Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5718
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5718, 724 aa
1>>>pF1KB5718 724 - 724 aa - 724 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9574+/-0.000919; mu= -0.4731+/- 0.056
mean_var=246.8858+/-50.102, 0's: 0 Z-trim(113.9): 25 B-trim: 4 in 1/52
Lambda= 0.081626
statistics sampled from 14515 (14536) to 14515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.447), width: 16
Scan time: 4.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3760.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4 ( 724) 4965 598.0 1.6e-170
CCDS3759.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4 ( 694) 3711 450.3 4.5e-126
CCDS8259.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11 ( 676) 1166 150.6 7.3e-36
CCDS8260.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11 ( 638) 921 121.8 3.4e-27
CCDS65357.1 GAB3 gene_id:139716|Hs108|chrX ( 548) 580 81.6 3.6e-15
CCDS42976.1 GAB4 gene_id:128954|Hs108|chr22 ( 574) 580 81.6 3.8e-15
CCDS48198.1 GAB3 gene_id:139716|Hs108|chrX ( 587) 580 81.6 3.8e-15
CCDS14760.1 GAB3 gene_id:139716|Hs108|chrX ( 586) 576 81.1 5.3e-15
>>CCDS3760.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4 (724 aa)
initn: 4965 init1: 4965 opt: 4965 Z-score: 3174.7 bits: 598.0 E(32554): 1.6e-170
Smith-Waterman score: 4965; 100.0% identity (100.0% similar) in 724 aa overlap (1-724:1-724)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSGGEVVCSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MSGGEVVCSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DLNLCQQVDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DLNLCQQVDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EEDPVKPPGSSLQAPADLPLAINTAPPSTQADSSSATLPPPYQLINVPPHLETLGIQEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EEDPVKPPGSSLQAPADLPLAINTAPPSTQADSSSATLPPPYQLINVPPHLETLGIQEDP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASSQSKHGMNGFFQQQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASSQSKHGMNGFFQQQM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IYDSPPSRAPSASVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGELYVFNTPSGTSSVETQM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPDIPPPRPPKPHPAHDRSPVETC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPDIPPPRPPKPHPAHDRSPVETC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDASSQDCYDIPRAFPSDRSSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDASSQDCYDIPRAFPSDRSSSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EGFHNHFKVKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQHSSSFTEPIQEANYVPMTPGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EGFHNHFKVKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQHSSSFTEPIQEANYVPMTPGTF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DFSSFGMQVPPPAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPPVDRNLKPDRKGQSPKILRLKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DFSSFGMQVPPPAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPPVDRNLKPDRKGQSPKILRLKPH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GLERTDSQTIGDFATRRKVKPAPLEIKPLPEWEELQAPVRSPITRSFARDSSRFPMSPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GLERTDSQTIGDFATRRKVKPAPLEIKPLPEWEELQAPVRSPITRSFARDSSRFPMSPRP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 DSVHSTTSSSDSHDSEENYVPMNPNLSSEDPNLFGSNSLDGGSSPMIKPKGDKQVEYLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DSVHSTTSSSDSHDSEENYVPMNPNLSSEDPNLFGSNSLDGGSSPMIKPKGDKQVEYLDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DLDSGKSTPPRKQKSSGSGSSVADERVDYVVVDQQKTLALKSTREAWTDGRQSTESETPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DLDSGKSTPPRKQKSSGSGSSVADERVDYVVVDQQKTLALKSTREAWTDGRQSTESETPA
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 KSVK
::::
CCDS37 KSVK
>>CCDS3759.1 GAB1 gene_id:2549|Hs108|chr4 (694 aa)
initn: 3667 init1: 3667 opt: 3711 Z-score: 2376.9 bits: 450.3 E(32554): 4.5e-126
