FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5679, 960 aa 1>>>pF1KB5679 960 - 960 aa - 960 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1744+/-0.000507; mu= 21.9997+/- 0.032 mean_var=71.0657+/-14.487, 0's: 0 Z-trim(105.9): 70 B-trim: 40 in 1/53 Lambda= 0.152140 statistics sampled from 13980 (14050) to 13980 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.503), E-opt: 0.2 (0.165), width: 16 Scan time: 10.310 The best scores are: opt bits E(85289) NP_071745 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ami ( 960) 6406 1416.7 0 NP_001123612 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ( 960) 6406 1416.7 0 NP_001316158 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ( 915) 4528 1004.5 0 XP_011541846 (OMIM: 609497) PREDICTED: endoplasmic ( 937) 3356 747.2 8.8e-215 NP_001185470 (OMIM: 606832) endoplasmic reticulum ( 941) 3242 722.2 3e-207 XP_011541788 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 941) 3242 722.2 3e-207 NP_001035548 (OMIM: 606832) endoplasmic reticulum ( 941) 3242 722.2 3e-207 XP_016865071 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 948) 3242 722.2 3e-207 NP_057526 (OMIM: 606832) endoplasmic reticulum ami ( 948) 3242 722.2 3e-207 XP_016865069 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 XP_016865070 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 XP_011541786 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 XP_011541783 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 XP_005272072 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 XP_011541782 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 XP_011541787 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 XP_005272073 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 951) 3242 722.2 3e-207 NP_001316162 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum ( 350) 2147 481.6 3.1e-135 XP_016865072 (OMIM: 606832) PREDICTED: endoplasmic ( 586) 1927 433.4 1.6e-120 NP_037513 (OMIM: 606950) thyrotropin-releasing hor (1024) 1416 321.4 1.4e-86 XP_016874732 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin (1016) 1332 303.0 5.1e-81 NP_001968 (OMIM: 138297) glutamyl aminopeptidase [ ( 957) 1194 272.7 6.4e-72 NP_001317186 (OMIM: 606793) puromycin-sensitive am ( 915) 1181 269.8 4.5e-71 XP_016880862 (OMIM: 606793) PREDICTED: puromycin-s ( 920) 1181 269.8 4.5e-71 NP_006301 (OMIM: 606793) puromycin-sensitive amino ( 919) 1179 269.4 6.1e-71 XP_016880861 (OMIM: 606793) PREDICTED: puromycin-s ( 924) 1179 269.4 6.1e-71 XP_005268876 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin ( 777) 1146 262.1 8e-69 NP_787116 (OMIM: 151300) leucyl-cystinyl aminopept (1011) 1133 259.3 7.2e-68 NP_005566 (OMIM: 151300) leucyl-cystinyl aminopept (1025) 1133 259.3 7.2e-68 XP_016874733 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin ( 721) 1055 242.1 7.8e-63 XP_011519775 (OMIM: 151530) PREDICTED: aminopeptid ( 967) 1051 241.3 1.8e-62 NP_001141 (OMIM: 151530) aminopeptidase N precurso ( 967) 1051 241.3 1.8e-62 XP_005254949 (OMIM: 151530) PREDICTED: aminopeptid ( 967) 1051 241.3 1.8e-62 XP_016864704 (OMIM: 610046) PREDICTED: aminopeptid ( 549) 883 204.3 1.5e-51 XP_011541566 (OMIM: 610046) PREDICTED: aminopeptid ( 681) 883 204.3 1.7e-51 XP_011541565 (OMIM: 610046) PREDICTED: aminopeptid ( 709) 883 204.3 1.8e-51 NP_776161 (OMIM: 610046) aminopeptidase Q [Homo sa ( 990) 883 204.4 2.3e-51 XP_011536550 (OMIM: 606950) PREDICTED: thyrotropin ( 619) 795 185.0 1e-45 XP_016863366 (OMIM: 138297) PREDICTED: glutamyl am ( 599) 597 141.5 1.2e-32 XP_005247093 (OMIM: 605287) PREDICTED: arginyl ami ( 714) 247 64.7 1.9e-09 NP_060696 (OMIM: 605287) arginyl aminopeptidase-li ( 725) 241 63.4 4.8e-09 NP_001306111 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isofo ( 519) 233 61.6 1.2e-08 NP_064601 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isoform ( 650) 233 61.6 1.5e-08 XP_016857511 (OMIM: 602675) PREDICTED: aminopeptid ( 360) 227 60.1 2.3e-08 XP_005245478 (OMIM: 602675) PREDICTED: aminopeptid ( 360) 227 60.1 2.3e-08 NP_001306113 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isofo ( 360) 227 60.1 2.3e-08 NP_001306112 (OMIM: 602675) aminopeptidase B isofo ( 360) 227 60.1 2.3e-08 XP_011536651 (OMIM: 151570) PREDICTED: leukotriene ( 480) 228 60.5 2.5e-08 NP_001243573 (OMIM: 151570) leukotriene A-4 hydrol ( 508) 228 60.5 2.6e-08 XP_011536650 (OMIM: 151570) PREDICTED: leukotriene ( 518) 228 60.5 2.6e-08 >>NP_071745 (OMIM: 609497) endoplasmic reticulum aminope (960 aa) initn: 6406 init1: 6406 opt: 6406 Z-score: 7594.8 bits: 1416.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6406; 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