Result of FASTA (omim) for
pF1KB5573
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5573, 1205 aa
1>>>pF1KB5573 1205 - 1205 aa - 1205 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1840+/-0.000523; mu= 23.0719+/- 0.032
mean_var=76.5597+/-15.432, 0's: 0 Z-trim(108.6): 235 B-trim: 1091 in 2/46
Lambda= 0.146580
statistics sampled from 16457 (16741) to 16457 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 11.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001675 (OMIM: 108732) plasma membrane calcium-t (1205) 7886 1678.6 0
NP_001001396 (OMIM: 108732) plasma membrane calciu (1170) 7248 1543.7 0
NP_001673 (OMIM: 108731) plasma membrane calcium-t (1220) 6090 1298.9 0
XP_005274747 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma memb (1220) 6009 1281.7 0
NP_001001344 (OMIM: 300014) plasma membrane calciu (1220) 6009 1281.7 0
XP_016861973 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1212) 5936 1266.3 0
XP_016861972 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1212) 5936 1266.3 0
XP_011536709 (OMIM: 108731) PREDICTED: plasma memb (1249) 5889 1256.4 0
NP_001001323 (OMIM: 108731) plasma membrane calciu (1176) 5888 1256.1 0
XP_005274749 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma memb (1173) 5847 1247.5 0
NP_068768 (OMIM: 300014) plasma membrane calcium-t (1173) 5847 1247.5 0
XP_005274746 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma memb (1249) 5847 1247.5 0
XP_011529476 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma memb (1262) 5819 1241.6 0
XP_016861978 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1168) 5755 1228.0 0
XP_016861977 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1174) 5755 1228.0 0
XP_016874846 (OMIM: 108731) PREDICTED: plasma memb (1213) 5485 1170.9 0
XP_016874848 (OMIM: 108731) PREDICTED: plasma memb (1140) 5358 1144.0 0
XP_016874847 (OMIM: 108731) PREDICTED: plasma memb (1184) 5358 1144.0 0
XP_005274748 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma memb (1206) 4607 985.2 0
NP_001674 (OMIM: 108733,601386) plasma membrane ca (1198) 4543 971.7 0
XP_016861976 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1198) 4543 971.7 0
XP_016861970 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1243) 4524 967.7 0
XP_016861971 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1243) 4524 967.7 0
XP_005265236 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1243) 4524 967.7 0
XP_006713238 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1243) 4524 967.7 0
NP_001001331 (OMIM: 108733,601386) plasma membrane (1243) 4524 967.7 0
XP_011532054 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1243) 4524 967.7 0
XP_011529479 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma memb (1248) 4417 945.1 0
XP_016885042 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma memb (1274) 4404 942.3 0
NP_001317540 (OMIM: 108733,601386) plasma membrane (1154) 4362 933.4 0
XP_016861979 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1160) 4362 933.4 0
XP_016861975 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1199) 4343 929.4 0
XP_016861974 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1205) 4343 929.4 0
XP_016861981 (OMIM: 108733,601386) PREDICTED: plas (1272) 4343 929.4 0
XP_016874849 (OMIM: 108731) PREDICTED: plasma memb ( 705) 3361 721.6 4.5e-207
XP_011510988 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 671) 454 106.8 4.9e-22
NP_001186114 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 454 106.9 6e-22
NP_001001485 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 454 106.9 6e-22
NP_001186113 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 903) 454 106.9 6.1e-22
NP_055197 (OMIM: 169600,604384) calcium-transporti ( 919) 454 106.9 6.2e-22
NP_001186108 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 919) 454 106.9 6.2e-22
NP_001186112 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 923) 454 106.9 6.2e-22
XP_005247415 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 933) 454 106.9 6.3e-22
NP_001001487 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 939) 454 106.9 6.3e-22
XP_016861653 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 939) 454 106.9 6.3e-22
NP_001186111 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 944) 454 106.9 6.3e-22
XP_005247412 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 454 106.9 6.4e-22
