMEKYADREDMIIMFVDSYDVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 FAGGPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVN
.::.: :.:::: ... ...:.:... ::. ::..:: : :::.::::::::.: ..
NP_001 LAGSPTELLKKFVQSGSRLLFSAESFCWPEWGLAEQYPEVGTGKRFLNSGGFIGFATTIH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RIVQQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGK
.::.::. .:.::::::::..:.:: :: ....:::: .:::.::::.:::::::. ..
NP_001 QIVRQWKYKDDDDDQLFYTRLYLDPGLREKLSLNLDHKSRIFQNLNGALDEVVLKFDRNR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ARAKNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPN
.: .:. :.:::....::::::. :::.::::::.:: ..:: .:. : : . . :
NP_001 VRIRNVAYDTLPIVVHGNGPTKLQLNYLGNYVPNGWTPEGGCGFCNQDRRTLPGGQPPPR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VSIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTI
: ..::.:::::::::::. :: :::: . . ::.::.::.:: : . . . .....
NP_001 VFLAVFVEQPTPFLPRFLQRLLLLDYPPDRVTLFLHNNEVFHEPHIADSWPQLQDHFSAV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPL
:.::::: :: .:::.:.::.:::: .:..:::.:::.:::: .::.::::.:::.:::.
NP_001 KLVGPEEALSPGEARDMAMDLCRQDPECEFYFSLDADAVLTNLQTLRILIEENRKVIAPM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMN
..:::::::::::::::: :::::::::..:: .:::::::::....:.:.: ::: :.
NP_001 LSRHGKLWSNFWGALSPDEYYARSEDYVELVQRKRVGVWNVPYISQAYVIRGDTLRMELP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENP
.:. : . :::::.:.. :. :.:...::.:::::::.:. :.: : . ::::::.::
NP_001 QRDVFSGSDTDPDMAFCKSFRDKGIFLHLSNQHEFGRLLATSRYDTEHLHPDLWQIFDNP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 VDWKEKYINRDYSKIFT-ENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHD
:::::.::...::. . :.:::::::::.:::..::. ::::: ::::::.::::.:.:
NP_001 VDWKEQYIHENYSRALEGEGIVEQPCPDVYWFPLLSEQMCDELVAEMEHYGQWSGGRHED
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 SRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYS
::..:::::::: ::::::: :. ::...: ...:.: ..: ::.::. :..::::.:
NP_001 SRLAGGYENVPTVDIHMKQVGYEDQWLQLLRTYVGPMTESLFPGYHTKARAVMNFVVRYR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 PERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTH
:..: :::::::.::::.:.:::. : :..::::.::::.: : ::::::...:::::::
NP_001 PDEQPSLRPHHDSSTFTLNVALNHKGLDYEGGGCRFLRYDCVISSPRKGWALLHPGRLTH
660 670 680 690 700 710
720 730
pF1KB5 LHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
:::::. ::::: :::.::
NP_001 YHEGLPTTWGTRYIMVSFVDP
720 730
>>NP_000293 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine,2-o (727 aa)
initn: 3159 init1: 2076 opt: 3165 Z-score: 4189.0 bits: 785.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3165; 59.8% identity (85.1% similar) in 734 aa overlap (6-737:1-727)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
..: ::::::. : : :.. : .. : :.:::.::::::..::.:: .::.
NP_000 MRP-LLLLALL--GW--LLLAEA-KGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
.::: ...:: ::.: : .: ::::::::.:...:..::..:::..:.. .::.::.
NP_000 FFNYKIQALGLGEDWNVEKG-TSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFAS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
::.:.::::..: .:::.:. ...::.:: ::::: :::.:.::::::::: ....:
NP_000 GPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
.:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.:::::::: :..::
NP_000 AEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAV--DVHPNV
.: :.:::: :.::::::. :::.:::.: :: ..:::.:. .:... .. :.:
NP_000 RNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIK
.::::::::::. :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :. . : ...:
NP_000 LVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 IVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLV
.:::: ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..::.::...::::.
NP_000 LVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLM
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNE
::::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.:::::..::.:..
