Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5674
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5674, 435 aa
1>>>pF1KB5674 435 - 435 aa - 435 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0886+/-0.000816; mu= 11.1864+/- 0.050
mean_var=133.7446+/-26.773, 0's: 0 Z-trim(113.0): 104 B-trim: 340 in 1/52
Lambda= 0.110901
statistics sampled from 13580 (13685) to 13580 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.42), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 2995 490.1 1.8e-138
CCDS63309.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 362) 2495 410.1 1.9e-114
CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 353) 1493 249.7 3.3e-66
CCDS11863.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 387) 1493 249.8 3.5e-66
CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 415) 1493 249.8 3.7e-66
CCDS77155.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 386) 1279 215.5 7.2e-56
CCDS59306.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 410) 757 132.0 1e-30
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 680 120.1 1.4e-26
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 678 119.9 2.2e-26
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 678 119.9 2.2e-26
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 678 119.9 2.3e-26
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 678 119.9 2.4e-26
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 678 119.9 2.5e-26
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 618 109.8 4.8e-24
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 618 109.8 5.1e-24
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2 ( 926) 617 109.9 1.1e-23
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 618 110.1 1.2e-23
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 613 109.1 1.2e-23
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 613 109.1 1.2e-23
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 618 110.1 1.2e-23
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 614 109.4 1.3e-23
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 614 109.4 1.5e-23
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 614 109.5 1.8e-23
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 606 108.0 2.7e-23
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 608 108.6 4.2e-23
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 600 107.2 8.5e-23
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 597 106.6 8.9e-23
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 597 106.6 9e-23
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 600 107.3 9.5e-23
CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 737) 593 106.0 1.3e-22
CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 782) 593 106.0 1.4e-22
CCDS6776.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 913) 593 106.0 1.6e-22
CCDS47096.1 PTPN13 gene_id:5783|Hs108|chr4 (2294) 599 107.3 1.6e-22
CCDS47095.1 PTPN13 gene_id:5783|Hs108|chr4 (2466) 599 107.3 1.7e-22
CCDS47094.1 PTPN13 gene_id:5783|Hs108|chr4 (2485) 599 107.3 1.8e-22
CCDS47093.1 PTPN13 gene_id:5783|Hs108|chr4 (2490) 599 107.3 1.8e-22
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 579 104.0 1.1e-21
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 579 104.0 1.1e-21
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 579 104.0 1.3e-21
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 579 104.0 1.3e-21
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 807) 571 102.5 1.6e-21
CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2 ( 460) 561 100.7 3.1e-21
CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 889) 562 101.1 4.7e-21
CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 950) 562 101.1 5e-21
CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 979) 562 101.1 5.1e-21
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 564 101.6 6.9e-21
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 564 101.6 6.9e-21
CCDS78294.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 977) 553 99.7 1.4e-20
CCDS5949.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 986) 553 99.7 1.4e-20
CCDS5948.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 998) 553 99.7 1.4e-20
>>CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 (435 aa)
initn: 2995 init1: 2995 opt: 2995 Z-score: 2599.6 bits: 490.1 E(32554): 1.8e-138
Smith-Waterman score: 2995; 100.0% identity (100.0% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-435)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 CAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTTWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTTWP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVKEETQEDKDCPIKEEKGSPLNAAPYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVKEETQEDKDCPIKEEKGSPLNAAPYG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 IESMSQDTEVRSRVVGGSLRGAQAASPAKGEPSLPEKDEDHALSYWKPFLVNMCVATVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IESMSQDTEVRSRVVGGSLRGAQAASPAKGEPSLPEKDEDHALSYWKPFLVNMCVATVLT
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB5 AGAYLCYRFLFNSNT
:::::::::::::::
CCDS13 AGAYLCYRFLFNSNT
430
>>CCDS63309.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 (362 aa)
initn: 2495 init1: 2495 opt: 2495 Z-score: 2168.4 bits: 410.1 E(32554): 1.9e-114
Smith-Waterman score: 2495; 100.0% identity (100.0% similar) in 362 aa overlap (74-435:1-362)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 NRYRDVSPFDHSRIKLHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQK
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 SRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENL
