Result of FASTA (omim) for
pF1KB5634
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5634, 784 aa
1>>>pF1KB5634 784 - 784 aa - 784 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9189+/-0.000396; mu= 18.4518+/- 0.025
mean_var=88.8678+/-17.673, 0's: 0 Z-trim(113.5): 417 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.136051
statistics sampled from 22485 (22914) to 22485 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 10.640
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001786 (OMIM: 601120) cadherin-5 preproprotein ( 784) 5186 1028.5 0
XP_011521103 (OMIM: 601120) PREDICTED: cadherin-5 ( 793) 3507 699.0 2.1e-200
NP_114097 (OMIM: 605807) cadherin-20 preproprotein ( 801) 1925 388.4 6.3e-107
XP_016864413 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_005248285 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864417 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864420 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864414 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
NP_004925 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 pre ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864418 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864415 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864421 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
NP_001278885 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864416 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_006714498 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
XP_016864419 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 1845 372.7 3.3e-102
NP_057363 (OMIM: 609974) cadherin-9 preproprotein ( 789) 1840 371.8 6.5e-102
XP_016864399 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6 ( 790) 1834 370.6 1.5e-101
XP_011512223 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6 ( 790) 1834 370.6 1.5e-101
NP_004923 (OMIM: 603007) cadherin-6 preproprotein ( 790) 1834 370.6 1.5e-101
NP_006718 (OMIM: 604555) cadherin-10 isoform 1 pre ( 788) 1830 369.8 2.5e-101
XP_011512225 (OMIM: 604555) PREDICTED: cadherin-10 ( 788) 1830 369.8 2.5e-101
NP_001304153 (OMIM: 604555) cadherin-10 isoform 3 ( 786) 1827 369.2 3.8e-101
XP_016864404 (OMIM: 604555) PREDICTED: cadherin-10 ( 786) 1827 369.2 3.8e-101
NP_001787 (OMIM: 603008) cadherin-8 preproprotein ( 799) 1823 368.4 6.7e-101
NP_004352 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 1 prep ( 785) 1776 359.2 3.9e-98
NP_387450 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 1 prep ( 785) 1776 359.2 3.9e-98
XP_016881012 (OMIM: 605806) PREDICTED: cadherin-7 ( 785) 1776 359.2 3.9e-98
NP_004052 (OMIM: 600562) cadherin-12 isoform 1 pre ( 794) 1756 355.3 6e-97
XP_016864409 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 1756 355.3 6e-97
XP_011512229 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 1756 355.3 6e-97
XP_016864410 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 1756 355.3 6e-97
NP_001304156 (OMIM: 600562) cadherin-12 isoform 1 ( 794) 1756 355.3 6e-97
XP_011512230 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 724) 1741 352.3 4.3e-96
NP_066976 (OMIM: 603016) cadherin-19 isoform 1 pre ( 772) 1668 338.0 9.3e-92
XP_005255817 (OMIM: 603008) PREDICTED: cadherin-8 ( 711) 1544 313.6 1.8e-84
XP_011512231 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 622) 1505 305.9 3.3e-82
XP_005255820 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1502 305.4 6.1e-82
XP_005255819 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1502 305.4 6.1e-82
XP_011521105 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1502 305.4 6.1e-82
XP_005255818 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1502 305.4 6.1e-82
NP_001788 (OMIM: 600023) cadherin-11 isoform 1 pre ( 796) 1502 305.4 6.1e-82
XP_016864400 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6 ( 663) 1478 300.6 1.4e-80
XP_016878318 (OMIM: 603008) PREDICTED: cadherin-8 ( 621) 1459 296.9 1.7e-79
NP_067071 (OMIM: 609920) cadherin-22 precursor [Ho ( 828) 1431 291.5 9.9e-78
XP_011527296 (OMIM: 609920) PREDICTED: cadherin-22 ( 828) 1431 291.5 9.9e-78
NP_001304143 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 2 p ( 630) 1411 287.5 1.2e-76
XP_016864423 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 567) 1345 274.5 8.8e-73
XP_016864422 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 567) 1345 274.5 8.8e-73
NP_001317505 (OMIM: 600023) cadherin-11 isoform 3 ( 670) 1300 265.7 4.6e-70
>>NP_001786 (OMIM: 601120) cadherin-5 preproprotein [Hom (784 aa)
initn: 5186 init1: 5186 opt: 5186 Z-score: 5500.1 bits: 1028.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5186; 100.0% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-784)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSPPAGNRAQVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSPPAGNRAQVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 INITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 KPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 SVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 DGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPRE
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 ELLY
::::
NP_001 ELLY
>>XP_011521103 (OMIM: 601120) PREDICTED: cadherin-5 isof (793 aa)
initn: 3507 init1: 3507 opt: 3507 Z-score: 3718.9 bits: 699.0 E(85289): 2.1e-200
Smith-Waterman score: 5158; 98.9% identity (98.9% similar) in 793 aa overlap (1-784:1-793)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB5 TATVLVTLQDINDNFPFFTQT---------KYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNR
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TATVLVTLQDINDNFPFFTQTLWGALFASAKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 MTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRR
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TSDKGQFFRVTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSDKGQFFRVTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHD
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 NTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 AQVGVSIQAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AQVGVSIQAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGG
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 EMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEV
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 KKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLA
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 ELYGSDPREELLY
:::::::::::::
XP_011 ELYGSDPREELLY
790
>>NP_114097 (OMIM: 605807) cadherin-20 preproprotein [Ho (801 aa)
initn: 1581 init1: 433 opt: 1925 Z-score: 2040.7 bits: 388.4 E(85289): 6.3e-107
Smith-Waterman score: 1925; 41.6% identity (69.0% similar) in 781 aa overlap (16-776:24-793)
10 20 30 40
pF1KB5 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLL---P-THRRQKRD
::. ..... . . : . ..:: : .:.: ::.
