Result of FASTA (omim) for
pF1KB5640
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5640, 512 aa
1>>>pF1KB5640 512 - 512 aa - 512 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5559+/-0.000386; mu= 17.0125+/- 0.024
mean_var=71.3451+/-15.232, 0's: 0 Z-trim(112.5): 76 B-trim: 973 in 1/53
Lambda= 0.151842
statistics sampled from 21442 (21518) to 21442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 9.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydroge ( 512) 3429 760.7 0
NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 518) 2491 555.2 1.7e-157
NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [ ( 501) 2438 543.6 5.1e-154
NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase ( 497) 2435 542.9 8e-154
NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydroge ( 517) 2254 503.3 7.2e-142
XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde de ( 517) 2193 489.9 7.5e-138
NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, ( 517) 2193 489.9 7.5e-138
NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 422) 2170 484.8 2.1e-136
NP_001280744 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydr ( 405) 1902 426.1 9.5e-119
NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydr ( 470) 1848 414.3 3.9e-115
XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1544 347.8 6.7e-95
XP_016874378 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1544 347.8 6.7e-95
NP_001029345 (OMIM: 613584) mitochondrial 10-formy ( 923) 1544 347.9 7.7e-95
NP_001257294 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 801) 1522 343.0 1.9e-93
XP_011510657 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1522 343.0 2.1e-93
NP_036322 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltetrah ( 902) 1522 343.0 2.1e-93
XP_006713544 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1522 343.0 2.1e-93
NP_001257293 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 912) 1522 343.0 2.2e-93
NP_733797 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 480) 1271 287.9 4.5e-77
XP_016861103 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 828) 1167 265.3 5.1e-70
XP_016861102 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 838) 1167 265.3 5.2e-70
NP_000687 (OMIM: 602733) 4-trimethylaminobutyralde ( 518) 1127 256.4 1.5e-67
NP_072090 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 487) 1122 255.3 3e-67
XP_011507596 (OMIM: 602733) PREDICTED: 4-trimethyl ( 424) 1088 247.8 4.7e-65
NP_001071 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 535) 910 208.9 3.1e-53
NP_005580 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate-sem ( 535) 768 177.7 7.3e-44
NP_001180409 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase ( 437) 748 173.3 1.3e-42
NP_001188306 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadip ( 511) 720 167.2 1e-40
NP_001173 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadipic ( 539) 720 167.2 1.1e-40
NP_001265522 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 522) 655 153.0 2e-36
XP_016876820 (OMIM: 603178,614105) PREDICTED: meth ( 381) 635 148.5 3.2e-35
NP_001265523 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 381) 635 148.5 3.2e-35
XP_011541719 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 634 148.3 3.9e-35
XP_016864982 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 634 148.3 3.9e-35
NP_739577 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 433) 630 147.5 7.6e-35
NP_733936 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 548) 622 145.8 3.1e-34
NP_001128639 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453) 588 138.3 4.7e-32
NP_001128640 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453) 588 138.3 4.7e-32
NP_000682 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase, d ( 453) 588 138.3 4.7e-32
NP_001317079 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 380) 553 130.6 8.2e-30
XP_011522033 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 380) 553 130.6 8.2e-30
XP_011536290 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 622) 552 130.5 1.4e-29
NP_000373 (OMIM: 270200,609523) fatty aldehyde deh ( 485) 536 126.9 1.3e-28
XP_016879845 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 485) 536 126.9 1.3e-28
XP_016879846 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 485) 536 126.9 1.3e-28
XP_011522035 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 508) 536 126.9 1.4e-28
XP_011522034 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 508) 536 126.9 1.4e-28
NP_001026976 (OMIM: 270200,609523) fatty aldehyde ( 508) 536 126.9 1.4e-28
XP_016879847 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 424) 508 120.7 8.3e-27
XP_016879844 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 424) 508 120.7 8.3e-27
>>NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydrogenase (512 aa)
initn: 3429 init1: 3429 opt: 3429 Z-score: 4059.2 bits: 760.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3429; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
490 500 510
>>NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (518 aa)
initn: 2491 init1: 2491 opt: 2491 Z-score: 2948.6 bits: 555.2 E(85289): 1.7e-157
Smith-Waterman score: 2491; 72.0% identity (91.5% similar) in 492 aa overlap (20-511:26-517)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNP
:: : :::.:.:::::::::..:.::. : . ::
NP_003 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 STREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATL
.: ::.:::.:.:: :.::::.::..::. :: :::.:: ::::: .::::::::::.:
NP_003 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 AALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVC
:..:... :::::.::..::.: :.:.::.:::::::.: :::.: . ::::::::::
NP_003 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GAITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVP
: : ::::::::..::.:::::::::.:.::::::::.:::.:.:::::::::::.::.:
NP_003 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GFGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADAD
:.:::.::::.:: :.:::::::::::::..:::.::::::::::::::.: :. ::::
NP_003 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LDLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQG
:: ::: :::::::::::::::.::.::::..: :::::::: ::.: ::.::: ::::
NP_003 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PQIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFG
::::.::..::::::.:: :::::::::... ::.::.:::::.:::.::::::::::
NP_003 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PVQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQ
::: ::.::...:::.:::..:.::.:::::....::: ..::...::::::::::: ::
NP_003 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 APFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
.:::::::::::::.::..: ::.::::::.:. .::
NP_003 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
490 500 510
>>NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [Homo (501 aa)
initn: 2438 init1: 2438 opt: 2438 Z-score: 2886.1 bits: 543.6 E(85289): 5.1e-154
Smith-Waterman score: 2438; 70.9% identity (89.7% similar) in 494 aa overlap (18-511:7-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
: :: . .:....::::::::::.: ::::: . ::.:.:..
