Result of FASTA (omim) for
pF1KB5645
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5645, 1170 aa
1>>>pF1KB5645 1170 - 1170 aa - 1170 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5008+/-0.000556; mu= 12.4164+/- 0.034
mean_var=238.5767+/-49.250, 0's: 0 Z-trim(115.2): 540 B-trim: 122 in 1/51
Lambda= 0.083035
statistics sampled from 24805 (25466) to 24805 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 15.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003237 (OMIM: 188060) thrombospondin-1 precurso (1170) 8531 1037.1 0
NP_003238 (OMIM: 188061,603932) thrombospondin-2 p (1172) 5578 683.3 2.3e-195
XP_011520273 (OMIM: 188060) PREDICTED: thrombospon (1112) 5131 629.8 2.9e-179
NP_000086 (OMIM: 132400,177170,600310) cartilage o ( 757) 2502 314.6 1.5e-84
XP_011508238 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 704) 2425 305.3 8.5e-82
XP_011508237 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 780) 2425 305.4 9e-82
XP_011508236 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 780) 2425 305.4 9e-82
XP_011508233 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 921) 2425 305.5 1e-81
XP_011508235 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 921) 2425 305.5 1e-81
XP_011508234 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 921) 2425 305.5 1e-81
XP_011508231 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 959) 2425 305.5 1e-81
XP_011508230 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 985) 2425 305.5 1e-81
XP_011508229 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon (1007) 2425 305.5 1.1e-81
XP_011508228 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon (1016) 2425 305.5 1.1e-81
NP_001239537 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isofo ( 836) 2422 305.1 1.2e-81
NP_001239536 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isofo ( 947) 2422 305.2 1.3e-81
NP_009043 (OMIM: 188062) thrombospondin-3 isoform ( 956) 2422 305.2 1.3e-81
XP_006711561 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon (1013) 2422 305.2 1.4e-81
NP_001293142 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isofo ( 870) 2364 298.2 1.5e-79
NP_001293143 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isofo ( 870) 2364 298.2 1.5e-79
NP_001293141 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isofo ( 870) 2364 298.2 1.5e-79
NP_003239 (OMIM: 600715) thrombospondin-4 isoform ( 961) 2364 298.2 1.6e-79
XP_011508232 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 954) 2245 284.0 3.2e-75
XP_016857695 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospon ( 488) 2110 267.4 1.5e-70
XP_016865288 (OMIM: 600715) PREDICTED: thrombospon ( 656) 866 118.6 1.3e-25
XP_016865289 (OMIM: 600715) PREDICTED: thrombospon ( 637) 857 117.5 2.8e-25
XP_016865287 (OMIM: 600715) PREDICTED: thrombospon ( 663) 857 117.5 2.9e-25
XP_016857926 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (4976) 705 100.4 3e-19
XP_011508340 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (5518) 705 100.4 3.2e-19
NP_114141 (OMIM: 603075,608548) hemicentin-1 precu (5635) 705 100.4 3.3e-19
XP_011515504 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1161) 601 87.1 6.9e-16
NP_001693 (OMIM: 602682) brain-specific angiogenes (1584) 601 87.3 8.4e-16
XP_011515501 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1584) 601 87.3 8.4e-16
XP_016869185 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1618) 601 87.3 8.5e-16
XP_016869184 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1623) 601 87.3 8.5e-16
XP_016869183 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1630) 601 87.3 8.5e-16
XP_016869181 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1662) 601 87.3 8.6e-16
XP_016869180 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1663) 601 87.3 8.6e-16
XP_016869186 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1608) 590 86.0 2.1e-15
XP_016869182 (OMIM: 602682) PREDICTED: brain-speci (1660) 587 85.6 2.8e-15
XP_016866633 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G ( 813) 568 83.0 8.6e-15
XP_016866632 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G ( 827) 568 83.0 8.7e-15
XP_016866631 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G ( 869) 568 83.0 8.9e-15