NP_114 MWTSGRMSNAKNWLGLGMSLYFWGLMDLTTTVLSDTPTPQGELEALLSDKPQSHQRTKRS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 WIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIE
:.:::. . :: . . : .:::..:...: .. ::.:.:: .: :: .: :::. ::.
NP_114 WVWNQFFVLEEYTGTDPLYVGKLHSDMDRGDGSIKYILSGEGAGIVFTIDDTTGDIHAIQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 RLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAV
:::::. ..: : : .:. ::. .: : : ::..:.::: : : . :.::: : :
NP_114 RLDREERAQYTLRAQALDRRTGRPMEPESEFIIKIQDINDNEPKFLDGPYVATVPEMSPV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 GTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDN-SGRIITITKSLDREKQARYEI
:::::.:::.:::::: :. : :.:.::.:. ::..:. .: : : ..::: . ::.
NP_114 GTSVIQVTATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVDSKTGVIRTALMNMDREAKEYYEV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VVEARDAQG-LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVED
...:.: : : : .::.:: .::.:.::: : : : .: . : :.. ....:: .:..:
NP_114 IIQAKDMGGQLGGLAGTTTVNITLSDVNDNPPRFPQKHYQMSVLESAPISSTVGRVFAKD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 PDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTI
:: : ::.:. :: ::: : :.: . ::: :::..: ..:.. ::...: .
NP_114 LDEGINAEMKYTIVDGDGADAFDISTDPNFQVGIITVKKPLSFESKKSYTLKVEGANPHL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 DLRYMS-PPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAAR
..:... : . . : :.. ::::::.:. :: .. :. : . : :::..
NP_114 EMRFLNLGPFQDTTTVHISVEDVDEPPVFEPGFYFVEVPEDVAIGTTIQIISAKDPDVTN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 HSIGYSIRRTSDKGQFFRVT-KKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKES
.:: ::: :.:: :.:: : : ... . :::: . :.:.:: : :... :. :
NP_114 NSIRYSIDRSSDPGRFFYVDITTGALMTARPLDREEFSWHNITVLAMEMNN---PSQVGS
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 IVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVK-FKFILNT
: : :.::: ::::::: . :. ::::: :::. .::.:.: ::: . : . :
NP_114 -VPVTIKVLDVNDNAPEFPRFYEAFVCENAKAGQLIQTVSAVDQD-DPRNGQHFYYSLAP
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KB5 EN----NFTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVC
: :::. ::.:::: : .. . : ... .: ::..:.:.:.: ..:.:::. ::
NP_114 EAANNPNFTIRDNQDNTARILTRRSGFRQQEQSVFHLPILIADSGQPVLSSTGTLTIQVC
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 KCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQ--AVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKS
.:...:. : : .. ::.. :..::: ::... :..:::. :: :::
NP_114 SCDDDGHVMSCSPEAYMLPVSLSRGALIAILACIFVLLVLVLLILSMRRHRKQPYIIDDE
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 VPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVR--RGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPP
.:::..: ::.::::: :: ..:.... . : ..:: : .: .. ....
NP_114 -ENIHENIVRYDDEGGGEEDTEAFDIAAMWNPREAQAGAAPK-----TRQDMLPEIESLS
660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 RHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSD
:..: . . . . ... .: ::: : .::.:.:. : .::. :.: ::::: . .::
NP_114 RYVPQTCAVNSTVHSYVLAKLYEADMDLWAPPFDSLQTYMFEGDGSVAGSLSSLQSATSD
710 720 730 740 750 760
760 770 780
pF1KB5 SDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY
:. ..:::.::::::. ::::::.
