Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5691
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5691, 860 aa
1>>>pF1KB5691 860 - 860 aa - 860 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6819+/-0.00105; mu= 0.2830+/- 0.063
mean_var=202.9669+/-41.554, 0's: 0 Z-trim(110.5): 39 B-trim: 122 in 2/50
Lambda= 0.090025
statistics sampled from 11630 (11653) to 11630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.358), width: 16
Scan time: 4.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30933.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 ( 860) 5765 762.0 0
CCDS1267.2 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 ( 880) 3167 424.6 3.7e-118
CCDS55657.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 ( 951) 3123 418.9 2.1e-116
CCDS55658.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 ( 920) 2548 344.2 6.2e-94
CCDS1200.1 DCAF8 gene_id:50717|Hs108|chr1 ( 597) 461 73.1 1.7e-12
CCDS59162.1 DCAF8L2 gene_id:347442|Hs108|chrX ( 631) 455 72.3 3e-12
CCDS35222.1 DCAF8L1 gene_id:139425|Hs108|chrX ( 600) 430 69.1 2.7e-11
>>CCDS30933.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 (860 aa)
initn: 5765 init1: 5765 opt: 5765 Z-score: 4058.5 bits: 762.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5765; 99.9% identity (100.0% similar) in 860 aa overlap (1-860:1-860)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB5 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
::::::::::::::::::::
CCDS30 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
850 860
>>CCDS1267.2 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 (880 aa)
initn: 3161 init1: 3126 opt: 3167 Z-score: 2234.7 bits: 424.6 E(32554): 3.7e-118
Smith-Waterman score: 5715; 97.6% identity (97.7% similar) in 880 aa overlap (1-860:1-880)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSD--------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQD
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELD
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 TLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEAD
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 NHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTI
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860
pF1KB5 TVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
850 860 870 880
>>CCDS55657.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 (951 aa)
initn: 4373 init1: 3115 opt: 3123 Z-score: 2203.3 bits: 418.9 E(32554): 2.1e-116
Smith-Waterman score: 5193; 89.7% identity (89.8% similar) in 892 aa overlap (1-801:1-892)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS---------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQLRLK
430 440 450 460 470 480
460
pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
::::
CCDS55 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
490 500 510 520 530 540
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
550 560 570 580 590 600
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
610 620 630 640 650 660
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
670 680 690 700 710 720
650 660 670 680
pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRR
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS55 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
730 740 750 760 770 780
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
790 800 810 820 830 840
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
850 860 870 880 890 900
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
CCDS55 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
910 920 930 940 950
>>CCDS55658.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1 (920 aa)
initn: 3798 init1: 2540 opt: 2548 Z-score: 1799.9 bits: 344.2 E(32554): 6.2e-94
Smith-Waterman score: 4911; 86.2% identity (86.3% similar) in 892 aa overlap (1-801:1-861)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCV------
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 -------------------------LTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
330 340 350 360 370 380
430 440 450
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS---------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQLRLK
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460
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::::
CCDS55 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
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470 480 490 500 510 520
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CCDS55 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
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530 540 550 560 570 580
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CCDS55 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
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590 600 610 620 630 640
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CCDS55 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
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650 660 670 680
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CCDS55 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
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690 700 710 720 730 740
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CCDS55 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
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750 760 770 780 790 800
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CCDS55 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
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810 820 830 840 850 860
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CCDS55 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
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:. .. :. :. .:.: :: . .:.
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..:::..:.:.::::: ..:. .. :. :: . ... . . . : :.....
CCDS12 DFESGHKSNVFQAKFLPNSGDSTLAMCARDGQVRVAELSATQCCKNTKRVAQHKGASHKL
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:..: :::: :::..: .: : : ::: : . . .. . :
CCDS12 ALEPDSPCTFLSAGEDAVVFTIDLRQDRPASKLVVTKEKEK-------KVGLYTIYVNPA
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. .::: :. :::::.: . ..:.. .: : :: :. . .: :
CCDS12 NTHQFAVGGRDQFVRIYDQRKIDENE--------NNGVLKKFCPHHLVNSESKANITCLV
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::.:: :.:.::... ::::. . .: :. .:
CCDS12 YSHDGTELLASYNDEDIYLFNSSHSDGAQYVKRYKGHRNNATVKGVNFYGPKSEFVVSGS
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CCDS12 DCGHIFLWEKSSCQIIQFMEGDKGGVVNCLEPHPHLPVLATSGLDHDVKIWAPTAEASTE
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pF1KB5 LTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVIFYTN-VEQDAETNRQCQFTCHYGTT
. ...::: :.:.::::: .:. .. :. :: . .. .. . .: .: . : : .
CCDS59 VLNFESGHTNNVFQAKFLPNCGDSTLAMCARDGQVRVAELINASYFNNTKC-VAQHRGPA
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... :..:: ::. :::..: .: : .: . : .... .... :
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: .::: .:. :::::.: . . . .:.. .: : :: : . .: . :
CCDS59 TYQFAVGGQDQFVRIYDQRKIDKKEN--------NGVLKKFTPHHLVNCDFPTNITCVVY
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pF1KB5 SEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGP
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CCDS59 SHDGTELLASYNDDDIYLFNSSHSDGAQYSKRFKGHRNNTTVKGVNFYGPRSEFVVSGSD
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CCDS35 EQPRMCPRCGGTNHDQCLLDEDQALEEWISSETSALPRSRWQVLTALRQRQLG--SSARF
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CCDS35 VYEACGARTFVQRFRLQYLLGSHAGSVSTIHFNQRGTRLASSGDDLRVIVWDWVRQKPVL
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CCDS35 NFESGHDINVIQAKFFPNCGDSTLAMCGHDGQVRVAELINASYCENTKRVAKHRGPAHEL
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CCDS35 ALEPDSPYKFLTSGEDAVVFTIDLRQDRPASKVVVTRE---NDKKVGLYTISMNPANIYQ
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CCDS35 FAVGGHDQFVRIYDQRRIDKKE--------NNGVLKKFTPHHLVYCDFPTNITCVVYSHD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]