Result of FASTA (ccds) for pF1KB5625
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5625, 1253 aa
  1>>>pF1KB5625 1253 - 1253 aa - 1253 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7913+/-0.00116; mu= -2.4354+/- 0.069
 mean_var=297.0273+/-61.661, 0's: 0 Z-trim(111.0): 39  B-trim: 17 in 1/51
 Lambda= 0.074418
 statistics sampled from 11996 (12025) to 11996 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.369), width:  16
 Scan time:  4.680

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3        (1253) 8118 886.4       0
CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3         (1210) 4383 485.4 3.7e-136
CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3        (1237) 4383 485.4 3.8e-136
CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11       (1319) 1366 161.5 1.3e-38
CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11        (1377) 1144 137.7   2e-31
CCDS12621.2 PHLDB3 gene_id:653583|Hs108|chr19      ( 640)  655 85.0 6.8e-16


>>CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3             (1253 aa)
 initn: 8118 init1: 8118 opt: 8118  Z-score: 4724.8  bits: 886.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8118; 100.0% identity (100.0% similar) in 1253 aa overlap (1-1253:1-1253)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 TLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQFSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQFSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 YPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSSRHKSHDNVYSLGGLEGRKASGSLLAMW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSSRHKSHDNVYSLGGLEGRKASGSLLAMW
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 NGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPKQARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRTRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPKQARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRTRK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 YSSSSLSHMGAYSRSLPRLYRATENQLTPLSLPPRNSLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YSSSSLSHMGAYSRSLPRLYRATENQLTPLSLPPRNSLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 YLNFSSLSSGALPYKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YLNFSSLSSGALPYKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 GTNPSHSLLAGESDRVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTNPSHSLLAGESDRVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GRDDLMDYHRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GRDDLMDYHRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKIN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 KELEKLQLSDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KELEKLQLSDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 DELLSDLTRTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DELLSDLTRTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 LEELKQKIKDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEELKQKIKDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 IVGEKTKEKVKLDAEREKLERLQELYSEQKTQLDNCPESMREQLQQQLKRDADLLDVESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVGEKTKEKVKLDAEREKLERLQELYSEQKTQLDNCPESMREQLQQQLKRDADLLDVESK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 HFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 REQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 REQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 CGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHKEGLYLSDTLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHKEGLYLSDTLP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 RKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDSESRRMLRGYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDSESRRMLRGYN
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB5 HQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFHYPDHSYKDQAFDTLSLDSSDSMETSISACS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFHYPDHSYKDQAFDTLSLDSSDSMETSISACS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB5 PDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKR
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB5 LQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB5 ITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250   
pF1KB5 HLKNANKSPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HLKNANKSPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
             1210      1220      1230      1240      1250   

>>CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3              (1210 aa)
 initn: 4359 init1: 4359 opt: 4383  Z-score: 2557.9  bits: 485.4 E(32554): 3.7e-136
Smith-Waterman score: 7746; 96.6% identity (96.6% similar) in 1253 aa overlap (1-1253:1-1210)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 TLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQFSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQFSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 YPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSSRHKSHDNVYSLGGLEGRKASGSLLAMW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 YPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSSRHKSHDNVYSLGGLEGRKASGSLLAMW
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 NGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPKQARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRTRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 NGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPKQARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRTRK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 YSSSSLSHMGAYSRSLPRLYRATENQLTPLSLPPRNSLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 YSSSSLSHMGAYSRSLPRLYRATENQLTPLSLPPRNSLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 YLNFSSLSSGALPYKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 YLNFSSLSSGALPYKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 GTNPSHSLLAGESDRVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 GTNPSHSLLAGESDRVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GRDDLMDYHRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 GRDDLMDYHRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKIN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 KELEKLQLSDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 KELEKLQLSDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 DELLSDLTRTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 DELLSDLTRTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 LEELKQKIKDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LEELKQKIKDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 IVGEKTKEKVKLDAEREKLERLQELYSEQKTQLDNCPESMREQLQQQLKRDADLLDVESK
       :::::::                                           ::::::::::
CCDS29 IVGEKTK-------------------------------------------DADLLDVESK
                                                         670       

