FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5625, 1253 aa 1>>>pF1KB5625 1253 - 1253 aa - 1253 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7913+/-0.00116; mu= -2.4354+/- 0.069 mean_var=297.0273+/-61.661, 0's: 0 Z-trim(111.0): 39 B-trim: 17 in 1/51 Lambda= 0.074418 statistics sampled from 11996 (12025) to 11996 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16 Scan time: 4.680 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1253) 8118 886.4 0 CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1210) 4383 485.4 3.7e-136 CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1237) 4383 485.4 3.8e-136 CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1319) 1366 161.5 1.3e-38 CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1377) 1144 137.7 2e-31 CCDS12621.2 PHLDB3 gene_id:653583|Hs108|chr19 ( 640) 655 85.0 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2557.8 bits: 485.4 E(32554): 3.8e-136 Smith-Waterman score: 7746; 96.6% identity (96.6% similar) in 1253 aa overlap (1-1253:28-1237) 10 20 30 pF1KB5 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQN ::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MEEEDTKREVPKEDGVGDVQHFDSSKIMEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQN 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 MMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MMESLSPKKYSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPVPAKRSPSPLGTSVRSSPSLAKIQGSKQ 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 FSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 FSYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 RHKSHDNVYSLGGLEGRKASGSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPKQARKMSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 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CCDS44 ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH 220 230 240 250 260 270 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS- : .: . . . : .: ... :. : .. .: :: :::.: . . : CCDS44 SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 pF1KB5 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK : :. . :.:.:. :. : . . :::. : . : .:.:.::: CCDS44 GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 pF1KB5 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRT--RKYSSSSLSHMGAYSRSL--- : . .: .: .: .. .:: . . :. . ..: : .:.: CCDS44 FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP 390 400 410 420 430 440 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP ::: : ... : :: . ::. . : . : : :: .. . : CCDS44 ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP 450 460 470 480 490 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA . .: ..: . .:.. : : .:. : . : ..:. : .:..:: :. CCDS44 RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT 500 510 520 530 540 380 390 400 410 420 pF1KB5 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY : : . ..:..: : ::. :. ::::.::. :: ..:::..: CCDS44 GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY 550 560 570 580 590 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL :::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :. : . .. .:.. : : CCDS44 HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL 600 610 620 630 640 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT . .. :. ::. .. :. . : : .. : :: CCDS44 AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE 650 660 670 680 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI ::: ::. . : . . :. :.:: : .:...:.:: .. CCDS44 NLKEECSST------ESTQ-----QEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLKVRV 690 700 710 720 730 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 KDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKE :....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .: :. :: CCDS44 KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE 740 750 760 770 780 790 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 KVKLDAEREKLERLQELYSEQKTQLDNCPESMREQLQQQLKRDADLLDVESKHFEDLEFQ :. :..:.: ::::::: CCDS44 -------------------------------------------AEALETETKLFEDLEFQ 800 810 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 QLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQREQDHFVK :::.:::..::.: : ::: :: :.:..:::... : .::..: :: .:...... CCDS44 QLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLAR 820 830 840 850 860 870 790 800 810 820 830 840 pF1KB5 EKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGYISVNEINEPCGNSTNLS .:: ...::.:::.: ::..: ::.::. :: . .:::: : : CCDS44 DKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEVYRS--------------- 880 890 900 910 850 860 870 880 890 900 pF1KB5 PSTQFPADADAVATEPATAVLASQPQSKEHFRSLEERKKQHKEGLYLSDTLPRKKTTSSI :. :: : :... : :: .. .:: CCDS44 -------KMDGEATSPL-------PRTR-------------------SGPLPSSSGSSSS 920 930 940 910 920 930 940 950 960 pF1KB5 SPHFSSATMGRSITPKAHLPLGQSNSCGSVLPPSLAAMAKDSESRRML--RGYNHQQMSE : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .::: .: :..:.: . ..: . : CCDS44 SSQLSVATLGRSPSPKSAL-LTQ-NGTGS-LPRNLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEE 950 960 970 980 990 1000 970 980 990 pF1KB5 GHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFH----YP----------DHSY-------------KDQ .:. .:. ...:.:.. ...: .: :: .. CCDS44 QRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGPSGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEH 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB5 AFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLLE :.:::::.:::::::::: ::::::.:::: ....:::::..::.:::::.::.: CCDS44 AYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSASGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLME 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB5 SREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYLP ::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.:::::.::.: .:::::::::: CCDS44 SREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLP 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB5 VRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGKIKTWKKRWFVFDRNKRTF .:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.:::::::.:::::::::: :::. 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CCDS84 ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH 220 230 240 250 260 270 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS- : .: . . . : .: ... :. : .. .: :: :::.: . . : CCDS84 SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 pF1KB5 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK : :. . :.:.:. :. : . . :::. : . : .:.:.::: CCDS84 GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 pF1KB5 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLRT--RKYSSSSLSHMGAYSRSL--- : . .: .: .: .. .:: . . :. . ..: : .:.: CCDS84 FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP 390 400 410 420 430 440 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP ::: : ... : :: . ::. . : . : : :: .. . : CCDS84 ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP 450 460 470 480 490 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA . .: ..: . .:.. : : .:. : . : ..:. : .:..:: :. CCDS84 RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT 500 510 520 530 540 380 390 400 410 420 pF1KB5 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY : : . ..:..: : ::. :. ::::.::. :: ..:::..: CCDS84 GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY 550 560 570 580 590 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL :::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :. : . .. .:.. : : CCDS84 HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL 600 610 620 630 640 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT . .. :. ::. .. :. . : : .. : :: CCDS84 AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE 650 660 670 680 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI ::: ::. . : . . :. :.:: : .:...:.:: .. CCDS84 NLKEECSST------ESTQ-----QEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVLGHVEQLKVRV 690 700 710 720 730 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 KDINDQMDESFRELDMECALLDGEQKSETTELMKEKEILDHLNRKIAELEKNIVGEKTKE :....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .: :. :: CCDS84 KELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALETGIQKERDKE 740 750 760 770 780 790 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 KVKLDAEREKLERLQELYSEQKTQLDNCPESMREQLQQQLKRDADLLDVESKHFEDLEFQ :. :..:.: ::::::: CCDS84 -------------------------------------------AEALETETKLFEDLEFQ 800 810 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 QLEHESRLDEEKENLTQQLLREVAEYQRNIVSRKEKISALKKQANHIVQQAQREQDHFVK :::.:::..::.: : ::: :: :.:..:::... : .::..: :: .:...... CCDS84 QLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRSIAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLAR 820 830 840 850 860 870 790 800 810 820 830 840 pF1KB5 EKNNLIMMLQREKENLCNLEKKYSSLSGGKGFPVNPNTLKEGY-ISVNEINEPCGNSTNL .:: ...::.:::.: ::..: ::.::. :: . .:::: . . .. . . 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