Result of FASTA (omim) for
pF1KB5569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5569, 469 aa
1>>>pF1KB5569 469 - 469 aa - 469 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2136+/-0.000374; mu= 18.7393+/- 0.023
mean_var=73.7962+/-15.563, 0's: 0 Z-trim(113.5): 83 B-trim: 926 in 1/49
Lambda= 0.149299
statistics sampled from 22860 (22943) to 22860 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 7.640
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitia ( 469) 3270 713.9 2.4e-205
NP_001139410 (OMIM: 120353,226600,606963) intersti ( 403) 2829 618.8 8.3e-177
NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase is ( 467) 1909 420.7 4.2e-117
XP_011541137 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 1861 410.4 5.2e-114
NP_001291370 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 1861 410.4 5.2e-114
NP_001291371 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase ( 444) 1861 410.4 5.2e-114
XP_016873260 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 444) 1861 410.4 5.2e-114
XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 476) 1857 409.5 1e-113
NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastas ( 470) 1567 347.1 6.3e-95
NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase ( 471) 1556 344.7 3.3e-94
XP_011541138 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil ( 377) 1392 309.3 1.2e-83
NP_002413 (OMIM: 185250,614466) stromelysin-1 prep ( 477) 1034 232.3 2.3e-60
NP_002416 (OMIM: 185260) stromelysin-2 preproprote ( 476) 967 217.8 5.1e-56
NP_004762 (OMIM: 604629,612529) matrix metalloprot ( 483) 902 203.8 8.5e-52
NP_002414 (OMIM: 178990) matrilysin preproprotein ( 267) 801 181.9 1.9e-45
XP_011526802 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 556) 697 159.7 1.9e-38
NP_002419 (OMIM: 602261) matrix metalloproteinase- ( 669) 652 150.1 1.8e-35
XP_016880550 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 409) 640 147.3 7.3e-35
XP_011523534 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 494) 640 147.4 8.4e-35
XP_016883087 (OMIM: 604871) PREDICTED: matrix meta ( 614) 604 139.7 2.1e-32
NP_006681 (OMIM: 604871) matrix metalloproteinase- ( 645) 604 139.7 2.2e-32
NP_004521 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV col ( 660) 594 137.6 1e-31
NP_002420 (OMIM: 601807,611543) matrix metalloprot ( 508) 589 136.4 1.7e-31
NP_068573 (OMIM: 605470) matrix metalloproteinase- ( 261) 585 135.3 1.9e-31
NP_001121363 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 610) 583 135.2 4.9e-31
NP_004985 (OMIM: 120361,613073) matrix metalloprot ( 707) 580 134.6 8.6e-31
XP_011518521 (OMIM: 605470) PREDICTED: matrix meta ( 191) 568 131.6 1.9e-30
NP_001289438 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 569 132.2 3.8e-30
NP_001289437 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 569 132.2 3.8e-30
NP_001289439 (OMIM: 120360,259600) 72 kDa type IV ( 584) 569 132.2 3.8e-30
NP_005931 (OMIM: 185261) stromelysin-3 preproprote ( 488) 568 131.9 3.9e-30
NP_005932 (OMIM: 602262) matrix metalloproteinase- ( 607) 558 129.8 2e-29
XP_016874798 (OMIM: 601807,611543) PREDICTED: matr ( 366) 539 125.5 2.4e-28
XP_016874797 (OMIM: 601807,611543) PREDICTED: matr ( 387) 539 125.6 2.5e-28
XP_016874796 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 434) 519 121.3 5.3e-27
NP_057239 (OMIM: 602285) matrix metalloproteinase- ( 603) 519 121.4 6.9e-27
XP_011536659 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 493 115.8 3e-25
XP_011536658 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 493 115.8 3e-25
XP_011536657 (OMIM: 602285) PREDICTED: matrix meta ( 519) 493 115.8 3e-25
XP_016880551 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 490 115.0 3.6e-25
XP_016880553 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 490 115.0 3.6e-25
XP_016880552 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 378) 490 115.0 3.6e-25
XP_011523533 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 390) 490 115.0 3.7e-25
NP_116568 (OMIM: 608417) matrix metalloproteinase- ( 393) 490 115.0 3.7e-25
XP_011523532 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 418) 490 115.0 3.9e-25
XP_011523529 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 490 115.0 4e-25
XP_011523531 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 490 115.0 4e-25
XP_011523528 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 490 115.0 4e-25
XP_011523530 (OMIM: 608417) PREDICTED: matrix meta ( 435) 490 115.0 4e-25
NP_077278 (OMIM: 608417) matrix metalloproteinase- ( 520) 490 115.1 4.7e-25
>>NP_002412 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitial co (469 aa)