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 HFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 HFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQ
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              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 REQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 REQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 CGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHKEGLYLSDTLP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDSESRRMLRGYN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 HQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFHYPDHSYKDQAFDTLSLDSSDSMETSISACS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKR
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pF1KB5 LQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVS
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pF1KB5 ITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYD
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             1210      1220      1230      1240      1250   
pF1KB5 HLKNANKSPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 HLKNANKSPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
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>>CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3             (1237 aa)
 initn: 4359 init1: 4359 opt: 4383  Z-score: 2557.8  bits: 485.4 E(32554): 3.8e-136
Smith-Waterman score: 7746; 96.6% identity (96.6% similar) in 1253 aa overlap (1-1253:28-1237)

                                          10        20        30   
pF1KB5                            MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQN
                                  :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MEEEDTKREVPKEDGVGDVQHFDSSKIMEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQN
               10        20        30        40        50        60

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB5 MMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQ
               70        80        90       100       110       120

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB5 FSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS
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pF1KB5 RHKSHDNVYSLGGLEGRKASGSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPKQARKMSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RHKSHDNVYSLGGLEGRKASGSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPKQARKMSI
              190       200       210       220       230       240

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB5 QDSLALQPKLTRHKELASENINLRTRKYSSSSLSHMGAYSRSLPRLYRATENQLTPLSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QDSLALQPKLTRHKELASENINLRTRKYSSSSLSHMGAYSRSLPRLYRATENQLTPLSLP
              250       260       270       280       290       300

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB5 PRNSLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALPYKTSASEGNPYVSSTLSVPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PRNSLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALPYKTSASEGNPYVSSTLSVPA
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB5 SPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGTNPSHSLLAGESDRVFATRRNFSCGSVEFDEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGTNPSHSLLAGESDRVFATRRNFSCGSVEFDEA
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pF1KB5 DLESLRQASGTPQPALRERKSSISSISGRDDLMDYHRRQREERLREQEMERLERQRLETI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLESLRQASGTPQPALRERKSSISSISGRDDLMDYHRRQREERLREQEMERLERQRLETI
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pF1KB5 LSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQLSDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQLSDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDS
              490       500       510       520       530       540

           520       530       540       550       560       570   
pF1KB5 LPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLTRTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLTRTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPK
              550       560       570       580       590       600

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pF1KB5 TPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKIKDINDQMDESFRELDMECALLDGEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKIKDINDQMDESFRELDMECALLDGEQ
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB5 KSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKEKVKLDAEREKLERLQELYSEQKTQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::                          
CCDS46 KSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTK--------------------------
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           700       710       720       730       740       750   
pF1KB5 DNCPESMREQLQQQLKRDADLLDVESKHFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAE
                        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 -----------------DADLLDVESKHFEDLEFQQLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAE
                           700       710       720       730       

           760       770       780       790       800       810   
pF1KB5 YQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQREQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQREQDHFVKEKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSS
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           820       830       840       850       860       870   
pF1KB5 LSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEPCGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEPCGNSTNLSPSTQFPADADAVATEPATAVLASQP
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pF1KB5 QSKEHFRSLEERKKQHKEGLYLSDTLPRKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QSKEHFRSLEERKKQHKEGLYLSDTLPRKKTTSSISPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSN
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pF1KB5 SCGSVLPPSLAAMAKDSESRRMLRGYNHQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFHYPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SCGSVLPPSLAAMAKDSESRRMLRGYNHQQMSEGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFHYPD
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pF1KB5 HSYKDQAFDTLSLDSSDSMETSISACSPDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HSYKDQAFDTLSLDSSDSMETSISACSPDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLL
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pF1KB5 ESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYL
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pF1KB5 PVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRT
      1100      1110      1120      1130      1140      1150       

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pF1KB5 FSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANKSPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANKSPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEA
      1160      1170      1180      1190      1200      1210       

          1240      1250   
pF1KB5 MRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
       ::::::::::::::::::::
CCDS46 MRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
      1220      1230       

>>CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11            (1319 aa)
 initn: 2102 init1: 1268 opt: 1366  Z-score: 806.8  bits: 161.5 E(32554): 1.3e-38
Smith-Waterman score: 2144; 38.5% identity (60.1% similar) in 1308 aa overlap (22-1252:188-1318)

                        10        20        30           40        
pF1KB5          MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
                                     :.: :.:.: :..:.::    :    ::  
CCDS44 PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
       160       170       180       190       200       210       

