Result of FASTA (ccds) for pF1KB5705
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5705, 744 aa
  1>>>pF1KB5705 744 - 744 aa - 744 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0632+/-0.00107; mu= 13.2253+/- 0.064
 mean_var=184.8153+/-38.581, 0's: 0 Z-trim(109.6): 124  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.094342
 statistics sampled from 10872 (11006) to 10872 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.338), width:  16
 Scan time:  4.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7764.1 TRIM3 gene_id:10612|Hs108|chr11         ( 744) 4991 692.6 5.7e-199
CCDS58115.1 TRIM3 gene_id:10612|Hs108|chr11        ( 625) 4122 574.3  2e-163
CCDS47147.1 TRIM2 gene_id:23321|Hs108|chr4         ( 744) 3470 485.6 1.2e-136
CCDS3781.2 TRIM2 gene_id:23321|Hs108|chr4          ( 771) 3470 485.6 1.2e-136
CCDS893.1 TRIM45 gene_id:80263|Hs108|chr1          ( 580)  514 83.2 1.3e-15
CCDS43060.1 TRIM71 gene_id:131405|Hs108|chr3       ( 868)  454 75.2 4.9e-13


>>CCDS7764.1 TRIM3 gene_id:10612|Hs108|chr11              (744 aa)
 initn: 4991 init1: 4991 opt: 4991  Z-score: 3685.7  bits: 692.6 E(32554): 5.7e-199
Smith-Waterman score: 4991; 100.0% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAKREDSPGPEVQPMDKQFLVCSICLDRYQCPKVLPCLHTFCERCLQNYIPAQSLTLSCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MAKREDSPGPEVQPMDKQFLVCSICLDRYQCPKVLPCLHTFCERCLQNYIPAQSLTLSCP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 VCRQTSILPEQGVSALQNNFFISSLMEAMQQAPDGAHDPEDPHPLSVVAGRPLSCPNHEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VCRQTSILPEQGVSALQNNFFISSLMEAMQQAPDGAHDPEDPHPLSVVAGRPLSCPNHEG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 KTMEFYCEACETAMCGECRAGEHREHGTVLLRDVVEQHKAALQRQLEAVRGRLPQLSAAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KTMEFYCEACETAMCGECRAGEHREHGTVLLRDVVEQHKAALQRQLEAVRGRLPQLSAAI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 ALVGGISQQLQERKAEALAQISAAFEDLEQALQQRKQALVSDLETICGAKQKVLQSQLDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ALVGGISQQLQERKAEALAQISAAFEDLEQALQQRKQALVSDLETICGAKQKVLQSQLDT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LRQGQEHIGSSCSFAEQALRLGSAPEVLLVRKHMRERLAALAAQAFPERPHENAQLELVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LRQGQEHIGSSCSFAEQALRLGSAPEVLLVRKHMRERLAALAAQAFPERPHENAQLELVL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 EVDGLRRSVLNLGALLTTSATAHETVATGEGLRQALVGQPASLTVTTKDKDGRLVRTGSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EVDGLRRSVLNLGALLTTSATAHETVATGEGLRQALVGQPASLTVTTKDKDGRLVRTGSA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ELRAEITGPDGTRLPVPVVDHKNGTYELVYTARTEGELLLSVLLYGQPVRGSPFRVRALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ELRAEITGPDGTRLPVPVVDHKNGTYELVYTARTEGELLLSVLLYGQPVRGSPFRVRALR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 PGDLPPSPDDVKRRVKSPGGPGSHVRQKAVRRPSSMYSTGGKRKDNPIEDELVFRVGSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PGDLPPSPDDVKRRVKSPGGPGSHVRQKAVRRPSSMYSTGGKRKDNPIEDELVFRVGSRG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 REKGEFTNLQGVSAASSGRIVVADSNNQCIQVFSNEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRPTGVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 REKGEFTNLQGVSAASSGRIVVADSNNQCIQVFSNEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRPTGVA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 VDTNGDIIVADYDNRWVSIFSPEGKFKTKIGAGRLMGPKGVAVDRNGHIIVVDNKSCCVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VDTNGDIIVADYDNRWVSIFSPEGKFKTKIGAGRLMGPKGVAVDRNGHIIVVDNKSCCVF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 TFQPNGKLVGRFGGRGATDRHFAGPHFVAVNNKNEIVVTDFHNHSVKVYSADGEFLFKFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TFQPNGKLVGRFGGRGATDRHFAGPHFVAVNNKNEIVVTDFHNHSVKVYSADGEFLFKFG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 SHGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRIQVFDSSGSFLSYINTSAEPLYGPQGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SHGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRIQVFDSSGSFLSYINTSAEPLYGPQGLA
              670       680       690       700       710       720