XP_005247413 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 454 106.9 6.4e-22
NP_001001486 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 949) 454 106.9 6.4e-22
NP_001186110 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 953) 454 106.9 6.4e-22
>>NP_001675 (OMIM: 108732) plasma membrane calcium-trans (1205 aa)
initn: 7886 init1: 7886 opt: 7886 Z-score: 9007.0 bits: 1678.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7886; 100.0% identity (100.0% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:1-1205)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTNPSDRVLPANSMAESREGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLCSRLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTNPSDRVLPANSMAESREGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLCSRLKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAIISLVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAIISLVLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYRPAGEENELCGQVATTPEDENEAQAGWIEGAAILFSVIIVVLVTAFNDWSKEKQFRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYRPAGEENELCGQVATTPEDENEAQAGWIEGAAILFSVIIVVLVTAFNDWSKEKQFRGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GESDHVKKSLDKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIILTLLGVNEDDEGEKKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GESDHVKKSLDKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIILTLLGVNEDDEGEKKKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GKKQGVPENRNKAKTQDGVALEIQPLNSQEGIDNEEKDKKAVKVPKKEKSVLQGKLTRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKKQGVPENRNKAKTQDGVALEIQPLNSQEGIDNEEKDKKAVKVPKKEKSVLQGKLTRLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VQIGKAGLLMSALTVFILILYFVIDNFVINRRPWLPECTPIYIQYFVKFFIIGITVLVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQIGKAGLLMSALTVFILILYFVIDNFVINRRPWLPECTPIYIQYFVKFFIIGITVLVVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YIGGIHYRQIPSPDVFLPKVLDLIVNGISINSAYTSKILPPEKEGGLPRQVGNKTECALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YIGGIHYRQIPSPDVFLPKVLDLIVNGISINSAYTSKILPPEKEGGLPRQVGNKTECALL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GFVTDLKQDYQAVRNEVPEEKLYKVYTFNSVRKSMSTVIRNPNGGFRMYSKGASEIILRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFVTDLKQDYQAVRNEVPEEKLYKVYTFNSVRKSMSTVIRNPNGGFRMYSKGASEIILRK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 CNRILDRKGEAVPFKNKDRDDMVRTVIEPMACDGLRTICIAYRDFDDTEPSWDNENEILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CNRILDRKGEAVPFKNKDRDDMVRTVIEPMACDGLRTICIAYRDFDDTEPSWDNENEILT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 ELTCIAVVGIEDPVRPEVPDAIAKCKQAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILTPGDDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELTCIAVVGIEDPVRPEVPDAIAKCKQAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILTPGDDFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 CLEGKEFNRLIRNEKGEVEQEKLDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVGEHRQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLEGKEFNRLIRNEKGEVEQEKLDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVGEHRQVV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 AVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 SKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTFASLALATEPPTESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTFASLALATEPPTESLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 KRRPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLIVIFILVFAGEKFFDIDSGRKAPLHSPPSQHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRRPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLIVIFILVFAGEKFFDIDSGRKAPLHSPPSQHY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB5 TIVFNTFVLMQLFNEINSRKIHGEKNVFSGIYRNIIFCSVVLGTFICQIFIVEFGGKPFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIVFNTFVLMQLFNEINSRKIHGEKNVFSGIYRNIIFCSVVLGTFICQIFIVEFGGKPFS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 CTSLSLSQWLWCLFIGIGELLWGQFISAIPTRSLKFLKEAGHGTTKEEITKDAEGLDEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CTSLSLSQWLWCLFIGIGELLWGQFISAIPTRSLKFLKEAGHGTTKEEITKDAEGLDEID
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB5 HAEMELRRGQILWFRGLNRIQTQIKVVKAFHSSLHESIQKPYNQKSIHSFMTHPEFAIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HAEMELRRGQILWFRGLNRIQTQIKVVKAFHSSLHESIQKPYNQKSIHSFMTHPEFAIEE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB5 ELPRTPLLDEEEEENPDKASKFGTRVLLLDGEVTPYANTNNNAVDCNQVQLPQSDSSLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELPRTPLLDEEEEENPDKASKFGTRVLLLDGEVTPYANTNNNAVDCNQVQLPQSDSSLQS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB5 LETSV