NP_000 TRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 RNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPV
. : ..:::::::.: : :.. :::...::: .:.::: .: :.: .::::..: ::
NP_000 SDLFHHSKLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPE
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 DWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSR
:::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::::::::.:.:: :...:.:
NP_000 DWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNR
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 ISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPE
:.:::::::: ::::.:. .: : .:. :.:::.: :.. ::::.. : :::.:.:.
NP_000 IQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPD
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 RQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLH
.: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::..:::::..:::::::: :
NP_000 EQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYH
650 660 670 680 690 700
720 730
pF1KB5 EGLPVKNGTRYIAVSFIDP
::::. :::::::::.::
NP_000 EGLPTTRGTRYIAVSFVDP
710 720
>>NP_001303249 (OMIM: 153454,225400) procollagen-lysine, (774 aa)
initn: 3150 init1: 2076 opt: 3155 Z-score: 4175.3 bits: 783.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3155; 60.1% identity (85.3% similar) in 721 aa overlap (25-737:55-774)
10 20 30 40
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIP------TDKLLVITVATKE
:. : . :::: .:.:::.::::::
NP_001 EAPCCQEGLRAGGSGSLHLGRDFTVLAGARGSPSPSVSSIPRFWIPGSDNLLVLTVATKE
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 SDGFHRFMQSAKYFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVV
..::.:: .::..::: ...:: ::.: : .: ::::::::.:...:..::..:::.
NP_001 TEGFRRFKRSAQFFNYKIQALGLGEDWNVEKG-TSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVI
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 MFTECFDVIFAGGPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGG
.:.. .::.::.::.:.::::..: .:::.:. ...::.:: ::::: :::.:.:::
NP_001 LFADSYDVLFASGPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGG
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FIGYAPYVNRIVQQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDE
:::::: ....: .:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.::
NP_001 FIGYAPNLSKLVAEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDE
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VVLKFENGKARAKNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVD
:::::: :..::.: :.:::: :.::::::. :::.:::.: :: ..:::.:. .
NP_001 VVLKFEMGHVRARNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRS
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LSAV--DVHPNVSIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVF
:... .. :.: .::::::::::. :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :
NP_001 LKGIGDEALPTVLVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEF
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FDKAKHEIKTIKIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKIL
. . : ...:.:::: ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..:
NP_001 LAQHGSEYQSVKLVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLL
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 IEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYL
:.::...::::.::::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.::
NP_001 IQQNKNVIAPLMTRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYL
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 IKGKTLRSEMNERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHY
:::..::.:.. . : ..:::::::.: : :.. :::...::: .:.::: .: :.:
NP_001 IKGSALRGELQSSDLFHHSKLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHL
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 NNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHY
.::::..: :: :::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::::::::.
NP_001 HNDLWEVFSNPEDWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHF
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 GKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGF
:.:: :...:.::.:::::::: ::::.:. .: : .:. :.:::.: :.. ::::..
NP_001 GQWSLGNNKDNRIQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQ
630 640 650 660 670 680
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGW
: :::.:.:..: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::..:::::
NP_001 FDLAFVVRYKPDEQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGW
690 700 710 720 730 740
710 720 730
pF1KB5 SFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
..:::::::: :::::. :::::::::.::
NP_001 TLMHPGRLTHYHEGLPTTRGTRYIAVSFVDP
750 760 770
>>XP_005247592 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: procolla (666 aa)
initn: 4440 init1: 2779 opt: 2779 Z-score: 3677.6 bits: 691.0 E(85289): 4.2e-198
Smith-Waterman score: 4402; 96.8% identity (96.8% similar) in 666 aa overlap (93-737:1-666)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
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130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
100 110 120 130 140 150
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pF1KB5 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 VRDKLDPDMALCRNAREM---------------------GVFMYISNRHEFGRLLSTANY
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