initn: 3270 init1: 3270 opt: 3270 Z-score: 3807.6 bits: 713.9 E(85289): 2.4e-205
Smith-Waterman score: 3270; 100.0% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (1-469:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSGPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRIEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRIEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGPGGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGPGGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TFSGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITTIRGEVMFFKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TFSGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITTIRGEVMFFKDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQGQNVLHGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQGQNVLHGY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPKMIAHDFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPKMIAHDFP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB5 GIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN
430 440 450 460
>>NP_001139410 (OMIM: 120353,226600,606963) interstitial (403 aa)
initn: 2829 init1: 2829 opt: 2829 Z-score: 3295.2 bits: 618.8 E(85289): 8.3e-177
Smith-Waterman score: 2829; 100.0% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (67-469:1-403)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 YLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSGPVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPD
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPD
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 VAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQ
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 ADIMISFVRGDHRDNSPFDGPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADIMISFVRGDHRDNSPFDGPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 AHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSYTFSGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSYTFSGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPK
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 ACDSKLTFDAITTIRGEVMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ACDSKLTFDAITTIRGEVMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFAD
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 RDEVRFFKGNKYWAVQGQNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDEVRFFKGNKYWAVQGQNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANK
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 YWRYDEYKRSMDPGYPKMIAHDFPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YWRYDEYKRSMDPGYPKMIAHDFPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILT
340 350 360 370 380 390
460
pF1KB5 LQKANSWFNCRKN
:::::::::::::
NP_001 LQKANSWFNCRKN
400
>>NP_002415 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase isofor (467 aa)
initn: 1318 init1: 948 opt: 1909 Z-score: 2223.4 bits: 420.7 E(85289): 4.2e-117
Smith-Waterman score: 1909; 58.0% identity (82.3% similar) in 464 aa overlap (6-467:8-465)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSG
:.:::: . :..::.. ..:... :: ::::.:.: .. : .. ...
NP_002 MFSLKTLPFLLLLHVQI-SKAFPVS--SKEKNTKTVQDYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRI
.:::::.::.::::.:::::. ::: .::.::::::: . :.:: :::.::.:.:::::
NP_002 VIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGPG
.::::.: .:.:..::. ::.::: ..:: ::..:.:.::: :.: . :: ::::::::.
NP_002 RNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMYP
: :::::::: ::::::::: .: :::. .::: :::::.::::::.::.: ::::::
NP_002 GILAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SYTF--SGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITTIRGEVMF
.:.: ... .: :::::::::::: :.::.:: ::.::: :: .::::::::.:::..:
NP_002 NYAFRETSNYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQGQNV
::::.. : .: .::.::::.:::.::.:..:::: ::: . .::::.:::..: ..
NP_002 FKDRYFWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPKMIA
:.:::::: :..::: .:. ::::. .. :::::: ...::::. .. :.::::: :.
NP_002 LQGYPKDI-SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSIS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB5 HDFPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN
:::: ::::::... ::. : : : : :: ..:. . ..:.:.:::
NP_002 GAFPGIESKVDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG
420 430 440 450 460
>>XP_011541137 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil coll (444 aa)
initn: 1308 init1: 937 opt: 1861 Z-score: 2167.8 bits: 410.4 E(85289): 5.2e-114
Smith-Waterman score: 1861; 58.7% identity (82.6% similar) in 443 aa overlap (27-467:6-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSGPV
::.... ::::.:.: .. : .. ... .