NP_000 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEEL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
:.:::::: ::::::.::. ::: ::::: .:: :::::..::::.:::: ::..:.:
NP_000 CQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLATMESM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
. :: . .:.. :: :::.:::: :::::::::.::: : : .:::::::::: : ::
NP_000 NGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPW
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::.::.::..::: ::::.:.:::::::::::...::::::::::::::::::.:::.
NP_000 NFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::::: .:.:.:::::::::::.::::..:::::::::::::.:::: :::::: :::
NP_000 GAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
::.:::..::::: ::::.::::..:.:::::::: ::: .:.:. . ::::::..
NP_000 FAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
:.::::.::::::::::::::::. .:: :..:::::.:::.::::::::::::: :.
NP_000 QYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIM
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
::::...::::::.: :::.:.::::..:::. ..:::..::::.:::... :: :::::
NP_000 KFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGF
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::::::.. :::::::::.:...::
NP_000 KMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
470 480 490 500
>>NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 is (497 aa)
initn: 2435 init1: 2435 opt: 2435 Z-score: 2882.6 bits: 542.9 E(85289): 8e-154
Smith-Waterman score: 2435; 71.6% identity (91.5% similar) in 483 aa overlap (29-511:14-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
.:. :::::::..:.::. : . ::.: ::.
NP_001 MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPATGEQV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
:::.:.:: :.::::.::..::. :: :::.:: ::::: .::::::::::.::..:..
NP_001 CEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
. :::::.::..::.: :.:.::.:::::::.: :::.: . ::::::::::: : ::
NP_001 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::::..::.:::::::::.:.::::::::.:::.:.:::::::::::.::.::.:::.
NP_001 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::.:: :.:::::::::::::..:::.::::::::::::::.: :. :::::: :::
NP_001 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
:::::::::::::::.::.::::..: :::::::: ::.: ::.::: ::::::::.:
NP_001 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
:..::::::.:: :::::::::... ::.::.:::::.:::.::::::::::::: ::
NP_001 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
.::...:::.:::..:.::.:::::....::: ..::...::::::::::: ::.:::::
NP_001 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
410 420 430 440 450 460
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::.::..: ::.::::::.:. .::
NP_001 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
470 480 490
>>NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogenase (517 aa)
initn: 2236 init1: 2236 opt: 2254 Z-score: 2668.0 bits: 503.3 E(85289): 7.2e-142
Smith-Waterman score: 2254; 66.1% identity (86.4% similar) in 493 aa overlap (19-511:24-516)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
:.: : .. :: ..::::::::.. : : : : :::
NP_000 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
: : ::.: :::: ::::::.::..::: ::::::.:: :::::..::::.::::. ::
NP_000 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
::::.:.:::.. ....::. .. :::.:::::: .::::: : . .:::::.::::
NP_000 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
: :::::::: .:::.::: ::..:.: ::::::::::...:::::::::::::::::
NP_000 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
::::.::::.:: ...:.:::::::.:.... ::. :::::::::::::.: :. .:::.
NP_000 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
: ::: :: ..:::::::: :.::.::.:..:.:::.::: ::.: ::.::: ::::::
NP_000 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
:.:. :: ::: :..::.::::: :::. :.: ::.::::..: :.: :::::::::
NP_000 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
:. :::::.::::. :::.. :::.::::::.:::: :..::..::::.:::... ::.
NP_000 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::.::::.:::::::.: ::::::::.:. .::
NP_000 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
490 500 510
>>XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde dehydr (517 aa)
initn: 2193 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 2595.8 bits: 489.9 E(85289): 7.5e-138
Smith-Waterman score: 2193; 64.3% identity (86.2% similar) in 493 aa overlap (19-511:24-516)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
::: :: : .. ....::::::... : : : : ::.
XP_011 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
: : : .: :::. :::.::.::. ::. ::::::.:: :::::..:::::::::. ::
XP_011 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRVYLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
.:::.:.:::: ... .::. :.. ::::::::: .::::: : . :::::::.::::
XP_011 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
: ::::::.: ::::::: :::.:.: ::::::.::::.:::::::::::::::. :
XP_011 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
.:::.::::..: ...:.:::::::::.:...::. :::::::::::::.: :: ::::.