:::::
NP_001 LETSV
>>NP_001001396 (OMIM: 108732) plasma membrane calcium-tr (1170 aa)
initn: 7248 init1: 7248 opt: 7248 Z-score: 8278.1 bits: 1543.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7248; 99.5% identity (99.9% similar) in 1112 aa overlap (1-1112:1-1112)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTNPSDRVLPANSMAESREGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLCSRLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTNPSDRVLPANSMAESREGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLCSRLKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAIISLVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAIISLVLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYRPAGEENELCGQVATTPEDENEAQAGWIEGAAILFSVIIVVLVTAFNDWSKEKQFRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYRPAGEENELCGQVATTPEDENEAQAGWIEGAAILFSVIIVVLVTAFNDWSKEKQFRGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKIDESSLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GESDHVKKSLDKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIILTLLGVNEDDEGEKKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GESDHVKKSLDKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIILTLLGVNEDDEGEKKKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GKKQGVPENRNKAKTQDGVALEIQPLNSQEGIDNEEKDKKAVKVPKKEKSVLQGKLTRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKKQGVPENRNKAKTQDGVALEIQPLNSQEGIDNEEKDKKAVKVPKKEKSVLQGKLTRLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VQIGKAGLLMSALTVFILILYFVIDNFVINRRPWLPECTPIYIQYFVKFFIIGITVLVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQIGKAGLLMSALTVFILILYFVIDNFVINRRPWLPECTPIYIQYFVKFFIIGITVLVVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTMNRMTVVQA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YIGGIHYRQIPSPDVFLPKVLDLIVNGISINSAYTSKILPPEKEGGLPRQVGNKTECALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YIGGIHYRQIPSPDVFLPKVLDLIVNGISINSAYTSKILPPEKEGGLPRQVGNKTECALL
490 500 510 520 530 540
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pF1KB5 GFVTDLKQDYQAVRNEVPEEKLYKVYTFNSVRKSMSTVIRNPNGGFRMYSKGASEIILRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFVTDLKQDYQAVRNEVPEEKLYKVYTFNSVRKSMSTVIRNPNGGFRMYSKGASEIILRK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 CNRILDRKGEAVPFKNKDRDDMVRTVIEPMACDGLRTICIAYRDFDDTEPSWDNENEILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CNRILDRKGEAVPFKNKDRDDMVRTVIEPMACDGLRTICIAYRDFDDTEPSWDNENEILT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 ELTCIAVVGIEDPVRPEVPDAIAKCKQAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILTPGDDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELTCIAVVGIEDPVRPEVPDAIAKCKQAGITVRMVTGDNINTARAIATKCGILTPGDDFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 CLEGKEFNRLIRNEKGEVEQEKLDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVGEHRQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLEGKEFNRLIRNEKGEVEQEKLDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDSTVGEHRQVV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 AVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVMWGRNVYDSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 SKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTFASLALATEPPTESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTFASLALATEPPTESLL
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pF1KB5 KRRPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLIVIFILVFAGEKFFDIDSGRKAPLHSPPSQHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRRPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLIVIFILVFAGEKFFDIDSGRKAPLHSPPSQHY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB5 TIVFNTFVLMQLFNEINSRKIHGEKNVFSGIYRNIIFCSVVLGTFICQIFIVEFGGKPFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIVFNTFVLMQLFNEINSRKIHGEKNVFSGIYRNIIFCSVVLGTFICQIFIVEFGGKPFS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 CTSLSLSQWLWCLFIGIGELLWGQFISAIPTRSLKFLKEAGHGTTKEEITKDAEGLDEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CTSLSLSQWLWCLFIGIGELLWGQFISAIPTRSLKFLKEAGHGTTKEEITKDAEGLDEID
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB5 HAEMELRRGQILWFRGLNRIQTQIKVVKAFHSSLHESIQKPYNQKSIHSFMTHPEFAIEE
:::::::::::::::::::::::: :...:..
