Result of FASTA (ccds) for pF1KB5688
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5688, 695 aa
  1>>>pF1KB5688 695 - 695 aa - 695 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4406+/-0.00102; mu= 6.4721+/- 0.061
 mean_var=217.3980+/-42.800, 0's: 0 Z-trim(110.5): 47  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.086985
 statistics sampled from 11640 (11680) to 11640 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.359), width:  16
 Scan time:  3.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 695) 4603 591.1 1.8e-168
CCDS44775.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 522) 2511 328.5 1.6e-89
CCDS44773.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 751) 2511 328.6 2.1e-89
CCDS58196.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11          ( 761) 2511 328.6 2.1e-89
CCDS8486.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11           ( 763) 2092 276.0 1.4e-73
CCDS13577.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 695) 1916 253.9 5.8e-67
CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 660) 1860 246.8 7.3e-65
CCDS46638.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 639) 1629 217.8 3.8e-56
CCDS56213.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 752) 1287 175.0 3.6e-43
CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 746)  989 137.6 6.4e-32
CCDS33523.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 751)  989 137.6 6.5e-32
CCDS46639.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 714)  959 133.8 8.5e-31
CCDS13576.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21            ( 770)  959 133.8   9e-31
CCDS32997.1 APLP1 gene_id:333|Hs108|chr19          ( 651)  802 114.1 6.8e-25


>>CCDS44774.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (695 aa)
 initn: 4603 init1: 4603 opt: 4603  Z-score: 3138.0  bits: 591.1 E(32554): 1.8e-168
Smith-Waterman score: 4603; 100.0% identity (100.0% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-695)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 EITHDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EITHDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690     
pF1KB5 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
              670       680       690     

>>CCDS44775.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (522 aa)
 initn: 2511 init1: 2511 opt: 2511  Z-score: 1720.8  bits: 328.5 E(32554): 1.6e-89
Smith-Waterman score: 3051; 75.1% identity (75.1% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-522)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
       :::::::::::::::                                             
CCDS44 KQCKSRFVTPFKCLV---------------------------------------------
              130                                                  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
                                                                   
CCDS44 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
                                                                   
CCDS44 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 EITHDVKVPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 --------PPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
                 140       150       160       170       180       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
       190       200       210       220       230       240       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
       250       260       270       280       290       300       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
       310       320       330       340       350       360       

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PPFHPFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNA
       370       380       390       400       410       420       

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGI
       430       440       450       460       470       480       

              670       680       690     
pF1KB5 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       490       500       510       520  

>>CCDS44773.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (751 aa)
 initn: 4588 init1: 2510 opt: 2511  Z-score: 1718.7  bits: 328.6 E(32554): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 4347; 92.2% identity (92.3% similar) in 727 aa overlap (25-695:25-751)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
                               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
              250       260       270       280       290       300

                                                                   
pF1KB5 EITHDVK-----------------------------------------------------
       :::::::                                                     
CCDS44 EITHDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVC
              310       320       330       340       350       360

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB5 ---VPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
          .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KAMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
              370       380       390       400       410       420

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB5 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
              430       440       450       460       470       480

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB5 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
              490       500       510       520       530       540

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB5 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
              550       560       570       580       590       600

          550       560       570       580       590       600    
pF1KB5 PFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PFHPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVG
              610       620       630       640       650       660

          610       620       630       640       650       660    
pF1KB5 GLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVD
              670       680       690       700       710       720

          670       680       690     
pF1KB5 PMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
              730       740       750 

>>CCDS58196.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11               (761 aa)
 initn: 4388 init1: 2510 opt: 2511  Z-score: 1718.6  bits: 328.6 E(32554): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 4280; 92.0% identity (92.2% similar) in 716 aa overlap (36-695:46-761)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 TAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLCRLGPGRGRAFFKWRCLPASVDRGNPLWALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNI
          20        30        40        50        60        70     

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB5 QTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKS
          80        90       100       110       120       130     

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB5 RFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYG
         140       150       160       170       180       190     

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB5 MLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEFPTEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEFPTEAD
         200       210       220       230       240       250     

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB5 LEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHD
         260       270       280       290       300       310     

                                                                   
pF1KB5 VK--------------------------------------------------------VP
       ::                                                        .:
CCDS58 VKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVCKAMIP
         320       330       340       350       360       370     

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB5 PTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKA
         380       390       400       410       420       430     