XP_011 MQQIPQEKSIN---DYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRIEN
:::::.::.::::.:::::. ::: .::.::::::: . :.:: :::.::.:.:::::.:
XP_011 VEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGPGGN
:::.: .:.:..::. ::.::: ..:: ::..:.:.::: :.: . :: ::::::::.:
XP_011 YTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSY
:::::::: ::::::::: .: :::. .::: :::::.::::::.::.: ::::::.:
XP_011 LAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KB5 TF--SGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITTIRGEVMFFK
.: ... .: :::::::::::: :.::.:: ::.::: :: .::::::::.:::..:::
XP_011 AFRETSNYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQGQNVLH
::.. : .: .::.::::.:::.::.:..:::: ::: . .::::.:::..: ..:.
XP_011 DRYFWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPKMIAHD
:::::: :..::: .:. ::::. .. :::::: ...::::. .. :.::::: :.
XP_011 GYPKDI-SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KB5 FPGIGHKVDAVFMKDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN
:::: ::::::... ::. : : : : :: ..:. . ..:.:.:::
XP_011 FPGIESKVDAVFQQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG
400 410 420 430 440
>>NP_001291370 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase iso (444 aa)
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>>NP_001291371 (OMIM: 120355) neutrophil collagenase iso (444 aa)
initn: 1308 init1: 937 opt: 1861 Z-score: 2167.8 bits: 410.4 E(85289): 5.2e-114
Smith-Waterman score: 1861; 58.7% identity (82.6% similar) in 443 aa overlap (27-467:6-442)
10 20 30 40 50 60
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NP_001 MQQIPQEKSIN---DYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVI
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>>XP_016873260 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil coll (444 aa)
initn: 1308 init1: 937 opt: 1861 Z-score: 2167.8 bits: 410.4 E(85289): 5.2e-114
Smith-Waterman score: 1861; 58.7% identity (82.6% similar) in 443 aa overlap (27-467:6-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSGPV
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XP_016 MQQIPQEKSIN---DYLEKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVI
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pF1KB5 VEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYRIEN
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XP_016 VEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTYRIRN
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XP_016 YTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGI
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pF1KB5 LAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSY
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XP_016 LAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNY
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>>XP_011541136 (OMIM: 120355) PREDICTED: neutrophil coll (476 aa)
initn: 1284 init1: 937 opt: 1857 Z-score: 2162.7 bits: 409.5 E(85289): 1e-113
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XP_011 NYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKPCDPSLTFDAITTLRGEILFFKDRYFWR
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XP_011 -SNYGFPSSVQAIDAAVFYRS--KTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGIES
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>>NP_002417 (OMIM: 601046) macrophage metalloelastase pr (470 aa)
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pF1KB5 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFP--ATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSG
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>>NP_002418 (OMIM: 250400,600108,602111) collagenase 3 p (471 aa)
initn: 1493 init1: 763 opt: 1556 Z-score: 1812.4 bits: 344.7 E(85289): 3.3e-94
Smith-Waterman score: 1556; 49.8% identity (78.8% similar) in 444 aa overlap (25-466:30-471)
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pF1KB5 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRR
. .:.:......::..::. : . . :.
NP_002 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLA-GILKEN
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.. ..:.:..:: ::::.:::: : .:: :::.::::::::... . . .: . .::
NP_002 AASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLT
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pF1KB5 YRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFD
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NP_002 YRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFD
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pF1KB5 GPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGAL
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NP_002 GPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGAL
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pF1KB5 MYPSYTFSGDVQ--LAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITTIRGE
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NP_002 MFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITSLRGE
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NP_002 TMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNG
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pF1KB5 QNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPK
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NP_002 YDILEGYPKKI-SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPR
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NP_002 LIEEDFPGIGDKVDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC
420 430 440 450 460 470
469 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:55:15 2016 done: Fri Nov 4 03:55:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]