NP_001 HAEMELRRGQILWFRGLNRIQTQIDVINTFQTGASFKGVLRRQNMGQHLDVKLVPSSSYV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB5 ELPRTPLLDEEEEENPDKASKFGTRVLLLDGEVTPYANTNNNAVDCNQVQLPQSDSSLQS
NP_001 AVAPVKSSPTTSVPAVSSPPMGNQSGQSVP
1150 1160 1170
>>NP_001673 (OMIM: 108731) plasma membrane calcium-trans (1220 aa)
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Smith-Waterman score: 6090; 76.6% identity (90.4% similar) in 1214 aa overlap (12-1205:16-1220)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTNPSDRVLPANSMAES-REGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLC
::. :. ..:::: :. ::: :::::: ::: .:. :: : ..:
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10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SRLKTSPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAII
..::::: :::::::::::.:. :::.: ::::::::::.:::::::::::::::::::.
NP_001 TKLKTSPNEGLSGNPADLERREAVFGKNFIPPKKPKTFLQLVWEALQDVTLIILEIAAIV
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pF1KB5 SLVLSFYRPAGEENELCGQVATTPEDENEAQAGWIEGAAILFSVIIVVLVTAFNDWSKEK
:: ::::.: .: :::.: .. :.:.:...:::::::::.::. ::::::::::::::
NP_001 SLGLSFYQPPEGDNALCGEV-SVGEEEGEGETGWIEGAAILLSVVCVVLVTAFNDWSKEK
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pF1KB5 QFRGLQCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKID
:::::: ::::::::..::.::.::.:::.:.::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFRGLQSRIEQEQKFTVIRGGQVIQIPVADITVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKID
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240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ESSLTGESDHVKKSLDKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIILTLLGVN-----
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::::..
NP_001 ESSLTGESDHVKKSLDKDPLLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEE
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300 310 320 330 340
pF1KB5 EDDEGEKKKKGKKQ-GVPENRNKAKTQDGVALEIQPLNSQEGIDNEEKDKKAVKVPKKEK
. :: .:.::.::: :. :::::::.:::.:.:.:::.:.:: :..::::: ...:::::
NP_001 KKDEKKKEKKNKKQDGAIENRNKAKAQDGAAMEMQPLKSEEGGDGDEKDKKKANLPKKEK
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pF1KB5 SVLQGKLTRLAVQIGKAGLLMSALTVFILILYFVIDNFVINRRPWLPECTPIYIQYFVKF
::::::::.::::::::::::::.::.::.::::::.: ...:::: :::::::::::::
NP_001 SVLQGKLTKLAVQIGKAGLLMSAITVIILVLYFVIDTFWVQKRPWLAECTPIYIQYFVKF
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pF1KB5 FIIGITVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGT
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIIGVTVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGT
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pF1KB5 LTMNRMTVVQAYIGGIHYRQIPSPDVFLPKVLDLIVNGISINSAYTSKILPPEKEGGLPR
:::::::::::::. ::...: :... :..:. .:.:::.: :::::::::::::::::
NP_001 LTMNRMTVVQAYINEKHYKKVPEPEAIPPNILSYLVTGISVNCAYTSKILPPEKEGGLPR
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pF1KB5 QVGNKTECALLGFVTDLKQDYQAVRNEVPEEKLYKVYTFNSVRKSMSTVIRNPNGGFRMY
.:::::::::::.. :::.::: ::::.::: :::::::::::::::::..: .:..:..