Smith-Waterman score: 4696; 95.9% identity (95.9% similar) in 724 aa overlap (1-724:1-694)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSGGEVVCSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MSGGEVVCSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DLNLCQQVDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DLNLCQQVDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EEDPVKPPGSSLQAPADLPLAINTAPPSTQADSSSATLPPPYQLINVPPHLETLGIQEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EEDPVKPPGSSLQAPADLPLAINTAPPSTQADSSSATLPPPYQLINVPPHLETLGIQEDP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASSQSKHGMNGFFQQQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASSQSKHGMNGFFQQQM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IYDSPPSRAPSASVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGELYVFNTPSGTSSVETQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IYDSPPSRAPSASVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGELYVFNTPSGTSSVETQM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPDIPPPRPPKPHPAHDRSPVETC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPDIPPPRPPKPHPAHDRSPVETC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDASSQDCYDIPRAFPSDRSSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDASSQDCYDIPRAFPSDRSSSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EGFHNHFKVKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQHSSSFTEPIQEANYVPMTPGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EGFHNHFKVKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQHSSSFTEPIQEANYVPMTPGTF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DFSSFGMQVPPPAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPPVDRNLKPDRKGQSPKILRLKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DFSSFGMQVPPPAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPPVDRNLKPDRK------------
490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GLERTDSQTIGDFATRRKVKPAPLEIKPLPEWEELQAPVRSPITRSFARDSSRFPMSPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ------------------VKPAPLEIKPLPEWEELQAPVRSPITRSFARDSSRFPMSPRP
530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 DSVHSTTSSSDSHDSEENYVPMNPNLSSEDPNLFGSNSLDGGSSPMIKPKGDKQVEYLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DSVHSTTSSSDSHDSEENYVPMNPNLSSEDPNLFGSNSLDGGSSPMIKPKGDKQVEYLDL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DLDSGKSTPPRKQKSSGSGSSVADERVDYVVVDQQKTLALKSTREAWTDGRQSTESETPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DLDSGKSTPPRKQKSSGSGSSVADERVDYVVVDQQKTLALKSTREAWTDGRQSTESETPA
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 KSVK
::::
CCDS37 KSVK
>>CCDS8259.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11 (676 aa)
initn: 1245 init1: 703 opt: 1166 Z-score: 757.4 bits: 150.6 E(32554): 7.3e-36
Smith-Waterman score: 1460; 39.2% identity (61.8% similar) in 748 aa overlap (3-724:4-675)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSGGEVVCSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRI
::.:::.::::::::::::.:::::.:::.:::::..:::::::::::::.:::.::
CCDS82 MSGGGDVVCTGWLRKSPPEKKLRRYAWKKRWFILRSGRMSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 IDLNLCQQVDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNP
:.::.:.::::::::::::...:..:::.: .: :::::..::.:::::. ::.:::::
CCDS82 INLNFCEQVDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICQICGFNQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB5 TEE--DPVKPPGSSLQAPADLPLAINTAP-----------PSTQADSSSATLPPPYQLIN
.:: : .. .:. ..: . : .... :: ... . :. ::
CCDS82 AEESTDSLRNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPP-----
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 VPPHLETLGIQEDPQDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASS
: :.. ::.:: : .: :.. : .:. . : . .: .:.. .. ...
CCDS82 VSNHMQPTLSTSAPQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRASFLMRSDTAVQKLAQGNG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 QSKHGMNGFFQQQMIYDSP-PSRAPSASVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGE-L
. .:..: : . .:. : ::: . ::. :.:::: . : : ...:.:.: .
