FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5640, 512 aa
1>>>pF1KB5640 512 - 512 aa - 512 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1186+/-0.000911; mu= 13.6550+/- 0.054
mean_var=72.3676+/-14.905, 0's: 0 Z-trim(106.4): 43 B-trim: 342 in 1/51
Lambda= 0.150766
statistics sampled from 8919 (8962) to 8919 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10389.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15 ( 512) 3429 755.3 3.8e-218
CCDS10163.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15 ( 518) 2491 551.2 9.9e-157
CCDS6644.1 ALDH1A1 gene_id:216|Hs108|chr9 ( 501) 2438 539.7 2.8e-153
CCDS55968.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15 ( 497) 2435 539.1 4.4e-153
CCDS9155.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12 ( 517) 2254 499.7 3.3e-141
CCDS6615.1 ALDH1B1 gene_id:219|Hs108|chr9 ( 517) 2193 486.4 3.2e-137
CCDS45266.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15 ( 422) 2170 481.4 8.6e-136
CCDS76794.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15 ( 405) 1902 423.1 2.9e-118
CCDS55885.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12 ( 470) 1848 411.4 1.1e-114
CCDS31891.1 ALDH1L2 gene_id:160428|Hs108|chr12 ( 923) 1544 345.3 1.7e-94
CCDS58850.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3 ( 801) 1522 340.5 4.2e-93
CCDS3034.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3 ( 902) 1522 340.5 4.6e-93
CCDS58851.1 ALDH1L1 gene_id:10840|Hs108|chr3 ( 912) 1522 340.5 4.7e-93
CCDS10164.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15 ( 480) 1271 285.9 7.1e-77
CCDS1250.2 ALDH9A1 gene_id:223|Hs108|chr1 ( 518) 1127 254.6 2e-67
CCDS5171.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6 ( 487) 1122 253.5 4.1e-67
CCDS4555.1 ALDH5A1 gene_id:7915|Hs108|chr6 ( 535) 910 207.4 3.4e-53
CCDS9826.1 ALDH6A1 gene_id:4329|Hs108|chr14 ( 535) 768 176.5 6.7e-44
CCDS55057.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6 ( 437) 748 172.1 1.1e-42
CCDS4137.2 ALDH7A1 gene_id:501|Hs108|chr5 ( 539) 720 166.0 9.4e-41
CCDS61501.1 ALDH6A1 gene_id:4329|Hs108|chr14 ( 522) 655 151.9 1.6e-36
CCDS5172.1 ALDH8A1 gene_id:64577|Hs108|chr6 ( 433) 630 146.4 6e-35
CCDS4556.1 ALDH5A1 gene_id:7915|Hs108|chr6 ( 548) 622 144.7 2.5e-34
CCDS11212.1 ALDH3A1 gene_id:218|Hs108|chr17 ( 453) 588 137.3 3.5e-32
CCDS82090.1 ALDH3A1 gene_id:218|Hs108|chr17 ( 380) 553 129.7 5.8e-30
CCDS11210.1 ALDH3A2 gene_id:224|Hs108|chr17 ( 485) 536 126.0 9.5e-29
CCDS32589.1 ALDH3A2 gene_id:224|Hs108|chr17 ( 508) 536 126.0 9.9e-29
CCDS188.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1 ( 563) 490 116.0 1.1e-25
CCDS53272.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1 ( 503) 473 112.3 1.3e-24
CCDS12766.1 ALDH16A1 gene_id:126133|Hs108|chr19 ( 802) 470 111.7 3.2e-24
CCDS81273.1 ALDH4A1 gene_id:8659|Hs108|chr1 ( 512) 403 97.1 5.1e-20
CCDS31622.1 ALDH3B2 gene_id:222|Hs108|chr11 ( 385) 395 95.3 1.3e-19
CCDS73336.1 ALDH3B1 gene_id:221|Hs108|chr11 ( 431) 385 93.1 6.6e-19
CCDS73335.1 ALDH3B1 gene_id:221|Hs108|chr11 ( 468) 385 93.2 7.1e-19
>>CCDS10389.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15 (512 aa)
initn: 3429 init1: 3429 opt: 3429 Z-score: 4030.0 bits: 755.3 E(32554): 3.8e-218
Smith-Waterman score: 3429; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
490 500 510
>>CCDS10163.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15 (518 aa)
initn: 2491 init1: 2491 opt: 2491 Z-score: 2927.3 bits: 551.2 E(32554): 9.9e-157
Smith-Waterman score: 2491; 72.0% identity (91.5% similar) in 492 aa overlap (20-511:26-517)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNP
:: : :::.:.:::::::::..:.::. : . ::
CCDS10 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 STREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATL
.: ::.:::.:.:: :.::::.::..::. :: :::.:: ::::: .::::::::::.:
CCDS10 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVC
:..:... :::::.::..::.: :.:.::.:::::::.: :::.: . ::::::::::
CCDS10 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GAITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVP
: : ::::::::..::.:::::::::.:.::::::::.:::.:.:::::::::::.::.:
CCDS10 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GFGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADAD
:.:::.::::.:: :.:::::::::::::..:::.::::::::::::::.: :. ::::
CCDS10 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LDLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQG
:: ::: :::::::::::::::.::.::::..: :::::::: ::.: ::.::: ::::