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB5 ERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPR
         440       450       460       470       480       490     

     430       440       450       460       470       480         
pF1KB5 PHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLS
         500       510       520       530       540       550     

     490       500       510       520       530       540         
pF1KB5 LLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFHPFHPF
         560       570       580       590       600       610     

     550       560       570       580       590       600         
pF1KB5 PALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEE
         620       630       640       650       660       670     

     610       620       630       640       650       660         
pF1KB5 RESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTP
         680       690       700       710       720       730     

     670       680       690     
pF1KB5 EERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
         740       750       760 

>>CCDS8486.1 APLP2 gene_id:334|Hs108|chr11                (763 aa)
 initn: 3712 init1: 2092 opt: 2092  Z-score: 1434.4  bits: 276.0 E(32554): 1.4e-73
Smith-Waterman score: 4199; 90.5% identity (90.6% similar) in 727 aa overlap (1-659:1-727)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KQCKSRFVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDYDVYKSEF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PTEADLEDFTEAAVDEDDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDK
              250       260       270       280       290       300

                                                                   
pF1KB5 EITHDVK-----------------------------------------------------
       :::::::                                                     
CCDS84 EITHDVKAVCSQEAMTGPCRAVMPRWYFDLSKGKCVRFIYGGCGGNRNNFESEDYCMAVC
              310       320       330       340       350       360

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB5 ---VPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
          .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KAMIPPTPLPTNDVDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAK
              370       380       390       400       410       420

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB5 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQ
              430       440       450       460       470       480

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB5 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERR
              490       500       510       520       530       540

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB5 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEIPPFH
              550       560       570       580       590       600

          550                   560       570       580       590  
pF1KB5 PFHPFPALPENE------------GSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLD
       ::::::::::::            ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PFHPFPALPENEDTQPELYHPMKKGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLD
              610       620       630       640       650       660

            600       610       620       630       640       650  
pF1KB5 VKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQ
              670       680       690       700       710       720

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pF1KB5 YGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       :::::::                                    
CCDS84 YGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
              730       740       750       760   

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                     : ::::.. :: :: .        .:::    .::::::::::.::
CCDS13           MLPGLALLLLAAWTARALEV-----PTDGNAGL---LAEPQIAMFCGRLN
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       ::.:.:.:::. ::.:::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .
CCDS13 MHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGR
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       ::::..  :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.:  ..
CCDS13 KQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKS
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        .:..::::::::.:.:.:.:.:::: ..   .:.. . :::. .      . :: :  .
CCDS13 TNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSE
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       ..    :. :. .:.  .:  ::::.:.:.:: :. .  :.         :  :  ..  
CCDS13 DKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTT
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       : . . . . :.:: :   : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .
CCDS13 TTTTESVEEVVRVPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMR
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pF1KB5 EWEEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRM
       :::::: ::::::::.....:::::  :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.
CCDS13 EWEEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRL
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       :::::..:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..::  :::.::::..::::
CCDS13 ALENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVM
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pF1KB5 THLHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------D
       :::.:: :: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::...       :.:          :
CCDS13 THLRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGND
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pF1KB5 QFTASISETPVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAE
        .  :..:: . :.   :..: : ... :.: :     ::  :::   :  . .    :.
CCDS13 ALMPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARPA----AD
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pF1KB5 EKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLL
       . . .  ..   :.  .:  .:: :  . .. .: : .....  . :: . ...:.:::.
CCDS13 RGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLM
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pF1KB5 VIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLE
       : .:.:::::::.::::.:.:: .: ::.::::  .:::::::.:::..::::::::..:
CCDS13 VGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFE
             640       650       660       670       680       690 