XP_011534314 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G ( 908) 568 83.0 9.2e-15
XP_011534311 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G (1267) 568 83.2 1.1e-14
XP_006715597 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G (1489) 568 83.3 1.2e-14
XP_016866629 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G (1489) 568 83.3 1.2e-14
XP_005248809 (OMIM: 602684) PREDICTED: adhesion G (1522) 568 83.3 1.3e-14
NP_001695 (OMIM: 602684) adhesion G protein-couple (1522) 568 83.3 1.3e-14
NP_001138724 (OMIM: 300383,312060) properdin precu ( 469) 543 79.7 4.8e-14
>>NP_003237 (OMIM: 188060) thrombospondin-1 precursor [H (1170 aa)
initn: 8531 init1: 8531 opt: 8531 Z-score: 5540.2 bits: 1037.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8531; 99.9% identity (100.0% similar) in 1170 aa overlap (1-1170:1-1170)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TLDNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDSIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TLDNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDSIRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VTEENKELANELRRPPLCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKVSCPIMPCSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VTEENKELANELRRPPLCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKVSCPIMPCSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQI
490 500 510 520 530 540
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pF1KB5 CNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKN
610 620 630 640 650 660
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pF1KB5 AKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPSENLVCVANATYHCKKDNCPN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_003 AKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATYHCKKDNCPN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 LPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYN
730 740 750 760 770 780
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pF1KB5 HNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQCDNCPLEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQCDNCPLEH
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pF1KB5 NPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDN
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pF1KB5 DGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRF
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pF1KB5 QMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB5 DYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNAL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB5 WHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170
pF1KB5 KTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
1150 1160 1170
>>NP_003238 (OMIM: 188061,603932) thrombospondin-2 precu (1172 aa)
initn: 5432 init1: 4955 opt: 5578 Z-score: 3628.4 bits: 683.3 E(85289): 2.3e-195
Smith-Waterman score: 5612; 61.6% identity (83.0% similar) in 1176 aa overlap (3-1169:1-1171)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
..: : ::. . : ... .. :.. ::.: ... :: : . .::::. ::.:
NP_003 MVWRL-VLLALWVWPSTQAGHQDKDTT-FDLFSISNINRKTIGAKQFRGPDPGVPAYR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
. . :::: : .. .. .: ..::.: :.:.: :.:::::::: : . : .:
NP_003 FVRFDYIPPVNADDLSKITKIMRQKEGFFLTAQLKQDGKSRGTLLALEGPGLSQRQFEIV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
::: : ::::. ..: .::::.:.. :: .:::..:. : . .:.. :. ... ::
NP_003 SNGPADTLDLTYWIDGTRHVVSLEDVGLADSQWKNVTVQVAGETYSLHVGCDLIDSFALD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDN-FQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVL
:. . . : .:. .:::.. .. :.:.::::..:: .. :::: .:::... ..
NP_003 EPF---YEHLQAEKSRMYVAKGSARESHFRGLLQNVHLVFENSVEDILSKKGCQQGQGAE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LTL--DNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDS
.. .:. . .: . :.:.: ... .: ::.::..:: :: ::...:. :...
NP_003 INAISENTETLRLGPHVTTEYVGPSSERRPEVCERSCEELGNMVQELSGLHVLVNQLSEN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 IRKVTEENKELANELRRPP------LCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKV
...:...:. : . . :: :...: . .:: :.::::: : :.. :::...