XP_005 VRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTANY
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pF1KB5 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
580 590 600 610 620 630
710 720 730
pF1KB5 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
640 650 660
>>XP_016862114 (OMIM: 601865,609220) PREDICTED: procolla (666 aa)
initn: 4440 init1: 2779 opt: 2779 Z-score: 3677.6 bits: 691.0 E(85289): 4.2e-198
Smith-Waterman score: 4402; 96.8% identity (96.8% similar) in 666 aa overlap (93-737:1-666)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAGGP
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIVQQ
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARAKN
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGV
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGP
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHG
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYF
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520
pF1KB5 VRDKLDPDMALCRNAREM---------------------GVFMYISNRHEFGRLLSTANY
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
XP_016 VRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTANY
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pF1KB5 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVE
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGY
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIES
580 590 600 610 620 630
710 720 730
pF1KB5 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
640 650 660
>>XP_011517065 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable inacti (517 aa)
initn: 195 init1: 114 opt: 226 Z-score: 293.6 bits: 64.4 E(85289): 1.3e-09
Smith-Waterman score: 226; 27.0% identity (60.5% similar) in 152 aa overlap (370-515:46-192)
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 EKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTN
: .. .. : : . :: . .:.: .:::
XP_011 VVWRPEGEPRFYPDEEGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFAR-NWGADYILFADTDNILTN
20 30 40 50 60 70
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 PRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVP
.::..:. :. ..::.. . .:::: ...:.::: :. .: . .: : . ::
XP_011 NQTLRLLMGQGLPVVAPMLDSQ-TYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVP
80 90 100 110 120 130
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pF1KB5 YMANVYLIKGKTLRSEMNERNYFVRDK------LDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFG
.. ...: .::.: .. : . .: ... . :: ... :.:..:
XP_011 MVHSTFL---ASLRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYG
140 150 160 170 180 190
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 RLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSE
.
XP_011 YMNVPVKSHQGLEDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLA
200 210 220 230 240 250
>>NP_001273689 (OMIM: 616626) probable inactive glycosyl (517 aa)
initn: 195 init1: 114 opt: 226 Z-score: 293.6 bits: 64.4 E(85289): 1.3e-09
Smith-Waterman score: 226; 27.0% identity (60.5% similar) in 152 aa overlap (370-515:46-192)
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 EKDIKVFFDKAKHEIKTIKIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTN
: .. .. : : . :: . .:.: .:::
NP_001 VVWRPEGEPRFYPDEEGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFAR-NWGADYILFADTDNILTN
20 30 40 50 60 70
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 PRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVP
.::..:. :. ..::.. . .:::: ...:.::: :. .: . .: : . ::
NP_001 NQTLRLLMGQGLPVVAPMLDSQ-TYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVP
80 90 100 110 120 130
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pF1KB5 YMANVYLIKGKTLRSEMNERNYFVRDK------LDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFG
.. ...: .::.: .. : . .: ... . :: ... :.:..:
NP_001 MVHSTFL---ASLRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYG
140 150 160 170 180 190
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 RLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSE
.
NP_001 YMNVPVKSHQGLEDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLA
200 210 220 230 240 250
>>XP_011517064 (OMIM: 616626) PREDICTED: probable inacti (595 aa)
initn: 274 init1: 114 opt: 226 Z-score: 292.7 bits: 64.5 E(85289): 1.4e-09
Smith-Waterman score: 249; 24.9% identity (53.5% similar) in 245 aa overlap (296-515:31-270)
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 GNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPK
: : .... .. ::..: : ::::.
XP_011 MRAARAAPLLQLLLLLGPWLEAAGVAESPLPAVVLAILARNAEHSLPHYLGALERLDYPR
10 20 30 40 50 60
330 340 350 360
pF1KB5 EALKLFI---HN----KEVYHE------KDIKVFFDKAKHEIKTIKIV-GP-----EENL
. :. :: :. .: : . . . : . :: :..
XP_011 ARMALWCATDHNVDNTTEMLQEWLAAVGDDYAAVVWRPEGEPRFYPDEEGPKHWTKERHQ
70 80 90 100 110 120
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHGKLWS
: .. .. : : . :: . .:.: .::: .::..:. :. ..::.. . .:
XP_011 FLMELKQEALTFAR-NWGADYILFADTDNILTNNQTLRLLMGQGLPVVAPMLDSQ-TYYS
130 140 150 160 170
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 NFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERNYFVRDK
::: ...:.::: :. .: . .: : . ::.. ...: .::.: .. : .
XP_011 NFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPMVHSTFL---ASLRAEGADQLAFYPPH
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