CCDS82 HCVNGISG--QVHGFYSLPKPSRHNTEFRDST-YDLPRSLASHGHTKGSLTGSETDNEDV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 YVFNTPSGTSSVETQMRHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPD---IP
:.:.:::.: : :. ..:.: :: ..::::::: .. . : : :
CCDS82 YTFKTPSNTLCREFGDLLVD-NMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNAMTVATPGDSAIAP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PPRPPKPHPAHDRSPVETCSIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDAS
::::::: :. .: : . .: .:. : : ::. ..: ..:.. ::
CCDS82 PPRPPKPSQAE--TPRWGSPQQRPPISENSR---SVAATIP-RRNTLPAMDNSRLHR-AS
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB5 SQDCYDIPRAFPSDRSSSLEGFHNHFK--VKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQH
: . :. :. . . : :.. . . . . :: .: . ..:::::::.:
CCDS82 SCETYEYPQRGGESAGRSAESMSDGVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPGSSTLLA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 SSSFTEPIQEANYVPMTPGTFDFSSFGMQVPP-PAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPP
. : . :.::.::. :.:.:. :.: : : : . .:::
CCDS82 MERAGDNSQSV-YIPMSPGAHHFDSLGYPSTTLPVHRG--------PSRGSEI---QPPP
470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 VDRNLKPDRKGQSPKILRLKPHGLERTDSQTIGDFATRRKVKPAPLEIKPLPEWEELQAP
:.::::::::. ::.::... .:: :
CCDS82 VNRNLKPDRKA------------------------------KPTPLDLRNNTVIDEL--P
520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 VRSPITRSFARDSSRFPMSP----RPDSVHSTTSSSDSHDSEENYVPM-NPNLSSEDPNL
.::::.:..: . : : :: :..: ::. :: ::::::::: :: .: :.
CCDS82 FKSPITKSWSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITST-DSGDSEENYVPMQNPVSASPVPS-
550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 FGSNSLDGGSSPMIKPKGDKQVEYLDLDLDSGKSTPPRKQKSSGSGSSVADERVDYVVVD
:.:: : : :. .:.:: ::.. .. .: :: ..: : ..::.:::: ::
CCDS82 -GTNS------PAPK-KSTGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTS---SVTSDEKVDYVQVD
600 610 620 630 640
700 710 720
pF1KB5 QQKTLALKSTREAWTDGRQSTESETPAKSVK
..:: ::..: . ::: :::.: :.:..:
CCDS82 KEKTQALQNTMQEWTDVRQSSE---PSKGAKL
650 660 670
>>CCDS8260.1 GAB2 gene_id:9846|Hs108|chr11 (638 aa)
initn: 1000 init1: 458 opt: 921 Z-score: 601.8 bits: 121.8 E(32554): 3.4e-27
Smith-Waterman score: 1215; 36.9% identity (60.0% similar) in 713 aa overlap (38-724:1-637)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 CSGWLRKSPPEKKLKRYAWKRRWFVLRSGRLTGDPDVLEYYKNDHAKKPIRIIDLNLCQQ
..:::::::::::::.:::.:::.::.:.:
CCDS82 MSGDPDVLEYYKNDHSKKPLRIINLNFCEQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VDAGLTFNKKEFENSYIFDINTIDRIFYLVADSEEEMNKWVRCICDICGFNPTEE--DPV
:::::::::::...:..:::.: .: :::::..::.:::::. ::.::::: .:: : .
CCDS82 VDAGLTFNKKELQDSFVFDIKTSERTFYLVAETEEDMNKWVQSICQICGFNQAEESTDSL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB5 KPPGSSLQAPADLPLAINTAP-----------PSTQADSSSATLPPPYQLINVPPHLETL
. .:. ..: . : .... :: ... . :. :: : :..
CCDS82 RNVSSAGHGPRSSPAELSSSSQHLLRERKSSAPSHSSQPTLFTFEPP-----VSNHMQPT
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GIQEDPQDYLLLINCQSKKPEPTRTHADSAKSTSSETDCNDNVPSHKNPASSQSKHGMNG
::.:: : .: :.. : .:. . : . .: .:.. .. .... .:..:
CCDS82 LSTSAPQEYLYLHQCISRRAENARSASFSQGTRASFLMRSDTAVQKLAQGNGHCVNGISG
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FFQQQMIYDSP-PSRAPSASVDSSLYNLPRSYSHDVLPKVSPSSTEADGE-LYVFNTPSG
: . .:. : ::: . ::. :.:::: . : : ...:.:.: .:.:.:::.