NP_003 LKRVSNDNQFLWELIGGPPKTRNMSACWQDGRFFAENETWVVDSCTTCTCKKFKTICHQI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SCPIMPCSNATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNN
.:: :.. . .::::: : : ....:::::.:::.::..::.: :::::::: .:
NP_003 TCPPATCASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSCDVTSN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 RCEGSSVQTRTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNG
: : :.:::.: ...:: :..::::::::::::::::::: : :::::::::: :::.:
NP_003 TCLGPSIQTRACSLSKCDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSPVPQMGG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KPCEGEARETKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDC
: :.: .::::::. :::.: :.:::::. :.:::.::...:.:.::.: ::.::: :
NP_003 KNCKGSGRETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKAC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 VGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDE
:::: : :.:::..::.::::::::: :..:.:.:::::.::.:: :. ::: .: :.::
NP_003 VGDVQERQMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 CKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCT
: ::: ::. . :: ::.::..:::::::. :.:: : :.: : ..::::.:.:::
NP_003 CALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCEPENPCK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DGTHDCNKNAKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPSENLVCVANATY
: ::.:.:.:.: ::::.:::::.:::. ::::.:.:::::.::::::. ::::..::::
NP_003 DKTHNCHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNATY
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 HCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVG
:: :::::.::::::::.:::::::::::::::: . :..::: . .:: : :::.:.::
NP_003 HCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEVG
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 DRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGD
:::::::: ::: : :::::::::::..::::: ..:::::: ::::.:::::: :::::
NP_003 DRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVGD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 QCDNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKG
.:::::: ::::: : :.: .:: ::::.:::.:::::: :::::. ::::::::.::.:
NP_003 HCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQG
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB5 DACDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVD
:::: ::::::.:::.:::::: ::::.: ::::::: ::::::.:..:::::.::::
NP_003 DACDPDDDNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENNA
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB5 ISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGT
::::::: :::.:::::::.: :::::.::::::::::.: :::.:::.:::..::::::
NP_003 ISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSGT
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB5 FFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTG
:..::.::::::::::::::::::::::::::::.::. .:::: ::::.:.::::::::
NP_003 FYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTTG
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB5 PGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKI
::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::.:.::::::.:::...:::..
NP_003 TGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170
pF1KB5 MADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
:::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::
NP_003 MADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI
1140 1150 1160 1170
>>XP_011520273 (OMIM: 188060) PREDICTED: thrombospondin- (1112 aa)
initn: 8050 init1: 4664 opt: 5131 Z-score: 3339.2 bits: 629.8 E(85289): 2.9e-179
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLDNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDSIRK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTEENKELANELRRPPLCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKVSCPIMPCSN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARE
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::::::::::
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.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 --------NGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKN
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQCDNCPLEH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYD
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XP_011 KTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
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pF1KB5 ATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKNAKC-NYLGHYS-------------------------
: :::::: : : : :.: :. : : : ..
NP_000 AKANKQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCP
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: : : :.:::::.::.::::::.:.:.: : .:
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.:::: ..::::::: :.:::::::: : :.: .:...::::. :: : . :.: ::
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pF1KB5 CDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQC
:::: ..: :: :::..:.:::: ::::: : :. ::: : : ::.:.: ::.:: :
NP_000 CDNCRSQKNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDAC
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pF1KB5 DNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDA
:::: . :::: : : : .::.::..:: : ::::.. :::: :::. : : :.::.:::
NP_000 DNCPQKSNPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDA
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pF1KB5 CDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDIS
:: ::::::.::..::::::::: :.:.: :: ::.:.:::: :.: : :.::::....
NP_000 CDDDDDNDGVPDSRDNCRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVT
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pF1KB5 ETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFF
:::: :: . :::.: .: :::::: .::.:.:::.: :::::::: ::.::: :::
NP_000 LTDFRAFQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFH
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pF1KB5 INTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPG
.:: :::::::.::::.:: ::::::::. :.::..:: :: . :...:.:.:.::::
NP_000 VNTVTDDDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPG
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pF1KB5 EHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMA
:.:::::::::.: .::: ::.:::..:::: .::: :.:::..:.::: .::: ...:
NP_000 EQLRNALWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPELVA
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pF1KB5 DSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
::. . : :. :::::.: :::: .....:.:.: :
NP_000 DSNVVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
710 720 730 740 750
>>XP_011508238 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospondin- (704 aa)
initn: 1828 init1: 1253 opt: 2425 Z-score: 1589.5 bits: 305.3 E(85289): 8.5e-82
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pF1KB5 SVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTS
. : :.:. .. . : :::: :: :
XP_011 MSLIRNTIMECQVCGFHE-QRSHCSPNPCFRGVDCME
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570 580 590 600 610 620
pF1KB5 -YPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPR
: ...:: :::: .::: .:.:..:: .. : :: .. : :: ::..: ::
XP_011 VYEYPGYRCGPCPPGLQGNGTHCSDINECAHA-DPCFPGSS---CINTMPGFHCEACPRG
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 FTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHD-CNKNAKCN--------------YLGH
. :.: : :...: :.::::. . :.::.. :. :. :. .::.
