Result of FASTA (omim) for
pF1KB5610
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5610, 1012 aa
1>>>pF1KB5610 1012 - 1012 aa - 1012 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6166+/-0.000439; mu= 19.5758+/- 0.027
mean_var=68.2047+/-13.868, 0's: 0 Z-trim(108.9): 96 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.155298
statistics sampled from 16979 (17077) to 16979 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 9.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001138472 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1012) 6762 1525.0 0
NP_001138471 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1002) 5531 1249.2 0
NP_002201 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform (1048) 5531 1249.2 0
NP_003629 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha-8 I (1063) 2590 590.3 1.8e-167
NP_001278423 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha- (1048) 2454 559.8 2.7e-158
NP_002196 (OMIM: 135620) integrin alpha-5 precurso (1049) 2132 487.7 1.4e-136
XP_011518054 (OMIM: 191830,604063) PREDICTED: inte ( 799) 1876 430.3 2e-119
NP_000410 (OMIM: 187800,273800,607759) integrin al (1039) 1585 365.1 1.1e-99
XP_011523052 (OMIM: 187800,273800,607759) PREDICTE (1000) 1425 329.3 6.4e-89
XP_011523051 (OMIM: 187800,273800,607759) PREDICTE (1005) 1389 321.2 1.7e-86
NP_002195 (OMIM: 605025,614748) integrin alpha-3 p (1051) 845 199.4 8.8e-50
NP_000876 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isoform (1032) 817 193.1 6.7e-48
NP_002198 (OMIM: 603963) integrin alpha-9 precurso (1035) 793 187.7 2.8e-46
XP_016859497 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte ( 944) 624 149.8 6.5e-35
XP_016859495 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte ( 962) 624 149.8 6.6e-35
XP_006712574 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte (1058) 624 149.8 7.1e-35
XP_006712573 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte (1076) 624 149.8 7.3e-35
XP_005257365 (OMIM: 605025,614748) PREDICTED: inte ( 916) 612 147.1 4.1e-34
NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152) 591 142.5 1.3e-32
XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091) 581 140.2 5.8e-32
NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153) 581 140.2 6.1e-32
XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160) 564 136.4 8.6e-31
NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform (1161) 556 134.6 3e-30
XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 556 134.6 3.1e-30
XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 554 134.2 4.2e-30
NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform (1163) 547 132.6 1.2e-29
NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169) 547 132.6 1.2e-29
XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028) 546 132.4 1.3e-29
NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162) 546 132.4 1.4e-29
XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164) 546 132.4 1.4e-29
XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173) 546 132.4 1.4e-29
XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179) 546 132.4 1.4e-29
XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190) 546 132.4 1.4e-29
XP_016878705 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 917) 540 131.0 2.9e-29
NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086) 503 122.7 1.1e-26
XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169) 503 122.7 1.1e-26
XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074) 498 121.6 2.3e-26
XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087) 498 121.6 2.3e-26
NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform (1170) 498 121.6 2.5e-26
XP_011544144 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1103) 489 119.6 9.4e-26
XP_016880076 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al ( 848) 477 116.9 4.8e-25
XP_011522130 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1137) 477 116.9 6.3e-25
XP_011522129 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1163) 477 116.9 6.4e-25
NP_002199 (OMIM: 604682) integrin alpha-E precurso (1179) 477 116.9 6.5e-25
XP_011522127 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1185) 477 116.9 6.5e-25
XP_016880075 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1191) 477 116.9 6.5e-25
XP_011522125 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1217) 477 116.9 6.6e-25
XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798) 469 115.1 1.6e-24
XP_011544148 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 790) 455 111.9 1.4e-23
XP_016858116 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 835) 447 110.1 5e-23
>>NP_001138472 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform 3 (1012 aa)
initn: 6762 init1: 6762 opt: 6762 Z-score: 8179.6 bits: 1525.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6762; 100.0% identity (100.0% similar) in 1012 aa overlap (1-1012:1-1012)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSRQLISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQEREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSRQLISD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 FGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 EVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 SCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 SPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 PSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 VAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 TFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KB5 IILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
970 980 990 1000 1010
>>NP_001138471 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform 2 (1002 aa)
initn: 6352 init1: 5531 opt: 5531 Z-score: 6689.1 bits: 1249.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6247; 96.2% identity (96.3% similar) in 986 aa overlap (63-1012:17-1002)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 LDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLLGTLLLILYILMLCRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWS
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 STRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STRRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQER
50 60 70 80 90 100
160 170
pF1KB5 EPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSR------------------------------------Q
::::::::::::::::::::::. :
NP_001 EPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGSDGKLQEVGQVSVSLQRASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKAD
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 RDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 KPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEA
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 LARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNL
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 FDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYEL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTE
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 KNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSL
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KB5 LWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPV
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB5 PVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
950 960 970 980 990 1000
>>NP_002201 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform 1 pr (1048 aa)
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Smith-Waterman score: 6644; 96.5% identity (96.6% similar) in 1044 aa overlap (5-1012:5-1048)
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NP_002 FKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
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. .:.::::.:::::.:.... :..:::::::::: . :..:::::. .:. .
