Result of FASTA (omim) for
pF1KB5666
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5666, 967 aa
1>>>pF1KB5666 967 - 967 aa - 967 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2417+/-0.000431; mu= 22.0578+/- 0.027
mean_var=68.7924+/-13.321, 0's: 0 Z-trim(109.3): 58 B-trim: 15 in 1/54
Lambda= 0.154634
statistics sampled from 17446 (17503) to 17446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 10.120
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005254949 (OMIM: 151530) PREDICTED: aminopeptid ( 967) 6426 1443.6 0
XP_011519775 (OMIM: 151530) PREDICTED: aminopeptid ( 967) 6426 1443.6 0
NP_001141 (OMIM: 151530) aminopeptidase N precurso ( 967) 6426 1443.6 0
NP_776161 (OMIM: 610046) aminopeptidase Q [Homo sa ( 990) 1964 448.1 1e-124
NP_037513 (OMIM: 606950) thyrotropin-releasing hor (1024) 1822 416.5 3.6e-115
XP_016874732 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin (1016) 1699 389.0 6.5e-107
XP_016874733 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin ( 721) 1582 362.8 3.5e-99
XP_011541565 (OMIM: 610046) PREDICTED: aminopeptid ( 709) 1580 362.4 4.8e-99
XP_011541566 (OMIM: 610046) PREDICTED: aminopeptid ( 681) 1500 344.5 1.1e-93
NP_001968 (OMIM: 138297) glutamyl aminopeptidase [ ( 957) 1380 317.9 1.6e-85
XP_005268876 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin ( 777) 1366 314.7 1.2e-84
XP_011541846 (OMIM: 609497) PREDICTED: endoplasmic ( 937) 1364 314.3 1.9e-84
XP_011536550 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin ( 619) 1316 303.5 2.3e-81
NP_001317186 (OMIM: 606793) puromycin-sensitive am ( 915) 1285 296.6 3.8e-79
NP_006301 (OMIM: 606793) puromycin-sensitive amino ( 919) 1285 296.6 3.8e-79
XP_016880862 (OMIM: 606793) PREDICTED: puromycin-s ( 920) 1285 296.6 3.8e-79
XP_016880861 (OMIM: 606793) PREDICTED: puromycin-s ( 924) 1285 296.7 3.8e-79
XP_011541788 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 941) 1231 284.6 1.6e-75
NP_001185470 (OMIM: 606832) endoplasmic reticulum ( 941) 1231 284.6 1.6e-75
NP_001035548 (OMIM: 606832) endoplasmic reticulum ( 941) 1231 284.6 1.6e-75
NP_057526 (OMIM: 606832) endoplasmic reticulum ami ( 948) 1231 284.6 1.6e-75
XP_016865071 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 948) 1231 284.6 1.6e-75
XP_011541783 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
XP_016865069 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
XP_011541786 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
XP_011541787 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
XP_016865070 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
XP_005272073 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
XP_011541782 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
XP_005272072 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 1231 284.6 1.7e-75
NP_787116 (OMIM: 151300) leucyl-cystinyl aminopept (1011) 1209 279.7 5.2e-74
NP_005566 (OMIM: 151300) leucyl-cystinyl aminopept (1025) 1209 279.7 5.3e-74
XP_016864704 (OMIM: 610046) PREDICTED: aminopeptid ( 549) 1137 263.5 2.2e-69
NP_001123612 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ( 960) 1051 244.5 2e-63
NP_071745 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ami ( 960) 1051 244.5 2e-63
XP_016863366 (OMIM: 138297) PREDICTED: glutamyl am ( 599) 885 207.3 2e-52
NP_001316158 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ( 915) 755 178.4 1.5e-43
NP_001316162 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ( 350) 421 103.6 1.8e-21
XP_016865072 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 586) 402 99.5 5.3e-20
NP_060696 (OMIM: 605287) arginyl aminopeptidase-li ( 725) 233 61.9 1.4e-08
NP_001306113 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isofo ( 360) 218 58.4 8e-08
NP_001306112 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isofo ( 360) 218 58.4 8e-08
XP_005245478 (OMIM: 602675) PREDICTED: aminopeptid ( 360) 218 58.4 8e-08
XP_016857511 (OMIM: 602675) PREDICTED: aminopeptid ( 360) 218 58.4 8e-08
NP_001306111 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isofo ( 519) 218 58.5 1.1e-07
NP_064601 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isoform ( 650) 218 58.5 1.3e-07
XP_011536651 (OMIM: 151570) PREDICTED: leukotriene ( 480) 216 58.0 1.4e-07
NP_001243573 (OMIM: 151570) leukotriene A-4 hydrol ( 508) 216 58.0 1.4e-07
XP_011536650 (OMIM: 151570) PREDICTED: leukotriene ( 518) 216 58.0 1.5e-07
XP_005268928 (OMIM: 151570) PREDICTED: leukotriene ( 532) 216 58.0 1.5e-07
>>XP_005254949 (OMIM: 151530) PREDICTED: aminopeptidase (967 aa)
initn: 6426 init1: 6426 opt: 6426 Z-score: 7740.0 bits: 1443.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6426; 99.9% identity (100.0% similar) in 967 aa overlap (1-967:1-967)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYL
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQISELFDAISYSKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNRSIQLPTTVRDIM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDY
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610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WLIDVRAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQ
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pF1KB5 IINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKN
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730 740 750 760 770 780
pF1KB5 YLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYNEVNAISTACSNGVPECEEMVSGLFKQWM
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACSNGVPECEEMVSGLFKQWM
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pF1KB5 ENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWI
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850 860 870 880 890 900
pF1KB5 LNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQ
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 WFTENSK
:::::::
XP_005 WFTENSK