NP_114 SEQSFDFLTDWGPRFRKLAELYGASEGPAPLW
770 780 790 800
>>XP_016864413 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 iso (790 aa)
initn: 1502 init1: 398 opt: 1845 Z-score: 1955.9 bits: 372.7 E(85289): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
:.: :: :.:::. . ::. :..:::.
XP_016 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
.:. .. .. ::.: :: .: .: .: :::. . . ::::. ..: : : .:. :..
XP_016 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
:: : : :::.:.::: : :: . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
XP_016 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
.:.::.:. ::..: ..: : : ...::: . .: .:..:.: : : ::..:: .:
XP_016 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
: :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: : .: :::. :: . :.
XP_016 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
: :. :::.. :::.:: ..:.. .:... .:.:. : . ... : . ::
XP_016 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
::::.:..: : ... :: : ..:::::.:::.. . : : . . .:: . ..
XP_016 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
: : . : :::: ::::.:: :.:.:. : : : :.::: ::: ::.:. :.
XP_016 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::. ::.. ::: ::: . .:.:.:. .. :::: ::.::::.: ..
XP_016 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
.:.: :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:. : : . ...:.:
XP_016 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
:..:::::.: . .:..:.. :: .:. : ...:..::::.::::: :: ..
XP_016 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
:...: . ..:. . : :: .:. ::: .. .. .:. . :::
XP_016 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
: . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::
XP_016 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 REELLY
XP_016 SERTT
790
>>XP_005248285 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 iso (790 aa)
initn: 1502 init1: 398 opt: 1845 Z-score: 1955.9 bits: 372.7 E(85289): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
:.: :: :.:::. . ::. :..:::.
XP_005 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
.:. .. .. ::.: :: .: .: .: :::. . . ::::. ..: : : .:. :..
XP_005 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
:: : : :::.:.::: : :: . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
XP_005 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
.:.::.:. ::..: ..: : : ...::: . .: .:..:.: : : ::..:: .:
XP_005 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
: :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: : .: :::. :: . :.
XP_005 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
: :. :::.. :::.:: ..:.. .:... .:.:. : . ... : . ::
XP_005 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
::::.:..: : ... :: : ..:::::.:::.. . : : . . .:: . ..
XP_005 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
: : . : :::: ::::.:: :.:.:. : : : :.::: ::: ::.:. :.
XP_005 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::. ::.. ::: ::: . .:.:.:. .. :::: ::.::::.: ..
XP_005 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
.:.: :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:. : : . ...:.:
XP_005 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
:..:::::.: . .:..:.. :: .:. : ...:..::::.::::: :: ..
XP_005 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
:...: . ..:. . : :: .:. ::: .. .. .:. . :::
XP_005 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
: . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::
XP_005 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 REELLY
XP_005 SERTT
790
>>XP_016864417 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 iso (790 aa)
initn: 1502 init1: 398 opt: 1845 Z-score: 1955.9 bits: 372.7 E(85289): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
:.: :: :.:::. . ::. :..:::.
XP_016 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
.:. .. .. ::.: :: .: .: .: :::. . . ::::. ..: : : .:. :..
XP_016 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
:: : : :::.:.::: : :: . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
XP_016 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
.:.::.:. ::..: ..: : : ...::: . .: .:..:.: : : ::..:: .:
XP_016 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
: :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: : .: :::. :: . :.
XP_016 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
: :. :::.. :::.:: ..:.. .:... .:.:. : . ... : . ::
XP_016 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
::::.:..: : ... :: : ..:::::.:::.. . : : . . .:: . ..
XP_016 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
: : . : :::: ::::.:: :.:.:. : : : :.::: ::: ::.:. :.
XP_016 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::. ::.. ::: ::: . .:.:.:. .. :::: ::.::::.: ..
XP_016 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
.:.: :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:. : : . ...:.:
XP_016 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
:..:::::.: . .:..:.. :: .:. : ...:..::::.::::: :: ..
XP_016 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
:...: . ..:. . : :: .:. ::: .. .. .:. . :::
XP_016 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
: . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::
XP_016 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 REELLY
XP_016 SERTT
790
>>XP_016864420 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 iso (790 aa)
initn: 1502 init1: 398 opt: 1845 Z-score: 1955.9 bits: 372.7 E(85289): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
:.: :: :.:::. . ::. :..:::.
XP_016 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
.:. .. .. ::.: :: .: .: .: :::. . . ::::. ..: : : .:. :..
XP_016 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
:: : : :::.:.::: : :: . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
XP_016 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
.:.::.:. ::..: ..: : : ...::: . .: .:..:.: : : ::..:: .:
XP_016 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
: :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: : .: :::. :: . :.
XP_016 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
: :. :::.. :::.:: ..:.. .:... .:.:. : . ... : . ::
XP_016 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
::::.:..: : ... :: : ..:::::.:::.. . : : . . .:: . ..