NP_001 HVGNKTECALLGLLLDLKRDYQDVRNEIPEEALYKVYTFNSVRKSMSTVLKNSDGSYRIF
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pF1KB5 SKGASEIILRKCNRILDRKGEAVPFKNKDRDDMVRTVIEPMACDGLRTICIAYRDFD--D
:::::::::.:: .::. .::: :. .::::.:.::::::: .::::::.:.::: .
NP_001 SKGASEIILKKCFKILSANGEAKVFRPRDRDDIVKTVIEPMASEGLRTICLAFRDFPAGE
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pF1KB5 TEPSWDNENEILTELTCIAVVGIEDPVRPEVPDAIAKCKQAGITVRMVTGDNINTARAIA
:: :::::.:.: ::::::::::::::::::::: ::..::::::::::::::::::::
NP_001 PEPEWDNENDIVTGLTCIAVVGIEDPVRPEVPDAIKKCQRAGITVRMVTGDNINTARAIA
660 670 680 690 700 710
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pF1KB5 TKCGILTPGDDFLCLEGKEFNRLIRNEKGEVEQEKLDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKG
:::::: ::.::::::::.::: :::::::.:::..::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKCGILHPGEDFLCLEGKDFNRRIRNEKGEIEQERIDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKG
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770 780 790 800 810 820
pF1KB5 IIDSTVGEHRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIV
::::::...:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIDSTVSDQRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIV
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830 840 850 860 870 880
pF1KB5 KAVMWGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTFAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
NP_001 KAVMWGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTLAS
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KB5 LALATEPPTESLLKRRPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLIVIFILVFAGEKFFDIDSG
::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::.:.: :.::::::::::::
NP_001 LALATEPPTESLLLRKPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLVVVFTLLFAGEKFFDIDSG
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pF1KB5 RKAPLHSPPSQHYTIVFNTFVLMQLFNEINSRKIHGEKNVFSGIYRNIIFCSVVLGTFIC
:.::::.:::.:::::::::::::::::::.::::::.::: ::. : :::..:::::.
NP_001 RNAPLHAPPSEHYTIVFNTFVLMQLFNEINARKIHGERNVFEGIFNNAIFCTIVLGTFVV
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pF1KB5 QIFIVEFGGKPFSCTSLSLSQWLWCLFIGIGELLWGQFISAIPTRSLKFLKEAGHGTTKE
::.::.::::::::. ::. :::: .:.:.: :::::.::.::: ::::::::::: ::
NP_001 QIIIVQFGGKPFSCSELSIEQWLWSIFLGMGTLLWGQLISTIPTSRLKFLKEAGHGTQKE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB5 EITKD--AEGLDEIDHAEMELRRGQILWFRGLNRIQTQIKVVKAFHSSLHESIQKPYNQK
:: .. :: ..:::::: ::::::::::::::::::::.::.::.:::.:...:: ...
NP_001 EIPEEELAEDVEEIDHAERELRRGQILWFRGLNRIQTQIRVVNAFRSSLYEGLEKPESRS
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB5 SIHSFMTHPEFAIEEELPRTPLLDEEEEENPDKASKFGTRVLLLDGEVTPYANTNNNAVD
:::.::::::: ::. :. ::.:. . :. : .: .. : : ::::::
NP_001 SIHNFMTHPEFRIEDSEPHIPLIDDTDAED-DAPTKRNSSP-------PPSPNKNNNAVD
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200
pF1KB5 CN---QVQLPQSDSS------LQSLETSV
. ... .: .: :.:::::.
NP_001 SGIHLTIEMNKSATSSSPGSPLHSLETSL
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>>XP_005274747 (OMIM: 300014) PREDICTED: plasma membrane (1220 aa)
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Smith-Waterman score: 6009; 76.1% identity (89.8% similar) in 1194 aa overlap (1-1185:4-1187)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTNPSDRVLPANSMAES--REGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLC
:.: : . : .. .. . : ::::. ::: :::::. .:: .:. :: :..::
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pF1KB5 SRLKTSPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAII
::::::.:::. : :::::::..:.: ::::.:::::.:::::::::::::::.:::.
