Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5584
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5584, 641 aa
1>>>pF1KB5584 641 - 641 aa - 641 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5258+/-0.000918; mu= 13.6982+/- 0.055
mean_var=103.1482+/-20.536, 0's: 0 Z-trim(108.3): 23 B-trim: 12 in 1/50
Lambda= 0.126283
statistics sampled from 10111 (10127) to 10111 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS895.1 MAN1A2 gene_id:10905|Hs108|chr1 ( 641) 4370 807.1 0
CCDS5122.1 MAN1A1 gene_id:4121|Hs108|chr6 ( 653) 2487 464.1 2.7e-130
CCDS265.1 MAN1C1 gene_id:57134|Hs108|chr1 ( 630) 2123 397.8 2.4e-110
CCDS7029.1 MAN1B1 gene_id:11253|Hs108|chr9 ( 699) 1125 216.0 1.4e-55
CCDS13247.1 EDEM2 gene_id:55741|Hs108|chr20 ( 578) 383 80.7 6e-15
CCDS1363.2 EDEM3 gene_id:80267|Hs108|chr1 ( 932) 345 73.9 1.1e-12
>>CCDS895.1 MAN1A2 gene_id:10905|Hs108|chr1 (641 aa)
initn: 4370 init1: 4370 opt: 4370 Z-score: 4306.9 bits: 807.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4370; 100.0% identity (100.0% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB5 YLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
610 620 630 640
>>CCDS5122.1 MAN1A1 gene_id:4121|Hs108|chr6 (653 aa)
initn: 2656 init1: 2108 opt: 2487 Z-score: 2452.7 bits: 464.1 E(32554): 2.7e-130
Smith-Waterman score: 2647; 63.8% identity (84.4% similar) in 614 aa overlap (29-627:34-641)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLP
:.:::.:::.:::..::::::::::.::::
CCDS51 GGLLPLFSSPAGGVLGGGLGGGGGRKGSGPAALRLTEKFVLLLVFSAFITLCFGAIFFLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB5 DSSKHKRFDL-GLEDVLIPHVD--AGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREE------EERLRN
:::: : .: : .: : ::. . . . :.::: : :..
CCDS51 DSSKLLSGVLFHSSPALQPAADHKPGPGARAEDA----AEGRARRREEGAPGDPEAALED
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 ---KIRADHEKALEEAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKP---LPPVPIPN
.:: .::.::.:::: :.: :::. .: ::.::.:. ..... : :::: .
CCDS51 NLARIRENHERALREAKETLQKLPEEIQRDILLEKKKVAQD-QLRDKAPFRGLPPVDFVP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LVGIRGGDPEDNDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQM
.:... .: : ::::: ::::::::::.::. :.:: :::.::.. ::: ..::. .
CCDS51 PIGVESREPADAAIREKRAKIKEMMKHAWNNYKGYAWGLNELKPISKGGHSSSLFGNIK-
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSG
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CCDS51 GATIVDALDTLFIMEMKHEFEEAKSWVEENLDFNVNAEISVFEVNIRFVGGLLSAYYLSG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 EEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEF
::::. :::.:. ::::::.::.:::::..:.:::.:::: :::.::::::::::::.::
CCDS51 EEIFRKKAVELGVKLLPAFHTPSGIPWALLNMKSGIGRNWPWASGGSSILAEFGTLHLEF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 IHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYE
.:::.:.:. . .:::.:: .:.:...:.::::::::: .:.:::.:.:::::::::::
CCDS51 MHLSHLSGNPIFAEKVMNIRTVLNKLEKPQGLYPNYLNPSSGQWGQHHVSVGGLGDSFYE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 YLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACF
::::::::::::: ::.::: ::..::: :::.:: .:::.:.:::.: ::.:::::.::
CCDS51 YLLKAWLMSDKTDLEAKKMYFDAVQAIETHLIRKSSSGLTYIAEWKGGLLEHKMGHLTCF
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 AGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQ
::::::::::.. : :::::::::::::::::.:: .:::::.:.:::.:::.:.::
CCDS51 AGGMFALGADAAPEGMAQHYLELGAEIARTCHESYNRTFMKLGPEAFRFDGGVEAIATRQ
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 AEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPT
::::::::::.::: :.::.::::.::.:.:::. :.:..::::::.::..::: .
