FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5631, 1036 aa
1>>>pF1KB5631 1036 - 1036 aa - 1036 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6998+/-0.00115; mu= 19.2647+/- 0.068
mean_var=63.2670+/-12.400, 0's: 0 Z-trim(101.3): 33 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.161245
statistics sampled from 6455 (6463) to 6455 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46957.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1036) 6974 1631.9 0
CCDS3216.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1074) 3937 925.4 0
CCDS11057.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 ( 933) 1847 439.2 2e-122
CCDS58507.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 ( 922) 1801 428.5 3.3e-119
>>CCDS46957.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1036 aa)
initn: 6974 init1: 6974 opt: 6974 Z-score: 8756.5 bits: 1631.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6974; 100.0% identity (100.0% similar) in 1036 aa overlap (1-1036:1-1036)
10 20 30 40 50 60
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CCDS46 MSLKNEPRVNTSALQKIAADMSNIIENLDTRELHFEGEEVDYDVSPSDPKIQEVYIPFSA
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IYNTQGFKEPNIQTYLSGCPIKAQVLEVERFTSTTRVPSINLYTIELTHGEFKWQVKRKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KHFQEFHRELLKYKAFIRIPIPTRRHTFRRQNVREEPREMPSLPRSSENMIREEQFLGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KHFQEFHRELLKYKAFIRIPIPTRRHTFRRQNVREEPREMPSLPRSSENMIREEQFLGRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPGLNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPGLNC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CGQGRACYRWSKRWLIVKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGIRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CGQGRACYRWSKRWLIVKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGIRID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NLSRTLILKCNSYRHARWWGGAIEEFIQKHGTNFLKDHRFGSYAAIQENALAKWYVNAKG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YFEDVANAMEEANEEIFITDWWLSPEIFLKRPVVEGNRWRLDCILKRKAQQGVRIFIMLY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEVELALGINSEYTKRTLMRLHPNIKVMRHPDHVSSTVYLWAHHEKLVIIDQSVAFVGGI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLAYGRWDDNEHRLTDVGSVKRVTSGPSLGSLPPAAMESMESLRLKDKNEPVQNLPIQKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 IDDVDSKLKGIGKPRKFSKFSLYKQLHRHHLHDADSISSIDSTSNTGSIRSLQTGVGELH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IDDVDSKLKGIGKPRKFSKFSLYKQLHRHHLHDADSISSIDSTSNTGSIRSLQTGVGELH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GETRFWHGKDYCNFVFKDWVQLDKPFADFIDRYSTPRMPWHDIASAVHGKAARDVARHFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GETRFWHGKDYCNFVFKDWVQLDKPFADFIDRYSTPRMPWHDIASAVHGKAARDVARHFI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 QRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLLPKSQTTAHELRYQVPGSVHANVQLLRSAADWSAGIKYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLLPKSQTTAHELRYQVPGSVHANVQLLRSAADWSAGIKYH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 EESIHAAYVHVIENSRHYIYIENQFFISCADDKVVFNKIGDAIAQRILKAHRENQKYRVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EESIHAAYVHVIENSRHYIYIENQFFISCADDKVVFNKIGDAIAQRILKAHRENQKYRVY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 VVIPLLPGFEGDISTGGGNALQAIMHFNYRTMCRGENSILGQLKAELGNQWINYISFCGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VVIPLLPGFEGDISTGGGNALQAIMHFNYRTMCRGENSILGQLKAELGNQWINYISFCGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 RTHAELEGNLVTELIYVHSKLLIADDNTVIIGSANINDRSMLGKRDSEMAVIVQDTETVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RTHAELEGNLVTELIYVHSKLLIADDNTVIIGSANINDRSMLGKRDSEMAVIVQDTETVP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 SVMDGKEYQAGRFARGLRLQCFRVVLGYLDDPSEDIQDPVSDKFFKEVWVSTAARNATIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVMDGKEYQAGRFARGLRLQCFRVVLGYLDDPSEDIQDPVSDKFFKEVWVSTAARNATIY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB5 DKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFINKPVLAKEDPIRAEEELKKIRGFLVQFPFYFLSEESLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFINKPVLAKEDPIRAEEELKKIRGFLVQFPFYFLSEESLL
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB5 PSVGTKEAIVPMEVWT
::::::::::::::::
CCDS46 PSVGTKEAIVPMEVWT
1030
>>CCDS3216.1 PLD1 gene_id:5337|Hs108|chr3 (1074 aa)