XP_011 YGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
. ::: :...:::.:::: :.::.::::..:.::..:.:: ::.: ::.::.. :.:::
XP_011 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
:.:..::...: :. :.:::::: ::: . ..:.:::::::. : :.:::::::::::
XP_011 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
:::..:::.::::..:::.: :::.:::::..::::. ...::..::::.: :: . ..
XP_011 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
:::::: ::::::::: .: ::::::::::. .::
XP_011 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
490 500 510
>>NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, mit (517 aa)
initn: 2193 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 2595.8 bits: 489.9 E(85289): 7.5e-138
Smith-Waterman score: 2193; 64.3% identity (86.2% similar) in 493 aa overlap (19-511:24-516)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
::: :: : .. ....::::::... : : : : ::.
NP_000 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPSPILNPDIPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTVNPT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
: : : .: :::. :::.::.::. ::. ::::::.:: :::::..:::::::::. ::
NP_000 TGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRVYLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
.:::.:.:::: ... .::. :.. ::::::::: .::::: : . :::::::.::::
NP_000 SLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
: ::::::.: ::::::: :::.:.: ::::::.::::.:::::::::::::::. :
NP_000 QIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNIITG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
.:::.::::..: ...:.:::::::::.:...::. :::::::::::::.: :: ::::.
NP_000 YGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLADADM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
. ::: :...:::.:::: :.::.::::..:.::..:.:: ::.: ::.::.. :.:::
NP_000 EHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQQGP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
:.:..::...: :. :.:::::: ::: . ..:.:::::::. : :.:::::::::::
NP_000 QVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
:::..:::.::::..:::.: :::.:::::..::::. ...::..::::.: :: . ..
NP_000 VQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVTCHT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
:::::: ::::::::: .: ::::::::::. .::
NP_000 PFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
490 500 510
>>NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (422 aa)
initn: 2170 init1: 2170 opt: 2170 Z-score: 2569.9 bits: 484.8 E(85289): 2.1e-136
Smith-Waterman score: 2170; 73.4% identity (92.4% similar) in 421 aa overlap (91-511:1-421)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
.:: ::::: .::::::::::.::..:..
NP_733 MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
. :::::.::..::.: :.:.::.:::::::.: :::.: . ::::::::::: : ::
NP_733 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
::::::..::.:::::::::.:.::::::::.:::.:.:::::::::::.::.::.:::.
NP_733 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::.:: :.:::::::::::::..:::.::::::::::::::.: :. :::::: :::
NP_733 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
:::::::::::::::.::.::::..: :::::::: ::.: ::.::: ::::::::.:
NP_733 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
:..::::::.:: :::::::::... ::.::.:::::.:::.::::::::::::: ::
NP_733 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
.::...:::.:::..:.::.:::::....::: ..::...::::::::::: ::.:::::
NP_733 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
340 350 360 370 380 390
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::.::..: ::.::::::.:. .::
NP_733 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
400 410 420
>>NP_001280744 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydrogen (405 aa)
initn: 1902 init1: 1902 opt: 1902 Z-score: 2252.9 bits: 426.1 E(85289): 9.5e-119
Smith-Waterman score: 2454; 79.1% identity (79.1% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAA----
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
NP_001 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
:::::::::::::::::
NP_001 -------------------------------------------GFPPGVVNIVPGFGPTV
120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
140 150 160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
260 270 280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
320 330 340 350 360 370
490 500 510
pF1KB5 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
380 390 400
>>NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogen (470 aa)
initn: 1996 init1: 1843 opt: 1848 Z-score: 2188.0 bits: 414.3 E(85289): 3.9e-115
Smith-Waterman score: 1924; 59.2% identity (77.9% similar) in 493 aa overlap (19-511:24-469)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPS
:.: : .. :: ..::::::::.. : : : : :::
NP_001 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TREQICEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLA
: : ::.: ::::
NP_001 TGEVICQVAEGDK-----------------------------------------------
70
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ALETMDTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCG
::::.:.:::.. ....::. .. :::.:::::: .::::: : . .:::::.::::
NP_001 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 AITPWNFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPG
: :::::::: .:::.::: ::..:.: ::::::::::...:::::::::::::::::
NP_001 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FGPTVGAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADL
::::.::::.:: ...:.:::::::.:.... ::. :::::::::::::.: :. .:::.
NP_001 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DLAVECAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGP
: ::: :: ..:::::::: :.::.::.:..:.:::.::: ::.: ::.::: ::::::
NP_001 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QIDQKQFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGP
:.:. :: ::: :..::.::::: :::. :.: ::.::::..: :.: :::::::::
NP_001 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VQPILKFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQA
:. :::::.::::. :::.. :::.::::::.:::: :..::..::::.:::... ::.
NP_001 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510
pF1KB5 PFGGFKMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
::::.::::.:::::::.: ::::::::.:. .::
NP_001 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
440 450 460 470
512 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:49:27 2016 done: Thu Nov 3 17:49:28 2016
Total Scan time: 9.020 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]