              730       740    
pF1KB5 LTSDGHVVVADAGNHCFKAYRYLQ
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LTSDGHVVVADAGNHCFKAYRYLQ
              730       740    

>>CCDS58115.1 TRIM3 gene_id:10612|Hs108|chr11             (625 aa)
 initn: 4122 init1: 4122 opt: 4122  Z-score: 3047.3  bits: 574.3 E(32554): 2e-163
Smith-Waterman score: 4122; 100.0% identity (100.0% similar) in 624 aa overlap (121-744:2-625)

              100       110       120       130       140       150
pF1KB5 QAPDGAHDPEDPHPLSVVAGRPLSCPNHEGKTMEFYCEACETAMCGECRAGEHREHGTVL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                              MKTMEFYCEACETAMCGECRAGEHREHGTVL
                                            10        20        30 

              160       170       180       190       200       210
pF1KB5 LRDVVEQHKAALQRQLEAVRGRLPQLSAAIALVGGISQQLQERKAEALAQISAAFEDLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRDVVEQHKAALQRQLEAVRGRLPQLSAAIALVGGISQQLQERKAEALAQISAAFEDLEQ
              40        50        60        70        80        90 

              220       230       240       250       260       270
pF1KB5 ALQQRKQALVSDLETICGAKQKVLQSQLDTLRQGQEHIGSSCSFAEQALRLGSAPEVLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ALQQRKQALVSDLETICGAKQKVLQSQLDTLRQGQEHIGSSCSFAEQALRLGSAPEVLLV
             100       110       120       130       140       150 

              280       290       300       310       320       330
pF1KB5 RKHMRERLAALAAQAFPERPHENAQLELVLEVDGLRRSVLNLGALLTTSATAHETVATGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKHMRERLAALAAQAFPERPHENAQLELVLEVDGLRRSVLNLGALLTTSATAHETVATGE
             160       170       180       190       200       210 

              340       350       360       370       380       390
pF1KB5 GLRQALVGQPASLTVTTKDKDGRLVRTGSAELRAEITGPDGTRLPVPVVDHKNGTYELVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLRQALVGQPASLTVTTKDKDGRLVRTGSAELRAEITGPDGTRLPVPVVDHKNGTYELVY
             220       230       240       250       260       270 

              400       410       420       430       440       450
pF1KB5 TARTEGELLLSVLLYGQPVRGSPFRVRALRPGDLPPSPDDVKRRVKSPGGPGSHVRQKAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TARTEGELLLSVLLYGQPVRGSPFRVRALRPGDLPPSPDDVKRRVKSPGGPGSHVRQKAV
             280       290       300       310       320       330 

              460       470       480       490       500       510
pF1KB5 RRPSSMYSTGGKRKDNPIEDELVFRVGSRGREKGEFTNLQGVSAASSGRIVVADSNNQCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RRPSSMYSTGGKRKDNPIEDELVFRVGSRGREKGEFTNLQGVSAASSGRIVVADSNNQCI
             340       350       360       370       380       390 

              520       530       540       550       560       570
pF1KB5 QVFSNEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRPTGVAVDTNGDIIVADYDNRWVSIFSPEGKFKTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QVFSNEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRPTGVAVDTNGDIIVADYDNRWVSIFSPEGKFKTKI
             400       410       420       430       440       450 