initn: 3931 init1: 3931 opt: 3937 Z-score: 4938.1 bits: 925.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6835; 96.3% identity (96.4% similar) in 1068 aa overlap (1-1030:1-1068)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSLKNEPRVNTSALQKIAADMSNIIENLDTRELHFEGEEVDYDVSPSDPKIQEVYIPFSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSLKNEPRVNTSALQKIAADMSNIIENLDTRELHFEGEEVDYDVSPSDPKIQEVYIPFSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IYNTQGFKEPNIQTYLSGCPIKAQVLEVERFTSTTRVPSINLYTIELTHGEFKWQVKRKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IYNTQGFKEPNIQTYLSGCPIKAQVLEVERFTSTTRVPSINLYTIELTHGEFKWQVKRKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KHFQEFHRELLKYKAFIRIPIPTRRHTFRRQNVREEPREMPSLPRSSENMIREEQFLGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KHFQEFHRELLKYKAFIRIPIPTRRHTFRRQNVREEPREMPSLPRSSENMIREEQFLGRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPGLNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPGLNC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CGQGRACYRWSKRWLIVKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGIRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGQGRACYRWSKRWLIVKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGIRID
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NLSRTLILKCNSYRHARWWGGAIEEFIQKHGTNFLKDHRFGSYAAIQENALAKWYVNAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLSRTLILKCNSYRHARWWGGAIEEFIQKHGTNFLKDHRFGSYAAIQENALAKWYVNAKG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YFEDVANAMEEANEEIFITDWWLSPEIFLKRPVVEGNRWRLDCILKRKAQQGVRIFIMLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YFEDVANAMEEANEEIFITDWWLSPEIFLKRPVVEGNRWRLDCILKRKAQQGVRIFIMLY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KEVELALGINSEYTKRTLMRLHPNIKVMRHPDHVSSTVYLWAHHEKLVIIDQSVAFVGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEVELALGINSEYTKRTLMRLHPNIKVMRHPDHVSSTVYLWAHHEKLVIIDQSVAFVGGI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DLAYGRWDDNEHRLTDVGSVKRVTSGPSLGSLPPAAMESMESLRLKDKNEPVQNLPIQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLAYGRWDDNEHRLTDVGSVKRVTSGPSLGSLPPAAMESMESLRLKDKNEPVQNLPIQKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB5 IDDVDSKLKGIGKPRKFSKFSLYKQLHRHHLHDADSISSIDSTS----------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IDDVDSKLKGIGKPRKFSKFSLYKQLHRHHLHDADSISSIDSTSSYFNHYRSHHNLIHGL
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620
pF1KB5 ----------------------NTGSIRSLQTGVGELHGETRFWHGKDYCNFVFKDWVQL
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPHFKLFHPSSESEQGLTRPHADTGSIRSLQTGVGELHGETRFWHGKDYCNFVFKDWVQL
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 DKPFADFIDRYSTPRMPWHDIASAVHGKAARDVARHFIQRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DKPFADFIDRYSTPRMPWHDIASAVHGKAARDVARHFIQRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLL
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 PKSQTTAHELRYQVPGSVHANVQLLRSAADWSAGIKYHEESIHAAYVHVIENSRHYIYIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKSQTTAHELRYQVPGSVHANVQLLRSAADWSAGIKYHEESIHAAYVHVIENSRHYIYIE
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 NQFFISCADDKVVFNKIGDAIAQRILKAHRENQKYRVYVVIPLLPGFEGDISTGGGNALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQFFISCADDKVVFNKIGDAIAQRILKAHRENQKYRVYVVIPLLPGFEGDISTGGGNALQ
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 AIMHFNYRTMCRGENSILGQLKAELGNQWINYISFCGLRTHAELEGNLVTELIYVHSKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AIMHFNYRTMCRGENSILGQLKAELGNQWINYISFCGLRTHAELEGNLVTELIYVHSKLL
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KB5 IADDNTVIIGSANINDRSMLGKRDSEMAVIVQDTETVPSVMDGKEYQAGRFARGLRLQCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IADDNTVIIGSANINDRSMLGKRDSEMAVIVQDTETVPSVMDGKEYQAGRFARGLRLQCF
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KB5 RVVLGYLDDPSEDIQDPVSDKFFKEVWVSTAARNATIYDKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVVLGYLDDPSEDIQDPVSDKFFKEVWVSTAARNATIYDKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFI
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030
pF1KB5 NKPVLAKEDPIRAEEELKKIRGFLVQFPFYFLSEESLLPSVGTKEAIVPMEVWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NKPVLAKEDPIRAEEELKKIRGFLVQFPFYFLSEESLLPSVGTKEAIVPMEVWT
1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS11057.1 PLD2 gene_id:5338|Hs108|chr17 (933 aa)
initn: 3282 init1: 1041 opt: 1847 Z-score: 2311.5 bits: 439.2 E(32554): 2e-122
Smith-Waterman score: 3503; 52.8% identity (75.3% similar) in 1014 aa overlap (26-1036:13-933)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSLKNEPRVNTSALQKIAADMSNIIENLDTRELHFEGEEVDYDVSPSDPKIQEVYIPFSA
..::. .:..:..::: :: . . :: :
CCDS11 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPA--DRMHPFLA
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 IYNTQGFK-EPNIQTYLSGCPIKAQVLEVERFTSTTRVPSINLYTIELTHGEFKWQVKRK
::. :..: .: . . : :. :::. .::.:: ..: . .::...::::.:.: .:.:
CCDS11 IYELQSLKVHPLV--FAPGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 FKHFQEFHRELLKYKAFIRIPIPTRRHTFRRQNVREEP-REMPSLPRSS-ENMIREEQFL
..::::.::.::..:... . .: : . . .:. ::::::::.. :. :.