             50        60         70        80              90     
pF1KB5 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
        .: :   :::   : :: :: :. :.  :   .:.: . .::... ..     ::  . 
CCDS44 ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
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pF1KB5 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
       : .: . .  . : .:  ...  :.  :      .. .:  ::   :::.:  . .  : 
CCDS44 SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
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         :    :.  .    :.:.:.     :. : .  . :::.  :   . :  .:.:.:::
CCDS44 GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
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pF1KB5 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRT--RKYSSSSLSHMGAYSRSL---
             : . .:  .:  .:    ..  .:: .   .  :.  . ..:  :  .:.:   
CCDS44 FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
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         ::: :   ...  :  :: . ::.    . :  .  :      :  ::   .. .  :
CCDS44 ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
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        . .:  ..:  . .:.. :  : .:.    : .   :    ..:. :  .:..::  :.
CCDS44 RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT
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       : :  .   ..:..: :       ::.          :. ::::.::. :: ..:::..:
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       :::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :.    :  . .. .:..    : :
CCDS44 HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL
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       . ..                      :.  ::. .. :.   .  : :  .. :  ::  
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       :....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .:  :. ::
CCDS44 KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE
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CCDS44 -------------------------------------------AEALETETKLFEDLEFQ
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       :::.:::..::.:   : :::  ::  :.:..:::... : .::..:  :: .:......
CCDS44 QLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLAR
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       .::  ...::.:::.:  ::..: ::.::. :: . .:::: : :               
CCDS44 DKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEVYRS---------------
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                :. :: :        :...                   :  :: .. .:: 
CCDS44 -------KMDGEATSPL-------PRTR-------------------SGPLPSSSGSSSS
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       : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .:::  .: :..:.:  .  ..: . :
CCDS44 SSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEE
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        .:. .:. ...:.:..   ...:    .:           ::               ..
CCDS44 QRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEH
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pF1KB5 AFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLLE
       :.:::::.::::::::::     ::::::.::::  ....:::::..::.:::::.::.:
CCDS44 AYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLME
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       ::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.:::::.::.: .::::::::::
CCDS44 SREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLP
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       .:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.:::::::.:::::::::: :::.
CCDS44 IRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTL
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       :::.::::::::::::::::::::::::..: ::::: ::: ::::::.::::::: :::
CCDS44 SYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKSPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAM
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       :::::::::::::::.:. 
CCDS44 RIWMDVIVTGAEGYTQFMN
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CCDS84 PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
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CCDS84 ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
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       : .: . .  . : .:  ...  :.  :      .. .:  ::   :::.:  . .  : 
CCDS84 SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
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CCDS84 FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
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       :....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .:  :. ::
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CCDS84 -------------------------------------------AEALETETKLFEDLEFQ
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       :::.:::..::.:   : :::  ::  :.:..:::... : .::..:  :: .:......
CCDS84 QLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLAR
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       .::  ...::.:::.:  ::..: ::.::. :: . .::::   . .  ..     .  .
CCDS84 DKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELM
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        : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .:::  .: :..:.:  .  ..: . 
CCDS84 SSSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIE
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       : .:. .:. ...:.:..   ...:    .:           ::               .
CCDS84 EQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGE
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       .:.:::::.::::::::::     ::::::.::::  ....:::::..::.:::::.::.
CCDS84 HAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLM
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       :.:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.:::::::.:::::::::: :::
CCDS84 PIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRT
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       .:::.::::::::::::::::::::::::..: :           :::: ::: ::::::
CCDS84 LSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKKRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDR
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CCDS84 LYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
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CCDS12 ARREEEQLRELLEQQAASEQRGRQQREQEQRRLSQERDRLEGLRQRLRKAQGQLDSQPED
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        . :.:  :               ....::    :.:  . .  .: . .. . :.:  :
CCDS12 -NCLQGTPG---------------GDFSEPNPALTKLLFTQK--TDRQLLVLQDAVAHSA
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        ..:  .:.:::...                                          .: 
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CCDS12 RYP-------LYQLLNCGRGNS----CGAIHPD------------IAHMERLLQQAMAER
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        :::..::    . .:. :                 ..    .           : . : 
CCDS12 ERLLKARE----GTRRGTE-----------------GSSGPAVP----------AITAPP
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CCDS12 TPPHPPGPRILDLRQHLEGWGHNPENCPHVQVSGCCCRGPLVKMGGRIKTWRKRWFCFDR
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CCDS12 QARRLAYYADKEETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRCAFKSPNPRLTFCVKTYERLFYMVAP
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CCDS12 SPEAMRIWMDVIVTAADENHAP  
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1253 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 17:43:26 2016 done: Thu Nov  3 17:43:27 2016
 Total Scan time:  4.680 Total Display time:  0.290

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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