              580       590       600       610       620       630
pF1KB5 GAGRLMGPKGVAVDRNGHIIVVDNKSCCVFTFQPNGKLVGRFGGRGATDRHFAGPHFVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAGRLMGPKGVAVDRNGHIIVVDNKSCCVFTFQPNGKLVGRFGGRGATDRHFAGPHFVAV
             460       470       480       490       500       510 

              640       650       660       670       680       690
pF1KB5 NNKNEIVVTDFHNHSVKVYSADGEFLFKFGSHGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NNKNEIVVTDFHNHSVKVYSADGEFLFKFGSHGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGN
             520       530       540       550       560       570 

              700       710       720       730       740    
pF1KB5 SRIQVFDSSGSFLSYINTSAEPLYGPQGLALTSDGHVVVADAGNHCFKAYRYLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRIQVFDSSGSFLSYINTSAEPLYGPQGLALTSDGHVVVADAGNHCFKAYRYLQ
             580       590       600       610       620     

>>CCDS47147.1 TRIM2 gene_id:23321|Hs108|chr4              (744 aa)
 initn: 2184 init1: 1692 opt: 3470  Z-score: 2566.8  bits: 485.6 E(32554): 1.2e-136
Smith-Waterman score: 3470; 67.3% identity (88.5% similar) in 740 aa overlap (8-744:9-744)

                10        20        30        40        50         
pF1KB5  MAKREDSPGPEVQPMDKQFLVCSICLDRYQCPKVLPCLHTFCERCLQNYIPAQSLTLSC
               :.: :. .:::::.:::::.::. :::::::::::::::::::::.::::::
CCDS47 MASEGTNIPSPVVRQIDKQFLICSICLERYKNPKVLPCLHTFCERCLQNYIPAHSLTLSC
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100          110      
pF1KB5 PVCRQTSILPEQGVSALQNNFFISSLMEAMQQAPDGAHDPEDP---HPLSVVAGRPLSCP
       :::::::::::.::.::::::::..::...:..: :..  :.       .:.::.:::::
CCDS47 PVCRQTSILPEKGVAALQNNFFITNLMDVLQRTP-GSNAEESSILETVTAVAAGKPLSCP
               70        80        90        100       110         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB5 NHEGKTMEFYCEACETAMCGECRAGEHREHGTVLLRDVVEQHKAALQRQLEAVRGRLPQL
       ::.:..:::::..:::::: ::  ::: :: :: :.::::::::.:: ::.::  :::..
CCDS47 NHDGNVMEFYCQSCETAMCRECTEGEHAEHPTVPLKDVVEQHKASLQVQLDAVNKRLPEI
     120       130       140       150       160       170         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB5 SAAIALVGGISQQLQERKAEALAQISAAFEDLEQALQQRKQALVSDLETICGAKQKVLQS
       ..:. ... : .:: ..::  . .: ..:..:...:. ::..:. .::.  : :.:::::
CCDS47 DSALQFISEIIHQLTNQKASIVDDIHSTFDELQKTLNVRKSVLLMELEVNYGLKHKVLQS
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB5 QLDTLRQGQEHIGSSCSFAEQALRLGSAPEVLLVRKHMRERLAALAAQAFPERPHENAQL
       ::::: :::: : :  .:. :::  :.  :::::.:.: :.:  :: : :: .:.:: ::
CCDS47 QLDTLLQGQESIKSCSNFTAQALNHGTETEVLLVKKQMSEKLNELADQDFPLHPRENDQL
     240       250       260       270       280       290         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB5 ELVLEVDGLRRSVLNLGALLTTSATAHETVATGEGLRQALVGQPASLTVTTKDKDGRLVR
       ....:..::..:. :::..:::.:.: :::::::::::...::: :.:.:::::::.: .
CCDS47 DFIVETEGLKKSIHNLGTILTTNAVASETVATGEGLRQTIIGQPMSVTITTKDKDGELCK
     300       310       320       330       340       350         

