Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5610
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5610, 1012 aa
1>>>pF1KB5610 1012 - 1012 aa - 1012 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8095+/-0.00104; mu= 18.3335+/- 0.062
mean_var=66.6723+/-13.518, 0's: 0 Z-trim(102.8): 39 B-trim: 0 in 0/46
Lambda= 0.157073
statistics sampled from 7078 (7109) to 7078 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012) 6761 1541.8 0
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002) 5530 1262.9 0
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048) 5530 1262.9 0
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063) 2590 596.7 8.6e-170
CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049) 2132 492.9 1.5e-138
CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039) 1585 368.9 3e-101
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051) 845 201.2 9.3e-51
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032) 817 194.9 7.4e-49
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3 (1035) 793 189.4 3.2e-47
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 591 143.7 2.1e-33
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 581 141.4 1e-32
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 556 135.7 5.3e-31
CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 547 133.7 2.2e-30
CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 547 133.7 2.2e-30
CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086) 503 123.7 2e-27
CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 498 122.6 4.8e-27
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179) 477 117.8 1.3e-25
CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 ( 954) 430 107.2 1.7e-22
CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1073) 430 107.2 1.9e-22
CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1091) 430 107.2 2e-22
CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181) 400 100.4 2.3e-20
CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1044) 370 93.6 2.3e-18
CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1137) 370 93.6 2.5e-18
CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1141) 370 93.6 2.5e-18
>>CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012 aa)
initn: 6761 init1: 6761 opt: 6761 Z-score: 8270.3 bits: 1541.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6761; 99.9% identity (100.0% similar) in 1012 aa overlap (1-1012:1-1012)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSRQLISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSRQLISD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 FGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 EVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 SCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 SPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNG
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 PSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 VAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 TFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KB5 IILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
970 980 990 1000 1010
>>CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002 aa)
initn: 6351 init1: 5530 opt: 5530 Z-score: 6762.8 bits: 1262.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6246; 96.1% identity (96.3% similar) in 986 aa overlap (63-1012:17-1002)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 LDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLLGTLLLILYILMLCRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWS
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 STRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQER
50 60 70 80 90 100
160 170
pF1KB5 EPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSR------------------------------------Q
::::::::::::::::::::::. :
CCDS46 EPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKAD
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 RDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 KPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEA
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 LARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNL
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 FDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTE
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 KNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSL
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KB5 LWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPV
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB5 PVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
950 960 970 980 990 1000
>>CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048 aa)
initn: 6748 init1: 5530 opt: 5530 Z-score: 6762.5 bits: 1262.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6643; 96.4% identity (96.6% similar) in 1044 aa overlap (5-1012:5-1048)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB5 HQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSR-----
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS22 HQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSQDIDAD
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KB5 -------------------------------QLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLAT
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GQGFCQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLAT
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 RTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 QMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTK
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 LNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQI
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 LEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVY
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 PSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRR
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 ALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAAD
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 TTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVK
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 AQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAG
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 TQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS22 ILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIH
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CCDS22 TLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIE
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CCDS22 FKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
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CCDS31 ILEVGWPFSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNPNINPQDIKPAASPEDTPELSAFLRNST
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CCDS31 LQRKND--PYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPEGSIVIKTSVIWATPNVSFSIPLWVII
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CCDS31 LAILLGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA
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CCDS88 WIIILAILFGLLLLGLLIYILYKLGFFKRSLPYGTAMEKAQLKPPATSDA
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CCDS32 FKARQGLGASVVSWSDVIVACAPWQHWNVLEKTE-EAEKTPVGSCFLAQPESGRRAEYSP
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CCDS32 CRGNTLSRIYVENDFSWDKRYCEAGFSSVVTQAGELVLGAPGGYYFLGLLAQAPVADIFS
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CCDS32 SYRPGILLWHVSSQSLSFDSSNPEYFDGYWGYSVAVGEFDGDLNTTEYVVGAPTWSWTLG
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CCDS32 AVEILDSY-YQRLHRLRGEQMASYFGHSVAVTDVNGDGRHDLLVGAPLYMESRADRKLAE
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CCDS32 VGRVYLFLQPRGPHALGA-PSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDRDGYNDIAVAAPYGGP
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CCDS32 SGRGQVLVFLGQSEGLRSRPSQVLDSPFPTGS---AFGFSLRGAVDIDDNGYPDLIVGAY
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CCDS32 GANQVAVYRAQPVVKASVQLLVQDS-LNPAVKSCVLPQTKTPVSCFNIQMCVGATGHNI-
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CCDS32 PQKLSLNAELQLDRQKPRQG-RRVLLLGSQQAGTTLNLDLGGKHSPICHTTMAFLRDEAD
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pF1KB5 FRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLE
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CCDS32 FRDKLSPIVLSLNVSLPPTEA----GMAPAVVLHGDTHVQEQTRIVLDCGEDDVCVPQLQ
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pF1KB5 VSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLS
.... . . .: :: : : . : :.::::::::: : .: : .. .. : :.. ::
CCDS32 LTASVTGSPLLVGADNVLELQMDAANEGEGAYEAELAVHLPQGAHYMRALSNVEGFERLI
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CCDS42 QKSAMQTLK--GIVRFLSKTD----KRLLYCIKADPH--------CLNFLCNFGKMESGK
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CCDS42 EASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATG------FPEPNPRVIELNKDENVAHVLLE
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CCDS42 GLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYI
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CCDS26 -HDNTR-WVLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCGK
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CCDS26 TCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACA--HRWKNIYYEADHILPHGFCYIIPSNLQAK
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CCDS26 GRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVLN-LTDNTY
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CCDS26 LKLNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHPSTIDVVGGAPQD-KGIGKVYIFRADRRSGTLI
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CCDS26 KIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMF------SEIRDEGQVTVYINRG
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CCDS26 NGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKE-DDFAGAVYIYHGDA
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CCDS26 GGIVPQYSMKLSGQ-KINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLRARPV
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pF1KB5 ITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLD
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CCDS26 ITVDVSIFL-PGSINITAPQCH-DGQQ-PVNCLNVTTCFSFHGKHV-PGEIGLNYVLMAD
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CCDS26 VAKKEKGQMPRVYFVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVK--RRVQDVISPIVFE
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CCDS26 AAYSLSEHVTGEEERELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQTVFERNCRSEDCAADLQLQGKLL
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