FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5631, 1036 aa 1>>>pF1KB5631 1036 - 1036 aa - 1036 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6998+/-0.00115; mu= 19.2647+/- 0.068 mean_var=63.2670+/-12.400, 0's: 0 Z-trim(101.3): 33 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.161245 statistics sampled from 6455 (6463) to 6455 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16 Scan time: 3.250 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46957.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1036) 6974 1631.9 0 CCDS3216.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1074) 3937 925.4 0 CCDS11057.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 ( 933) 1847 439.2 2e-122 CCDS58507.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 ( 922) 1801 428.5 3.3e-119 >>CCDS46957.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1036 aa) initn: 6974 init1: 6974 opt: 6974 Z-score: 8756.5 bits: 1631.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6974; 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CCDS11 YRHFQELHRDLLRHKVLMSL-LPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAA-- 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 GRRKQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPG ...: ::.::...: : .:::::: ::::..:::::: ::: ::.:::: :::::::.:: CCDS11 SKQKYLENYLNRLLTMSFYRNYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 LNCCGQGRACYRWSKRWLIVKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGI :.:::. ..:::::::::.::::::::: ..:::.:: : : :...:::. ::...:. CCDS11 LTCCGRDQVCYRWSKRWLVVKDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 RIDNLSRTLILKCNSYRHARWWGGAIEEFIQKHGTNFLKDHRFGSYAAIQENALAKWYVN :::. :.:::::.:::.::::. : :. : : .::. :: ::: . ..::.:.:: CCDS11 RIDTSHRSLILKCSSYRQARWWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVN 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 AKGYFEDVANAMEEANEEIFITDWWLSPEIFLKRPVVEGNRWRLDCILKRKAQQGVRIFI . ::: ::.:. .:.:::::::::::::..::::. ... :::: .:::::..:::. : CCDS11 GAGYFAAVADAILRAQEEIFITDWWLSPEVYLKRPA-HSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSI 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 MLYKEVELALGINSEYTKRTLMRLHPNIKVMRHPDHVSSTVYLWAHHEKLVIIDQSVAFV .:.::::::::::: :.::.:: ::::::::::::.:. ::::::::...:: :::. CCDS11 LLFKEVELALGINSGYSKRALMLLHPNIKVMRHPDQVT----LWAHHEKLLVVDQVVAFL 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 GGIDLAYGRWDDNEHRLTDVGSVKRVTSGPSLGSLPPAAMESMESLRLKDKNEPVQNLPI ::.::::::::: ..::::.:. :. : .: ::. 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