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pF1KB5 SLVLSFYRPAGEENELCGQVATTPEDENEAQAGWIEGAAILFSVIIVVLVTAFNDWSKEK
:: :::: : :::.: ::.:. :::.::.::::::::::.::: ::::::::::::::
XP_005 SLGLSFYAPPGEESEACGNVSGGAEDEGEAEAGWIEGAAILLSVICVVLVTAFNDWSKEK
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pF1KB5 QFRGLQCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKID
:::::: ::::::::..::::::.:.::: .::::::::::::::::::.:::.::::::
XP_005 QFRGLQSRIEQEQKFTVIRNGQLLQVPVAALVVGDIAQVKYGDLLPADGVLIQANDLKID
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:::::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.. ..:
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pF1KB5 EKKKKGKKQ-GVPEN-RNKAKTQDG-VALEIQPLNSQEGIDNEEKDKKAVKVPKKEKSVL
.: ::::.: :. :. ..::: ::: ::.:.:::.: :: . ::..:: ...::::::::
XP_005 KKDKKGKQQDGAMESSQTKAKKQDGAVAMEMQPLKSAEGGEMEEREKKKANAPKKEKSVL
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pF1KB5 QGKLTRLAVQIGKAGLLMSALTVFILILYFVIDNFVINRRPWLPECTPIYIQYFVKFFII
:::::.::::::::::.:::.::.::.:::::..::.. : :: ::::.:.:::::::::
XP_005 QGKLTKLAVQIGKAGLVMSAITVIILVLYFVIETFVVEGRTWLAECTPVYVQYFVKFFII
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pF1KB5 GITVLVVAVPEGLPLAVTISLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTM
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 NRMTVVQAYIGGIHYRQIPSPDVFLPKVLDLIVNGISINSAYTSKILPPEKEGGLPRQVG
:::::::.:.: ::..::.:... ::.:::.:..::::::::.:::::::::.::::::
XP_005 NRMTVVQSYLGDTHYKEIPAPSALTPKILDLLVHAISINSAYTTKILPPEKEGALPRQVG
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pF1KB5 NKTECALLGFVTDLKQDYQAVRNEVPEEKLYKVYTFNSVRKSMSTVIRNPNGGFRMYSKG
::::::::::: :::.:.: ::...::.:::::::::::::::::::: :.::::..:::
XP_005 NKTECALLGFVLDLKRDFQPVREQIPEDKLYKVYTFNSVRKSMSTVIRMPDGGFRLFSKG
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pF1KB5 ASEIILRKCNRILDRKGEAVPFKNKDRDDMVRTVIEPMACDGLRTICIAYRDFD-DTEPS
::::.:.::. ::. .:: :. .::::::: .:::::::::::::::::::. ::.