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB5 TGSAELRAEITGPDGTRLPVPVVDHKNGTYELVYTARTEGELLLSVLLYGQPVRGSPFRV
       ::.: : ::.. :::.     ..:.::::::..::.. ::.. ::. :: : .:::::..
CCDS47 TGNAYLTAELSTPDGSVADGEILDNKNGTYEFLYTVQKEGDFTLSLRLYDQHIRGSPFKL
     360       370       380       390       400       410         

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB5 RALRPGDLPPSPDDVKRRVKSPGGPGSHVRQKAVRRPSSMYSTGGKRKDNPIEDELVFRV
       ...: .:. :. . :::::::::  ..::.::::.::.:::::: :::.:::::.:.:::
CCDS47 KVIRSADVSPTTEGVKRRVKSPG--SGHVKQKAVKRPASMYSTG-KRKENPIEDDLIFRV
     420       430       440         450       460        470      

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB5 GSRGREKGEFTNLQGVSAASSGRIVVADSNNQCIQVFSNEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRP
       :..::.::::::::::.:...:.:..:::::::.:.:::.:::: :::.:::::::::::
CCDS47 GTKGRNKGEFTNLQGVAASTNGKILIADSNNQCVQIFSNDGQFKSRFGIRGRSPGQLQRP
        480       490       500       510       520       530      

        540       550       560       570       580       590      
pF1KB5 TGVAVDTNGDIIVADYDNRWVSIFSPEGKFKTKIGAGRLMGPKGVAVDRNGHIIVVDNKS
       :::::  .::::.:::::.:::::: .::::::::.:.:::::::.:::::::::::::.
CCDS47 TGVAVHPSGDIIIADYDNKWVSIFSSDGKFKTKIGSGKLMGPKGVSVDRNGHIIVVDNKA
        540       550       560       570       580       590      

        600       610       620       630       640       650      
pF1KB5 CCVFTFQPNGKLVGRFGGRGATDRHFAGPHFVAVNNKNEIVVTDFHNHSVKVYSADGEFL
       :::: ::::::.: :::.::  ::.::::::.:::..:::..::::::::::.. .:::.
CCDS47 CCVFIFQPNGKIVTRFGSRGNGDRQFAGPHFAAVNSNNEIIITDFHNHSVKVFNQEGEFM
        600       610       620       630       640       650      

        660       670       680       690       700       710      
pF1KB5 FKFGSHGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRIQVFDSSGSFLSYINTSAEPLYGP
       .::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::
CCDS47 LKFGSNGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRIQVFDGSGSFLSYINTSADPLYGP
        660       670       680       690       700       710      

        720       730       740    
pF1KB5 QGLALTSDGHVVVADAGNHCFKAYRYLQ
       :::::::::::::::.::::::.:::::
CCDS47 QGLALTSDGHVVVADSGNHCFKVYRYLQ
        720       730       740    

>>CCDS3781.2 TRIM2 gene_id:23321|Hs108|chr4               (771 aa)
 initn: 2184 init1: 1692 opt: 3470  Z-score: 2566.7  bits: 485.6 E(32554): 1.2e-136
Smith-Waterman score: 3470; 67.3% identity (88.5% similar) in 740 aa overlap (8-744:36-771)

                                      10        20        30       
pF1KB5                        MAKREDSPGPEVQPMDKQFLVCSICLDRYQCPKVLPC
                                     :.: :. .:::::.:::::.::. ::::::
CCDS37 RYGTQQQRAGSKTAGPPCQWSRMASEGTNIPSPVVRQIDKQFLICSICLERYKNPKVLPC
          10        20        30        40        50        60     

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB5 LHTFCERCLQNYIPAQSLTLSCPVCRQTSILPEQGVSALQNNFFISSLMEAMQQAPDGAH
       :::::::::::::::.:::::::::::::::::.::.::::::::..::...:..: :..
CCDS37 LHTFCERCLQNYIPAHSLTLSCPVCRQTSILPEKGVAALQNNFFITNLMDVLQRTP-GSN
          70        80        90       100       110       120     