           
pF1KB5 QMQI
       ::: 
CCDS13 QMQN
           

>>CCDS56211.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21                 (660 aa)
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                                     ::::.::::.:.:.:::. ::.:::.:..:
CCDS56                               MFCGRLNMHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDT
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pF1KB5 KEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSD
       :: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .::::..  :: :..:::::::::
CCDS56 KEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSD
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pF1KB5 VLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYV
       .::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.:  .. .:..::::::::.:.:.:.:.:
CCDS56 ALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFV
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pF1KB5 CCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDY-DVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDE--DD
       ::: ..   .:.. . :::. .      . :: :  ...    :. :. .:.  .:  ::
CCDS56 CCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVEEEEADDD
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pF1KB5 EDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDVKVPPTPLPTND-
       ::.:.:.:: :. .  :.         :  :  ..  : . . . . :.:: :   : : 
CCDS56 EDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTTTTTTESVEEVVRVPTTAASTPDA
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pF1KB5 VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQAKNLPKAERQTLIQH
       :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .:::::: ::::::::.....:::
CCDS56 VDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQAKNLPKADKKAVIQH
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pF1KB5 FQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAALQSDPPRPHRILQAL
       ::  :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::..:::. ::::..... :
CCDS56 FQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITALQAVPPRPRHVFNML
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pF1KB5 RRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEERRNQSLSLLYKVPYV
       ..:::::.::: ::..:..::  :::.::::..:::::::.:: :: ::::::::.:: :
CCDS56 KKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYERMNQSLSLLYNVPAV
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pF1KB5 AQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQFTASISETPVDVR---VSSEES
       :.:::.:.:::::...       :.:          : .  :..:: . :.   :..: :
CCDS56 AEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTETKTTVELLPVNGEFS
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pF1KB5 -EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVK
        ... :.: :     ::  :::   :  .     .:.. . .  ..   :.  .:  .::
CCDS56 LDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARP----AADRGLTTRPGSGLTNIKTEEISEVK
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pF1KB5 EMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYG
        :  . .. .: : .....  . :: . ...:.:::.: .:.:::::::.::::.:.:: 
CCDS56 -MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYT
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pF1KB5 TISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       .: ::.::::  .:::::::.:::..::::::::..:::: 
CCDS56 SIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
     620       630       640       650       660

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CCDS46             MLPGLALLLLAAWTARALEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQ
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pF1KB5 CKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMT
       ::..  :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.:  .. .
CCDS46 CKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTN
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pF1KB5 LYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEEEEEEDEEEDY-DVYKSE
       :..::::::::.:.:.:.:.:::: ..   .:.. . :::. .      . :: :  ...
CCDS46 LHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDK
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pF1KB5 FPTEADLEDFTEAAVDE--DDEDEEEGEEVVEDRDYYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTM
           :. :. .:.  .:  ::::.:.:.:: :. .  :.         :  :  ..  : 
CCDS46 VVEVAEEEEVAEVEEEEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEE------ATERTTSIATTTTT
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pF1KB5 SDKEITHDVKVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEW
       . . . . :.:: :   : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .::
CCDS46 TTESVEEVVRVPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREW
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pF1KB5 EEAELQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMAL
       :::: ::::::::.....:::::  :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.::
CCDS46 EEAERQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLAL
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pF1KB5 ENYLAALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTH
       :::..:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..::  :::.::::..::::::
CCDS46 ENYITALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTH
            350       360       370       380       390       400  

        480       490       500       510                          
pF1KB5 LHVIEERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQF
       :.:: :: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::...       :.:          : .
CCDS46 LRVIYERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDAL
            410       420       430       440       450       460  

     520       530           540         550       560       570   
pF1KB5 TASISETPVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEK
         :..:: . :.   :..: : ... :.: :     ::  :::   :  . .    :.. 
CCDS46 MPSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARPA----ADRG
            470       480       490       500       510            

           580       590       600       610       620       630   
pF1KB5 VINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVI
       . .  ..   :.  .:  .:: :  . .. .: : .....  . :: . ...:.:::.: 
CCDS46 LTTRPGSGLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVG
      520       530        540       550       560       570       

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pF1KB5 AVAIATVIVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQM
       .:.:::::::.::::.:.:: .: ::.::::  .:::::::.:::..::::::::..:::
CCDS46 GVVIATVIVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQM
       580       590       600       610       620       630       

         
pF1KB5 QI
       : 
CCDS46 QN
         

>>CCDS56213.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21                 (752 aa)
 initn: 1812 init1: 1181 opt: 1287  Z-score: 888.6  bits: 175.0 E(32554): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 2119; 49.2% identity (72.1% similar) in 728 aa overlap (47-694:29-751)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB5 LLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLNMHVNIQTGKWEPDPTG
                                     .::::::::::.::::.:.:.:::. ::.:
CCDS56   MLPGLALLLLAAWTARALEVPTDGNAGLLAEPQIAMFCGRLNMHMNVQNGKWDSDPSG
                 10        20        30        40        50        