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 TTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMG
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 DSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVKEETQEDKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVKEETQEDKD
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 CPIKEEKGSPLNAAPYGIESMSQDTEVRSRVVGGSLRGAQAASPAKGEPSLPEKDEDHAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 CPIKEEKGSPLNAAPYGIESMSQDTEVRSRVVGGSLRGAQAASPAKGEPSLPEKDEDHAL
280 290 300 310 320 330
410 420 430
pF1KB5 SYWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SYWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSNT
340 350 360
>>CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 (353 aa)
initn: 1474 init1: 645 opt: 1493 Z-score: 1302.1 bits: 249.7 E(32554): 3.3e-66
Smith-Waterman score: 1498; 66.6% identity (86.6% similar) in 320 aa overlap (3-322:5-315)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIK
.:.:::..: . : .: .::.:. :.: ::::.:.:.::::::::::.::::.:
CCDS11 MPTTIEREFEELDTQRRWQPLYLEIRNESHDYPHRVAKFPENRNRNRYRDVSPYDHSRVK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGS
:.. .::::::::. .:::::::::::::::::: ::: :::.::...::::::..:: :
CCDS11 LQNAENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRIVEKES
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTT
.::::::: ...::.:..:.... :.:::.::::::. :.:::... ::: : ::::::
CCDS11 VKCAQYWPT-DDQEMLFKETGFSVKLLSEDVKSYYTVHLLQLENINSGETRTISHFHYTT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 WPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKR
::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.:::::::::::: :.::::.::.:
CCDS11 WPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPDHGPAVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLVLMEKG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KDPSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHED
: ..::.:::.:::.::::::: :::::::.:.::::: : ::::.: .:::::.::
CCDS11 DD---INIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKCIKGDSSIQKRWKELSKED
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVKEETQEDKDCPIKEEKGSPLNAAP
: : .: : : . : .::
CCDS11 LSPAFDH-----SPNKIMTEKYNGNRIGLEEEKLTGDRCTGLSSKMQDTMEENSERPRLT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11863.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 (387 aa)
initn: 1474 init1: 645 opt: 1493 Z-score: 1301.5 bits: 249.8 E(32554): 3.5e-66
Smith-Waterman score: 1498; 66.6% identity (86.6% similar) in 320 aa overlap (3-322:5-315)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIK
.:.:::..: . : .: .::.:. :.: ::::.:.:.::::::::::.::::.:
CCDS11 MPTTIEREFEELDTQRRWQPLYLEIRNESHDYPHRVAKFPENRNRNRYRDVSPYDHSRVK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGS
:.. .::::::::. .:::::::::::::::::: ::: :::.::...::::::..:: :
CCDS11 LQNAENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRIVEKES
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTT
.::::::: ...::.:..:.... :.:::.::::::. :.:::... ::: : ::::::
CCDS11 VKCAQYWPT-DDQEMLFKETGFSVKLLSEDVKSYYTVHLLQLENINSGETRTISHFHYTT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 WPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKR
::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.:::::::::::: :.::::.::.:
CCDS11 WPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPDHGPAVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLVLMEKG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KDPSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHED
: ..::.:::.:::.::::::: :::::::.:.::::: : ::::.: .:::::.::
CCDS11 DD---INIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKCIKGDSSIQKRWKELSKED
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVKEETQEDKDCPIKEEKGSPLNAAP
: : .: : : . : .::
CCDS11 LSPAFDH-----SPNKIMTEKYNGNRIGLEEEKLTGDRCTGLSSKMQDTMEENSESALRK
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 (415 aa)
initn: 1543 init1: 645 opt: 1493 Z-score: 1301.1 bits: 249.8 E(32554): 3.7e-66
Smith-Waterman score: 1549; 54.3% identity (77.1% similar) in 433 aa overlap (3-434:5-413)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIK
.:.:::..: . : .: .::.:. :.: ::::.:.:.::::::::::.::::.:
CCDS11 MPTTIEREFEELDTQRRWQPLYLEIRNESHDYPHRVAKFPENRNRNRYRDVSPYDHSRVK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGS
:.. .::::::::. .:::::::::::::::::: ::: :::.::...::::::..:: :
CCDS11 LQNAENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRIVEKES
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTT
.::::::: ...::.:..:.... :.:::.::::::. :.:::... ::: : ::::::
CCDS11 VKCAQYWPT-DDQEMLFKETGFSVKLLSEDVKSYYTVHLLQLENINSGETRTISHFHYTT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 WPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKR
::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.:::::::::::: :.::::.::.:
CCDS11 WPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPDHGPAVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLVLMEKG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KDPSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHED
: ..::.:::.:::.::::::: :::::::.:.::::: : ::::.: .:::::.::
CCDS11 DD---INIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAIIEGAKCIKGDSSIQKRWKELSKED
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVKEETQEDKDCPIKEEKGSPLNAAP
: : .: : : . : .:: :. ..:: : . :..
CCDS11 LSPAFDH-----SPNKIMTEKYNG-------NRIGLEEEKLTGDRC-------TGLSSKM
300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YGIESMSQDTEVRSRVVGG-SLRGAQAASPAKGEPSLPEKDEDHALSYWKPFLVNMCVAT
.... .:.:. . :: .. : . . :. . . : ::.:.:..: .