XP_011 YKGTQVSGVGIDYARASKQVCNDIDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGFLGN
100 110 120 130 140 150
670 680 690 700
pF1KB5 YSD----------PMYR-----------------CECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPSE
:. : . :.:. :.:::: .:: :::.::.:..
XP_011 QSQGCLPARTCHSPAHSPCHIHAHCLFERNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDIDGYPDQ
160 170 180 190 200 210
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 NLVCVANATYHCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPA
: :. : . :::.::: ::::::: :.::.:: :::: :.: : . .::: . :
XP_011 ALPCMDN-NKHCKQDNCLLTPNSGQEDADNDGVGDQCDDDADGDGIKNVEDNCRLFPNKD
220 230 240 250 260 270
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 QYDYDRDDVGDRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQ
: . : :. :: ::::: : :: :::.::::::: :.::::: : ::: : : :
XP_011 QQNSDTDSFGDACDNCPNVPNNDQKDTDGNGEGDACDNDVDGDGIPNGLDNCPKVPNPLQ
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 RDTDMDGVGDQCDNCPLEHNPDQL---DSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVP
: : ::::: ::.:: :: :. :.::: .::.::.:.: : ::::.. :::: .:
XP_011 TDRDEDGVGDACDSCPEMSNPTQVQGDDADSDLVGDVCDTNEDSDGDGHQDTKDNCPQLP
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 NANQADHDKDGKGDACDHDDDNDGIPD----DKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDF
:..: : :.:: :: :: ::::::::: :::::::::.::::::.: ::.:.:::
XP_011 NSSQLDSDNDGLGDECDGDDDNDGIPDYVPPGPDNCRLVPNPNQKDSDGNGVGDVCEDDF
400 410 420 430 440 450
940 950 960 970 980 990
pF1KB5 DHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDP
:.:.: : :.:::..... :::: .: . :::.: .: :::::: .:: :.:::.: ::
XP_011 DNDAVVDPLDVCPESAEVTLTDFRAYQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGMEIVQTMNSDP
460 470 480 490 500 510
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB5 GLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTR
:::::: ::.::: ::: .:: :::::::.:.::.:.:::::::::. :.::...: :
XP_011 GLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTDDDYAGFLFSYQDSGRFYVVMWKQTEQTYWQATPFR
520 530 540 550 560 570
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB5 AQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSH
: . ::..:.:.:..::::::::::::::.:: ::: :: :::..::.: :.:::.: :
XP_011 AVAQPGLQLKAVTSVSGPGEHLRNALWHTGHTPDQVRLLWTDPRNVGWRDKTSYRWQLLH
580 590 600 610 620 630
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB5 RPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
::..:.::: .::: ...:::: : : .. :::::.: :::: ...:.:.:.: :
XP_011 RPQVGYIRVKLYEGPQLVADSGVIIDTSMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLQYRCNDTVPED
640 650 660 670 680 690
XP_011 FEPFRRQLLQGRV
700
>>XP_011508237 (OMIM: 188062) PREDICTED: thrombospondin- (780 aa)
initn: 1828 init1: 1253 opt: 2425 Z-score: 1589.0 bits: 305.4 E(85289): 9e-82
Smith-Waterman score: 2561; 52.1% identity (71.2% similar) in 685 aa overlap (535-1169:84-762)
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 SVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTS
. : :.:. .. . : :::: :: :
XP_011 TQLTLFNQILVELRDDIRDQVKEMSLIRNTIMECQVCGFHE-QRSHCSPNPCFRGVDCME
60 70 80 90 100 110
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 -YPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPR
: ...:: :::: .::: .:.:..:: .. : :: .. : :: ::..: ::
XP_011 VYEYPGYRCGPCPPGLQGNGTHCSDINECAHA-DPCFPGSS---CINTMPGFHCEACPRG
120 130 140 150 160
630 640 650 660
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