CCDS51 NEKYYILRPEVMETYMYMWRLTHDPKYRKWAWEAVEALENHCRVNGGYSGLRDVYLLHES
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 HDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
.::::::::::::::::::.:: ::::::.::.::.::: ::.:
CCDS51 YDDVQQSFFLAETLKYLYLIFSDDDLLPLEHWIFNSEAHLLPILPKDKKEVEIREE
600 610 620 630 640 650
>>CCDS265.1 MAN1C1 gene_id:57134|Hs108|chr1 (630 aa)
initn: 2165 init1: 1403 opt: 2123 Z-score: 2094.6 bits: 397.8 E(32554): 2.4e-110
Smith-Waterman score: 2127; 52.4% identity (77.9% similar) in 630 aa overlap (22-628:7-619)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSF-PHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPD
:.: : ::: .::..::.::...::::::.:.::
CCDS26 MLMRKVPGFVPASPWGLRLPQKFLFLLFLSGLVTLCFGALFLLPH
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SSKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKAL
::. ::. : :.. ..::. .. : .:.: : : .
CCDS26 SSRLKRL------FLAPRT------QQPGLEVVAEIAGHAPAREQEPPPNPAPAAPAPGE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB5 EE----AKEKLRKSR-EEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPP-VPI------------
.. :. . ::. .. : :. ... .: ..: ::.
CCDS26 DDPSSWASPRRRKGGLRRTRPTGPREEATAARGNSIPASRPGDEGVPFRFDFNAFRSRLR
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KB5 -PNLVGIRGGDPED--NDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIF
: : : :. . .. ...: .::::::::. ::..:. :. :.:::::... :. :.:
CCDS26 HPVL-GTRADESQEPQSQVRAQREKIKEMMQFAWQSYKRYAMGKNELRPLTKDGYEGNMF
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 GSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAA
:. . :::..:.:::::.: :..:: ... :. ... ..:..:.:.::::::.:::::.:
CCDS26 GGLS-GATVIDSLDTLYLMELKEEFQEAKAWVGESFHLNVSGEASLFEVNIRYIGGLLSA
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSS-ILAEFG
.::.:::.:.:::..:.:::::::::::::: ..:..::: :::::.:::: ::::::
CCDS26 FYLTGEEVFRIKAIRLGEKLLPAFNTPTGIPKGVVSFKSG---NWGWATAGSSSILAEFG
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 TLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGL
.::.::.::. :.:. .. .:: .:::.:.:...: :::::.:.: .: : :.:.:::::
CCDS26 SLHLEFLHLTELSGNQVFAEKVRNIRKVLRKIEKPFGLYPNFLSPVSGNWVQHHVSVGGL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKM
::::::::.:.:::: ::: ::..:: .:.:::: .:.. : ::::.:.::..: :..::
CCDS26 GDSFYEYLIKSWLMSGKTDMEAKNMYYEALEAIETYLLNVSPGGLTYIAEWRGGILDHKM
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 GHLACFAGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVE
::::::.:::.::::. .. .: .:: ::.:.:..:::::: :. :::::.: :... :
CCDS26 GHLACFSGGMIALGAEDAKEEKRAHYRELAAQITKTCHESYARSDTKLGPEAFWFNSGRE
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 AVAVRQAEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDV
:::.. .:.::::::::.:.: :::: ::.: ::.::::..::.:::::...::::..::
CCDS26 AVATQLSESYYILRPEVVESYMYLWRQTHNPIYREWGWEVVLALEKYCRTEAGFSGIQDV
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 YSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGN
:::::.::. :::::::::::::::::: :::: :. :::::::::::: :
CCDS26 YSSTPNHDNKQQSFFLAETLKYLYLLFSEDDLLSLEDWVFNTEAHPLPVNHSDSSGRAWG
570 580 590 600 610 620
640
pF1KB5 PAVR
CCDS26 RH
630
>>CCDS7029.1 MAN1B1 gene_id:11253|Hs108|chr9 (699 aa)
initn: 948 init1: 332 opt: 1125 Z-score: 1111.2 bits: 216.0 E(32554): 1.4e-55
Smith-Waterman score: 1152; 34.8% identity (65.0% similar) in 632 aa overlap (32-626:80-695)
10 20 30 40 50
pF1KB5 TTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFF--LPD
::....::.:. ::. .: : .:. : :
CCDS70 ISVTLSFGENYDNSKSWRRRSCWRKWKQLSRLQRNMILFLL--AFLLFC-GLLFYINLAD
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100
pF1KB5 SSKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLI---------HGPDEHRHREEEERLRN-
: : : :. . :.. :: :: :. . :. .. ... :.