CCDS10 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PQIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFG
::::.::..::::::.:: :::::::::... ::.::.:::::.:::.::::::::::
CCDS10 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PVQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQ
::: ::.::...:::.:::..:.::.:::::....::: ..::...::::::::::: ::
CCDS10 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 APFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
.:::::::::::::.::..: ::.::::::.:. .::
CCDS10 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
490 500 510
>>CCDS6644.1 ALDH1A1 gene_id:216|Hs108|chr9 (501 aa)
initn: 2438 init1: 2438 opt: 2438 Z-score: 2865.2 bits: 539.7 E(32554): 2.8e-153
Smith-Waterman score: 2438; 70.9% identity (89.7% similar) in 494 aa overlap (18-511:7-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
: :: . .:....::::::::::.: ::::: . ::.:.:..
CCDS66 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEEL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
:.:::::: ::::::.::. ::: ::::: .:: :::::..::::.:::: ::..:.:
CCDS66 CQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLATMESM
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130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
. :: . .:.. :: :::.:::: :::::::::.::: : : .:::::::::: : ::
CCDS66 NGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPW
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190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::.::.::..::: ::::.:.:::::::::::...::::::::::::::::::.:::.
CCDS66 NFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::::: .:.:.:::::::::::.::::..:::::::::::::.:::: :::::: :::
CCDS66 GAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
::.:::..::::: ::::.::::..:.:::::::: ::: .:.:. . ::::::..
CCDS66 FAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
:.::::.::::::::::::::::. .:: :..:::::.:::.::::::::::::: :.
CCDS66 QYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIM
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
::::...::::::.: :::.:.::::..:::. ..:::..::::.:::... :: :::::
CCDS66 KFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGF
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::::::.. :::::::::.:...::
CCDS66 KMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
470 480 490 500
>>CCDS55968.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15 (497 aa)
initn: 2435 init1: 2435 opt: 2435 Z-score: 2861.7 bits: 539.1 E(32554): 4.4e-153
Smith-Waterman score: 2435; 71.6% identity (91.5% similar) in 483 aa overlap (29-511:14-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
.:. :::::::..:.::. : . ::.: ::.
CCDS55 MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPATGEQV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
:::.:.:: :.::::.::..::. :: :::.:: ::::: .::::::::::.::..:..
CCDS55 CEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
. :::::.::..::.: :.:.::.:::::::.: :::.: . ::::::::::: : ::
CCDS55 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::::..::.:::::::::.:.::::::::.:::.:.:::::::::::.::.::.:::.
CCDS55 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::.:: :.:::::::::::::..:::.::::::::::::::.: :. :::::: :::
CCDS55 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
:::::::::::::::.::.::::..: :::::::: ::.: ::.::: ::::::::.:
CCDS55 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
:..::::::.:: :::::::::... ::.::.:::::.:::.::::::::::::: ::
CCDS55 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
.::...:::.:::..:.::.:::::....::: ..::...::::::::::: ::.:::::
CCDS55 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::.::..: ::.::::::.:. .::
CCDS55 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
470 480 490
>>CCDS9155.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12 (517 aa)
initn: 2236 init1: 2236 opt: 2254 Z-score: 2648.7 bits: 499.7 E(32554): 3.3e-141
Smith-Waterman score: 2254; 66.1% identity (86.4% similar) in 493 aa overlap (19-511:24-516)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
:.: : .. :: ..::::::::.. : : : : :::
CCDS91 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
: : ::.: :::: ::::::.::..::: ::::::.:: :::::..::::.::::. ::
CCDS91 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
::::.:.:::.. ....::. .. :::.:::::: .::::: : . .:::::.::::
CCDS91 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
: :::::::: .:::.::: ::..:.: ::::::::::...:::::::::::::::::
CCDS91 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
::::.::::.:: ...:.:::::::.:.... ::. :::::::::::::.: :. .:::.