XP_005 ASEILLKKCTNILNSNGELRGFRPRDRDDMVRKIIEPMACDGLRTICIAYRDFSAGQEPD
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pF1KB5 WDNENEILTELTCIAVVGIEDPVRPEVPDAIAKCKQAGITVRMVTGDNINTARAIATKCG
::::::.. .::::::::::::::::::.:: ::..::::::::::::::::::::.:::
XP_005 WDNENEVVGDLTCIAVVGIEDPVRPEVPEAIRKCQRAGITVRMVTGDNINTARAIAAKCG
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pF1KB5 ILTPGDDFLCLEGKEFNRLIRNEKGEVEQEKLDKIWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDS
:. ::.:::::::::::: :::::::.:::.:::.:::::::::::::::::::::::::
XP_005 IIQPGEDFLCLEGKEFNRRIRNEKGEIEQERLDKVWPKLRVLARSSPTDKHTLVKGIIDS
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pF1KB5 TVGEHRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVM
:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTGEQRQVVAVTGDGTNDGPALKKADVGFAMGIAGTDVAKEASDIILTDDNFTSIVKAVM
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pF1KB5 WGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTFASLALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTFASLALA
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pF1KB5 TEPPTESLLKRRPYGRNKPLISRTMMKNILGHAFYQLIVIFILVFAGEKFFDIDSGRKAP
::::::::: :.::::.:::::::::::::::: ::: .:: :.:.:: ::::::::.::
XP_005 TEPPTESLLLRKPYGRDKPLISRTMMKNILGHAVYQLAIIFTLLFVGELFFDIDSGRNAP
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pF1KB5 LHSPPSQHYTIVFNTFVLMQLFNEINSRKIHGEKNVFSGIYRNIIFCSVVLGTFICQIFI
::::::.::::.:::::.::::::::.::::::.:::.::. : :::..::::: :: :
XP_005 LHSPPSEHYTIIFNTFVMMQLFNEINARKIHGERNVFDGIFSNPIFCTIVLGTFGIQIVI
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pF1KB5 VEFGGKPFSCTSLSLSQWLWCLFIGIGELLWGQFISAIPTRSLKFLKEAGHGTTKEEITK
:.::::::::. :: :::::::.:.:::.::: :..::: .:: ::::::: :.:.:
XP_005 VQFGGKPFSCSPLSTEQWLWCLFVGVGELVWGQVIATIPTSQLKCLKEAGHGPGKDEMTD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB5 D--AEGLDEIDHAEMELRRGQILWFRGLNRIQTQIKVVKAFHSSLHESIQKPYNQKSIHS
. ::: .:::::: ::::::::::::::::::::.:::::.:::.:...:: .. :::.
XP_005 EELAEGEEEIDHAERELRRGQILWFRGLNRIQTQIRVVKAFRSSLYEGLEKPESKTSIHN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB5 FMTHPEFAIEEELPRTPLLDEEE-EENPDKASKFGTRVLLLDGEVTPYANTNNNAVDCNQ
::. ::: :.. ::.:. . .:: .. : . : : ::::.:
XP_005 FMATPEFLINDYTHNIPLIDDTDVDENEER----------LRAPPPPSPNQNNNAIDSGI
1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200
pF1KB5 VQLPQSDSSLQSLETSV
XP_005 YLTTHVTKSATSSVFSSSPGSPLHSVETSL
1200 1210 1220
>>NP_001001344 (OMIM: 300014) plasma membrane calcium-tr (1220 aa)
initn: 4520 init1: 2463 opt: 6009 Z-score: 6861.8 bits: 1281.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6009; 76.1% identity (89.8% similar) in 1194 aa overlap (1-1185:4-1187)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTNPSDRVLPANSMAES--REGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLC
:.: : . : .. .. . : ::::. ::: :::::. .:: .:. :: :..::
NP_001 MGDMANSSIEFHPKPQQQRDVPQAGGFGCTLAELRTLMELRGAEALQKIEEAYGDVSGLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SRLKTSPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAII
::::::.:::. : :::::::..:.: ::::.:::::.:::::::::::::::.:::.