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:. . : .. :..: : .::::::::::.:.:.::. ...:.:.::.:...:.:
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250 260 270 280 290 300
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: .. .:. . ::::::::.:::..:...:.:.: ::..::::::.: ... .::::
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. . :: .: :. . :.: :.:.:::::.: ::::.:::.:::::..:..:.:..: :
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:.:: . :::. :::.:.: ::....: .::....: .::::: ::::::::::. ..
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.::::::.::.: : ..: :.: .::::..: . ...::..: : .. :... . .
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..:. ::.:::::::.:.::: ... . ..:.: ::...:.:::::.::::::.
NP_003 MAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKSHQCQDFIVYLRDETEFRDKLS
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pF1KB5 PITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVSVDSD
::.: ..: :: : . ..:::: . .:.:::::.::::::.: : :..:. :
NP_003 PINISLNYSLDESTFKEGLEVKPILNYYRENIVSEQAHILVDCGEDNLCVPDLKLSARPD
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pF1KB5 QKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTE
.... :::.: : ::..:.:.:::::::::.: :: .::..:. :::... ::: .: :
NP_003 KHQVIIGDENHLMLIINARNEGEGAYEAELFVMIPEEADYVGIERNNKGFRPLSCEYKME
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pF1KB5 NQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHK
: ::.::::::::: .::. ::::.: . . . :..:::::.::: . : :: .
NP_003 NVTRMVVCDLGNPMVSGTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIRSSNKDNPDSNFVSLQ
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pF1KB5 VDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNGPSSFSKA
......: ::::::: : .: ::: ::: .:.:. ::.:::.:.:::::.: :::..: .
NP_003 INITAVAQVEIRGVSHPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEVGPLVEHIYELHNIGPSTISDT
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pF1KB5 MLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIK-ISSLQTTEKNDTVAGQGE
.:.. ::.. .. ::::.: . ::..: . .::: :: .: . : . .. ..
NP_003 ILEVGWPFSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNPNINPQDIKPAASPEDTPELSAFLRNST
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pF1KB5 RDHLITKRDLALSE----GDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETF
::. :::. . : . . :.: .::.: : ::::. :.::.: :.: ::..::
NP_003 IPHLVRKRDVHVVEFHRQSPAKILNCTNIECLQISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTF
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pF1KB5 MNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWVII
....:. :.: : .::.: ..:: . : . .: .. :.: :. . . .:.::::
NP_003 LQRKND--PYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPEGSIVIKTSVIWATPNVSFSIPLWVII
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970 980 990 1000 1010
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::.: :::.::.:...... ::: :.:::::.. .:::: .. :
NP_003 LAILLGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA
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10 20 30 40
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:::: ::. :.:: : :.::::::.. . ::::.:::
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::.:::: .:.: . .:::::::::.:: ::::: : : : . . .:. : ::.:.
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:: . .:.::::.:::::.:.... :..:::::::::: . :..:::::. .
NP_001 NRKIRVNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAHKGKVVACAPLYHWRTLKPTPEKDPVGTCYVAI
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:. . .:..:::. :.:. .::.
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:...:. . : .. :..: : .::::: ..:.:.::.:...
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:.: : .. .:. . ::::::::.:::..:...:.:.: ::..::::::.: ... .