CCDS11 QDTMEENSESALRKRIREDRKATTAQKVQQMKQRLNENERKRKRWL-YWQPILTKMGFMS
340 350 360 370 380 390
420 430
pF1KB5 VLTAGAYLCYRFLFNSNT
:. .::.. . ..:..:
CCDS11 VILVGAFVGWTLFFQQNAL
400 410
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30 40 50 60 70 80
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::::.::.. .::::::::. .::::::::
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:::::::::: ::: :::.::...::::::..:: :.::::::: ...::.:..:....
CCDS77 LTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRIVEKESVKCAQYWPT-DDQEMLFKETGFSV
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pF1KB5 TLISEDIKSYYTVRQLELENLTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESG
:.:::.::::::. :.:::... ::: : ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KLLSEDVKSYYTVHLLQLENINSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESG
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210 220 230 240 250 260
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::.:.:::.:.:::::::::::: :.::::.::.: : ..::.:::.:::.::::::
CCDS77 SLNPDHGPAVIHCSAGIGRSGTFSLVDTCLVLMEKGDD---INIKQVLLNMRKYRMGLIQ
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270 280 290 300 310 320
pF1KB5 TADQLRFSYLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNG
: :::::::.:.::::: : ::::.: .:::::.::: : .: : : . : .::
CCDS77 TPDQLRFSYMAIIEGAKCIKGDSSIQKRWKELSKEDLSPAFDH-----SPNKIMTEKYNG
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:. ..:: : . :.. .... .:.:. .
CCDS77 -------NRIGLEEEKLTGDRC-------TGLSSKMQDTMEENSESALRKRIREDRKATT
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pF1KB5 AQAASPAKGEPSLPEKDEDHALSYWKPFLVNMCVATVLTAGAYLCYRFLFNSNT
:: .. : . . :. . . : ::.:.:..: .:. .::.. . ..:..:
CCDS77 AQKVQQMKQRLNENERKRKRWL-YWQPILTKMGFMSVILVGAFVGWTLFFQQNAL
340 350 360 370 380
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pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLPKNKNRNRYRDVSPFDHSRIK
.:.:::..: . : .: .::.:. :.: ::::.:.:.::::::::::.::::.:
CCDS59 MPTTIEREFEELDTQRRWQPLYLEIRNESHDYPHRVAKFPENRNRNRYRDVSPYDHSRVK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 LHQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGHFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGS
:.. .::::::::. .:::::::::::::::::: ::: :::.::...::::::..:: :
CCDS59 LQNAENDYINASLVDIEEAQRSYILTQGPLPNTCCHFWLMVWQQKTKAVVMLNRIVEKES
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120 130 140 150 160
pF1KB5 LKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYTVRQLELEN----------------
.::::::: ...::.:..:.... :.:::.::::::. :.:::
CCDS59 VKCAQYWPT-DDQEMLFKETGFSVKLLSEDVKSYYTVHLLQLENINYIENLWITLYLKLL
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB5 -------LTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVVHC
: . ::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.::
CCDS59 MLDVKRSLKSGETRTISHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLNPDHGPAVIHC
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 SAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRFSYLAVI
:::::::::: :.::::.::.: : ..::.:::.:::.::::::: :::::::.:.:
CCDS59 SAGIGRSGTFSLVDTCLVLMEKGDD---INIKQVLLNMRKYRMGLIQTPDQLRFSYMAII
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pF1KB5 EGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNHQWVK
:::: : ::::.: .:::::.::: : .: : : . : .::
CCDS59 EGAKCIKGDSSIQKRWKELSKEDLSPAFDH-----SPNKIMTEKYNGNRIGLEEEKLTGD
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CCDS59 RCTGLSSKMQDTMEENSESALRKRIREDRKATTAQKVQQMKQRLNENERKRKRPRLTDT
360 370 380 390 400 410
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10 20 30
pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKL
.: :.. ..: :.:.. . . : .:.:
CCDS79 AKNNEVSFSQIKPKKSKLIRVENFEAYFKKQQADSNCGFAEEYEDLKLVGISQPKYAAEL
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pF1KB5 PKNKNRNRYRDVSPFDHSRIKL----HQEDNDYINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCG
.:...::: .: :.: ::.:: :. : :::::. . ......: ::::::::
CCDS79 AENRGKNRYNNVLPYDISRVKLSVQTHSTD-DYINANYMPGYHSKKDFIATQGPLPNTLK
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KB5 HFWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYY
::.::::.. ...::.. .:.: :: .:::.:. .. . : .. .: :: . .