         80        90       100       110       120         130    
pF1KB5 TKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDKKQCKSR--FVTPFKCL
       ::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .::::..  :: :..::
CCDS56 TKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGRKQCKTHPHFVIPYRCL
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pF1KB5 VGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQGMTLYSYGMLLPCGVDQ
       :::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.:  .. .:..::::::::.:.
CCDS56 VGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKSTNLHDYGMLLPCGIDK
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          200       210       220              230       240       
pF1KB5 FHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEE-------EEEEDEEEDYDVYKSEFPTEADLE
       :.:.:.:::: ..   .:.. . :::. .        .  :  ::  :  .:    :..:
CCDS56 FRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSEDKVVEVAEEEEVAEVE
      180       190       200       210       220       230        

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pF1KB5 DFTEAAVDEDDED----EEEGEEVVED-----------------------RD--------
       .  ::  ::::::    :::.::  :.                       :.        
CCDS56 E-EEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTESVEEVVREVCSEQAET
       240       250       260       270       280       290       

                     280                 290             300       
pF1KB5 ---------YYYDTFKGD---------DYNEEN-PTEP------GSDGTMSDKEITHD--
                .:.:. .:            :..:  ::       ::  ..:  . :..  
CCDS56 GPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVCGSAMSQSLLKTTQEPL
       300       310       320       330       340       350       

             310        320       330       340       350       360
pF1KB5 ----VKVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAE
           ::.: :   : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .::::::
CCDS56 ARDPVKLPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAE
       360       370       380       390       400       410       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LQAKNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYL
        ::::::::.....:::::  :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::.
CCDS56 RQAKNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYI
       420       430       440       450       460       470       

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pF1KB5 AALQSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVI
       .:::. ::::..... :..:::::.::: ::..:..::  :::.::::..:::::::.::
CCDS56 TALQAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVI
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pF1KB5 EERRNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQRADMDQFTASISETPVDVRVSSEESEEI
        :: ::::::::.:: ::.:::.:.:::::...   :.  :..   :   :.:  ..  .
CCDS56 YERMNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEP---RISYGNDALM
       540       550       560       570       580          590    

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pF1KB5 PPFHPFHP-FPALPEN-EGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNKVDENMVIDETLDVKEMIF
       : .   .     :: : : :    :    .::.    :..:.   ...  .: ...:. .
CCDS56 PSLTETKTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENE-GSGLTNIKTEEISEVKM
          600       610       620       630        640       650   

      600         610       620       630       640       650      
pF1KB5 NAE--RVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATVIVISLVMLRKRQYGTI
       .::  . .: : .....  . :: . ...:.:::.: .:.:::::::.::::.:.:: .:
CCDS56 DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATVIVITLVMLKKKQYTSI
           660       670       680       690       700       710   

        660       670       680       690     
pF1KB5 SHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
        ::.::::  .:::::::.:::..::::::::..:::: 
CCDS56 HHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
           720       730       740       750  

>>CCDS56212.1 APP gene_id:351|Hs108|chr21                 (746 aa)
 initn: 1911 init1: 925 opt: 989  Z-score: 686.5  bits: 137.6 E(32554): 6.4e-32
Smith-Waterman score: 2124; 48.2% identity (71.9% similar) in 745 aa overlap (30-694:8-745)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAATGTAAAAATGRLLLLLLVGLTAPALALAGYIEALAANAGTGFAVAEPQIAMFCGKLN
                                    :. .:. . .....:. .::::::::::.::
CCDS56                       MDQLEDLLVLFINYVPTDGNAGL-LAEPQIAMFCGRLN
                                     10        20         30       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 MHVNIQTGKWEPDPTGTKSCFETKEEVLQYCQEMYPELQITNVMEANQRVSIDNWCRRDK
       ::.:.:.:::. ::.:::.:..::: .::::::.:::::::::.:::: :.:.:::.: .
CCDS56 MHMNVQNGKWDSDPSGTKTCIDTKEGILQYCQEVYPELQITNVVEANQPVTIQNWCKRGR
        40        50        60        70        80        90       