NP_001 GYVSIINSTDMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLDDVLVGAPLFMEREFESNPR
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pF1KB5 EVGQVSVSLQRASGDFQTTK-LNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDK
::::. . :: .: :. . :.: :.:.:::::.: ::::.:::.:::::..:..:.:.
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.: : :.:: . :::. :::.:.: ::....: .::....: .::::: ::::::::::.
NP_001 RGKVLIYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLRGDSDIDKNDYPDLIVGAFGT
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.. .::::::.::.: : ..: :.: .::::..: . ...::..: : .. :...
NP_001 GKVAVYRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTSAACFSLRVCASVTGQSI-AN
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. ...:. ::.:::::::.:.::: ... . ..:.: ::...:.:::::.:::
NP_001 TIVLMAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKSHQCQDFIVYLRDETEFR
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:::.::.: ..: :: : . ..:::: . .:.:::::.::::::.: : :..:
NP_001 DKLSPINISLNYSLDESTFKEGLEVKPILNYYRENIVSEQAHILVDCGEDNLCVPDLKLS
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pF1KB5 VDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCA
. :.... :::.: : ::..:.:.:::::::::.: :: .::..:. :::... :::
NP_001 ARPDKHQVIIGDENHLMLIINARNEGEGAYEAELFVMIPEEADYVGIERNNKGFRPLSCE
640 650 660 670 680 690
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pF1KB5 FKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPV
.: :: ::.::::::::: .::. ::::.: . . . :..:::::.::: . :
NP_001 YKMENVTRMVVCDLGNPMVSGTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIRSSNKDNPDSNF
700 710 720 730 740 750
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pF1KB5 VSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQHIYELRNNGPSS
:: .......: ::::::: : .: ::: ::: .:.:. ::.:::.:.:::::.: :::.
NP_001 VSLQINITAVAQVEIRGVSHPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEVGPLVEHIYELHNIGPST
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pF1KB5 FSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPMNCTSDMEINPLRIK-ISSLQTTEKNDTVA
.: ..:.. ::.. .. ::::.: . ::..: . .::: :: .: . : . ..
NP_001 ISDTILEVGWPFSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNPNINPQDIKPAASPEDTPELSAFL
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pF1KB5 GQGERDHLITKRDLALSE----GDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLW
.. ::. :::. . : . . :.: .::.: : ::::. :.::.: :.: ::
NP_001 RNSTIPHLVRKRDVHVVEFHRQSPAKILNCTNIECLQISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLW
880 890 900 910 920 930
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pF1KB5 TETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPV
..::... .: :.: : .::.: ..:: . : . .: .. :.: :. . . .:.
NP_001 AHTFLQR--KNDPYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPEGSIVIKTSVIWATPNVSFSIPL
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KB5 WVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQ-EREQLQPHENGEGNSET
::::::.: :::.::.:...... ::: :.:::::.. .:::: .. :
NP_001 WVIILAILLGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA
1000 1010 1020 1030 1040
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10 20 30 40
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NP_000 LTASVTGSPLLVGADNVLELQMDAANEGEGAYEAELAVHLPQGAHYMRALSNVEGFERLI
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NP_000 CNQKKENETRVVLCELGNPMKKNAQIGIAMLVSVGNLEEAGESVSFQLQIRSKNSQNPNS
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NP_000 GTVNGLHLSIHLPGQSQPSDLLYILDIQPQGGLQCFPQPPVNPLKVDWG-LPIPSPSPIH
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pF1KB5 AGQGERDHLITKRDLALSEG-------DIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVK
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NP_000 PAHHKRD----RRQIFLPEPEQPSRLQDPVLVSCDSAPCTVVQCDLQEMARGQRAMVTVL
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pF1KB5 SLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPM
..:: ..... . .. :.: : ::: .:: :. . . : :.. ...
NP_000 AFLWLPSLYQRPLD--QFVLQSHAWFNVSSLPYAVPPLSLPRGEAQVWTQLLRALEERA-
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KB5 PVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
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NP_000 -IPIWWVLVGVLGGLLLLTILVLAMWKVGFFKRNRPPLEEDDEEGE
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XP_011 -HGRVAIVVGAPR--TLGPSQEETGGVFLCPWRAEGGQCPSLLFDLRDETRNVGSQTLQT
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