CCDS82 --QVHGFYSLPKPSRHNTEFRDST-YDLPRSLASHGHTKGSLTGSETDNEDVYTFKTPSN
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KB5 TSSVETQMRHVSISYDIPPTPGNTYQIPRTFPEGTLGQTSKLDTIPD---IPPPRPPKPH
: : :. ..:.: :: ..::::::: .. . : : ::::::::
CCDS82 TLCREFGDLLVD-NMDVPATPLSAYQIPRTFTLDKNHNAMTVATPGDSAIAPPPRPPKPS
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PAHDRSPVETCSIPRTASDTDSSYCIPTAGMSPSRSNTISTVDLNKLRKDASSQDCYDIP
:. .: : . .: .:. : : ::. ..: ..:.. ::: . :. :
CCDS82 QAE--TPRWGSPQQRPPISENSR---SVAATIP-RRNTLPAMDNSRLHR-ASSCETYEYP
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 RAFPSDRSSSLEGFHNHFK--VKNVLTVGSVSSEELDENYVPMNPNSPPRQHSSSFTEPI
. . . : :.. . . . . :: .: . ..:::::::.: .
CCDS82 QRGGESAGRSAESMSDGVGSFLPGKMIVGRSDSTNSEDNYVPMNPGSSTLLAMERAGDNS
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 QEANYVPMTPGTFDFSSFGMQVPP-PAHMGFRSSPKTPPRRPVPVADCEPPPVDRNLKPD
: . :.::.::. :.:.:. :.: : : : .. .::::.::::::
CCDS82 QSV-YIPMSPGAHHFDSLGYPSTTLPVHRG--------PSRG---SEIQPPPVNRNLKPD
440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 RKGQSPKILRLKPHGLERTDSQTIGDFATRRKVKPAPLEIKPLPEWEELQAPVRSPITRS
::. ::.::... .:: : .::::.:
CCDS82 RKA------------------------------KPTPLDLRNNTVIDEL--PFKSPITKS
490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 FARDSSRFPMSP----RPDSVHSTTSSSDSHDSEENYVPM-NPNLSSEDPNLFGSNSLDG
..: . : : :: :..: ::. :: ::::::::: :: .: :. :.::
CCDS82 WSRANHTFNSSSSQYCRPISTQSITST-DSGDSEENYVPMQNPVSASPVPS--GTNS---
520 530 540 550 560
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 GSSPMIKPKGDKQVEYLDLDLDSGKSTPPRKQKSSGSGSSVADERVDYVVVDQQKTLALK
: : :. .:.:: ::.. .. .: :: ..: : ..::.:::: ::..:: ::.
CCDS82 ---PAPK-KSTGSVDYLALDFQPSSPSPHRKPSTS---SVTSDEKVDYVQVDKEKTQALQ
570 580 590 600 610
710 720
pF1KB5 STREAWTDGRQSTESETPAKSVK
.: . ::: :::.: :.:..:
CCDS82 NTMQEWTDVRQSSE---PSKGAKL
620 630
>>CCDS65357.1 GAB3 gene_id:139716|Hs108|chrX (548 aa)
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::.:..::.::: :::::.::.::::..:::::: ::..:.:::::::.: :..::::.:
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10 20 30 40 50 60
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. . : :. : .: ..: : . .: : : .: :
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:.: : . . ..: :. .. .:.: .: :: . . :::::::: .:
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: .: :. : . : : :: :...: .. .
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: .:: . . : . : .: . :: :.. :.:. : .:::
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: :. . . : . :. ... .: . .: :. : .:.::
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CCDS65 V
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: . ::.. ::....:. .. :.: :.:: . . :. . . :
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. ..... . : .: . .: :. . :..:: . ::
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:::.:: .. . : . .:. :. .: : ........ .
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. . :::.:.:::..:.. .: :: ....:.... :: :
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: : ..::.: :.. ...: ::.. .: . :: .. ..:
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CCDS42 DYVQVDLEKTQALQKTMHEQMCLRQSSEPPRGAKL
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CCDS48 VD-CLQPLPSSHLVHPSCHGSGAQEVPSSRPQAALIW----SREINGP------PRD---
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CCDS48 V
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:
CCDS14 SKV
724 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:11:37 2016 done: Sat Nov 5 16:11:38 2016
Total Scan time: 4.860 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]