       100          110       120       130       140       150    
pF1KB5 DPEDP---HPLSVVAGRPLSCPNHEGKTMEFYCEACETAMCGECRAGEHREHGTVLLRDV
         :.       .:.::.:::::::.:..:::::..:::::: ::  ::: :: :: :.::
CCDS37 AEESSILETVTAVAAGKPLSCPNHDGNVMEFYCQSCETAMCRECTEGEHAEHPTVPLKDV
          130       140       150       160       170       180    

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB5 VEQHKAALQRQLEAVRGRLPQLSAAIALVGGISQQLQERKAEALAQISAAFEDLEQALQQ
       ::::::.:: ::.::  :::....:. ... : .:: ..::  . .: ..:..:...:. 
CCDS37 VEQHKASLQVQLDAVNKRLPEIDSALQFISEIIHQLTNQKASIVDDIHSTFDELQKTLNV
          190       200       210       220       230       240    

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB5 RKQALVSDLETICGAKQKVLQSQLDTLRQGQEHIGSSCSFAEQALRLGSAPEVLLVRKHM
       ::..:. .::.  : :.:::::::::: :::: : :  .:. :::  :.  :::::.:.:
CCDS37 RKSVLLMELEVNYGLKHKVLQSQLDTLLQGQESIKSCSNFTAQALNHGTETEVLLVKKQM
          250       260       270       280       290       300    

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB5 RERLAALAAQAFPERPHENAQLELVLEVDGLRRSVLNLGALLTTSATAHETVATGEGLRQ
        :.:  :: : :: .:.:: ::....:..::..:. :::..:::.:.: :::::::::::
CCDS37 SEKLNELADQDFPLHPRENDQLDFIVETEGLKKSIHNLGTILTTNAVASETVATGEGLRQ
          310       320       330       340       350       360    

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB5 ALVGQPASLTVTTKDKDGRLVRTGSAELRAEITGPDGTRLPVPVVDHKNGTYELVYTART
       ...::: :.:.:::::::.: .::.: : ::.. :::.     ..:.::::::..::.. 
CCDS37 TIIGQPMSVTITTKDKDGELCKTGNAYLTAELSTPDGSVADGEILDNKNGTYEFLYTVQK
          370       380       390       400       410       420    

          400       410       420       430       440       450    
pF1KB5 EGELLLSVLLYGQPVRGSPFRVRALRPGDLPPSPDDVKRRVKSPGGPGSHVRQKAVRRPS
       ::.. ::. :: : .:::::.....: .:. :. . :::::::::  ..::.::::.::.
CCDS37 EGDFTLSLRLYDQHIRGSPFKLKVIRSADVSPTTEGVKRRVKSPG--SGHVKQKAVKRPA
          430       440       450       460         470       480  

          460       470       480       490       500       510    
pF1KB5 SMYSTGGKRKDNPIEDELVFRVGSRGREKGEFTNLQGVSAASSGRIVVADSNNQCIQVFS
       :::::: :::.:::::.:.::::..::.::::::::::.:...:.:..:::::::.:.::
CCDS37 SMYSTG-KRKENPIEDDLIFRVGTKGRNKGEFTNLQGVAASTNGKILIADSNNQCVQIFS
             490       500       510       520       530       540 

          520       530       540       550       560       570    
pF1KB5 NEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRPTGVAVDTNGDIIVADYDNRWVSIFSPEGKFKTKIGAGR
       :.:::: :::.::::::::::::::::  .::::.:::::.:::::: .::::::::.:.
CCDS37 NDGQFKSRFGIRGRSPGQLQRPTGVAVHPSGDIIIADYDNKWVSIFSSDGKFKTKIGSGK
             550       560       570       580       590       600 

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pF1KB5 LMGPKGVAVDRNGHIIVVDNKSCCVFTFQPNGKLVGRFGGRGATDRHFAGPHFVAVNNKN
       :::::::.:::::::::::::.:::: ::::::.: :::.::  ::.::::::.:::..:
CCDS37 LMGPKGVSVDRNGHIIVVDNKACCVFIFQPNGKIVTRFGSRGNGDRQFAGPHFAAVNSNN
             610       620       630       640       650       660 

