FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5713, 785 aa 1>>>pF1KB5713 785 - 785 aa - 785 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1010+/-0.000328; mu= 8.8647+/- 0.021 mean_var=162.6267+/-32.709, 0's: 0 Z-trim(120.7): 14 B-trim: 628 in 1/61 Lambda= 0.100572 statistics sampled from 36260 (36278) to 36260 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16 Scan time: 13.630 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060405 (OMIM: 152700,610292) B-cell scaffold pr ( 785) 5290 779.7 0 NP_001077376 (OMIM: 152700,610292) B-cell scaffold ( 755) 5065 747.1 6.5e-215 XP_016863826 (OMIM: 152700,610292) PREDICTED: B-ce ( 755) 5054 745.5 2e-214 NP_001120979 (OMIM: 152700,610292) B-cell scaffold ( 652) 4260 630.2 8.3e-180 XP_011537551 (OMIM: 607942) PREDICTED: phosphoinos ( 753) 356 63.8 3.1e-09 XP_011537550 (OMIM: 607942) PREDICTED: phosphoinos ( 796) 356 63.8 3.2e-09 NP_689522 (OMIM: 607942) phosphoinositide 3-kinase ( 805) 356 63.8 3.3e-09 XP_005269555 (OMIM: 607942) PREDICTED: phosphoinos ( 627) 232 45.8 0.00069 XP_005269556 (OMIM: 607942) PREDICTED: phosphoinos ( 627) 232 45.8 0.00069 >>NP_060405 (OMIM: 152700,610292) B-cell scaffold protei (785 aa) initn: 5290 init1: 5290 opt: 5290 Z-score: 4155.6 bits: 779.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5290; 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NP_689 HLSTDLLMKCS-LNPGCD--EDLYESMAAFVPAATEDLYVEMLQASTSNPIPGDGFSRAT 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 AFQLERPHFTLPGTMVEGQMERSQNWGHPGVRQETGDEPKGEKEKKEEEKEQEEEEDPYT .. : .: ..: ..::.: : : .::: : NP_689 KDSMIR-KFLEGNSMGMTNLERDQC--HLG-----------------------QEEDVYH 490 500 510 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 FAEIDDSEYDMILANLSIKKKTGSRSFIINRPPAPTPRPTSIPPKE----ETTPYIAQVF .. :: ... ::. :::.:.::: . : .. ::: .:: NP_689 TVD-DDEAFSVDLAS---------------RPPVPVPRPETTAPGAHQLPDNEPYIFKVF 520 530 540 550 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 QQKTARRQ-----SDDDKFRGLPKKQDRARIESPAFSTLRGCLTDGQEELILLQEKVKNG .:. .: :... .: : . : : .: .. . : : ::..:: :::.:: : NP_689 AEKSQERPGNFYVSSESIRKGPPVRPWRDRPQSSIYDPFAGMKTPGQRQLITLQEQVKLG 560 570 580 590 600 610 700 710 720 730 740 pF1KB5 KMSMDEALEKFKHWQMG---KSGLEMIQQEKLRQLRDCIIGKRPEEENVYNKLTIVHHPG ...:::. .::.::.. .: .:::.:..::: : .: .:.. .: : NP_689 IVNVDEAVLHFKEWQLNQKKRSESFRFQQENLKRLRDSIT-RRQREKQKSGKQTDLEITV 620 630 640 650 660 670 750 760 770 780 pF1KB5 GKETAHNENKFYNVHFSNKLPARPQVEKEFGFCCKKDH NP_689 PIRHSQHLPAKVEFGVYESGPRKSVIPPRTELRRGDWKTDSTSSTASSTSNRSSTRSLLS 680 690 700 710 720 730 >>XP_005269555 (OMIM: 607942) PREDICTED: phosphoinositid (627 aa) initn: 421 init1: 202 opt: 232 Z-score: 190.7 bits: 45.8 E(85289): 0.00069 Smith-Waterman score: 529; 27.8% identity (51.8% similar) in 571 aa overlap (199-741:2-493) 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 DLRAKHSGEISERKEIEELSEASRNTIPLAVVLPTEIPCENPGEIFIILRDEVIGDTV-- :: : .: : ...:.: . . : : XP_005 MVVQPDRIRCGAETTVYVIVRCK-LDDRVAT 10 20 30 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 EVEFTSSNK-RIRTRPALWNKKVWCMKALEFPAGSVHVNVYCDGIVKATTKIKYYPTAKA :.::. .. .: . . :. . .:: .. .:.: ...: .: : :.:: . 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