                130       140       150       160       170        
pF1KB5 KQCKSR--FVTPFKCLVGEFVSDVLLVPEKCQFFHKERMEVCENHQHWHTVVKEACLTQG
       ::::..  :: :..:::::::::.::::.::.:.:.:::.:::.: :::::.::.:  ..
CCDS56 KQCKTHPHFVIPYRCLVGEFVSDALLVPDKCKFLHQERMDVCETHLHWHTVAKETCSEKS
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pF1KB5 MTLYSYGMLLPCGVDQFHGTEYVCCPQTKIIGSVSKEEEEEDEEE-------EEEEDEEE
        .:..::::::::.:.:.:.:.:::: ..   .:.. . :::. .        .  :  :
CCDS56 TNLHDYGMLLPCGIDKFRGVEFVCCPLAEESDNVDSADAEEDDSDVWWGGADTDYADGSE
       160       170       180       190       200       210       

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pF1KB5 DYDVYKSEFPTEADLEDFTEAAVDEDDED----EEEGEEVVED-----------------
       :  :  .:    :..:.  ::  ::::::    :::.::  :.                 
CCDS56 DKVVEVAEEEEVAEVEE-EEADDDEDDEDGDEVEEEAEEPYEEATERTTSIATTTTTTTE
       220       230        240       250       260       270      

                                     280       290       300       
pF1KB5 ------RD-----------------YYYDTFKGDDYNEENPTEPGSDGTMSDKEITHDV-
             :.                 .:.:. .:           :. .... .:    : 
CCDS56 SVEEVVREVCSEQAETGPCRAMISRWYFDVTEGKCAPFFYGGCGGNRNNFDTEEYCMAVC
        280       290       300       310       320       330      

          310        320       330       340       350       360   
pF1KB5 --KVPPTPLPTND-VDVYFETSADDNEHARFQKAKEQLEIRHRNRMDRVKKEWEEAELQA
          .: :   : : :: :.:: .:.::::.::::::.:: .::.::..: .:::::: ::
CCDS56 GSAIPTTAASTPDAVDKYLETPGDENEHAHFQKAKERLEAKHRERMSQVMREWEEAERQA
        340       350       360       370       380       390      

           370       380       390       400       410       420   
pF1KB5 KNLPKAERQTLIQHFQAMVKALEKEAASEKQQLVETHLARVEAMLNDRRRMALENYLAAL
       ::::::.....:::::  :..::.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::..::
CCDS56 KNLPKADKKAVIQHFQEKVESLEQEAANERQQLVETHMARVEAMLNDRRRLALENYITAL
        400       410       420       430       440       450      

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB5 QSDPPRPHRILQALRRYVRAENKDRLHTIRHYQHVLAVDPEKAAQMKSQVMTHLHVIEER
       :. ::::..... :..:::::.::: ::..:..::  :::.::::..:::::::.:: ::
CCDS56 QAVPPRPRHVFNMLKKYVRAEQKDRQHTLKHFEHVRMVDPKKAAQIRSQVMTHLRVIYER
        460       470       480       490       500       510      

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pF1KB5 RNQSLSLLYKVPYVAQEIQEEIDELLQEQR-------ADM----------DQFTASISET
        ::::::::.:: ::.:::.:.:::::...       :.:          : .  :..::
CCDS56 MNQSLSLLYNVPAVAEEIQDEVDELLQKEQNYSDDVLANMISEPRISYGNDALMPSLTET
        520       530       540       550       560       570      

        530           540         550       560       570       580
pF1KB5 PVDVR---VSSEES-EEIPPFHPF--HPFPALPENEGSGVGEQDGGLIGAEEKVINSKNK
        . :.   :..: : ... :.: :     ::  :::   :  .     .:.. . .  ..
CCDS56 KTTVELLPVNGEFSLDDLQPWHSFGADSVPANTENEVEPVDARP----AADRGLTTRPGS
        580       590       600       610       620           630  

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pF1KB5 VDENMVIDETLDVKEMIFNAERVGGLEEERESVGPLREDFSLSSSALIGLLVIAVAIATV
          :.  .:  .:: :  . .. .: : .....  . :: . ...:.:::.: .:.::::
CCDS56 GLTNIKTEEISEVK-MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVVIATV
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pF1KB5 IVISLVMLRKRQYGTISHGIVEVDPMLTPEERHLNKMQNHGYENPTYKYLEQMQI
       :::.::::.:.:: .: ::.::::  .:::::::.:::..::::::::..:::: 
CCDS56 IVITLVMLKKKQYTSIHHGVVEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
             700       710       720       730       740      




695 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 04:04:39 2016 done: Fri Nov  4 04:04:40 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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