CCDS70 HWKALAFRLEEEQKMRPEI-AGLKPANPPVLPAPQKADTDPENLPEISSQKTQRHIQRGP
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150
pF1KB5 ---KIRADHEKALEEAKEKLRKSRE---EIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKP---LPP--
.:: . . ..:. : .: . : : . ... . . . : . ::
CCDS70 PHLQIRPPSQDLKDGTQEEATKRQEAPVDPRPEGDPQRTVISWRGAVIEPEQGTELPSRR
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 --VPI-PNLVGIRG-GDPEDNDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHS
:: : : : : : . :.: . ... ::: .:: ..:::.::.:..:.
CCDS70 AEVPTKPPLPPARTQGTPVHLNYRQK--GVIDVFLHAWKGYRKFAWGHDELKPVSRS--F
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 PNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGG
. :: .: :..:::::..:.::. :: ....:. .: : . .:..:: .::..::
CCDS70 SEWFG---LGLTLIDALDTMWILGLRKEFEEARKWVSKKLHFEKDVDVNLFESTIRILGG
290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 LLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILA
::.::.:::. .: :: .....:.::: ::. ::.. ::. .::.. :.: .: .:
CCDS70 LLSAYHLSGDSLFLRKAEDFGNRLMPAFRTPSKIPYSDVNIGTGVAHPPRWTS--DSTVA
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 EFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMD-RPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHT-
: ....:: .:: :::: . . : .. . .. .. . .:: : ..: ..: . . .
CCDS70 EVTSIQLEFRELSRLTGDKKFQEAVEKVTQHIHGLSGKKDGLVPMFINTHSGLFTHLGVF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGG-LTFIGEWKNG
..:. .::.:::::: :... : . . . : .:::... ::...:. . :::.:: .:
CCDS70 TLGARADSYYEYLLKQWIQGGKQETQLLEDYVEAIEGVRTHLLRHSEPSKLTFVGELAHG
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 HLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFK
.. :: ::.:: : .:::. .. :.: .::. :. .::.. . :.:: .
CCDS70 RFSAKMDHLVCFLPGTLALGV--YHGLPASH-MELAQELMETCYQMNRQMETGLSPEIVH
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560
pF1KB5 FD----GAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRV
:. . . : :. :... .::::..:. .::.: : : .:..:::: .. .. ::
CCDS70 FNLYPQPGRRDVEVKPADRHNLLRPETVESLFYLYRVTGDRKYQDWGWEILQSFSRFTRV
580 590 600 610 620 630
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 -NGGFSGVKDVYS-STPTHDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGD-DLLPLDHWVFNTEAHPL
.::.:....: . . : : ..::::.::::::.:::: : .:: :: .:::::::::
CCDS70 PSGGYSSINNVQDPQKPEPRDKMESFFLGETLKYLFLLFSDDPNLLSLDAYVFNTEAHPL
640 650 660 670 680 690
630 640
pF1KB5 PVLHLANTTLSGNPAVR
:.
CCDS70 PIWTPA
>>CCDS13247.1 EDEM2 gene_id:55741|Hs108|chr20 (578 aa)
initn: 718 init1: 177 opt: 383 Z-score: 381.9 bits: 80.7 E(32554): 6e-15
Smith-Waterman score: 664; 33.5% identity (58.0% similar) in 505 aa overlap (161-628:16-486)
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 EEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREKREKIKEMMKH
.:. : : : : . ::..: :. :
CCDS13 MPFRLLIPLGLLCALLPQHHGAPGPDGSAPDPAHYRERVKAMFYH
10 20 30 40
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 AWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWI
:.:.: .. .::::.. :: . .:: .. :..:::::: :.: .:: . .
CCDS13 AYDSYLENAFPFDELRPLTCDGH--DTWGSFSL--TLIDALDTLLILGNVSEFQRVVEVL
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290
pF1KB5 EDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKA--------VQLAE----KL
.:..::... ..::::.::: .::::.:. :: . ...: ...:: ::
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