CCDS91 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
: ::: :: ..:::::::: :.::.::.:..:.:::.::: ::.: ::.::: ::::::
CCDS91 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
:.:. :: ::: :..::.::::: :::. :.: ::.::::..: :.: :::::::::
CCDS91 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
:. :::::.::::. :::.. :::.::::::.:::: :..::..::::.:::... ::.
CCDS91 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::.::::.:::::::.: ::::::::.:. .::
CCDS91 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
490 500 510
>>CCDS6615.1 ALDH1B1 gene_id:219|Hs108|chr9 (517 aa)
initn: 2193 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 2577.0 bits: 486.4 E(32554): 3.2e-137
Smith-Waterman score: 2193; 64.3% identity (86.2% similar) in 493 aa overlap (19-511:24-516)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
::: :: : .. ....::::::... : : : : ::.
CCDS66 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
: : : .: :::. :::.::.::. ::. ::::::.:: :::::..:::::::::. ::
CCDS66 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRVYLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
.:::.:.:::: ... .::. :.. ::::::::: .::::: : . :::::::.::::
CCDS66 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
: ::::::.: ::::::: :::.:.: ::::::.::::.:::::::::::::::. :
CCDS66 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
.:::.::::..: ...:.:::::::::.:...::. :::::::::::::.: :: ::::.
CCDS66 YGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
. ::: :...:::.:::: :.::.::::..:.::..:.:: ::.: ::.::.. :.:::
CCDS66 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
:.:..::...: :. :.:::::: ::: . ..:.:::::::. : :.:::::::::::
CCDS66 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
:::..:::.::::..:::.: :::.:::::..::::. ...::..::::.: :: . ..
CCDS66 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
:::::: ::::::::: .: ::::::::::. .::
CCDS66 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
490 500 510
>>CCDS45266.1 ALDH1A2 gene_id:8854|Hs108|chr15 (422 aa)
initn: 2170 init1: 2170 opt: 2170 Z-score: 2551.4 bits: 481.4 E(32554): 8.6e-136
Smith-Waterman score: 2170; 73.4% identity (92.4% similar) in 421 aa overlap (91-511:1-421)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
.:: ::::: .::::::::::.::..:..
CCDS45 MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
. :::::.::..::.: :.:.::.:::::::.: :::.: . ::::::::::: : ::
CCDS45 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::::..::.:::::::::.:.::::::::.:::.:.:::::::::::.::.::.:::.
CCDS45 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::.:: :.:::::::::::::..:::.::::::::::::::.: :. :::::: :::
CCDS45 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
:::::::::::::::.::.::::..: :::::::: ::.: ::.::: ::::::::.:
CCDS45 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
:..::::::.:: :::::::::... ::.::.:::::.:::.::::::::::::: ::
CCDS45 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
.::...:::.:::..:.::.:::::....::: ..::...::::::::::: ::.:::::
CCDS45 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
340 350 360 370 380 390
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::.::..: ::.::::::.:. .::
CCDS45 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
400 410 420
>>CCDS76794.1 ALDH1A3 gene_id:220|Hs108|chr15 (405 aa)
initn: 1902 init1: 1902 opt: 1902 Z-score: 2236.7 bits: 423.1 E(32554): 2.9e-118
Smith-Waterman score: 2454; 79.1% identity (79.1% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAA----
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
CCDS76 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
:::::::::::::::::
CCDS76 -------------------------------------------GFPPGVVNIVPGFGPTV
120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
140 150 160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
260 270 280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
320 330 340 350 360 370
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
380 390 400
>>CCDS55885.1 ALDH2 gene_id:217|Hs108|chr12 (470 aa)
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Smith-Waterman score: 1924; 59.2% identity (77.9% similar) in 493 aa overlap (19-511:24-469)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
:.: : .. :: ..::::::::.. : : : : :::
CCDS55 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
: : ::.: ::::
CCDS55 TGEVICQVAEGDK-----------------------------------------------
70
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
::::.:.:::.. ....::. .. :::.:::::: .::::: : . .:::::.::::
CCDS55 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
: :::::::: .:::.::: ::..:.: ::::::::::...:::::::::::::::::
CCDS55 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
::::.::::.:: ...:.:::::::.:.... ::. :::::::::::::.: :. .:::.
