FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5688, 695 aa 1>>>pF1KB5688 695 - 695 aa - 695 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4406+/-0.00102; mu= 6.4721+/- 0.061 mean_var=217.3980+/-42.800, 0's: 0 Z-trim(110.5): 47 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.086985 statistics sampled from 11640 (11680) to 11640 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16 Scan time: 3.990 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 695) 4603 591.1 1.8e-168 CCDS44775.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 522) 2511 328.5 1.6e-89 CCDS44773.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 751) 2511 328.6 2.1e-89 CCDS58196.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 761) 2511 328.6 2.1e-89 CCDS8486.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 ( 763) 2092 276.0 1.4e-73 CCDS13577.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 695) 1916 253.9 5.8e-67 CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 660) 1860 246.8 7.3e-65 CCDS46638.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 639) 1629 217.8 3.8e-56 CCDS56213.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 752) 1287 175.0 3.6e-43 CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 746) 989 137.6 6.4e-32 CCDS33523.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 751) 989 137.6 6.5e-32 CCDS46639.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 714) 959 133.8 8.5e-31 CCDS13576.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 ( 770) 959 133.8 9e-31 CCDS32997.1 APLP1 gene_id:333|Hs108|chr19 ( 651) 802 114.1 6.8e-25 >>CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11 (695 aa) initn: 4603 init1: 4603 opt: 4603 Z-score: 3138.0 bits: 591.1 E(32554): 1.8e-168 Smith-Waterman score: 4603; 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90.5% identity (90.6% similar) in 727 aa overlap (1-659:1-727) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 EITHDVK----------------------------------------------------- ::::::: CCDS84 EITHDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVC 310 320 330 340 350 360 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 ---VPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 KAMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK 370 380 390 400 410 420 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ 430 440 450 460 470 480 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR 490 500 510 520 530 540 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH 550 560 570 580 590 600 550 560 570 580 590 pF1KB5 PFHPFPALPENE------------GSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLD :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 PFHPFPALPENEDTQPELYHPMKKGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLD 610 620 630 640 650 660 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 VKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS84 VKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQ 670 680 690 700 710 720 660 670 680 690 pF1KB5 YGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI ::::::: CCDS84 YGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI 730 740 750 760 >>CCDS13577.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (695 aa) initn: 1541 init1: 1214 opt: 1916 Z-score: 1315.6 bits: 253.9 E(32554): 5.8e-67 Smith-Waterman score: 2230; 51.1% identity (75.6% similar) in 709 aa overlap (15-694:5-694) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN : ::::.. :: :: . .::: .::::::::::.:: CCDS13 MLPGLALLLLAAWTARALEV-----PTDGNAGL---LAEPQIAMFCGRLN 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK ::.:.:.:::. ::.:::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: . CCDS13 MHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGR 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB5 KQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQG ::::.. :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: .. CCDS13 KQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKS 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 MTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDY-DVYK .:..::::::::.:.:.:.:.:::: .. .:.. . :::. . . :: : . CCDS13 TNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 SEFPTEADLEDFTEAAVDE--DDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDG .. :. :. .:. .: ::::.:.:.:: :. . :. : : .. CCDS13 DKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTT 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 TMSDKEITHDVKVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKK : . . . . :.:: : : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: . CCDS13 TTTTESVEEVVRVPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMR 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 EWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRM :::::: ::::::::.....::::: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::. CCDS13 EWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRL 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 ALENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVM :::::..:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..:::: CCDS13 ALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVM 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 pF1KB5 THLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------D :::.:: :: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::... :.: : CCDS13 THLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGND 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 QFTASISETPVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAE . :..:: . :. :..: : ... :.: : :: ::: : . . :. CCDS13 ALMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARPA----AD 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 EKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLL . . . .. :. .: .:: : . .. .: : ..... . :: . ...:.:::. CCDS13 RGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLM 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 VIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLE : .:.:::::::.::::.:.:: .: ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..: CCDS13 VGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFE 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 QMQI ::: CCDS13 QMQN >>CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (660 aa) initn: 1500 init1: 1173 opt: 1860 Z-score: 1277.9 bits: 246.8 E(32554): 7.3e-65 Smith-Waterman score: 2174; 51.3% identity (76.6% similar) in 670 aa overlap (54-694:1-659) 30 40 50 60 70 80 pF1KB5 TAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFET ::::.::::.:.:.:::. ::.:::.:..: CCDS56 MFCGRLNMHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDT 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 KEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSD :: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .::::.. :: :..::::::::: CCDS56 KEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSD 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 VLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYV .::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: .. .:..::::::::.:.:.:.:.: CCDS56 ALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFV 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 pF1KB5 CCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDY-DVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDE--DD ::: .. .:.. . :::. . . :: : ... :. :. .:. .: :: CCDS56 CCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDD 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 EDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDVKVPPTPLPTND- ::.:.:.:: :. . :. : : .. : . . . . :.:: : : : CCDS56 EDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTTTTTTESVEEVVRVPTTAASTPDA 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQH :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .:::::: ::::::::.....::: CCDS56 VDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQH 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 FQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQAL :: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::..:::. ::::..... : CCDS56 FQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNML 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 RRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYV ..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..:::::::.:: :: ::::::::.:: : CCDS56 KKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAV 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 pF1KB5 AQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQFTASISETPVDVR---VSSEES :.:::.:.:::::... :.: : . :..:: . :. :..: : CCDS56 AEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFS 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 -EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVK ... :.: : :: ::: : . .:.. . . .. :. .: .:: CCDS56 LDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARP----AADRGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVK 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 EMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYG : . .. .: : ..... . :: . ...:.:::.: .:.:::::::.::::.:.:: CCDS56 -MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYT 570 580 590 600 610 660 670 680 690 pF1KB5 TISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI .: ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..:::: CCDS56 SIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN 620 630 640 650 660 >>CCDS46638.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (639 aa) initn: 1269 init1: 942 opt: 1629 Z-score: 1121.4 bits: 217.8 E(32554): 3.8e-56 Smith-Waterman score: 1943; 50.2% identity (75.4% similar) in 631 aa overlap (93-694:19-638) 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 VNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQ :.:::::::::.:::: :.:.:::.: .:: CCDS46 MLPGLALLLLAAWTARALEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQ 10 20 30 40 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 CKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT ::.. :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: .. . 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CCDS56 VGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDK 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 pF1KB5 FHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEE-------EEEEDEEEDYDVYKSEFPTEADLE :.:.:.:::: .. .:.. . :::. . . : :: : .: :..: CCDS56 FRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 pF1KB5 DFTEAAVDEDDED----EEEGEEVVED-----------------------RD-------- . :: :::::: :::.:: :. :. CCDS56 E-EEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAET 240 250 260 270 280 290 280 290 300 pF1KB5 ---------YYYDTFKGD---------DYNEEN-PTEP------GSDGTMSDKEITHD-- .:.:. .: :..: :: :: ..: . :.. CCDS56 GPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSAMSQSLLKTTQEPL 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 ----VKVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE ::.: : : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .:::::: CCDS56 ARDPVKLPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAE 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL ::::::::.....::::: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::. CCDS56 RQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYI 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI .:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..:::::::.:: CCDS56 TALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVI 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI :: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::... :. :.. : :.: .. . 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CCDS56 PSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENE-GSGLTNIKTEEISEVKM 600 610 620 630 640 650 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 NAE--RVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTI .:: . .: : ..... . :: . ...:.:::.: .:.:::::::.::::.:.:: .: CCDS56 DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSI 660 670 680 690 700 710 660 670 680 690 pF1KB5 SHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..:::: CCDS56 HHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN 720 730 740 750 >>CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21 (746 aa) initn: 1911 init1: 925 opt: 989 Z-score: 686.5 bits: 137.6 E(32554): 6.4e-32 Smith-Waterman score: 2124; 48.2% identity (71.9% similar) in 745 aa overlap (30-694:8-745) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN :. .:. . .....:. .::::::::::.:: CCDS56 MDQLEDLLVLFINYVPTDGNAGL-LAEPQIAMFCGRLN 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK ::.:.:.:::. ::.:::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: . CCDS56 MHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGR 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 pF1KB5 KQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQG ::::.. :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.: .. CCDS56 KQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKS 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 MTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEE-------EEEEDEEE .:..::::::::.:.:.:.:.:::: .. .:.. . :::. . . : : CCDS56 TNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSE 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 pF1KB5 DYDVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDED----EEEGEEVVED----------------- : : .: :..:. :: :::::: :::.:: :. CCDS56 DKVVEVAEEEEVAEVEE-EEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTE 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 ------RD-----------------YYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDV- :. .:.:. .: :. .... .: : CCDS56 SVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVC 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 --KVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQA .: : : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .:::::: :: CCDS56 GSAIPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQA 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 KNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAAL ::::::.....::::: :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::..:: CCDS56 KNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITAL 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 QSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEER :. ::::..... :..:::::.::: ::..:..:: :::.::::..:::::::.:: :: CCDS56 QAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYER 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 pF1KB5 RNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQFTASISET ::::::::.:: ::.:::.:.:::::... :.: : . :..:: CCDS56 MNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTET 520 530 540 550 560 570 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 PVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNK . :. :..: : ... :.: : :: ::: : . .:.. . . .. CCDS56 KTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARP----AADRGLTTRPGS 580 590 600 610 620 630 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 VDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATV :. .: .:: : . .. .: : ..... . :: . ...:.:::.: .:.:::: CCDS56 GLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATV 640 650 660 670 680 690 650 660 670 680 690 pF1KB5 IVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI :::.::::.:.:: .: ::.:::: .:::::::.:::..::::::::..:::: CCDS56 IVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN 700 710 720 730 740 695 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 04:04:39 2016 done: Fri Nov 4 04:04:40 2016 Total Scan time: 3.990 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]