>>XP_011519775 (OMIM: 151530) PREDICTED: aminopeptidase (967 aa)
initn: 6426 init1: 6426 opt: 6426 Z-score: 7740.0 bits: 1443.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6426; 99.9% identity (100.0% similar) in 967 aa overlap (1-967:1-967)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
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pF1KB5 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
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pF1KB5 IIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHP
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pF1KB5 KDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLI
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310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TYRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYL
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pF1KB5 GADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQISELFDAISYSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 ASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNRSIQLPTTVRDIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNRSIQLPTTVRDIM
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pF1KB5 NRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDY
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pF1KB5 WLIDVRAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WLIDVRAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQ
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pF1KB5 IINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKN
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pF1KB5 YLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYNEVNAISTACSNGVPECEEMVSGLFKQWM
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACSNGVPECEEMVSGLFKQWM
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pF1KB5 ENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWI
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pF1KB5 LNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSN
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910 920 930 940 950 960
pF1KB5 LIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQ
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 WFTENSK
:::::::
XP_011 WFTENSK
>>NP_001141 (OMIM: 151530) aminopeptidase N precursor [H (967 aa)
initn: 6426 init1: 6426 opt: 6426 Z-score: 7740.0 bits: 1443.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6426; 99.9% identity (100.0% similar) in 967 aa overlap (1-967:1-967)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAKGFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSSPVASTTPSASATTNPA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVI
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NP_001 WFTENSK
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NP_776 SNE-TNIIEVVASSEVGRYVAKDFLVNNWQAVSKRY--GTQSLINLIYTIGRTVTTDLQI
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NP_776 VELQQFFSNMLEEHQRIRVHANLQTIKNE--NLKNKKLSARIA-AWLRRNT
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NP_037 QATYLSLSNM-P--VETSVFEEDGWVTDHFSQTPLMSTYYLAWAICNFTYRETTTKSGVV
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NP_037 SIFVEQRILLDPSVSSISYLLDVTMVIVHEICHQWFGDLVTPVWWEDVWLKEGFAHYFEF
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NP_037 VMDQWTLQMGYPVITILGNTTAENRIIITQQHFIYDISAKTKALKLQNNSYLWQIPLTIV
590 600 610 620 630 640
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NP_037 VGNRSHVSSEAIIWVSNKSEHHRITYLDKGSWLLGNINQTGYFRVNYDLRNWRLLIDQLI
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pF1KB5 RDHSAIPVINRAQIINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKL
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NP_037 RNHEVLSVSNRAGLIDDAFSLARAGYLPQNIPLEIIRYLSEEKDFLPWHAASRALYPLDK
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pF1KB5 MFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYNEV--NAISTACSNGV
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NP_037 LLDRMENYNIFNEYILKQVATTYIKLGWPKNNFNGSLVQASYQHEELRREVIMLACSFGN
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770 780 790 800 810 820
pF1KB5 PECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEA
.:....: :...:. . : : : :.:. :::.... :. :.: : .:...: :.:
NP_037 KHCHQQASTLISDWI-SSNRNRIPLNVRDIVYCTGVSLLDEDVWEFIWMKFHSTTAVSEK
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pF1KB5 DKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWK
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NP_037 KILLEALTCSDDRNLLNRLLNLSLNSEVVLDQDAIDVIIHVARNPHGRDLAWKFFRDKWK
890 900 910 920 930 940
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pF1KB5 KLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTK
: . :: . : :.::..::. ..:: ::..:..: :. . : .. .. .:.: ..
NP_037 ILNTRYGEALFMNSKLISGVTEFLNTEGELKELKNFMKNYD----GVAAASFSRAVETVE
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pF1KB5 ANIKWVKENKEVVLQWFTENSK
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NP_037 ANVRWKMLYQDELFQWLGKALRH
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>>XP_016874732 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin-rel (1016 aa)
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pF1KB5 GFYISKSLGILGILLGVAAVCTIIALSVVYSQEKNKNANSS---PVASTTPSASATT-NP
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XP_016 FDECGASATPGADGGPSGFPERGGNGSLPGSARRNHHAGGDSWQPEAGGVASPGTTSAQP
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pF1KB5 IIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLKGSLVKDSQYEMD
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XP_016 VVLHASRVAVEKVQ---LAEDRAFGAVP--VAGFFLYPQTQVLVVVLNRTLDAQRNYNLK
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XP_016 QATYLSLSNM-PV--ETSVFEEDGWVTDHFSQTPLMSTYYLAWAICNFTYRETTTKSGVV
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>>XP_011541566 (OMIM: 610046) PREDICTED: aminopeptidase (681 aa)
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