CCDS55 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
: ::: :: ..:::::::: :.::.::.:..:.:::.::: ::.: ::.::: ::::::
CCDS55 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
:.:. :: ::: :..::.::::: :::. :.: ::.::::..: :.: :::::::::
CCDS55 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
:. :::::.::::. :::.. :::.::::::.:::: :..::..::::.:::... ::.
CCDS55 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510
pF1KB5 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::.::::.:::::::.: ::::::::.:. .::
CCDS55 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
440 450 460 470
>>CCDS31891.1 ALDH1L2 gene_id:160428|Hs108|chr12 (923 aa)
initn: 1532 init1: 929 opt: 1544 Z-score: 1809.9 bits: 345.3 E(32554): 1.7e-94
Smith-Waterman score: 1544; 47.8% identity (74.5% similar) in 494 aa overlap (20-506:430-922)
10 20 30 40
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFT-KIFINNEWHESKSGKK
. . . .. ::. . :::... .. .::
CCDS31 YMATKFEGFIQKVVRKLRGEDQEVELVVDYISKEVNEIMVKMPYQCFINGQFTDADDGKT
400 410 420 430 440 450
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 FATCNPSTREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVE
. : ::. ::.: .. :::::: ::. ::. : : :..: ::::...::::.:
CCDS31 YDTINPTDGSTICKVSYASLADVDKAVAAAKDAFENGE-WGRMNARERGRLMYRLADLLE
460 470 480 490 500 510
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 RDRATLAALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTD----DNVVC
... ::..:..:.: . :. . ..:.:::::: :::::.::: . . .
CCDS31 ENQEELATIEALDSGAVYTLALKTHIGMSVQTFRYFAGWCDKIQGSTIPINQARPNRNLT
520 530 540 550 560 570
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FTRHEPIGVCGAITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAG
::..::.:::. : :::.::.::.:: : : :::.:::::. :::::: .. : .::
CCDS31 FTKKEPLGVCAIIIPWNYPLMMLAWKSAACLAAGNTLVLKPAQVTPLTALKFAELSVKAG
580 590 600 610 620 630
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FPPGVVNIVPGFGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGK
:: ::.::.:: : .: .: ::.: :..::::: .:: . .. . ::::.:.::::::
CCDS31 FPKGVINIIPGSGGIAGQRLSEHPDIRKLGFTGSTPIGKQIMKSCAVSNLKKVSLELGGK
640 650 660 670 680 690
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 NPCIVCADADLDLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVG
.: :. : .:: ::. . .::::.:. : ::.:.::::....::: : :: :: .:
CCDS31 SPLIIFNDCELDKAVRMGMGAVFFNKGENCIAAGRLFVEESIHDEFVTRVVEEIKKMKIG
700 710 720 730 740 750
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 DPFDVKTEQGPQIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDN
::.: .:..::: . ...:.:. :.: :::: : :: .. :.:..::::..: :
CCDS31 DPLDRSTDHGPQNHKAHLEKLLQYCETGVKEGATLVYGGRQVQRPGFFMEPTVFTDVEDY
760 770 780 790 800 810
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 MRIAKEEIFGPVQPILKFKS--IEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGT
: .:::: :::.. : ::.. :. :..:::::.:::...:::....::. .. ::.::
CCDS31 MYLAKEESFGPIMVISKFQNGDIDGVLQRANSTEYGLASGVFTRDINKAMYVSEKLEAGT
820 830 840 850 860 870
470 480 490 500 510
pF1KB5 VWINCYNALYAQAPFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
:.:: :: . ::::: :.:: :..::: :: :: ..::::..
CCDS31 VFINTYNKTDVAAPFGGVKQSGFGKDLGEEALNEYLKTKTVTLEY
880 890 900 910 920
512 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:49:26 2016 done: Thu Nov 3 17:49:26 2016
Total Scan time: 2.770 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]