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pF1KB5 EIVVTDFHNHSVKVYSADGEFLFKFGSHGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRIQ
       ::..::::::::::.. .:::..::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EIIITDFHNHSVKVFNQEGEFMLKFGSNGEGNGQFNAPTGVAVDSNGNIIVADWGNSRIQ
             670       680       690       700       710       720 

          700       710       720       730       740    
pF1KB5 VFDSSGSFLSYINTSAEPLYGPQGLALTSDGHVVVADAGNHCFKAYRYLQ
       :::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::.:::::
CCDS37 VFDGSGSFLSYINTSADPLYGPQGLALTSDGHVVVADSGNHCFKVYRYLQ
             730       740       750       760       770 

>>CCDS893.1 TRIM45 gene_id:80263|Hs108|chr1               (580 aa)
 initn: 601 init1: 323 opt: 514  Z-score: 393.8  bits: 83.2 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 514; 25.7% identity (53.0% similar) in 506 aa overlap (5-497:74-573)

                                         10           20        30 
pF1KB5                           MAKREDSPGPEVQP--MDKQF-LVCSICLDRYQC
                                     : :   :..:  ...:. ..: .:  . . 
CCDS89 CLHTVCTTCLEQLEPFSVVDIRGGDSDTSSEGSIFQELKPRSLQSQIGILCPVCDAQVDL
            50        60        70        80        90       100   

                  40        50        60        70        80       
pF1KB5 P----KVLPCLHTFCERCLQNYIPAQSLTLSCPVCRQTSILPEQGVSALQNNFFISSLME
       :    :.:   :   .  . . . ...  : : .: .  .  :.  .. . :.     . 
CCDS89 PMGGVKALTIDHLAVNDVMLESLRGEGQGLVCDLCNDREV--EKRCQTCKANLCHFCCQA
           110       120       130       140         150       160 

        90          100       110       120       130       140    
pF1KB5 AMQQAPDGAH---DPEDPHPLSVVAGRPLSCPNHEGKTMEFYCEACETAMCGECRAGEHR
         .:     :   : .: .  : . :.:. :: : .. ....:: :.  .: .: .::::
CCDS89 HRRQKKTTYHTMVDLKDLKGYSRI-GKPILCPVHPAEELRLFCEFCDRPVCQDCVVGEHR
             170       180        190       200       210       220

          150       160       170       180       190       200    
pF1KB5 EHGTVLLRDVVEQHKAALQRQLEAVRGRLPQLSAAIALVGGISQQLQERKAEALAQISAA
       ::   .  .:...:  .. . :.... ..  :  :.: .  :.. ::.:   . :.. . 
CCDS89 EHPCDFTSNVIHKHGDSVWELLKGTQPHVEALEEALAQIHIINSALQKRVEAVAADVRTF
              230       240       250       260       270       280

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB5 FEDLEQALQQRKQALVSDLETICGAKQKVLQSQLDTLRQGQEHIGSSCSFAEQALRLGSA
        :   .:...... :...:: : . :.. :: :   :.:    . ..  :.:. :  :: 
CCDS89 SEGYIKAIEEHRDKLLKQLEDIRAQKENSLQLQKAQLEQLLADMRTGVEFTEHLLTSGSD
              290       300       310       320       330       340

          270       280       290        300       310       320   
pF1KB5 PEVLLVRKHMRERLAALAAQAFPERPHENAQLELV-LEVDGLRRSVLNLGALLTTSATAH
        :.:.... . :::  :    .  ::  : ....   :  :  :.    :.. :  .   
CCDS89 LEILITKRVVVERLRKLNKVQYSTRPGVNDKIRFCPQEKAGQCRGYEIYGTINTKEVDPA
              350       360       370       380       390       400

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pF1KB5 ETVATGEGLRQALVGQPASLTVTTKDKDGRLVRTGSAELRAEITGPDGTRLPVP--VVDH
       . :  :: :..:   : ::.:.  ::  :...  :. .... ..  :    ::   : :.
CCDS89 KCVLQGEDLHRAREKQTASFTLLCKDAAGEIMGRGGDNVQVAVVPKDKKDSPVRTMVQDN
              410       420       430       440       450       460