XP_016 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
: : . : :::: ::::.:: :.:.:. : : : :.::: ::: ::.:. :.
XP_016 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::. ::.. ::: ::: . .:.:.:. .. :::: ::.::::.: ..
XP_016 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
.:.: :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:. : : . ...:.:
XP_016 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
:..:::::.: . .:..:.. :: .:. : ...:..::::.::::: :: ..
XP_016 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
:...: . ..:. . : :: .:. ::: .. .. .:. . :::
XP_016 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
: . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::
XP_016 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 REELLY
XP_016 SERTT
790
>>XP_016864414 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 iso (790 aa)
initn: 1502 init1: 398 opt: 1845 Z-score: 1955.9 bits: 372.7 E(85289): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
:.: :: :.:::. . ::. :..:::.
XP_016 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
.:. .. .. ::.: :: .: .: .: :::. . . ::::. ..: : : .:. :..
XP_016 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
:: : : :::.:.::: : :: . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
XP_016 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
.:.::.:. ::..: ..: : : ...::: . .: .:..:.: : : ::..:: .:
XP_016 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
: :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: : .: :::. :: . :.
XP_016 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
: :. :::.. :::.:: ..:.. .:... .:.:. : . ... : . ::
XP_016 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
::::.:..: : ... :: : ..:::::.:::.. . : : . . .:: . ..
XP_016 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
: : . : :::: ::::.:: :.:.:. : : : :.::: ::: ::.:. :.
XP_016 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::. ::.. ::: ::: . .:.:.:. .. :::: ::.::::.: ..
XP_016 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
.:.: :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:. : : . ...:.:
XP_016 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
:..:::::.: . .:..:.. :: .:. : ...:..::::.::::: :: ..
XP_016 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
:...: . ..:. . : :: .:. ::: .. .. .:. . :::
XP_016 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
: . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::
XP_016 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 REELLY
XP_016 SERTT
790
>>NP_004925 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 preprop (790 aa)
initn: 1502 init1: 398 opt: 1845 Z-score: 1955.9 bits: 372.7 E(85289): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
:.: :: :.:::. . ::. :..:::.
NP_004 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
.:. .. .. ::.: :: .: .: .: :::. . . ::::. ..: : : .:. :..
NP_004 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
:: : : :::.:.::: : :: . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
NP_004 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
.:.::.:. ::..: ..: : : ...::: . .: .:..:.: : : ::..:: .:
NP_004 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
: :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: : .: :::. :: . :.
NP_004 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
: :. :::.. :::.:: ..:.. .:... .:.:. : . ... : . ::
NP_004 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
::::.:..: : ... :: : ..:::::.:::.. . : : . . .:: . ..
NP_004 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
: : . : :::: ::::.:: :.:.:. : : : :.::: ::: ::.:. :.
NP_004 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::. ::.. ::: ::: . .:.:.:. .. :::: ::.::::.: ..
NP_004 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
.:.: :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:. : : . ...:.:
NP_004 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
:..:::::.: . .:..:.. :: .:. : ...:..::::.::::: :: ..
NP_004 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
:...: . ..:. . : :: .:. ::: .. .. .:. . :::
NP_004 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
: . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::
NP_004 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 REELLY
NP_004 SERTT
790
>>XP_016864418 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 iso (790 aa)
initn: 1502 init1: 398 opt: 1845 Z-score: 1955.9 bits: 372.7 E(85289): 3.3e-102
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
:.: :: :.:::. . ::. :..:::.
XP_016 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
.:. .. .. ::.: :: .: .: .: :::. . . ::::. ..: : : .:. :..
XP_016 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
:: : : :::.:.::: : :: . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
XP_016 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
.:.::.:. ::..: ..: : : ...::: . .: .:..:.: : : ::..:: .:
XP_016 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
: :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: : .: :::. :: . :.
XP_016 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
: :. :::.. :::.:: ..:.. .:... .:.:. : . ... : . ::
XP_016 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
::::.:..: : ... :: : ..:::::.:::.. . : : . . .:: . ..
XP_016 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
: : . : :::: ::::.:: :.:.:. : : : :.::: ::: ::.:. :.
XP_016 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
::::. ::.. ::: ::: . .:.:.:. .. :::: ::.::::.: ..
XP_016 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
.:.: :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:. : : . ...:.:
XP_016 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
:..:::::.: . .:..:.. :: .:. : ...:..::::.::::: :: ..
XP_016 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
:...: . ..:. . : :: .:. ::: .. .. .:. . :::
XP_016 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
: . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::
XP_016 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
730 740 750 760 770 780
780
pF1KB5 REELLY
XP_016 SERTT
790
784 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:47:28 2016 done: Thu Nov 3 17:47:30 2016
Total Scan time: 10.640 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]