CCDS79 DFWRMVWEKNVYAIIMLTKCVEQGRTKCEEYWPSKQAQD--YGDITVAMT--SEIVLPEW
1130 1140 1150 1160 1170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 TVRQLELENLTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPVVV
:.:.. ..:. :.:.. . .::.:.::: :::.. ..:: . ::. . :: ..:..:
CCDS79 TIRDFTVKNIQTSESHPLRQFHFTSWPDHGVPDTTDLLINFRYLVRDYMKQSPPESPILV
1180 1190 1200 1210 1220 1230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 HCSAGIGRSGTFCLADTCLLLMDKRKDPSSVDIKKVLLEMRKFRMGLIQTADQLRF---S
:::::.::.::: : :. . .. ..::. .. ..: : ..:: :: :
CCDS79 HCSAGVGRTGTFIAIDR---LIYQIENENTVDVYGIVYDLRMHRPLMVQTEDQYVFLNQC
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pF1KB5 YLAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPN
: .... : : :. .:.: :
CCDS79 VLDIVRSQKDSKVDLIYQNTTAMTIYENLAPVTTFGKTNGYIA
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340 350 360 370 380 390
pF1KB5 HQWVKEETQEDKDCPIKEEKGSPLNAAPYGIESMSQDTEVRSRVVGGSLRGAQAASPAKG
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10 20 30
pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLP
: :.. . :.... . . : .: ::
CCDS55 SVHLNLGQKGNRKTSCPIKINQFEGHFMKLQADSNYLLSKEYEELKDVGRNQSCDIALLP
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40 50 60 70 80 90
pF1KB5 KNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDND----YINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGH
.:...::: .. :.: .:.:: . :.: ::::: : .. .: ::.::::::.:
CCDS55 ENRGKNRYNNILPYDATRVKLSNVDDDPCSDYINASYIPGNNFRREYIVTQGPLPGTKDD
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pF1KB5 FWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYT
::.:::::. ...::... .::: .:: .::: ... . . : : : ..::.. .:
CCDS55 FWKMVWEQNVHNIVMVTQCVEKGRVKCDHYWPADQDS-LYYGD--LILQMLSESVLPEWT
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pF1KB5 VRQLEL---ENLTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPV
.:.... :.: .. : : :::::.::: ::::. :...:. ::. . :: ::.
CCDS55 IREFKICGEEQLDAH--RLIRHFHYTVWPDHGVPETTQSLIQFVRTVRDYINRSPGAGPT
1760 1770 1780 1790 1800 1810
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:::::::.::.::: : : .:. :: :::: .. ..: :. ..:: : . :
CCDS55 VVHCSAGVGRTGTFIALDRILQQLDS-KD--SVDIYGAVHDLRLHRVHMVQTECQ--YVY
1820 1830 1840 1850 1860
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pF1KB5 LAVIEGAKFIMGDSSVQDQWKELSHEDLEPPPEHIPPPPRPPKRILEPHNGKCREFFPNH
:
CCDS55 LHQCVRDVLRARKLRSEQENPLFPIYENVNPEYHRDPVYSRH
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initn: 586 init1: 255 opt: 678 Z-score: 587.0 bits: 119.9 E(32554): 2.2e-26
Smith-Waterman score: 678; 40.6% identity (68.6% similar) in 271 aa overlap (9-272:1606-1866)
10 20 30
pF1KB5 MEMEKEFEQIDKSGSWAAIYQDIRHEASDFPCRVAKLP
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CCDS55 SVHLNLGQKGNRKTSCPIKINQFEGHFMKLQADSNYLLSKEYEELKDVGRNQSCDIALLP
1580 1590 1600 1610 1620 1630
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 KNKNRNRYRDVSPFDHSRIKLHQEDND----YINASLIKMEEAQRSYILTQGPLPNTCGH
.:...::: .. :.: .:.:: . :.: ::::: : .. .: ::.::::::.:
CCDS55 ENRGKNRYNNILPYDATRVKLSNVDDDPCSDYINASYIPGNNFRREYIVTQGPLPGTKDD
1640 1650 1660 1670 1680 1690
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pF1KB5 FWEMVWEQKSRGVVMLNRVMEKGSLKCAQYWPQKEEKEMIFEDTNLKLTLISEDIKSYYT
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CCDS55 FWKMVWEQNVHNIVMVTQCVEKGRVKCDHYWPADQDS-LYYGD--LILQMLSESVLPEWT
1700 1710 1720 1730 1740 1750
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 VRQLEL---ENLTTQETREILHFHYTTWPDFGVPESPASFLNFLFKVRESGSLSPEHGPV
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CCDS55 IREFKICGEEQLDAH--RLIRHFHYTVWPDHGVPETTQSLIQFVRTVRDYINRSPGAGPT
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:
CCDS55 LHQCVRDVLRARKLRSEQENPLFPIYENVNPEYHRDPVYSRH
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435 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]