             390       400       410       420       430       440 
pF1KB5 KNGTYELVYTARTEGELLLSVLLYGQPVRGSPFRVRALRPGDLPPSPDDVKRRVKSPGGP
       :.::: . :: .  :   . : .  : :.:::: :  .:    : :         : :: 
CCDS89 KDGTYYISYTPKEPGVYTVWVCIKEQHVQGSPFTV-MVRRKHRPHSGVFHCCTFCSSGGQ
              470       480       490        500       510         

             450       460       470       480       490       500 
pF1KB5 GSHVRQKAVRRPSSMYSTGGKRKDNPIEDELVFRVGSRGREKGEFTNLQGVSAASSGRIV
        .     .   :... . :  .: .: . .  .   ..  ::.: :   : ::  :    
CCDS89 KTARCACGGTMPGGYLGCGHGHKGHPGHPH--WSCCGKFNEKSECTWTGGQSAPRSLLRT
     520       530       540         550       560       570       

             510       520       530       540       550       560 
pF1KB5 VADSNNQCIQVFSNEGQFKFRFGVRGRSPGQLQRPTGVAVDTNGDIIVADYDNRWVSIFS
                                                                   
CCDS89 VAL                                                         
       580                                                         

>>CCDS43060.1 TRIM71 gene_id:131405|Hs108|chr3            (868 aa)
 initn: 839 init1: 349 opt: 454  Z-score: 347.5  bits: 75.2 E(32554): 4.9e-13
Smith-Waterman score: 1001; 31.5% identity (58.6% similar) in 693 aa overlap (2-681:175-806)

                                             10           20       
pF1KB5                              MAKREDSPG-PEVQP---MDKQFLVCSICLD
                                     :  ...:: : ..:   . ..   :: : .
CCDS43 GHSNHRHHAHHAHPRASASAPPLPQAPQPPAPSRSAPGGPAASPSALLLRRPHGCSSCDE
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             . : : . .:. :.. .  .. :: .  . :     :  :..:           
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        : ::   :   :  :   :::   :   : .:. .....::..: . .: ::  :.:  
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       :. . :...... .: ..:   .: .::   :::  :  .  ...:.. .   . ....:
CCDS43 HSFIYLQEALQDSRALTIQLLADAQQGRQAIQLS--IEQAQTVAEQVEMKAKVVQSEVKA
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       .    ..::..:.  :.  .: :  .: : :  :.. :::. ... :. : ..:.:. : 
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       : ..::.: .:  ..  : .     .:.:. .. ..   ..:  .. ..: .....: : 
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        : :::.::..:: :. ::.::   :.::.   .:.  . : . ::::. . . : :..:
CCDS43 LTKATGDGLKRALQGKVASFTVIGYDHDGEPRLSGGDLMSAVVLGPDGNLFGAEVSDQQN
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       ::: . :  . ::: :.:: : .: ...:::.: ... :          :   . : :: 
CCDS43 GTYVVSYRPQLEGEHLVSVTLCNQHIENSPFKV-VVKSG----------RSYVGIGLPG-
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CCDS43 ----------------------------LSF--GSEGDSDGKLCRPWGVSVDKEGYIIVA
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       : .:. ::::.  : :. .::. :  :::..::.::: :..  :.::: ::. ..::. :
CCDS43 DRSNNRIQVFKPCGAFHHKFGTLGSRPGQFDRPAGVACDASRRIVVADKDNHRIQIFTFE
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       :.:  :.:      :..  :  :::. .:.:.: :...  .  : :.: .....: .:: 
CCDS43 GQFLLKFGEKGTKNGQFNYPWDVAVNSEGKILVSDTRNHRIQLFGPDGVFLNKYGFEGAL
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CCDS43 WKHFDSPRGVAFNHEGHLVVTDFNNHRLLVIHPDCQSARFLGSEGTGNGQFLRPQGVAVD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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