NP_001 RRLKTSPTEGLADNTNDLEKRRQIYGQNFIPPKQPKTFLQLVWEALQDVTLIILEVAAIV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB5 SLVLSFYRPAGEENELCGQVATTPEDENEAQAGWIEGAAILFSVIIVVLVTAFNDWSKEK
:: :::: : :::.: ::.:. :::.::.::::::::::.::: ::::::::::::::
NP_001 SLGLSFYAPPGEESEACGNVSGGAEDEGEAEAGWIEGAAILLSVICVVLVTAFNDWSKEK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 QFRGLQCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKID
:::::: ::::::::..::::::.:.::: .::::::::::::::::::.:::.::::::
NP_001 QFRGLQSRIEQEQKFTVIRNGQLLQVPVAALVVGDIAQVKYGDLLPADGVLIQANDLKID
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ESSLTGESDHVKKSLDKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIILTLLGVNEDDEG
:::::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.. ..:
NP_001 ESSLTGESDHVRKSADKDPMLLSGTHVMEGSGRMVVTAVGVNSQTGIIFTLLGAGGEEEE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EKKKKGKKQ-GVPEN-RNKAKTQDG-VALEIQPLNSQEGIDNEEKDKKAVKVPKKEKSVL
.: ::::.: :. :. ..::: ::: ::.:.:::.: :: . ::..:: ...::::::::
NP_001 KKDKKGKQQDGAMESSQTKAKKQDGAVAMEMQPLKSAEGGEMEEREKKKANAPKKEKSVL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QGKLTRLAVQIGKAGLLMSALTVFILILYFVIDNFVINRRPWLPECTPIYIQYFVKFFII
:::::.::::::::::.:::.::.::.:::::..::.. : :: ::::.:.:::::::::
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:::::::.:.: ::..::.:... ::.:::.:..::::::::.:::::::::.::::::
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::::::::::: :::.:.: ::...::.:::::::::::::::::::: :.::::..:::
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::::::.. .::::::::::::::::::.:: ::..::::::::::::::::::::.:::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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. ::: .:::::: ::::::::::::::::::::.:::::.:::.:...:: .. :::.
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1200
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XP_016 SSSPGSPIHSLETSL
1200 1210
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XP_011 QIIIVQFGGKPFSCSELSIEQWLWSIFLGMGTLLWGQLISTIPTSRLKFLKEAGHGTQKE
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pF1KB5 -------IKVVKAFHSSLHESIQKPYNQKSIHSFMTHPEFAIEEELPRTPLLDEEEEENP
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XP_011 IASQHHDIRVVNAFRSSLYEGLEKPESRSSIHNFMTHPEFRIEDSEPHIPLIDDTDAED-
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pF1KB5 DKASKFGTRVLLLDGEVTPYANTNNNAVDCN---QVQLPQSDSS------LQSLETSV
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XP_011 DAPTKRNSSP-------PPSPNKNNNAVDSGIHLTIEMNKSATSSSPGSPLHSLETSL
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NP_001 HVGNKTECALLGLLLDLKRDYQDVRNEIPEEALYKVYTFNSVRKSMSTVLKNSDGSYRIF
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NP_001 KAVMWGRNVYDSISKFLQFQLTVNVVAVIVAFTGACITQDSPLKAVQMLWVNLIMDTLAS
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NP_001 QIIIVQFGGKPFSCSELSIEQWLWSIFLGMGTLLWGQLISTIPTSRLKFLKEAGHGTQKE
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pF1KB5 EITKD--AEGLDEIDHAEMELRRGQILWFRGLNRIQTQIKVVKAFHSSLHESIQKPYN-Q
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pF1KB5 MTNPSDRVLPANSMAES--REGDFGCTVMELRKLMELRSRDALTQINVHYGGVQNLC
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pF1KB5 SRLKTSPVEGLSGNPADLEKRRQVFGHNVIPPKKPKTFLELVWEALQDVTLIILEIAAII
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pF1KB5 QFRGLQCRIEQEQKFSIIRNGQLIQLPVAEIVVGDIAQVKYGDLLPADGILIQGNDLKID
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XP_005 QFRGLQSRIEQEQKFTVIRNGQLLQVPVAALVVGDIAQVKYGDLLPADGVLIQANDLKID
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XP_005 QGKLTKLAVQIGKAGLVMSAITVIILVLYFVIETFVVEGRTWLAECTPVYVQYFVKFFII
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XP_005 NRMTVVQSYLGDTHYKEIPAPSALTPKILDLLVHAISINSAYTTKILPPEKEGALPRQVG
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