CCDS11 YRHFQELHRDLLRHKVLMSL-LPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAA--
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GRRKQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPG
...: ::.::...: : .:::::: ::::..:::::: ::: ::.:::: :::::::.::
CCDS11 SKQKYLENYLNRLLTMSFYRNYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LNCCGQGRACYRWSKRWLIVKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGI
:.:::. ..:::::::::.::::::::: ..:::.:: : : :...:::. ::...:.
CCDS11 LTCCGRDQVCYRWSKRWLVVKDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RIDNLSRTLILKCNSYRHARWWGGAIEEFIQKHGTNFLKDHRFGSYAAIQENALAKWYVN
:::. :.:::::.:::.::::. : :. : : .::. :: ::: . ..::.:.::
CCDS11 RIDTSHRSLILKCSSYRQARWWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVN
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AKGYFEDVANAMEEANEEIFITDWWLSPEIFLKRPVVEGNRWRLDCILKRKAQQGVRIFI
. ::: ::.:. .:.:::::::::::::..::::. ... :::: .:::::..:::. :
CCDS11 GAGYFAAVADAILRAQEEIFITDWWLSPEVYLKRPA-HSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSI
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 MLYKEVELALGINSEYTKRTLMRLHPNIKVMRHPDHVSSTVYLWAHHEKLVIIDQSVAFV
.:.::::::::::: :.::.:: ::::::::::::.:. ::::::::...:: :::.
CCDS11 LLFKEVELALGINSGYSKRALMLLHPNIKVMRHPDQVT----LWAHHEKLLVVDQVVAFL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GGIDLAYGRWDDNEHRLTDVGSVKRVTSGPSLGSLPPAAMESMESLRLKDKNEPVQNLPI
::.::::::::: ..::::.:. :. : .: ::.
CCDS11 GGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGD-----SSESAASQPPT----------------------
460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QKSIDDVDSKLKGIGKPRKFSKFSLYKQLHRHHLHDADSISSIDSTSNTGSIRSLQTGVG
:: :: .. : . :
CCDS11 ----------------PRP------------------DSPATPDLSHNQ-----------
490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 ELHGETRFWHGKDYCNFVFKDWVQLDKPFADFIDRYSTPRMPWHDIASAVHGKAARDVAR
:: :::: :.. :::::::.:: ::::: .::::::.:.. .::: :::.::
CCDS11 ------FFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPWRDVGVVVHGLPARDLAR
510 520 530 540 550
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 HFIQRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLLPKSQTTAHELRYQVPGSVHANVQLLRSAADWSAGI
:::::::::: :.::.. .::.::::: .::..: . .::. ..::.:::. ::::
CCDS11 HFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQCTTVQVLRSVDRWSAGT
560 570 580 590 600 610
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 KYHEESIHAAYVHVIENSRHYIYIENQFFISCADDKVVFNKIGDAIAQRILKAHRENQKY
:.:: ::.:.:..:.:..::::::::::.: ..:.::.:: :..::::::... :
CCDS11 L--ENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDEIVDRILKAHKQGWCY
620 630 640 650 660 670
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 RVYVVIPLLPGFEGDISTGGGNALQAIMHFNYRTMCRGENSILGQLKAELGNQWINYISF
::::..::::::::::::::::..:::.::.:::.:::: ::: .::: .:. : .:::.
CCDS11 RVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHRLKAAMGTAWRDYISI
680 690 700 710 720 730
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 CGLRTHAELEGNLVTELIYVHSKLLIADDNTVIIGSANINDRSMLGKRDSEMAVIVQDTE
::::::.:: :. :.::::.:::.::::: :::::::::::::.:::::::.::...:::
CCDS11 CGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLLGKRDSELAVLIEDTE
740 750 760 770 780 790
900 910 920 930 940 950
pF1KB5 TVPSVMDGKEYQAGRFARGLRLQCFRVVLGYLDDPSEDIQDPVSDKFFKEVWVSTAARNA
: ::.:.: :::::::: .:: .:: :.:: :. :..::. : ::. .: . : ::
CCDS11 TEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICDDFFQ-LWQDMAESNA
800 810 820 830 840 850
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB5 TIYDKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFINKPVLAKEDPIRAEEELKKIRGFLVQFPFYFLSEE
.::...:::::.. ...: ::... :: .: :. :: ...: ::.::. :: .:
CCDS11 NIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQGHLVHFPLKFLEDE
860 870 880 890 900 910
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]